# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02915s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0137.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0137, 801 aa vs ./tmplib.23147 library 1986704 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4738+/-0.00683; mu= 6.7254+/- 0.462 mean_var=246.3493+/-60.508, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 31 in 1/39 Lambda= 0.081714 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 366 56.7 1.4e-08 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 334 53.0 2e-07 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 287 47.7 1.2e-05 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 283 47.4 1.9e-05 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 279 46.6 2e-05 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 274 45.7 2e-05 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 274 45.7 2.1e-05 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 258 43.6 6.2e-05 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 269 45.7 6.2e-05 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 255 43.5 0.0001 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 257 43.9 0.00011 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 259 44.5 0.00013 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 248 42.4 0.00014 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 245 42.4 0.00025 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 243 42.4 0.00038 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 234 40.9 0.00052 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 224 39.9 0.0015 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 215 38.9 0.003 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 215 38.9 0.0033 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 211 38.3 0.0036 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 214 38.9 0.004 >>KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066 aa) initn: 280 init1: 102 opt: 366 Z-score: 245.7 bits: 56.7 E(): 1.4e-08 Smith-Waterman score: 390; 30.000% identity (60.000% similar) in 290 aa overlap (496-776:37-303) 470 480 490 500 510 520 KIAA01 HIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLN :.:.:.:. :.:. :.. : .. .: KIAA07 PAPRPRPACAMEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRH-REKHDLEVAVKCIN 10 20 30 40 50 60 530 540 550 560 570 580 KIAA01 KSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYL :. ... : : .: ::: : :: :::. . .... :.:::.:.:: :: KIAA07 KKNLAKSQTLLGK----EIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVY-LVMEYCNGGDLADYL 70 80 90 100 110 120 590 600 610 620 630 KIAA01 KQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVD--GTACG----EIK . . .:: : ...::..:.: :. . ::: :::: :::: . : . ..: KIAA07 HAMRTLSEDTIRLFLQQIAGAMRLLH--SKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVK 130 140 150 160 170 640 650 660 670 680 690 KIAA01 ITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIF :.:::... .... ... :. :. :: .. . ..:.:.::.:.: KIAA07 IADFGFARYLQSNM-------MAATLCGSPMYMAPEVIM----SQHYDGKADLWSIGTIV 180 190 200 210 220 700 710 720 730 740 750 KIAA01 FQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPV-VSSEAKAFIRRCLAYRKEDRF .::: :. :: . .: ::. . . ... :. : .:. . .. : ..::. KIAA07 YQCLTGKAPF-QASSPQDL---RLFYEKNKTLVPTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRM 230 240 250 260 270 280 760 770 780 790 800 KIAA01 DVHQLANDPYL--LPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY : .. . :.: : .:.: KIAA07 DFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGSGSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQKT 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100 aa) initn: 328 init1: 101 opt: 334 Z-score: 225.2 bits: 53.0 E(): 2e-07 Smith-Waterman score: 374; 31.317% identity (58.719% similar) in 281 aa overlap (496-769:78-335) 470 480 490 500 510 520 KIAA01 HIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLN :.:.:.:. :... .. : :...: KIAA06 APHCAARPSAVCPGGAAMEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRH-RQKTDWEVAIKSIN 50 60 70 80 90 100 530 540 550 560 570 580 KIAA01 KSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYL : .. .: . .: .: :::.: :: ::: : ...: :.:::.:.:: :: KIAA06 K--KNLSKSQILLG--KEIKILKELQHENIVALYDVQELPNSVF-LVMEYCNGGDLADYL 110 120 130 140 150 160 590 600 610 620 630 KIAA01 KQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLV-----DGTACG-EIK . . .:: : .. ::. :.: :. . ::: :::: :::: ... : .:: KIAA06 QAKGTLSEDTIRVFLHQIAAAMRILH--SKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIK 170 180 190 200 210 640 650 660 670 680 690 KIAA01 ITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIF :.:::... . .. ... :. :. :: .. . . :.:.::.:... KIAA06 IADFGFARYLHSNM-------MAATLCGSPMYMAPEVIM----SQHYDAKADLWSIGTVI 220 230 240 250 260 700 710 720 730 740 750 KIAA01 FQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYR-KEDRF .::: :. :: : : ::. . . .. .: : .: : . : : ..::. KIAA06 YQCLVGKPPFQAN-SPQDL---RMFYEKNRSLMPSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQKDRM 270 280 290 300 310 320 760 770 780 790 800 KIAA01 DVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIITY : . . . :.: KIAA06 DFEAFFSHPFLEQGPVKKSCPVPVPMYSGSVSGSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEEN 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583 aa) initn: 149 init1: 72 opt: 287 Z-score: 193.5 bits: 47.7 E(): 1.2e-05 Smith-Waterman score: 287; 32.099% identity (55.144% similar) in 243 aa overlap (478-709:375-600) 450 460 470 480 490 500 KIAA01 EEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVY- .:. : : :. . ..:.. :... :: KIAA09 RDPFPDVVHLEEQDSGGSNTPEQDDLSEGRSSKAKKPPGEND-FDTIKLISNGAYGAVYL 350 360 370 380 390 400 510 520 530 540 550 560 KIAA01 -KAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLD . : .::.: ::.. : : : ..: : : ..: .: .. : KIAA09 VRHRDT-RQRFAMKKINKQNLILR-----NQIQQAFVERDILTFAENPFVVGMFCSFETR 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 KIAA01 TDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPG .: :.:: ::.: ::. . . :: . : ::.::.. :.: :::: KIAA09 RH-LCMVMEYVEGGDCATLLKNIGALPVEMARMYFAETVLALEYLHNYG--IVHRDLKPD 460 470 480 490 500 510 630 640 650 660 670 KIAA01 NILLVDGTACGEIKITDFGLSKI--MDDDSYGVDGM---D----LTSQGAGTYWYLPPEC :.:. :. :.::.:::::::. :. . .: : : .: :: :. :: KIAA09 NLLI---TSMGHIKLTDFGLSKMGLMSLTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPE- 520 530 540 550 560 570 680 690 700 710 720 730 KIAA01 FVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKP :. .. .. :: :..:.:... : : :: KIAA09 -VILRQG--YGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVISDDILWPEGDEALP 580 590 600 610 620 740 750 760 770 780 790 KIAA01 VVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSS KIAA09 TEAQLLISSLLQTNPLVRLGAGGAFEVKQHSFFRDLDWTGLLRQKAEFIPHLESEDDTSY 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137 aa) initn: 157 init1: 72 opt: 283 Z-score: 189.5 bits: 47.4 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 283; 29.323% identity (55.639% similar) in 266 aa overlap (480-735:74-319) 450 460 470 480 490 500 KIAA01 AEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKA- ... .: .. . ..:.. :... :: . KIAA03 EEMAHLGNYDSGTAETPETDESVSSSNASLKLRRKPRESD-FETIKLISNGAYGAVYFVR 50 60 70 80 90 100 510 520 530 540 550 560 KIAA01 FDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDT .::.: ::.. : : : ..: : : ..: .:..: : KIAA03 HKESRQRFAMKKINKQNLILR-----NQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMYCSFETRRH- 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 620 KIAA01 FCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNIL .: :.:: ::.: .:. . :: . : ::.::.. :.: :::: :.: KIAA03 LCMVMEYVEGGDCATLMKNMGPLPVDMARMYFAETVLALEYLHNY--GIVHRDLKPDNLL 160 170 180 190 200 210 630 640 650 660 670 KIAA01 LVDGTACGEIKITDFGLSKI----MDDDSY-GVDGMD----LTSQGAGTYWYLPPECFVV . :. :.::.:::::::. : . : : : : .: :: :. :: :. KIAA03 V---TSMGHIKLTDFGLSKVGLMSMTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPE--VI 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 KIAA01 GKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVS .. .. :: :..:.:... : : :: ... .... . . . :...: : KIAA03 LRQG--YGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPF-FGDTPEELFGQ---VISDEINWPEKDEAP 270 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 790 KIAA01 SEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSII KIAA03 PPDAQDLITLLLRQNPLERLGTGGAYEVKQHRFFRSLDWNSLLRQKAEFIPQLESEDDTS 330 340 350 360 370 380 >>KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329 aa) initn: 118 init1: 72 opt: 279 Z-score: 189.2 bits: 46.6 E(): 2e-05 Smith-Waterman score: 279; 31.799% identity (56.067% similar) in 239 aa overlap (482-709:35-256) 460 470 480 490 500 510 KIAA01 IQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKA-FD : :. .: . ..:.. :... :. . KIAA08 EEMAQLSSCDSPDTPETDDSIEGHGASLPSKKTPS-EEDFETIKLISNGAYGAVFLVRHK 10 20 30 40 50 60 520 530 540 550 560 KIAA01 LYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDT-F .::.: ::.. : : : ..: : : ..: .:... :.:: . KIAA08 STRQRFAMKKINKQNLILR-----NQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMF--CSFDTKRHL 70 80 90 100 110 570 580 590 600 610 620 KIAA01 CTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILL : :.:: ::.: ::. . .: . : ::.::.. :.: :::: :.:. KIAA08 CMVMEYVEGGDCATLLKNIGALPVDMVRLYFAETVLALEYLHNYG--IVHRDLKPDNLLI 120 130 140 150 160 170 630 640 650 660 670 680 KIAA01 VDGTACGEIKITDFGLSKI--MDDDSYGVDGM---D----LTSQGAGTYWYLPPECFVVG :. :.::.:::::::. :. . .: : : .: :: :. :: :. KIAA08 ---TSMGHIKLTDFGLSKMGLMSLTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPE--VIL 180 190 200 210 220 690 700 710 720 730 740 KIAA01 KEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSS .. .. :: :..:.:... : : :: KIAA08 RQG--YGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVISDEIVWPEGDEALPPDAQ 230 240 250 260 270 280 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 216 init1: 85 opt: 274 Z-score: 189.2 bits: 45.7 E(): 2e-05 Smith-Waterman score: 377; 32.441% identity (59.866% similar) in 299 aa overlap (472-769:42-311) 450 460 470 480 490 500 KIAA01 LGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGG : : : ...: ... : ::. .:.:. KIAA18 NDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGN-YRLLRTIGKGN 20 30 40 50 60 70 510 520 530 540 550 560 KIAA01 FSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDY :..: : . : .:.:: ..:. . . . .. :: :: : :.:: ::::.. KIAA18 FAKVKLARHILTGREVAIKI--IDKT---QLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEV 80 90 100 110 120 570 580 590 600 610 620 KIAA01 FSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYD . . :. :.:: .... :: .: :.:::::. :::.:..: .. :.: : KIAA18 IETEK-TLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQ--KNIVHRD 130 140 150 160 170 180 630 640 650 660 670 680 KIAA01 LKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGK :: :.:: :. : .:::.:::.: .. . : . .: :. : :: : :: KIAA18 LKAENLLL-DAEA--NIKIADFGFS---NEFTLG-SKLDTFC---GSPPYAAPELFQ-GK 190 200 210 220 230 690 700 710 720 730 740 KIAA01 EPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPF-GHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSS . . .::.::.:::.. . : :: ::: .. :.: .. .: : .:. KIAA18 KYD--GPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKE---LRERVLRGKYRVPF----YMST 240 250 260 270 280 750 760 770 780 790 800 KIAA01 EAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTASPTPPSSSIIT . ....:: :. : ..:. .: .. KIAA18 DCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGM 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0151 ( 723 res) ha03241 (723 aa) initn: 221 init1: 73 opt: 274 Z-score: 188.9 bits: 45.7 E(): 2.1e-05 Smith-Waterman score: 274; 28.807% identity (55.144% similar) in 243 aa overlap (496-726:21-248) 470 480 490 500 510 520 KIAA01 HIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLN :::.:. . :::: . . .:::. . . KIAA01 PASSGQEMQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTT 10 20 30 40 50 530 540 550 560 570 580 KIAA01 KSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLD-TDTFCTVLEYCEGNDLDFY . : .. . ::... ..:.: ::::. . :.::: ...: KIAA01 SYLRPREVQ------VREFEVLRKLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSV 60 70 80 90 100 590 600 610 620 630 640 KIAA01 LKQHKL---MSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEI-KI :.. . . : : .. .: .. .: : :.: :.:::::. . : : :. 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