# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00469s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0041.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0041, 781 aa vs ./tmplib.23147 library 1986724 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4138+/-0.00604; mu= 14.2822+/- 0.411 mean_var=150.8478+/-37.132, 0's: 0 Z-trim: 34 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104425 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 2383 371.5 1.9e-103 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 1872 294.5 2.8e-80 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 505 88.7 3.2e-18 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 432 77.7 6.3e-15 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 414 74.7 3.2e-14 KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 410 74.3 5.9e-14 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 407 73.8 8e-14 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 367 67.7 4.9e-12 KIAA1428 ( 709 res) fh02979s1 ( 709) 351 65.3 2.5e-11 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 279 54.8 6.5e-08 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 276 54.5 1e-07 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 265 52.3 2e-07 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 200 42.6 0.00019 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 199 42.7 0.00025 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 198 42.5 0.00027 KIAA0172 ( 1366 res) ha02512s1 (1366) 190 41.4 0.00073 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 185 40.5 0.001 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 180 40.0 0.0021 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 178 39.5 0.0022 KIAA1200 ( 1403 res) fg02656 (1403) 179 39.8 0.0023 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 177 39.7 0.0034 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 173 39.0 0.0048 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 171 39.0 0.0074 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 168 38.3 0.0081 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 161 36.6 0.0095 >>KIAA1716 ( 804 res) hj06603 (804 aa) initn: 2945 init1: 986 opt: 2383 Z-score: 1949.1 bits: 371.5 E(): 1.9e-103 Smith-Waterman score: 2982; 60.966% identity (81.593% similar) in 766 aa overlap (18-749:14-778) 10 20 30 40 50 KIAA00 GGRMKMTVDFEECLKDSPR--FRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVA :: :::...::: ::.:.: ::::::::: .:...:::. . 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KIAA17 WVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA00 GNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCE ::..: ::: ::::::::::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::: KIAA17 GNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA00 LGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ- :::...:..:::. : : .:: .. ::.:::.:. ::::.::. : .. : :.. KIAA17 LGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRW 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 KIAA00 --QKKFVSKSSEEKRLSISK--FGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSS---DDGRESLPS :: . .:: . . : . : : : ::: . : ....: : .:: : KIAA17 RVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVA-ALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFS 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 KIAA00 TVSAN--------------SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMA .:. : : .:. . . : : ..:.::: .::. ..:: .: KIAA17 YFDAGAAGAGPRKGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAARARDLPALA 600 610 620 630 640 650 630 640 650 660 670 680 KIAA00 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV ::::::.::::..:.. :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::. 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KIAA00 LETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHK 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA00 INFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQH .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .: : ::..::.: : . . KIAA00 LDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQ 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA00 EVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLF :.::: : ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .: .. :. . :.::.. . KIAA00 EAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEEL 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA00 SELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVME :.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.: ..::...... . .. .:.::: KIAA00 SRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVME 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA00 GYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCF :.::::::::::::.::::.::.::::::::.:: ::::.:::::::: : : :::::: KIAA00 GHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCF 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 KIAA00 EVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGS :::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. . . :.: . ..: :... KIAA00 EVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAAT 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 KIAA00 LDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRS : ::. .. . : . .. .:: . :::.:::: :.:::::::.::::.::::::: KIAA00 LGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRS 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 KIAA00 LGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAY ::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::. KIAA00 LGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAW 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 KIAA00 IRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSND :.:::::.::. : :: . . ... : : . . :.: KIAA00 IHAKYVEKKFLTKL------PEIRGRRGGRGR-----------PRGQPPVPPKPSIR--- 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 KIAA00 SGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPK : : : :: .: : :.:: :.::: . .:: KIAA00 --------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPT 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 KIAA00 MAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHA ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: : :::::::: KIAA00 MADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHA 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 KIAA00 TVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGL :.::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. KIAA00 TILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAA 710 720 730 740 750 750 760 770 780 KIAA00 YGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF :: ::::: ::::::: :::..::::.: ..: KIAA00 QGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL 760 770 780 790 >>KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022 aa) initn: 451 init1: 314 opt: 505 Z-score: 419.0 bits: 88.7 E(): 3.2e-18 Smith-Waterman score: 669; 28.435% identity (59.351% similar) in 524 aa overlap (22-518:54-554) 10 20 30 40 50 KIAA00 GGRMKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELEL-KLDKLVKLCIAMID ::.::. :: .. : :. : :: :. . KIAA04 SEFVAETHEDYKAPTASSFTTRTAQCRNTVAAIEEAL-DVDRMVLYKMKKSVK---AINS 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 KIAA00 TGKAFCVANKQFMNGIRDLAQ--YSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSI .: : ..:. .... .. .: . ... ::: .:. . :... . : KIAA04 SGLAHVENEEQYTQALEKFGGNCVCRDDPDLGSAFLKFSVFTKELTALFKNLIQNMNNII 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 KIAA00 KAQLQNFVKEDLRKFK-DAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRN--KQH-----EVE--EA . :....: ::. : : :: :.:. .. :. ..: . ... : : :. : KIAA04 SFPLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKITKIEKEKKEHAKLHGMIRTEISGAEI 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA00 TNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGP .. . :. :. .:.:..: .. :. ..:........:. ::..: : : KIAA04 AEEMEKERRFFQLQMCEYLLKVNEIKIKKGVDLLQNLIKYFHAQCNFFQDGLKAVESLKP 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 KIAA00 YMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHST------IQQKDFSSDDSKLEYNV-----DAA .. :...: . .:.:.. : .. ..::. :. .. :.. . KIAA04 SIETLSTDLHTIKQAQDEERRQLIQLRDILKSALQVEQKEDSQIRQSTAYSLHQPQGNKE 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA00 NGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDI .: .: :.:.... :.:..: :..:. :. .. . : . . .: : :: . KIAA04 HGTERNGSLYKKSDGIRKVWQKRKCSVKNGFLTISHGTANRPPAKL-NLLTCQVK--TNP 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA00 ERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE--KGDESEKLDKKSSPST :.. ::...: .. .::..:. : :....:.: : . :::.. : KIAA04 EEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDN----------T 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 KIAA00 GSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHR : :. ..: : ...:: . :: ::::: :: : : :::: ::::::::: KIAA04 GE----NNIVQELTK--EIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHR 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 KIAA00 SLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQE-KEA ::::.:...:::::. : : ..:: .:...: . ::.::. .. .. KIAA04 ELGVHYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKD 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 KIAA00 YIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSN :: :::.::... : KIAA04 YITAKYIERRYARKKHADNAAKLHSLCEAVKTRDIFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHEP 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 446 init1: 348 opt: 432 Z-score: 359.9 bits: 77.7 E(): 6.3e-15 Smith-Waterman score: 564; 30.053% identity (60.904% similar) in 376 aa overlap (157-518:19-375) 130 140 150 160 170 180 KIAA00 KKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSK : .. . :. :. .:....: ...: KIAA12 KREHAKQHGMIRTEITGAEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVNEIKTK 10 20 30 40 190 200 210 220 230 240 KIAA00 RRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREM----E . ..:........:. ::..: ..: :.. :.:.: . .::... . KIAA12 KGVDLLQNLIKYYHAQCNFFQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQLTALRD 50 60 70 80 90 100 250 260 270 280 290 KIAA00 QKHSTIQ--QKDFSSDDSKLE--YNV-----DAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFS .:..: ::. :... . :.. . : .:::.:.... :.:.:: : KIAA12 LIKSSLQLDQKESRRDSQSRQGGYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGIRKVWQRRKCS 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 KIAA00 IQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQ ..:. :. .. .. . . .: : :: . : . :...: ... .::..:. KIAA12 VKNGILTISHATSNRQPAKL-NLLTCQVK--PNAEDKKSFDLISHNRTYHFQAEDEQDYV 170 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 KIAA00 AWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPG ::: :. : .: : : . : ..:..: : : : . .. :: .:: KIAA12 AWI-----SVLTNSKE-----EAL---TMAFRGEQSAGENSLEDLTK--AIIEDVQRLPG 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 KIAA00 NASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCEL : ::::: ..: : : :::: ::::::::: .:::.:...:: :: : : .. KIAA12 NDICCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNV 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 KIAA00 GNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQE-KEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKF ::. .: ..:::. . . :: :.. . .. :: ::::...: : KIAA12 GNNSFNDIMEANLPSPS-PKPTPSSDMTVRKEYITAKYVDHRFSRKTCSTSSAKLNELLE 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA00 VSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPE KIAA12 AIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPLLEPGQELGETALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGN 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1975 ( 597 res) aj01061 (597 aa) initn: 445 init1: 342 opt: 414 Z-score: 347.3 bits: 74.7 E(): 3.2e-14 Smith-Waterman score: 460; 31.613% identity (59.677% similar) in 310 aa overlap (213-516:202-488) 190 200 210 220 230 240 KIAA00 LQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREME .: :: :::.. . : ... : . KIAA19 QGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 KIAA00 QKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDA----ANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQ . .. :: .. : ...: ::. . : . . . .: . . . . KIAA19 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA00 LVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPT-KSCMLQADSEKLRQAWIK .:..: . : ..: : .. . :. :. : .:: : ..: ..: . . :.::.. KIAA19 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEE-EK---FMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQ 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 KIAA00 AVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASC :.:..: .. . . .:: : ..: : .:. ::: .: . ::. : KIAA19 AIQSQILASLQ---------SCESSKSKSQLTSQSEA--------MALQSIQNMRGNSHC 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 KIAA00 CDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDV :: .:.:::.:::. .::::::::::::...:.:::: :: : :: :.: .:::. KIAA19 VDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDL 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 KIAA00 INRVYEANVEKMGIKKPQ-PGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKS : ..:.. . : ::. . :.::: .::.:: .. :. KIAA19 ANSIWEGSSQ--GQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATAD 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 KIAA00 SEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQ KIAA19 EDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHG 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1099 ( 864 res) hk07834 (864 aa) initn: 431 init1: 332 opt: 410 Z-score: 342.4 bits: 74.3 E(): 5.9e-14 Smith-Waterman score: 429; 38.660% identity (64.948% similar) in 194 aa overlap (325-516:555-729) 300 310 320 330 340 350 KIAA00 QNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPT-KSCMLQADSEKLRQ :. :. : : .:: : .. ..: . . :. KIAA10 PPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERD 530 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 410 KIAA00 AWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPG ::..:....: .. . . .:: . . : : .:. ::: .. . : KIAA10 AWVQAIESQILASLQ---------SCESSKNKSRLTSQSEAM--------ALQSIRNMRG 590 600 610 620 420 430 440 450 460 470 KIAA00 NASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCEL :. : :: .: :::.::: .:::::::::.::.:.:.:::: :: : ::.:.: . KIAA10 NSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSI 630 640 650 660 670 680 480 490 500 510 520 530 KIAA00 GNDVINRVYEANVEKMGIKKPQ-PGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKF ::.. : :.: . . : ::. . :.::: .::::: .. :. KIAA10 GNELANSVWEESSQ--GRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR 690 700 710 720 730 740 540 550 560 570 580 590 KIAA00 VSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPE KIAA10 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 438 init1: 321 opt: 407 Z-score: 340.0 bits: 73.8 E(): 8e-14 Smith-Waterman score: 439; 38.725% identity (64.216% similar) in 204 aa overlap (328-529:525-709) 300 310 320 330 340 350 KIAA00 QLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPT-KSCMLQADSEKLRQAWI :. : : .:: : .. ..: : . :.::. KIAA01 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV 500 510 520 530 540 550 360 370 380 390 400 410 KIAA00 KAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNAS .:....: .. . :: :. .. :: .:. :.: .. ::. KIAA01 QAIESQILASLQCC--ESSKVKLRT-------DSQSEA--------VAIQAIRNAKGNSI 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 KIAA00 CCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGND : ::: .: :::.::: .:::::::::.::.:.:.:::: :: : :: .. .::: KIAA01 CVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGND 600 610 620 630 640 650 480 490 500 510 520 530 KIAA00 VINRVYEANVEKMGIKKP-QPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK . :::.:.... : :: . ..:.:.:..::::: . :. : : : .: KIAA01 TANRVWESDTR--GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQ 660 670 680 690 700 710 540 550 560 570 580 590 KIAA00 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGER KIAA01 AQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQ 720 730 740 750 760 770 >>KIAA0621 ( 753 res) hg04539 (753 aa) initn: 130 init1: 81 opt: 367 Z-score: 308.0 bits: 67.7 E(): 4.9e-12 Smith-Waterman score: 367; 22.895% identity (61.053% similar) in 380 aa overlap (73-439:16-382) 50 60 70 80 90 100 KIAA00 KLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFD .... . :: .:. :... . . ... KIAA06 DSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIE 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 KIAA00 QTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQ-RNKQHEVEEATNI .... . . :..: ::.. :.:::...: .:. . : :. ... ..:. ...:: . KIAA06 NASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQ 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 KIAA00 LTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMK . .:. : ...:.::.... .: .. :... .:.:. . ..:.:.::.: : KIAA06 VDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYEL-------AK 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 KIAA00 DLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRAS :.: .:... . . ..: .: ... . .. ::... . .:::::. . . KIAA06 DFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKT--ISPYTMEGYLYVQEK 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 KIAA00 NAFKT-WNRRWFSIQNN--QLVY----QK---KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRF : : : ... . : . :... :: : .. .:. :. :: .. ..::.:: KIAA06 RHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVI---LKSCTRRKTDSIEKRF 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 KIAA00 CFEVVSPTKSCM--LQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLD ::.: . . . .:: ::. :. :..:.. . .: ..:: . .: . . . KIAA06 CFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIR 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 KIAA00 SGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGV . .. : .:..: :. . . .. : ::. :: . .: : KIAA06 KCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTAS-ETETDICAEWEIKTITSAL 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 KIAA00 HFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQEKEAYIRAK KIAA06 KTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLAN 400 410 420 430 440 450 >>KIAA1428 ( 709 res) fh02979s1 (709 aa) initn: 175 init1: 77 opt: 351 Z-score: 295.2 bits: 65.3 E(): 2.5e-11 Smith-Waterman score: 391; 23.219% identity (61.214% similar) in 379 aa overlap (11-373:10-384) 10 20 30 40 50 60 KIAA00 GGRMKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANK :: :.:::. :. : : :.. . ...: . . :. . . .:.. KIAA14 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 KIAA00 QFMNGIRDLAQY----SSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFV . ... . ...: :. ..: .:: ..:. . :..: : .. . .: KIAA14 LTSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA00 KEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHE-VE-EATNILTATRKCFRHIAL ..::... :. :. .:.... :. . .......... :. :.:. . ..:: .. . KIAA14 ERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA00 DYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSE-LGPYMKDLGAQLDRLVVD : .:.:: :.. .:. .:..: :...::..: . ..: : .. ..:.... . . KIAA14 HYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 KIAA00 AAKEKREMEQKHSTIQ-QKD--FSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAF--KTWN .. . :.: .. .: . : . .. :. : ::: : .... .::. KIAA14 MDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNR-NLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWD 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA00 RRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVK--HCEDIERRFCFEVVS--PTKSCML :... :...:. : . : .. :. :.: ::: ::.::...: :: .: KIAA14 RQFYFTQGGNLMSQAR-GDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCED--RRYCFQITSFDGKKSSIL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 KIAA00 QADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESA ::.:.: .. :: .... : .. : KIAA14 QAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAA 360 370 380 390 400 410 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 237 init1: 189 opt: 279 Z-score: 234.0 bits: 54.8 E(): 6.5e-08 Smith-Waterman score: 302; 31.313% identity (55.556% similar) in 198 aa overlap (320-515:317-480) 290 300 310 320 330 340 KIAA00 RWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSE .: . ....:: :....: . ..:::: KIAA07 LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRR-SFDLTTPYRIFSFSADSE 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 KIAA00 KLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQ .. :..:.: .:: : : .: : .:. KIAA07 LEKEQWLEAMQGAIA-------------------------------EALSTSEVA-ERIW 350 360 370 410 420 430 440 450 460 KIAA00 CIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLD--TWEPELL : : ::: .: :::::: ...: .:.: ::.::. :::::: .: .: :. KIAA07 AAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLI 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 KIAA00 KLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPE .:. .::: . :: . ::: .:. . . .. ...::: : :. KIAA07 ELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSP-STRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEE 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 KIAA00 QQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANS KIAA07 LDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRT 500 510 520 530 540 550 781 residues in 1 query sequences 1986724 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:05:38 2008 done: Thu Dec 18 15:05:39 2008 Total Scan time: 0.590 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]