# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00941.fasta.huge -Q ../query/KIAA0045.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
KIAA0045, 2005 aa
vs ./tmplib.23147 library
1985500 residues in 2037 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6068+/-0.0091; mu= -3.9975+/- 0.614
mean_var=334.0819+/-84.015, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 78 in 1/39
Lambda= 0.070169
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2037)
KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168) 573 73.8 5.3e-13
KIAA1320 ( 567 res) fh13757 ( 567) 372 52.8 2.9e-07
KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 358 51.6 1e-06
KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 355 51.4 1.4e-06
KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 352 51.1 1.6e-06
KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 348 50.7 2.4e-06
KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 348 51.2 4.9e-06
KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581) 318 47.9 2.5e-05
KIAA0317 ( 826 res) hg00276 ( 826) 291 44.8 0.00011
KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 290 45.0 0.00018
>>KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168 aa)
initn: 1055 init1: 394 opt: 573 Z-score: 325.3 bits: 73.8 E(): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 1012; 30.504% identity (57.958% similar) in 754 aa overlap (1379-2005:1430-2168)
1350 1360 1370 1380 1390 1400
KIAA00 NSGNVRHRLQFYIGEHLLPYNMTVYQAVRQFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHT
..:. .. ..: .. : :. : :. :.
KIAA11 TIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKEN--GKMGCWSIEHV
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1410 1420 1430 1440 1450
KIAA00 IWYKPVREDEESNKDCVGGKRGRAQTA--------PTKTSPRNAKKHDEL---WHD----
: . :: ..: . . :..: :. : :. .. ..: ..:
KIAA11 EQY--LGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEH
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1460 1470 1480 1490 1500
KIAA00 GVCPSVSNPLEVYLIPTPPENITFEDPSL------------DVILLLRVLHAISRYWYYL
:. .... : . :.: :.:. ::. :::.:. .. :
KIAA11 GTKSGLNQGAISTLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSR
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1510 1520 1530 1540 1550
KIAA00 YDNAMCKE----IIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPF
.. : .: .:: ..:.:.: .:...::.. .: .: : .: . :::..::
KIAA11 ISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPF
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1560 1570 1580 1590 1600
KIAA00 DTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLD----------TNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN
.:::. : ::: .::. : . :. . ..: . ::. :: ... :
KIAA11 ETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVG-RLKHERVKVP
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1610 1620 1630 1640 1650 1660
KIAA00 R-EELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLW---
: : :.. ::.::: .. ...::... .: ::::::::::::::. :.::.::: :
KIAA11 RGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCD
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1670 1680 1690 1700 1710
KIAA00 ------RGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLM
....: :.. : . :.: :::. :: . . .. .. :.::: ..
KIAA11 DNFPDDESRHVDLGG--GLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSD--ELERITKLFHFLGIFL
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1720 1730 1740
KIAA00 AKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWML--------------------------RQETS------
:: :.: ::::::.. ::.: : ..:.:
KIAA11 AKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHD
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1750 1760 1770
KIAA00 -------------------------------LTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKR
:: .:. ..: :: . ...:.. ....
KIAA11 SLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQ
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1780 1790 1800 1810 1820
KIAA00 LEQDKSQTKESLQYALETLTM---NGC----SVEDLGLDFTL-P-----GFPNIELKKGG
. ..:. ... . :. :.. .: :.:::::.: . : :: ..:: .:
KIAA11 ILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSG
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1830 1840 1850 1860 1870 1880
KIAA00 KDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG
.: .:. : :::. :.. . .. :...:...:::::..:::. .:. : ::....:::
KIAA11 EDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCG
2000 2010 2020 2030 2040 2050
1890 1900 1910 1920 1930 1940
KIAA00 SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGG
... .: :. ... .: :::.:: . . ..: ........ ::::.:: :: ::
KIAA11 NQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGG
2060 2070 2080 2090 2100 2110
1950 1960 1970 1980 1990 2000
KIAA00 FRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQS
. .:.: ::.:::. . : ::: :::.:::::.::: :::::.:: :. : ..
KIAA11 LANLHPRLTVVRKV----DATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLAATME--KG
2120 2130 2140 2150 2160
KIAA00 FHLS
:::.
KIAA11 FHLN
>>KIAA1320 ( 567 res) fh13757 (567 aa)
initn: 402 init1: 231 opt: 372 Z-score: 222.4 bits: 52.8 E(): 2.9e-07
Smith-Waterman score: 424; 25.373% identity (57.463% similar) in 402 aa overlap (1606-2005:215-567)
1580 1590 1600 1610 1620 1630
KIAA00 QRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAM--LEIQY
:.:. ..... :.. . .. . ...
KIAA13 RCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRF
190 200 210 220 230 240
1640 1650 1660 1670 1680 1690
KIAA00 ENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALP
..: : : : . :.. ..:.:. : .:. : .:: . : ..
KIAA13 HGEEGMGQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQ----------SADGTTFQPNSNSY----
250 260 270 280 290
1700 1710 1720 1730 1740 1750
KIAA00 FGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFD
..: :. ::: :.... :. .::.. . ::: .: .. .:. .
KIAA13 ----VNPDHLNY----FRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILG--IPVNYQDVAS
300 310 320 330 340
1760 1770 1780 1790 1800 1810
KIAA00 IDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFP
::: :... . :..: :. : ...:: :. . ..
KIAA13 IDPEYAKNLQWI---------LDNDISDLGLELTFSVET---------DV-----FGAME
350 360 370
1820 1830 1840 1850 1860 1870
KIAA00 NIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPE
.. :: :: .: :: .: ::..:: ...... :...: .::. .: : .: :
KIAA13 EVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEY
380 390 400 410 420 430
1880 1890 1900 1910 1920 1930
KIAA00 ELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTG
::. :: : :.. .. . :: ... ......:.. .. .:.. :.::::::
KIAA13 ELELLLSG--MPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEERVLLLQFVTG
440 450 460 470 480 490
1940 1950 1960 1970 1980 1990
KIAA00 SPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLI
: :.: ::: .. . :. .. ..::. ::.:.::::.: : ::....::.
KIAA13 SSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLV
500 510 520 530 540 550
2000
KIAA00 AAREGQQSFHLS
: . :. .. ..
KIAA13 ALHCGSYGYTMA
560
>>KIAA1625 ( 859 res) hh15184 (859 aa)
initn: 367 init1: 188 opt: 358 Z-score: 212.5 bits: 51.6 E(): 1e-06
Smith-Waterman score: 435; 25.408% identity (52.995% similar) in 551 aa overlap (1468-1997:369-852)
1440 1450 1460 1470 1480 1490
KIAA00 KTSPRNAKKHDELWHDGVCPSVSNPLEVYLIPTPPENITFEDPSLDVILLLRVLHAISRY
::.: .: :. :. .: . :
KIAA16 PEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPSPSGTI----PGGDAAFLYEFLLQGHTS
340 350 360 370 380 390
1500 1510 1520 1530 1540
KIAA00 WYYLYDNAMCKEI--IPTSEFINSKLTAKA------NR--QLQDPLVIMTGNIPTWLTEL
... : :. .: . . : .... :: :. :: . : : :
KIAA16 EPRDLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRLHHIMNHQCQLKEP
400 410 420 430 440 450
1550 1560 1570 1580 1590 1600
KIAA00 GKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN
.. :. . .. . . ..:: .:.: :.. .. : .. :.. :.
KIAA16 SQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERD-LVQKLKVLRHELSLQQPQAGHC--RIE-----VS
460 470 480 490 500
1610 1620 1630 1640 1650 1660
KIAA00 REELLKQA-ESVMQ----DLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGL
:::..... ...:. :: ..: :.... :. . : : . :. :. .:. ::
KIAA16 REEIFEESYRQIMKMRPKDL-KKRLMVKFRGEEGLDYG-GVAREWLYLLCHEMLNPYYGL
510 520 530 540 550 560
1670 1680 1690 1700 1710 1720
KIAA00 WRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIM
. : .: : :: . . .: :.. :.:.:..:. :..
KIAA16 F-------------QYSTDNIYMLQ----INPDSSINPDHLSY----FHFVGRIMGLAVF
570 580 590 600
1730 1740 1750 1760 1770 1780
KIAA00 DFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQT
. .. . .:::: .: . .:. :: ..:: . .:. . ::.: . .
KIAA16 HGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLS--DLESVDPELHKSLVWI---------LENDITPV
610 620 630 640 650
1790 1800 1810 1820 1830 1840
KIAA00 KESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWA
: . : :: .. : ::: .:...::: .: .::.:: . :
KIAA16 ----------LDHTFC-VEHNAFGRILQH----ELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWR
660 670 680 690
1850 1860 1870 1880 1890
KIAA00 LNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG-SKADT--WDAKTLMECCRPD
. .:. :: ... ::. ..: :. : .::. .. : .: : : ..: .. :
KIAA16 FMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHC---
700 710 720 730 740 750
1900 1910 1920 1930 1940 1950
KIAA00 HGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFEST
. :: :..... . .::.:.. .::::::: :.:. ::..:. . . .
KIAA16 ---VADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTI
760 770 780 790 800 810
1960 1970 1980 1990 2000
KIAA00 ENPD---DFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS
. : : ::.. :: : . .: : : : . :::: :..:
KIAA16 HLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE
820 830 840 850
>>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa)
initn: 493 init1: 169 opt: 355 Z-score: 210.1 bits: 51.4 E(): 1.4e-06
Smith-Waterman score: 403; 24.138% identity (52.038% similar) in 638 aa overlap (1408-2002:431-991)
1380 1390 1400 1410 1420
KIAA00 QFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHTIWYKPVREDEE---------SNKDCVGG-
: : .:. . : ::. .
KIAA04 VHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQ
410 420 430 440 450 460
1430 1440 1450 1460 1470
KIAA00 -KRGRAQTAPTKT--SPRNAKKHDELWHDGVCPSVSNPLEV----YLIPTPPENIT--FE
.: :. ..:: : .: .. : : . .: ..::: : : : ...: :
KIAA04 IRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAK-DSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFL
470 480 490 500 510
1480 1490 1500 1510 1520 1530
KIAA00 DPSLDVILLLRVLHAISRYWYYLYDNAMCKEIIPTSEF-INSKLTAKANRQLQDPLVIMT
:. . .:. .: .. ... : .: .. . .. : . ::
KIAA04 PPGWE----MRIAPN-GRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLP---
520 530 540 550 560 570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
KIAA00 GNIPTWLTEL---GKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQS---DSQ
: : .. :.: :.. ... .: .. : .: :.: . : ..
KIAA04 ---PGWEERIHLDGRT--FYIDHNSK-----ITQWEDPR-LQNPAITGPAVPYSREFKQK
580 590 600 610 620
1600 1610 1620 1630 1640
KIAA00 DSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQD-----LGSSR-----AMLEIQYENEVGTGL
. .: . :: :. . ...... .. .: : : :..:.: :
KIAA04 YDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDY
630 640 650 660 670 680
1650 1660 1670 1680 1690 1700
KIAA00 GPTL-EFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKP
: . :.. :.:.:. ::. : . .... : :. .:: .
KIAA04 GGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLF---EYS-----ATDNYTLQINPNSGL--------CNE
690 700 710 720
1710 1720 1730 1740 1750 1760
KIAA00 AHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVAR
:.. : :.:.. . :.. .:.: . :::: :: .. .: .:. ..:
KIAA04 DHLS----YFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITL--NDMESVDSEYYN
730 740 750 760 770
1770 1780 1790 1800 1810 1820
KIAA00 SVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKG
:. : ::.: .. .:.. .. :..: . ...:: .
KIAA04 SL---------KWILENDPTEL--DLMFCIDE--------ENFGQTY------QVDLKPN
780 790 800 810
1830 1840 1850 1860 1870 1880
KIAA00 GKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLC
:..: :: .: .::. ::: : . . :..:...: .:: ..:.. .. : .::. :.:
KIAA04 GSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMC
820 830 840 850 860 870
1890 1900 1910 1920 1930
KIAA00 G---SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRL
: .. : ..... .:: . ....... . .: :.. .::::::. :.
KIAA04 GLGDVDVNDWRQHSIYK-----NGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRV
880 890 900 910 920
1940 1950 1960 1970 1980 1990
KIAA00 PVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIA
:..:: : : : . :.:. .:. :: . :: : : :: : ..: .:::::.:
KIAA04 PMNGFAELYGSNGPQLF---TIEQWGSPEK-LPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMA
930 940 950 960 970 980
2000
KIAA00 AREGQQSFHLS
. :. :.:
KIAA04 V-ENAQGFEGVD
990
>>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa)
initn: 443 init1: 174 opt: 352 Z-score: 208.9 bits: 51.1 E(): 1.6e-06
Smith-Waterman score: 406; 27.446% identity (55.847% similar) in 419 aa overlap (1598-2002:559-923)
1570 1580 1590 1600 1610 1620
KIAA00 AFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQD-----L
.: ... :. :. . .:..: .
KIAA00 EDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIM
530 540 550 560 570 580
1630 1640 1650 1660 1670
KIAA00 GSSRA-----MLEIQYENEVGTGLGPTL-EFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGS
: .:: : :....: : : . :.. :.:.:. ::. : . ..
KIAA00 GVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLF---EYSATD----
590 600 610 620 630 640
1680 1690 1700 1710 1720 1730
KIAA00 QEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFY
. : :. .:: . :.. :.:.:.. . :.. .:.: . :::
KIAA00 -NYTLQINPNSGL--------CNEDHLSY----FKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFY
650 660 670 680
1740 1750 1760 1770 1780 1790
KIAA00 KWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMN
: ::.. .: ::. ..: :. . ::.: :. .:.. ..
KIAA00 KMMLHKPITL--HDMESVDSEYYNSLRWI---------LEND--PTELDLRFIIDE----
690 700 710 720 730
1800 1810 1820 1830 1840 1850
KIAA00 GCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRD
: .: :::.::..: :: .: .::. ::: : . . ...:. .:..
KIAA00 ----ELFGQTHQH------ELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKE
740 750 760 770 780
1860 1870 1880 1890 1900 1910
KIAA00 GFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEIL
:: ..: . .. : .::. :.:: .:. :.. : . .::. . ........ .
KIAA00 GFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGL-GDV-DVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAV
790 800 810 820 830
1920 1930 1940 1950 1960 1970
KIAA00 SSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCV
.:.:.. .::::::. :.:..:: : : : .. : :. .:. :: . ::
KIAA00 LMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSF---TVEQWGTPEK-LPRAHTCF
840 850 860 870 880 890
1980 1990 2000
KIAA00 NYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS
: : :: : :.: . .:: .: :. :.:
KIAA00 NRLDLPPYESFEELWDKLQMAI-ENTQGFDGVD
900 910 920
>>KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086 aa)
initn: 344 init1: 148 opt: 348 Z-score: 205.8 bits: 50.7 E(): 2.4e-06
Smith-Waterman score: 396; 27.331% identity (52.754% similar) in 472 aa overlap (1544-2005:689-1086)
1520 1530 1540 1550 1560 1570
KIAA00 SEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDR
:::: :: ::. : .:
KIAA00 MGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTEL----PFVVPFEERVKIF---------
660 670 680 690 700
1580 1590 1600 1610 1620 1630
KIAA00 AMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQY
:::. .. . :.:. : :: . :. :. . ..: . ...
KIAA00 --QRLIYADKQEVQGDG------PFLDGINVTIRRNYIYEDAYD------------KLSP
710 720 730 740
1640 1650 1660 1670 1680
KIAA00 ENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADL---GLWRG--EEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQG
::: : .. . : .. :..: . :..: .:. :. . .: : :
KIAA00 ENE--PDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQ-GFFKTTNEGL
750 760 770 780 790 800
1690 1700 1710 1720 1730 1740
KIAA00 LFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTS
:. : .. .:. .. ::.....::... ::.::.. : . .: ...
KIAA00 LYPNPAAQMLVGDSFAR---HYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDI
810 820 830 840 850
1750 1760 1770 1780 1790 1800
KIAA00 HDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFT
: : ..:: : ... : : :.: ::.:::.::
KIAA00 HHLASLDPEVYKNLLFL-------KSYEDD---------------------VEELGLNFT
860 870 880 890
1810 1820 1830 1840 1850 1860
KIAA00 -----LPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFP
: .::: :::::::: : :..:: . ::. . .. .::.:. .:
KIAA00 VVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVS
900 910 920 930 940 950
1870 1880 1890 1900 1910 1920
KIAA00 LSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQ
: :..: .:.. :. :... . . : . ::. : ..: ..... .: .:.
KIAA00 LEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPI-SLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEE
960 970 980 990 1000 1010
1930 1940 1950 1960 1970 1980
KIAA00 QRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSS
.: .:.:::. : :. ::. : : . : .. . . ::.. ::.: ::::.. .
KIAA00 KRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCI-----HNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYD
1020 1030 1040 1050 1060
1990 2000
KIAA00 IEIMREKLLIAAREGQQSFHLS
..: ::: : : .:.::
KIAA00 ETLLRSKLLYAI-ECAAGFELS
1070 1080
>>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa)
initn: 413 init1: 203 opt: 348 Z-score: 200.2 bits: 51.2 E(): 4.9e-06
Smith-Waterman score: 419; 27.293% identity (52.838% similar) in 458 aa overlap (1556-2005:2799-3192)
1530 1540 1550 1560 1570 1580
KIAA00 NRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEI
:: . .. :. ..: : . . . ..
KIAA03 DTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAV--LVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERL
2770 2780 2790 2800 2810 2820
1590 1600 1610 1620 1630 1640
KIAA00 NQS-DSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPT
... ..: : : :. . :: : ... :.. : : .:.: : :
KIAA03 DEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRE-LHRKSPEEMKN------RLYIVFEGEEGQDAGGL
2830 2840 2850 2860 2870
1650 1660 1670 1680 1690
KIAA00 L-EFYALVSQELQRADLGLWR---GEEVTLS-NPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAK
: :.: ..:.:. .:.: :..:: . ::.. .
KIAA03 LREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSH---------------------CN
2880 2890 2900 2910
1700 1710 1720 1730 1740 1750
KIAA00 PAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVA
: :.. :.:.:...:::..: ::.. . ::: .: . . :. . :
KIAA03 PNHLSY----FKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESED------
2920 2930 2940 2950 2960
1760 1770 1780 1790 1800 1810
KIAA00 RSVYHL-EDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELK
::. . .: ::.: : .: .. :. .. : :.:: ::
KIAA03 ---YHFYQGLVYL---LENDVSTLGYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLK--------PN----
2970 2980 2990 3000 3010
1820 1830 1840 1850 1860 1870
KIAA00 KGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQL
: .: :: .: .::..:: .. .. .:. .: .:: ..: .. : .::. :
KIAA03 --GANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELL
3020 3030 3040 3050 3060
1880 1890 1900 1910 1920 1930
KIAA00 LCG-SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRL
. : : : :. : : : .: ...... : :::. .. :::::::. ..
KIAA03 ISGLPTIDIDDLKSNTEY----HKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKV
3070 3080 3090 3100 3110 3120
1940 1950 1960 1970 1980 1990
KIAA00 PVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAARE
:. :: .:. : . .. . : :::. :: : : :: : :.: .:. ::.: .:
KIAA03 PLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQE
3130 3140 3150 3160 3170 3180
2000
KIAA00 GQQSFHLS
...: :.
KIAA03 CSEGFGLA
3190
>>KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581 aa)
initn: 500 init1: 145 opt: 318 Z-score: 187.5 bits: 47.9 E(): 2.5e-05
Smith-Waterman score: 368; 29.854% identity (51.699% similar) in 412 aa overlap (1603-1997:1226-1574)
1580 1590 1600 1610 1620 1630
KIAA00 RAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQ
: . :..::..: . : .: :: :. .
KIAA13 APYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFN--QIMGYSRKDLQRN
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1640 1650 1660 1670 1680
KIAA00 --YENEVGT-GL---GPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNL
: . :: :: ::. ::. :::.:: ::. . : . : .:
KIAA13 KLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLF----------EYSANDTYTVQ--
1260 1270 1280 1290 1300
1690 1700 1710 1720 1730 1740
KIAA00 QGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSL
:.. : . . . ::: :.... :.. :.: . :::: .:: .:
KIAA13 ----ISPMS-----AFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDL
1310 1320 1330 1340 1350
1750 1760 1770 1780 1790 1800
KIAA00 TSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVED-LGL
.. . .: . .: .:::. :. ...: : :
KIAA13 SDLEYLDEE-------FH-------------------QSLQW------MKDNDIHDILDL
1360 1370 1380
1810 1820 1830 1840 1850 1860
KIAA00 DFTLPG--FPNI---ELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFES
::. : .: ::: :: .:::: .: .::.. .. : ...:: .: .:. ::
KIAA13 TFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1870 1880 1890 1900 1910
KIAA00 VFPLSHLQYFYPEELDQLLCGS-KADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAV-KFLFEILSS
: .. : .::. .. :. . : : .. : .: ::.. : .... .
KIAA13 VVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTE----YRGGYHDNHIVIRWFWAAVER
1450 1460 1470 1480 1490
1920 1930 1940 1950 1960 1970
KIAA00 FDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNY
:.:::. .::::::. .: :: :: : : :. . :: . :: :
KIAA13 FNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGP----RRFCVEKWGKITALPRAHTCFNR
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1980 1990 2000
KIAA00 LKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS
: :: : :. .. :::: :..:
KIAA13 LDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
1560 1570 1580
>>KIAA0317 ( 826 res) hg00276 (826 aa)
initn: 356 init1: 125 opt: 291 Z-score: 176.1 bits: 44.8 E(): 0.00011
Smith-Waterman score: 312; 26.238% identity (51.733% similar) in 404 aa overlap (1608-2004:454-825)
1580 1590 1600 1610 1620 1630
KIAA00 LLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEV
:. .:. .: . : .:.:: . .
KIAA03 LAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATR
430 440 450 460 470 480
1640 1650 1660 1670 1680 1690
KIAA00 GTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPK----GSQEGTKYIQNLQGLFALP
. ... . . .: :. . : : : : : .: :.. .: : ::
KIAA03 NFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQ---ALV
490 500 510 520 530 540
1700 1710 1720 1730 1740 1750
KIAA00 FGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFD
.:::. ..:: ..: :.:..: : . :: :: ..: . .: : .
KIAA03 HPNPNRPAHL-RLKM-YEFAGRLVGKC-----LYESSLG-GAYKQLVRAR--FTRSFLAQ
550 560 570 580 590
1760 1770 1780 1790 1800 1810
KIAA00 IDPVVARSVYHLED---IVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLP
: . . : : . ..: . ...... : .: : . .: :: .
KIAA03 IIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSG------QLDKV--
600 610 620 630 640
1820 1830 1840 1850 1860 1870
KIAA00 GFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYF
.:: :: . ::: : :: :. . : :... . : :.. . : . : :
KIAA03 ----VELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIF
650 660 670 680 690
1880 1890 1900 1910 1920 1930
KIAA00 YPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQF
.::. :.::. .: . . .. ....... ..::. .:. .:::
KIAA03 DENELELLMCGT-GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQF
700 710 720 730 740 750
1940 1950 1960 1970 1980 1990
KIAA00 VTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREK
.::: .:: ::: .: : . :. .:: ::.. :: : : :: :.: : ...
KIAA03 TTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTHST------LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRM
760 770 780 790 800 810
2000
KIAA00 LLIAAREGQQSFHLS
: .: :: ..: .
KIAA03 LQLAISEGCEGFGML
820
>>KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614 aa)
initn: 490 init1: 123 opt: 290 Z-score: 172.0 bits: 45.0 E(): 0.00018
Smith-Waterman score: 336; 27.340% identity (51.478% similar) in 406 aa overlap (1603-1997:1259-1607)
1580 1590 1600 1610 1620 1630
KIAA00 RAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQ
: . :..::. . : .. :: :. .
KIAA03 SPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEG--TFNQVMAYSRKELQRN
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1640 1650 1660 1670 1680
KIAA00 --YENEVGT-GL---GPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNL
: . :: :: ::. ::. :.:::: ::. . : . : .:
KIAA03 KLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLF----------EYSANDTYTVQ--
1290 1300 1310 1320 1330
1690 1700 1710 1720 1730 1740
KIAA00 QGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSL
:.. : . . ::: :.... :.. :.: . :::: .:: .:
KIAA03 ----ISPMS-----AFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDL
1340 1350 1360 1370 1380
1750 1760 1770 1780 1790 1800
KIAA00 TSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLD
.. . .: . .: .:::. .. : .. :: .
KIAA03 SDLEYLDEE-------FH-------------------QSLQWMKDN---NITDILDLTFT
1390 1400 1410
1810 1820 1830 1840 1850 1860
KIAA00 FTLPGFPNI---ELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFP
. : .. :::.:: . :: .: .::.. .. : ...:: .: ... :: :
KIAA03 VNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVD
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1870 1880 1890 1900 1910 1920
KIAA00 LSHLQYFYPEELDQLLCGS-KADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSR-AVKFLFEILSSFDN
.. : .::. .. :. . : : .. : .: ::.. ...... . :.:
KIAA03 SRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTE----YRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNN
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1930 1940 1950 1960 1970 1980
KIAA00 EQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDY
::. .::::::. .: :: .: . : .:. . . :: . :: : : :: :
KIAA03 EQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITS-LPRAHTCFNRLDLPPY
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1990 2000
KIAA00 SSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS
: .. :::: :..:
KIAA03 PSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
1600 1610
2005 residues in 1 query sequences
1985500 residues in 2037 library sequences
Scomplib [34.26]
start: Thu Dec 18 15:05:48 2008 done: Thu Dec 18 15:05:49 2008
Total Scan time: 1.000 Total Display time: 0.720
Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]