# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02373.fasta.huge -Q ../query/KIAA0164.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0164, 929 aa vs ./tmplib.23147 library 1986576 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8892+/-0.00986; mu= -9.5187+/- 0.666 mean_var=442.4749+/-106.288, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060972 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 380 48.8 1.1e-05 KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309) 285 40.4 0.0031 >>KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800 aa) initn: 520 init1: 240 opt: 380 Z-score: 194.1 bits: 48.8 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 457; 24.468% identity (51.182% similar) in 846 aa overlap (5-775:626-1441) 10 20 30 KIAA01 SCIKPRRKEMGRSNSRSHSSR-SKSRSQSSSRSR : :. ::: ::. . : :.::. . ::: KIAA03 TQRRGRSRSARRGRSHSRSPATRGRSRSRTPARR--GRSRSRTPARRRSRSRTPTRRRSR 600 610 620 630 640 650 40 50 60 70 80 90 KIAA01 SRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRMYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGG ::. .:. : ::. .: ::.:: : ::. :..:. : . :::.:. . 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