# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha03238.fasta.nr -Q ../query/KIAA0146.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0146, 918 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826789 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0636+/-0.000186; mu= 14.4675+/- 0.010 mean_var=76.7163+/-14.826, 0's: 27 Z-trim: 31 B-trim: 77 in 2/65 Lambda= 0.146430 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109086379|ref|XP_001104319.1| PREDICTED: hypoth ( 915) 5769 1228.9 0 gi|194376834|dbj|BAG57563.1| unnamed protein produ ( 845) 5531 1178.6 0 gi|194383254|dbj|BAG64598.1| unnamed protein produ ( 876) 5269 1123.2 0 gi|194375744|dbj|BAG57216.1| unnamed protein produ ( 737) 4882 1041.4 0 gi|119607081|gb|EAW86675.1| hCG1810961, isoform CR ( 683) 4188 894.8 0 gi|125858880|gb|AAI29121.1| RGD1566036 protein [Ra ( 878) 3397 727.8 5.2e-207 gi|26343021|dbj|BAC35167.1| unnamed protein produc ( 824) 3377 723.5 9.3e-206 gi|74218100|dbj|BAE42027.1| unnamed protein produc ( 760) 3214 689.1 2e-195 gi|149019696|gb|EDL77844.1| similar to RIKEN cDNA ( 772) 3183 682.5 1.9e-193 gi|194376796|dbj|BAG57544.1| unnamed protein produ ( 426) 2828 607.3 4.7e-171 gi|28422336|gb|AAH46558.1| 2310008H04Rik protein [ ( 625) 2749 590.8 6.6e-166 gi|194377178|dbj|BAG63150.1| unnamed protein produ ( 420) 2710 582.4 1.5e-163 gi|194381750|dbj|BAG64244.1| unnamed protein produ ( 405) 2697 579.6 9.6e-163 gi|74151304|dbj|BAE38782.1| unnamed protein produc ( 601) 2627 565.0 3.7e-158 gi|193786271|dbj|BAG51554.1| unnamed protein produ ( 390) 2616 562.5 1.3e-157 gi|47682209|gb|AAH69859.1| 2310008H04Rik protein [ ( 475) 2125 458.8 2.6e-126 gi|148664992|gb|EDK97408.1| RIKEN cDNA 2310008H04, ( 753) 1917 415.1 6.1e-113 gi|55391495|gb|AAH85258.1| 2310008H04Rik protein [ ( 414) 1867 404.3 5.9e-110 gi|20071267|gb|AAH26877.1| 2310008H04Rik protein [ ( 393) 1752 380.0 1.2e-102 gi|194387354|dbj|BAG60041.1| unnamed protein produ ( 209) 1175 257.8 3.6e-66 gi|194376000|dbj|BAG57344.1| unnamed protein produ ( 181) 1166 255.9 1.2e-65 gi|165970530|gb|AAI58396.1| LOC100145029 protein [ ( 395) 984 217.7 8.2e-54 gi|183986200|gb|AAI66296.1| Unknown (protein for M ( 645) 984 217.9 1.2e-53 gi|119607083|gb|EAW86677.1| hCG1810961, isoform CR ( 198) 772 172.7 1.5e-40 gi|74003788|ref|XP_535861.2| PREDICTED: hypothetic ( 358) 722 162.3 3.5e-37 gi|119607082|gb|EAW86676.1| hCG1810961, isoform CR ( 144) 587 133.5 6.8e-29 gi|47220367|emb|CAF98466.1| unnamed protein produc ( 479) 426 99.9 2.9e-18 gi|210119755|gb|EEA67478.1| hypothetical protein B (1010) 390 92.6 9.7e-16 gi|156226491|gb|EDO47300.1| predicted protein [Nem ( 970) 259 64.9 2e-07 gi|210116810|gb|EEA64552.1| hypothetical protein B ( 913) 240 60.9 3.1e-06 >>gi|109086379|ref|XP_001104319.1| PREDICTED: hypothetic (915 aa) initn: 5764 init1: 5764 opt: 5769 Z-score: 6580.6 bits: 1228.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5769; 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