# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00930.fasta.nr -Q ../query/KIAA0042.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0042, 1652 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7816740 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7216+/-0.000192; mu= 12.6612+/- 0.011 mean_var=98.0972+/-18.883, 0's: 29 Z-trim: 92 B-trim: 373 in 1/65 Lambda= 0.129493 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|23396633|sp|Q15058.1|KIF14_HUMAN RecName: Full= (1648) 10602 1992.6 0 gi|109730619|gb|AAI13743.1| Kinesin family member (1648) 10591 1990.5 0 gi|119611723|gb|EAW91317.1| kinesin family member (1649) 10590 1990.3 0 gi|109018931|ref|XP_001109736.1| PREDICTED: kinesi (1649) 9879 1857.5 0 gi|73960457|ref|XP_547369.2| PREDICTED: similar to (1697) 8079 1521.2 0 gi|194227393|ref|XP_001916122.1| PREDICTED: simila (1780) 7297 1375.2 0 gi|126306580|ref|XP_001377526.1| PREDICTED: simila (1643) 7065 1331.8 0 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LOC100145032 protein [ ( 527) 1743 337.1 2.2e-89 gi|148707599|gb|EDL39546.1| mCG142634 [Mus musculu (1610) 1677 325.2 2.6e-85 gi|149058501|gb|EDM09658.1| kinesin family member ( 639) 1652 320.2 3.4e-84 gi|109092971|ref|XP_001086122.1| PREDICTED: simila (1276) 1629 316.2 1.1e-82 gi|109092969|ref|XP_001085900.1| PREDICTED: simila (1287) 1629 316.2 1.1e-82 gi|109092967|ref|XP_001086226.1| PREDICTED: simila (1317) 1629 316.2 1.1e-82 gi|109092973|ref|XP_001086005.1| PREDICTED: simila (1392) 1629 316.2 1.2e-82 gi|122889598|emb|CAM13299.1| kinesin family member (1312) 1626 315.6 1.7e-82 gi|208022624|ref|NP_001101253.2| kinesin family me (1311) 1621 314.7 3.2e-82 gi|27549391|gb|AAO17292.1| kinesin motor protein [ (1317) 1621 314.7 3.2e-82 gi|114681078|ref|XP_514522.2| PREDICTED: kinesin-l (1317) 1621 314.7 3.2e-82 gi|50403793|sp|Q96L93.2|KI16B_HUMAN RecName: Full= (1317) 1621 314.7 3.2e-82 gi|123232418|emb|CAI22745.2| chromosome 20 open re (1392) 1621 314.7 3.3e-82 gi|152012531|gb|AAI50262.1| KIF16B protein [Homo s (1392) 1621 314.7 3.3e-82 gi|57997496|emb|CAI46105.1| hypothetical protein [ (1317) 1620 314.5 3.6e-82 gi|149733059|ref|XP_001491896.1| PREDICTED: kinesi (1314) 1613 313.2 9e-82 gi|118087588|ref|XP_419330.2| PREDICTED: similar t (1474) 1611 312.8 1.3e-81 gi|189233780|ref|XP_001814557.1| PREDICTED: simila (1837) 1595 309.9 1.2e-80 gi|119905114|ref|XP_610788.3| PREDICTED: similar t (1388) 1585 308.0 3.5e-80 gi|194044282|ref|XP_001925905.1| PREDICTED: kinesi (1361) 1577 306.5 9.8e-80 gi|156217679|gb|EDO38591.1| predicted protein [Nem (1299) 1572 305.5 1.8e-79 gi|149640967|ref|XP_001515352.1| PREDICTED: simila (1325) 1572 305.5 1.8e-79 gi|119630692|gb|EAX10287.1| chromosome 20 open rea (1317) 1567 304.6 3.5e-79 gi|157019966|gb|EAA04239.4| AGAP007592-PA [Anophel (1944) 1569 305.1 3.6e-79 gi|119630694|gb|EAX10289.1| chromosome 20 open rea (1392) 1567 304.6 3.6e-79 gi|73991495|ref|XP_542882.2| PREDICTED: similar to (1438) 1566 304.4 4.2e-79 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..::: .. .. ..: .....: . ::::::.:::::::::::::::::: gi|109 FLVEMRFHHVGQTSLELLTSGNLLPSASQSAEITGEEFMDAICDGVGLGMKILLDSGLEK 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA00 AKELQHELFRQCTKNEVTKEMKTNAMGLIRSLENIFAESKIKSFRRQVQEENFEYQDFKR ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. gi|109 AKELQHELLRQCTKNEVTKEMKTNAMGLIRSLENIFAESKIKSFRRQVQEENFEYQDFKK 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA00 MVNRAPEFLKLKHCLEKAIEIIISALKGCHSDINLLQTCVESIRNLASDFYSDFSVPSTS :.:.:::::::::::::.::::::::::: ::.::::.::::::::::::::::.::::: gi|109 MANHAPEFLKLKHCLEKTIEIIISALKGCSSDVNLLQNCVESIRNLASDFYSDFGVPSTS 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA00 VGSYESRVTHIVHQELESLAKSLLFCFESEESPDLLKPWETYNQNTKEEHQQSKSSGIDG : :::::::..::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: gi|109 VDSYESRVTNVVHKELESLAKSLLFCFESEESPDLLKPWETYNQNTKEEHQQSKSSRIDG 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA00 SKNKGVPKRVYELHGSSPAVSSEECTPSRIQWV 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