# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh23975.fasta.huge -Q ../query/KIAA0148.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0148, 704 aa vs ./tmplib.23147 library 1986801 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0319+/-0.00664; mu= 4.7771+/- 0.449 mean_var=189.0307+/-46.809, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 52 in 1/39 Lambda= 0.093284 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 317 55.7 2.2e-08 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 302 53.6 8.6e-08 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 290 51.9 2.1e-07 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 275 50.0 1e-06 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 265 48.6 2.6e-06 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 249 46.5 1.2e-05 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 241 45.5 2.9e-05 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 225 43.3 0.00012 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 218 42.5 0.00029 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 219 42.8 0.00031 >>KIAA1099 ( 864 res) hk07834 (864 aa) initn: 411 init1: 256 opt: 317 Z-score: 242.5 bits: 55.7 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 445; 32.685% identity (62.646% similar) in 257 aa overlap (26-275:623-863) 10 20 30 40 50 KIAA01 SAAATAAFAVPRPLVPRRWEVGAMSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCD . .:.. :.:: .:.:::.: :...: KIAA10 QILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCI 600 610 620 630 640 650 60 70 80 90 100 110 KIAA01 ECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRK :: ..::.:: :.:.:: : :: :.... .. :. :::.::.: .:: : KIAA10 ECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANSVWEES-------SQGRTK 660 670 680 690 700 120 130 140 150 160 170 KIAA01 ANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRL . :... .: ..:::::.. :. ::: : .:...: .. .:.: . : KIAA10 PSV-DSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPC------TELSLGQHLLRATADEDLRTAILL 710 720 730 740 750 180 190 200 210 220 230 KIAA01 LSLGA--QANFFHPE-KGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQ :. :. ..: : : : ::.: . :... :.:: ::.: ..:. :.: . :::: KIAA10 LAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQ 760 770 780 790 800 810 240 250 260 270 280 KIAA01 GGHHELAERLVEIQYELTDR----LAFYLCGRKPDHKNGQHFIIPQMADRRLSLDLSELA .. .: . : .:: :. .: .:. ...:.. .: . 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KIAA00 ---KKPGPSCS-RQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQPPVPPKPSIRP 560 570 580 590 600 160 170 180 190 KIAA01 LHSSVRT---------GNLE----------------TCLRLLSLGAQANFFHPEKGN-TP .:.:. :.:. : :. ::..:. . . : :: KIAA00 RPGSLRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATP 610 620 630 640 650 660 200 210 220 230 240 250 KIAA01 LHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRL : :. :...: :.: ::. . ::.:. :. .: :: :: ... .: : KIAA00 LIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARD 670 680 690 700 710 720 260 270 280 290 300 310 KIAA01 AFYLCGRKPDHKNGQHFIIPQMADRRLSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDE . :: : KIAA00 SE---GRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDP 730 740 750 760 770 780 >>KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022 aa) initn: 230 init1: 175 opt: 241 Z-score: 186.4 bits: 45.5 E(): 2.9e-05 Smith-Waterman score: 260; 24.880% identity (50.957% similar) in 418 aa overlap (20-386:438-838) 10 20 30 40 KIAA01 SAAATAAFAVPRPLVPRRWEVGAMSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNR :. . .:. ...:: ::..:::.: :.: KIAA04 LQNSKEEALNNAFKGDDNTGENNIVQELTKEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNL 410 420 430 440 450 460 50 60 70 80 90 100 KIAA01 GTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASI : . : :: ..:: :: : :... : . : ..... : : : : : : :. 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KIAA04 RD-AANLAKEKQRAFMPSI-LQNETYGALLSGSPP-PAQPAAPSTTSAPPLPPRNVGKVQ 760 770 780 790 800 810 360 370 380 390 400 410 KIAA01 LARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYD : . : ... :. ::..:: KIAA04 TASSANTLWKTNSVSV--DGGSRQRSSSDPPAVHPPLPPLRVTSTNPLTPTPPPPVAKTP 820 830 840 850 860 870 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 240 init1: 212 opt: 225 Z-score: 175.1 bits: 43.3 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 268; 20.370% identity (49.495% similar) in 594 aa overlap (26-593:266-814) 10 20 30 40 50 KIAA01 SAAATAAFAVPRPLVPRRWEVGAMSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCD .:: ....: ::.. .:.: :.: : . : KIAA12 EEALTMAFRGEQSAGENSLEDLTKAIIEDVQRLPGNDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCI 240 250 260 270 280 290 60 70 80 90 100 110 KIAA01 ECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRK :: ..:: .: :::... :. . : ..... ::. :.: : .: .:. : KIAA12 ECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSPSP------K 300 310 320 330 340 120 130 140 150 160 170 KIAA01 ANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRL .:.. . : :.: ::: ::. : :... :.. :.. ... .: . ... 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