# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00946.fasta.huge -Q ../query/KIAA0065.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0065, 848 aa vs ./tmplib.23147 library 1986657 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7467+/-0.00605; mu= 9.5150+/- 0.411 mean_var=159.9385+/-41.518, 0's: 0 Z-trim: 80 B-trim: 15 in 1/39 Lambda= 0.101414 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 2141 326.5 7.5e-90 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 2094 319.7 9.7e-88 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 2062 314.8 2.2e-86 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 2050 313.1 7.4e-86 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1938 296.6 5.9e-81 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1932 295.7 1e-80 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1886 289.0 1.2e-78 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1850 283.5 3.6e-77 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1831 281.1 3.6e-76 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1806 277.3 3.6e-75 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1742 268.2 3e-72 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1738 267.3 3.4e-72 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1649 254.3 2.9e-68 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1608 248.2 1.8e-66 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1605 248.0 2.8e-66 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1601 247.2 3.7e-66 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1596 246.5 5.9e-66 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 1585 244.9 1.8e-65 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1579 243.9 3.2e-65 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 1569 242.6 9.6e-65 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 1549 239.6 6.8e-64 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1545 239.0 1.1e-63 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1530 236.9 5.1e-63 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1458 226.5 8.6e-60 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1424 221.4 2.4e-58 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1386 215.8 1.1e-56 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 1374 214.2 4.6e-56 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1358 211.7 1.8e-55 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1347 210.0 5.2e-55 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 1299 202.9 6.6e-53 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1300 203.3 7.6e-53 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 1258 197.3 6.3e-51 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 1238 194.0 3.3e-50 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 1039 165.2 2.6e-41 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 1012 161.1 3.4e-40 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 922 147.9 3.1e-36 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 897 144.1 3.4e-35 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 798 129.9 9.8e-31 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 722 118.4 1.6e-27 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 716 117.4 2.5e-27 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 707 117.1 1.7e-26 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 659 109.5 1.2e-24 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 656 109.2 1.9e-24 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 626 104.5 3e-23 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 585 98.7 2.3e-21 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 584 98.9 3.6e-21 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 515 88.8 4e-18 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 474 82.9 2.9e-16 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 464 81.2 6.4e-16 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 452 79.2 1.6e-15 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 5909 init1: 2055 opt: 2141 Z-score: 1705.0 bits: 326.5 E(): 7.5e-90 Smith-Waterman score: 2315; 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KIAA16 KVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFR 740 750 760 770 780 790 830 840 KIAA00 QVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ : : . . : ::.: KIAA16 QSSNLASHHRMHTGEKPYK 800 810 >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 1785 init1: 1785 opt: 2094 Z-score: 1667.1 bits: 319.7 E(): 9.7e-88 Smith-Waterman score: 2107; 42.497% identity (67.213% similar) in 793 aa overlap (18-784:180-946) 10 20 30 40 KIAA00 GGGPGISRVYALFYGECNPTREWAVSSELSPSFQEQNKMNKVEQKS- .: ::. . :... ...... .. . KIAA18 PGQSVLGMAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQY-PAWHVEGSLEEGRRATG 150 160 170 180 190 200 50 60 70 80 90 100 KIAA00 ------QESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIF :: :.::::.: :::::: .:: ::.::::::::.:..:.::: . ::::: KIAA18 LPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVIS 210 220 230 240 250 260 110 120 130 140 150 160 KIAA00 RLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIG :.::::::. :. :... : :. :. :... .. . .. .::. . 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KIAA18 QSIQPIYPARIQTGDNLFK---CTDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQ 430 440 450 460 470 480 330 340 350 360 370 380 KIAA00 KSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHL . .... :. :. ..:. : : : . . : :: :: .. :: :.: : : KIAA18 SPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFL 490 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 440 KIAA00 TRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQ :.: ..:..::.. ::: .: .: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :. KIAA18 TQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHE 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 KIAA00 RTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHT ::::: :::.:: :::.: .: : :.: ::: ::: : :::::: .::: :::::: KIAA18 RTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHT 610 620 630 640 650 660 510 520 530 540 550 560 KIAA00 GEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKP ::::::: ::::::: .:.: :.:.: :.: ..:. : :.: : :..:. :.: :: KIAA18 GEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKP 670 680 690 700 710 720 570 580 590 600 610 620 KIAA00 YECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECH :.: ::::.: .: : .:::::::.::. : :::: : ..:.:..: :.: :::::. KIAA18 YKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECN 730 740 750 760 770 780 630 640 650 660 670 680 KIAA00 ECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGK .::: . ..:..:.::::::::::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: . KIAA18 KCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCER 790 800 810 820 830 840 690 700 710 720 730 740 KIAA00 AFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRH .: .: ::.:.:::: ::::.::::::.: .:.:: : :.:::::::.::.: : : . KIAA18 SFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCK 850 860 870 880 890 900 750 760 770 780 790 800 KIAA00 KSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNL .::: .:.: :.::: :.:::: : .: : ::::.:. :: KIAA18 NSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN 910 920 930 940 810 820 830 840 KIAA00 IVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 3872 init1: 1970 opt: 2062 Z-score: 1642.8 bits: 314.8 E(): 2.2e-86 Smith-Waterman score: 2097; 45.092% identity (68.279% similar) in 703 aa overlap (122-814:55-751) 100 110 120 130 140 150 KIAA00 CVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEML .: . : :.:: .:: . .. .. KIAA13 RTKAISEDLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTP 30 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 KIAA00 TKEQG---DVIGIPF-NVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMS--FNTVSELVISKI-NYLGKKS :...: . : :: .. . . :: :: . ... .: ... ..:: : : KIAA13 TSQRGFRFESILIPEPGIATEELHSR---CQTQEENFTENLNLITDTHLGKIICKEMKGS 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 KIAA00 DEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHHEETL-QHEKIQTLEHNFEYSICQE . ..: :. : ....:: .. . :.. : ::.. .: :. .: . : . KIAA13 KAIRQTSELTLGKK---SNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGK 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 KIAA00 TLLEKAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFL-- :. . . .. .:. .. :. :: :... ::::. :: .... :. . : : . KIAA13 TFSQPSYLSQHKKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQ 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 KIAA00 CVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHL :.. . . .. : : :.: :. : : :.. :. .::: ..:..::::: .::.: KIAA13 CARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYL 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 KIAA00 TRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQ . ::..:: .::.::::: :.: . . .. ::: :::::::.:::::::. .:.: .: KIAA13 SVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHI 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 KIAA00 RTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHT :::::::::.:: :::.: . ...:.::: ::: :::.: ::::.: : : ::.: :: KIAA13 RTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHT 380 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 KIAA00 GEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKP ::::..: ::::.: ..:.: ::::: .: : :: ::..: :: :: :: :::: :: KIAA13 GEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKP 440 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 KIAA00 YECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECH :.: .: ..: .: ::. ::: ::. : .::: : :: : : :::::::::.:. KIAA13 YKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCN 500 510 520 530 540 550 630 640 650 660 670 680 KIAA00 ECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGK :: : : : : :: :.: :::::::.::::::.: ..: .. ::: : ::::.:::.::: KIAA13 ECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGK 560 570 580 590 600 610 690 700 710 720 730 740 KIAA00 AFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRH :: . . ::. :. ::::::. :::.: : : : : ::::::: :.:::: KIAA13 AFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCIT 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 KIAA00 KSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNL :.::.:.: ::::. .:.:::: : .:... : : :::::::.:: : :.: ..:.: KIAA13 LSQLTLHQRIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSL 680 690 700 710 720 730 810 820 830 840 KIAA00 IVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ :::: : :. . KIAA13 TVHQRIHQRETQLI 740 750 >>KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 (766 aa) initn: 1966 init1: 1966 opt: 2050 Z-score: 1633.3 bits: 313.1 E(): 7.4e-86 Smith-Waterman score: 2178; 45.583% identity (67.222% similar) in 781 aa overlap (46-811:24-763) 20 30 40 50 60 70 KIAA00 ECNPTREWAVSSELSPSFQEQNKMNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALY :: ..:.::.. :.::::. :::.::.:: KIAA20 RLLVLEEETRKRKRRAKESGMAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLY 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 KIAA00 RDVMLENYSNLVSVGY---CVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERS :::::::: ::::. :. : .. :: ..: : . .. . . : . KIAA20 RDVMLENYRNLVSLDISSKCTMKE--FLSTAQG-----NREVFHAGTLQIHESHHNGDFC 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 KIAA00 QENQSK--HLWEVVFINNEM------LTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGM .. .: : .: . ..: .:: . . : : : .. . :. : KIAA20 YQDVDKDIHDYEFQWQEDERNGHEAPMTKIK-KLTGSTERYDQSHARNKPI---KDQLGS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA00 SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEV-LKNRNTLSHHEET ::. :.: .: .: :. ... .: :: . .. ... . .. .:.. KIAA20 SFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN-----QVVKSI-HDASLVSTAQRISCRPKTHISNN--- 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA00 LQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLEKAVFNTQKRE-NAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFH : .:: : .:: :::.: . .:.. . :: :... :: : : KIAA20 --HG------NNFWNS----SLL------TQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKH 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 KIAA00 QISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLS--KPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGD :: :. :. . : :.. : .:. . .. . : :.: :..: . :. .. KIAA20 QIIHLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLH 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 KIAA00 KGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEK ::: ..:.:: ::: :: : ::. .:: .::..:::: :.: .:: ::.:.: ::::: KIAA20 TGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEK 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 KIAA00 PFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYEC :..::::::.:::::.:: :.: :::::::.:: ::::: .::.:: :.: ::: :::.: KIAA20 PYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKC 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 KIAA00 YECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACG :: :.. :....:.. :: .. ..: ::::.::. :.:: :.: : :.. :.:. : KIAA20 EECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECD 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 KIAA00 KTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFS :.: :: : ::. :::: :::.: :::::: :: :: :.: :::.: . : ::.: :: KIAA20 KAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFS 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 KIAA00 HKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQ ::.:. : : :.:::::.:.:::: : .. : .: : :.::.::.:.. ::. ::. KIAA20 WKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSN 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 720 KIAA00 LTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFH : ::.:: ..:::::::::.: . :.: :.: :: ::::::.:: :.: :::.: : KIAA20 LEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGH 620 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 780 KIAA00 ERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSH .: :::::::.:::::: : .:: .. ::: ::::: .:::::: : .:: : :.: : KIAA20 RRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLH 680 690 700 710 720 730 790 800 810 820 830 840 KIAA00 TGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGES ::::::.:: : ::::::::: :.: : :: KIAA20 TGEKPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV 740 750 760 KIAA00 PDDILNVQ >>KIAA0798 ( 682 res) hk06584 (682 aa) initn: 1914 init1: 1914 opt: 1938 Z-score: 1545.2 bits: 296.6 E(): 5.9e-81 Smith-Waterman score: 2056; 46.026% identity (60.897% similar) in 780 aa overlap (33-810:25-679) 10 20 30 40 50 60 KIAA00 GPGISRVYALFYGECNPTREWAVSSELSPSFQEQNKMNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQE : .:.:: ..:: ....:::: :: : KIAA07 LKFLNRNLRQIQRRQRQSIPGAGHFPQQKKMI----NAQELLTLEDVTVEFTWE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA00 EWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPV ::: : : :. :::::::: ::::.:.:: : ::... .:..::::: .:.: :. : KIAA07 EWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA00 WTA--DHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCD . :::.. :: :..:: . . KIAA07 NNEVDDHLQD--------HLE-----NQRMLKSVE------------------------- 120 130 190 200 210 220 230 240 KIAA00 SCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHH . : :: :. : .: :. : .: : KIAA07 ----------------------QYHEHNAFGN---------TASQTKSLCLFREN---HD 140 150 250 260 270 280 290 300 KIAA00 EETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLEKAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLL : :.::. :. .. : .: .:. :. . :..:.: KIAA07 TFELY---IKTLKSNL------------SLVNQNK-------SCEINNSTKFSGDGKSFL 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 KIAA00 FHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGD : :. :. . :: .:: : .:. . .. :. :. KIAA07 -H------GNYEELYSAAKF-----------SVSTK-------ANSTKSQV--SKHQRTH 200 210 220 370 380 390 400 410 420 KIAA00 KGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEK . ::. :.:::::: .::.:: :.:::::.::. :. : :.: :: :..::: : :: KIAA07 EIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREK 230 240 250 260 270 280 430 440 450 460 470 480 KIAA00 PFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYEC : :.::::.:. :: : ::::::::::: :: ::: : : .: :::.::: : : : KIAA07 SFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYIC 290 300 310 320 330 340 490 500 510 520 530 540 KIAA00 YECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACG ::::.: : : .::::::::::. : ::::.:. : . ::: : :.: : :: :: KIAA07 SECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECG 350 360 370 380 390 400 550 560 570 580 590 600 KIAA00 KTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFS : : :: . .:: ::: ::: : :::: : ::.: ::::.:: .: . : :::: :. KIAA07 KGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFT 410 420 430 440 450 460 610 620 630 640 650 660 KIAA00 HKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQ :: : : ::::::::: : :::: : :: : :.:::::::::.:.::::.: .: KIAA07 VKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSG 470 480 490 500 510 520 670 680 690 700 710 720 KIAA00 LTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFH : ::: : ::::: ::::::.: :: :.::::::: :::. :.::::.: .: :: : KIAA07 LMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVH 530 540 550 560 570 580 730 740 750 760 770 780 KIAA00 ERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSH .. :: :: :.:::. : ... :..:...::::: :::::: : ::.: :::.: KIAA07 QQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTH 590 600 610 620 630 640 790 800 810 820 830 840 KIAA00 TGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGES :::::. :. :::.::.: ::::::: : : KIAA07 TGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP 650 660 670 680 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 3387 init1: 1897 opt: 1932 Z-score: 1541.0 bits: 295.7 E(): 1e-80 Smith-Waterman score: 1944; 44.304% identity (68.038% similar) in 632 aa overlap (178-808:8-606) 150 160 170 180 190 200 KIAA00 NEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEF :: : : ::... : .:.. KIAA19 DEEAPSKQCVSVG-----VSQVTTLKPALSTQKAQPC 10 20 30 210 220 230 240 250 260 KIAA00 NACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLE ..:..:: .: : : . : : :.. .::. ... . .... KIAA19 ETCSSLLKDILHLAEHDGTHP---KRTAKLYLHQKEHLREKLTRSDEG------RPSFVN 40 50 60 70 80 270 280 290 300 310 320 KIAA00 KAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQ-ISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKST .: ... . ... :.. : . : .. .:. .: ::.: : : .: KIAA19 DSVHLAKRNLTCMQGGKDFT--GDS--DLQQQALHSGWKPHRDTH----GVEAF---QS- 90 100 110 120 130 330 340 350 360 370 380 KIAA00 LSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQR ....:.: . :..: .. : . :: :. .::.:::: : .: : .::: KIAA19 -------GQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR 140 150 160 170 180 390 400 410 420 430 440 KIAA00 VHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTG :::..:..:.:: ::: : :...::. ::::.:.::.:::::: .:: : ::: :: KIAA19 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR 190 200 210 220 230 240 450 460 470 480 490 500 KIAA00 EKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPF .:: :. :::.: .. :. ::. ::: .:: : :::: : .: : ::..::::.:: KIAA19 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF 250 260 270 280 290 300 510 520 530 540 550 560 KIAA00 ECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYE : :::: : .. .: :::.: :.: :::: ::: : ..: : ::: .::: ::::: : KIAA19 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE 310 320 330 340 350 360 570 580 590 600 610 620 KIAA00 CGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKI ::: : : : .:::.:::.::. : .::::: . ::..: :.:.::.:::: ::::. 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KIAA19 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK 550 560 570 580 590 600 810 820 830 840 KIAA00 RHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ : KIAA19 VHTR >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 1577 init1: 1577 opt: 1886 Z-score: 1504.1 bits: 289.0 E(): 1.2e-78 Smith-Waterman score: 2026; 41.153% identity (65.924% similar) in 763 aa overlap (47-808:6-673) 20 30 40 50 60 70 KIAA00 CNPTREWAVSSELSPSFQEQNKMNKVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYR : .:.:.::.:.:.::::. :. :: ::. KIAA19 TPAIMQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYH 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA00 DVMLENYSNLVSVG-YCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQEN ::::::. . :.: .: : : .:: ::.. . ... :: KIAA19 DVMLENWVLISSLGCWC------------GSE----DEEAPSKK-----SISIQRVSQ-- 40 50 60 70 140 150 160 170 180 190 KIAA00 QSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMSFNTVSELVIS .. : .. :: :.. .:. :: .. . .:. 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KIAA14 WDYD-ALFETQP--------GLV--TIKNLAVDFRQQLHPAQKNFCKNG-----IWENNS 250 260 270 280 230 240 250 260 270 KIAA00 HTQEKNEVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLEKAVFNTQ----KREN .. . . . .: : :... ..... :. . ...: .:: :... KIAA14 DLGSAGHCVAKPDLVSLLE---QEKEPWMVKRELTGSLFSG---QRSVHETQELFPKQDS 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 KIAA00 AEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHY :. : . . :.: :.. . :. : :. .:. . : . . .. .. KIAA14 YAEGVTDRTSNTKLDCSS----FRE---NWDSDYVFG--RKLAVGQETQFRQEPITHNKT 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 KIAA00 DCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNE : .. .. :.: : .:.. . . : : ..: . .. ...:.: :.::: KIAA14 LSKERERTYNKSGRWSYL---DDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLFKCNE 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 KIAA00 CEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKT :.:.: ..:.:: ::: ::::::..::::::::: :... ::: :::.:::.: :::. 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KIAA19 GRYTDLNQHKKIHTGEKLYKCEECGKDFVWYTDLNQQKKIYTGEKPYKCEECGKAFAPST 280 290 300 310 320 330 580 590 600 610 620 630 KIAA00 DLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTK ::. : . ::.. . : :::: :. . .:.:: . :::::::.:.:::: : . :: KIAA19 DLNQHTKILTGEQSYKCEECGKAFGWSIALNQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFSRSRNLTT 340 350 360 370 380 390 640 650 660 670 680 690 KIAA00 HNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRT : :.:: ::::.:.. :..: ...:.....:: :.: :::.::::.: ..: : :.. KIAA19 HRRVHTREKPYKCEDRGRSFGWSTNLNEYKKIHTGDKLYKCKECGKVFKQSSHLNRHEKI 400 410 420 430 440 450 700 710 720 730 740 750 KIAA00 HTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGE :: .:::::.:::: . .:.. :.: ::::::..: :::: : ...:: :.: :::: KIAA19 HTGKKPYKCKECGKVITSSSSFAKHKRIHTGEKPFKCLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGE 460 470 480 490 500 510 760 770 780 790 800 810 KIAA00 KSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMN : :.:::: : ... : :.: ::::::: :. : ::: :..:: .:.. : ::. .. KIAA19 KPYTCEECGKAFRQSAILYVHRRIHTGEKPYTCGECGKTFRQSANLYAHKKIHTGEKPYT 520 530 540 550 560 570 820 830 840 KIAA00 EMDI-RNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ : ..:. ...:. : . : :. KIAA19 CGDCGKTFRQSANLY-AHKKIHTGDKTIQV 580 590 848 residues in 1 query sequences 1986657 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:06:32 2008 done: Thu Dec 18 15:06:33 2008 Total Scan time: 0.590 Total Display time: 0.330 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]