# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha01920.fasta.huge -Q ../query/KIAA0032.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0032, 1054 aa vs ./tmplib.23147 library 1986451 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1207+/-0.00468; mu= 19.9896+/- 0.319 mean_var=76.2015+/-17.890, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.146924 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1593 ( 953 res) fj09260 ( 953) 3486 749.5 5e-217 KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581) 642 146.9 2e-35 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 640 146.2 2e-35 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 620 141.9 3.7e-34 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 596 137.2 1.8e-32 KIAA1320 ( 567 res) fh13757 ( 567) 546 126.0 1.5e-29 KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 551 128.0 2e-29 KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 526 122.0 3.5e-28 KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 487 113.8 1.3e-25 KIAA1470 ( 564 res) fj01953 ( 564) 346 83.6 8.4e-17 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 343 83.3 1.8e-16 KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168) 302 75.0 1.2e-13 KIAA1563 ( 1658 res) fh20460s1 (1658) 298 74.0 1.9e-13 KIAA1417 ( 1379 res) fh14782 (1379) 253 64.4 1.2e-10 KIAA0896 ( 2820 res) hk08890s2 (2820) 218 57.4 3.3e-08 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 193 51.9 1e-06 KIAA0317 ( 826 res) hg00276 ( 826) 145 41.2 0.0007 KIAA0614 ( 3006 res) hg01176s2 (3006) 140 40.9 0.0032 >>KIAA1593 ( 953 res) fj09260 (953 aa) initn: 3332 init1: 1616 opt: 3486 Z-score: 3988.1 bits: 749.5 E(): 5e-217 Smith-Waterman score: 3486; 56.512% identity (79.010% similar) in 929 aa overlap (133-1053:25-952) 110 120 130 140 150 160 KIAA00 LSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQF : :..:.. :.::.:: .: :::. .. KIAA15 SCFPKIMCVDSLVRICSGLSYGRIRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEV 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 KIAA00 FTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNN : ::.:..:::::: . .:.::: ..:: :::. ::::::::::.:.::::.:::: :. KIAA15 FCWGQNKYGQLGLGTDCKKQTSPQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNK 60 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 280 KIAA00 AGQLGLSDEKDRESPCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDS :::::.::.:: : .: ::.::.::: :::.:::.::: :::::::::. :::::.: KIAA15 FGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNS 120 130 140 150 160 170 290 300 310 320 330 340 KIAA00 MNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCP . :.:::.:.::::: ::.:::::::: ::::::: ::.:: :. :::::: : : : : KIAA15 TSHEINPRKVFELMGSIVTEIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSP 180 190 200 210 220 230 350 360 370 380 390 400 KIAA00 SPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHY ::: : ..:: : .: ::.:::::::.: :. .: .: ::: : .. KIAA15 FTVKGNWYPYNGQCLPDIDSEEYFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPTKQ 240 250 260 270 280 290 410 420 430 440 450 460 KIAA00 TSLINDETIAVWRQKLSEHNNANTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGI .:. : : . : . .. : . .::..: ::::: . :.:..:. .. :. KIAA15 IWTVNEALIQKWLSYPSGRFPVEIANEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFSGV 300 310 320 330 340 350 470 480 490 500 510 520 KIAA00 DLNSTRVLFEKLMNSQHSMILEQILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQD :.:..:.::.::.. .: .: .:. :.:. :::.:.:: :::::.:.:: ::: ::..: KIAA15 DMNAARLLFHKLIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSD 360 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 KIAA00 SKYYITLTIPLAMAILRLDTNPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFL :. . :..::.. :.. :. : :::.:::: . : :.:.:.:.: .:..::. : . KIAA15 SNNFTTIAIPFGTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGI 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 KIAA00 IPV---LFNNYITAALKLLEKLYKVNLKVKHV-EYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQ : .::... .:::.:: :..:: :. .. .:: ::: :...:.::..::. : .: KIAA15 PPSERRIFNSFLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQ 480 490 500 510 520 530 640 650 660 670 680 690 KIAA00 A-GMKARPSIIQ--DT-VTLCSYPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLL : :: . .. . : ::.:.:::.::::::: .::::: ::::.:.. :. ::: :. KIAA15 AYGMDVNHGLTELADIPVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF 540 550 560 570 580 590 700 710 720 730 740 750 KIAA00 TLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEF : . . .: :.: :::.:.::::.. : ..:: :::::::: ::.::::::: ::: KIAA15 -LPVIESVNPCLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEF 600 610 620 630 640 650 760 770 780 790 800 810 KIAA00 FLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFP :::...:::.: :::: ::.:: :.:::: : . . :::::. ::::::: :.:::::: KIAA15 FLLIMRELLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFP 660 670 680 690 700 710 820 830 840 850 860 870 KIAA00 LALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQK ::::::::. ::.:.::::: : :::.:.::::: .:.:::::::::: :..:. : : KIAA15 LALYKKLLKKKPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVK 720 730 740 750 760 770 880 890 900 910 920 930 KIAA00 KLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSEL .:. .: ...: :.::::::::::.:.:. :: . :: .:: :::::::: ::::.:: KIAA15 ELVLNGADTAVNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNEL 780 790 800 810 820 830 940 950 960 970 980 990 KIAA00 RAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRI .::..::.::.:.:::... :::.: : :::.:.:::.:::.::::::.::::::::::: KIAA15 QAMVIGNTNYDWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRI 840 850 860 870 880 890 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA00 PIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA :: :: ::..:::::..:::::::.:::.::::::::. :: : ..: ::.:. ::::: KIAA15 PILGMKSLKLVIQSTGGGEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI 900 910 920 930 940 950 >>KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581 aa) initn: 627 init1: 281 opt: 642 Z-score: 727.8 bits: 146.9 E(): 2e-35 Smith-Waterman score: 642; 31.234% identity (63.255% similar) in 381 aa overlap (685-1053:1204-1580) 660 670 680 690 700 710 KIAA00 CSYPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNN :.:.: . : . : : .::.. KIAA13 RGSPVSSPQNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDH 1180 1190 1200 1210 1220 1230 720 730 740 750 760 770 KIAA00 LVGDALRELSIHSDIDLKK-PLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYY :. ::. .. .: ::.. : : : :::..: .: ..:::.:. .::.:: ::.: : KIAA13 LLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 780 790 800 810 820 KIAA00 -QDSNLLWFSD-TCFVE--HNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLE .:. . .: . ::. :.::.. : :::. .. ..: : .:: :: . : KIAA13 ANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 830 840 850 860 870 880 KIAA00 DLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDN ::. :. .::: . : .:... . :.::. .: .: : ...: ::: :. : . : KIAA13 DLEYLDEEFHQSLQWMKD---NDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKN 1360 1370 1380 1390 1400 1410 890 900 910 920 930 940 KIAA00 RQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEEL ..:... .:.. .. .: . .. :: .: .... .:. ::. ...:... . . KIAA13 KKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDW 1420 1430 1440 1450 1460 1470 950 960 970 980 990 1000 KIAA00 EETAIYKGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQ------ .... :.: : .: ... :: . ..: :.. ..: :.::.. :: :.:::. KIAA13 RNNTEYRGGYHDNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPR 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA00 -IVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA . ... .. :: ::::.: :::: : : .: .: :... :.: KIAA13 RFCVEKWGKITA-LPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1540 1550 1560 1570 1580 >>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa) initn: 420 init1: 197 opt: 640 Z-score: 727.7 bits: 146.2 E(): 2e-35 Smith-Waterman score: 640; 30.899% identity (64.326% similar) in 356 aa overlap (708-1051:640-991) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 MQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRE-LSIHSDIDLKKPLK ....:::. .. :. .:.. :: : KIAA04 AVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLW 610 620 630 640 650 660 740 750 760 770 780 790 KIAA00 VIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQ-DSNLLWF---SDTCFVEH-NW . :..:...: :::..:.:.:: ::..:: ::.: : :. : . : : .: .. KIAA04 IEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSY 670 680 690 700 710 720 800 810 820 830 840 850 KIAA00 FHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGE : .:: . :::.... ..: : .:: .:. . :.:.. .. ::. .:. KIAA04 FTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPT 730 740 750 760 770 780 860 870 880 890 900 910 KIAA00 DVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYT ... ::.. .:..: : : :.:... : ..:..:..: ... : :.. .. KIAA04 ELDLMFCID----EENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMN 790 800 810 820 830 840 920 930 940 950 960 970 KIAA00 AFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWE :: :: .. ....:. .::. .: : .. . .. .. .:::. : .::... ::. KIAA04 AFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWK 850 860 870 880 890 900 980 990 1000 1010 1020 KIAA00 TFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASL------QIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNL . . ::. ..: :.::..:.:. :.: : :. .. : :: ::::.: KIAA04 AVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNR 910 920 930 940 950 960 1030 1040 1050 KIAA00 LDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA :::: : . : : .: .:..: .:: KIAA04 LDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD 970 980 990 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 548 init1: 252 opt: 620 Z-score: 705.1 bits: 141.9 E(): 3.7e-34 Smith-Waterman score: 620; 31.092% identity (65.546% similar) in 357 aa overlap (708-1051:572-923) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 MQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDID-LKKPLK ...:: ... :. :.. . : :: : KIAA00 AVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLW 550 560 570 580 590 600 740 750 760 770 780 790 KIAA00 VIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQ-DSNLLWF---SDTCFVEH-NW . ::::...: :::..:.:.:. ::..:: ::.: : :. : . : : .: .. KIAA00 IEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSY 610 620 630 640 650 660 800 810 820 830 840 850 KIAA00 FHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGE :..:: . :.:.:.. ..: : .:: .:. :.:.. .. ::. .:. KIAA00 FKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPT 670 680 690 700 710 720 860 870 880 890 900 910 KIAA00 DVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYT ... : : : .: .: .:..: ::....: . :..:.. ... : ... .. KIAA00 ELD----LRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMA 730 740 750 760 770 920 930 940 950 960 970 KIAA00 AFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWE ::. ::... ....:. .::. .: : .. . .. .: . ::. :::.: ... ::. KIAA00 AFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWK 780 790 800 810 820 830 980 990 1000 1010 1020 KIAA00 TFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASL-------QIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN . . ::. ..: :.::..:.:. :.: : ...... .. :. :: ::::.: KIAA00 AVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEK-LPRAHTCFN 840 850 860 870 880 890 1030 1040 1050 KIAA00 LLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA :::: : : : : .: .:..: .:: KIAA00 RLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD 900 910 920 >>KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614 aa) initn: 383 init1: 131 opt: 596 Z-score: 675.0 bits: 137.2 E(): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 596; 29.843% identity (63.351% similar) in 382 aa overlap (685-1053:1237-1613) 660 670 680 690 700 710 KIAA00 CSYPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLV-LHVRRN :.:.: . : . . ...: . : .::. KIAA03 RCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGF-GQGPGKIKLIIRRD 1210 1220 1230 1240 1250 1260 720 730 740 750 760 770 KIAA00 NLVGDALRELSIHSDIDLKK-PLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTY .:. .. .. .: .:.. : : : :::..: .: ..:::.:: .::.:: ::.: : KIAA03 HLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEY 1270 1280 1290 1300 1310 1320 780 790 800 810 820 KIAA00 Y-QDSNLLWFSD-TCFVEHN--WFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGL .:. . .: . :::.. ::.. : :::. .. ..: : .:: :: . : KIAA03 SANDTYTVQISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDL 1330 1340 1350 1360 1370 1380 830 840 850 860 870 880 KIAA00 EDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKD ::. :. .::: . : ... . . :.::. .: .: . ...: :: :. : . KIAA03 SDLEYLDEEFHQSLQWMKD---NNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEK 1390 1400 1410 1420 1430 1440 890 900 910 920 930 940 KIAA00 NRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEE :..:... .:.. . .: . :. :: .: .... .:. ::. ...:... . .. KIAA03 NKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLND 1450 1460 1470 1480 1490 1500 950 960 970 980 990 1000 KIAA00 LEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQ----- .... :.: : : ... :: . ..: :.. ..: :.::.. .: :.:.:. KIAA03 WRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGL 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA00 --IVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA . :.. .. :: ::::.: :::: : : .: .: :... :.: KIAA03 RRFCIEKWGKITS-LPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1570 1580 1590 1600 1610 >>KIAA1320 ( 567 res) fh13757 (567 aa) initn: 448 init1: 195 opt: 546 Z-score: 622.6 bits: 126.0 E(): 1.5e-29 Smith-Waterman score: 546; 28.691% identity (63.788% similar) in 359 aa overlap (707-1054:212-567) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 QMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLK .: :.:... .. . .: . ::. . KIAA13 FKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIA 190 200 210 220 230 240 740 750 760 770 780 790 KIAA00 VIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCFV--EH-NWFH : : :::.. . ::..:.: .: .:..:: :..:: :.. . ... .: .: :.:. KIAA13 VRFHGEEGM-GQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYVNPDHLNYFR 250 260 270 280 290 300 800 810 820 830 840 850 KIAA00 LIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDV . : :::. . .:...: ..::..:.. . .:. ..: ...:: .:: :. KIAA13 FAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDL 310 320 330 340 350 360 860 870 880 890 900 910 KIAA00 EETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAF . :.:.. . .:..:. : ::: .. : ..:. :.:. .. . ... .:: KIAA13 --GLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAF 370 380 390 400 410 920 930 940 950 960 970 KIAA00 SSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETF .:: ....::. ::. .. : . . . ... : . : :... :::. KIAA13 LQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVV 420 430 440 450 460 470 980 990 1000 1010 1020 KIAA00 HEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIP------IYGMASLQ-IVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLL ... :.. .: :.:::.:.: :.: ..:: ..: .. . ::.. :: :.: KIAA13 EDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINML 480 490 500 510 520 530 1030 1040 1050 KIAA00 DLPKYSSKEILSARLTQALD-NYEGFSLA ::.: :::::. :: :: . :...: KIAA13 KLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA 540 550 560 >>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa) initn: 398 init1: 194 opt: 551 Z-score: 620.2 bits: 128.0 E(): 2e-29 Smith-Waterman score: 569; 28.142% identity (62.842% similar) in 366 aa overlap (702-1054:2831-3192) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 TDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDL :. ...::::... :. ::: .: .. KIAA03 AVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRELHRKSPEEM 2810 2820 2830 2840 2850 2860 740 750 760 770 780 KIAA00 KKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWF---SDTCFVE :. : ..:.:::. ::::. .:..... .:..::.:..: . . . :. : . KIAA03 KNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSHCNPN 2870 2880 2890 2900 2910 2920 790 800 810 820 830 840 KIAA00 H-NWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLD : ..:...: . :.:.. ... .: ..::..:. . :.. . ..: ::. KIAA03 HLSYFKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLVYLLE 2930 2940 2950 2960 2970 2980 850 860 870 880 890 900 KIAA00 YPGEDVEET-FCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISV .:: . :.:. . .:: : . : :.: :. : ..:..:.: .. . .. KIAA03 ---NDVSTLGYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLKPNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAI 2990 3000 3010 3020 3030 910 920 930 940 950 960 KIAA00 HEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTV .. .:: :: .. ... .: .::. .. : . . ..:. .. :. :... . KIAA03 RKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELLISGLPTIDIDDLKSNTEYH-KYQSNSIQI 3040 3050 3060 3070 3080 3090 970 980 990 1000 1010 KIAA00 KLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIV-------IQSTASGEEYLPVA . ::.... : . ::: :.::....:. :.:.:. . :. . . :: : KIAA03 QWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSA 3100 3110 3120 3130 3140 3150 1020 1030 1040 1050 KIAA00 HTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDN-YEGFSLA :::.: :::: : : : : : :... :::.:: KIAA03 HTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQECSEGFGLA 3160 3170 3180 3190 >>KIAA1625 ( 859 res) hh15184 (859 aa) initn: 464 init1: 169 opt: 526 Z-score: 597.8 bits: 122.0 E(): 3.5e-28 Smith-Waterman score: 601; 30.556% identity (63.056% similar) in 360 aa overlap (708-1053:503-858) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 MQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKV ..: :... .. :.. :::: : : KIAA16 AQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMV 480 490 500 510 520 530 740 750 760 770 780 790 KIAA00 IFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDS-NLLWFSDTCFV--EH-NWFH : :::..: :::..:.. :: .:.::: ::.: : :. .: .. . .: ..:: KIAA16 KFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFH 540 550 560 570 580 590 800 810 820 830 840 850 KIAA00 LIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDV ..: :::.... .. : . .::.::. : ::. ..: .:: .:. .:. KIAA16 FVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESVDPELHKSLVWILE---NDI 600 610 620 630 640 860 870 880 890 900 910 KIAA00 EETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAF .. .: . ....: : :..: :.: :: : ..:..:.: :::. :. ... . :. KIAA16 TPVLDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLAL 650 660 670 680 690 700 920 930 940 950 960 970 KIAA00 SSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETF ..:: .. ..:. :. .::. .. : .. . .. . .. : : :. ::.. KIAA16 QKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLK-HCVADSNIVRWFWQAV 710 720 730 740 750 760 980 990 1000 1010 1020 KIAA00 HEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQ----------IVIQSTASGEEYLPVAHTCY . : :.. ..: :.::: :.:. :. .:: ..:. .. . :: ::::. KIAA16 ETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCF 770 780 790 800 810 820 1030 1040 1050 KIAA00 NLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA : .:.: : : : : .: :... ::.. KIAA16 NRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE 830 840 850 >>KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086 aa) initn: 391 init1: 126 opt: 487 Z-score: 552.0 bits: 113.8 E(): 1.3e-25 Smith-Waterman score: 536; 30.728% identity (62.264% similar) in 371 aa overlap (704-1054:721-1086) 680 690 700 710 720 730 KIAA00 AELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFL---VLHVRRNNLVGDALRELSIHSDID ::: . .::: . :: .:: ... : KIAA00 ELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPD 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 KIAA00 LKKPLKV-IFDG----EEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFT-------YYQDSNL ::: ..: .... : ..:.::. .::. ::: .:: :.: : . . KIAA00 LKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQ 760 770 780 790 800 810 780 790 800 810 820 830 KIAA00 LWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLE--DLKELSP . .:. :..: .: .. : :.:.. .:.: : . .:::... .. : :.: KIAA00 MLVGDS-FARHYYF--LARMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDP 820 830 840 850 860 840 850 860 870 880 890 KIAA00 TEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDA ..: : .: .:::: . ::::. .. : . .: :: .. : . :: .. KIAA00 EVYKNLLFLKSYE-DDVEE-LGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHL 870 880 890 900 910 920 900 910 920 930 940 950 KIAA00 YVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNS-NYNWEELEETAIY ..: .. .... :: .:. .: . . :..:. .:..... : . . :.:. . : KIAA00 VADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNY 930 940 950 960 970 980 960 970 980 990 1000 1010 KIAA00 KGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQ--IVIQSTASGE .: ::: ::..:.::.. . : :.:.:.: :.:. .: :. :. : . :.. .: KIAA00 SGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1020 1030 1040 1050 KIAA00 EYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA : ::.: ::.::: ::.. .. .: ..: :.. :: :. KIAA00 ERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1470 ( 564 res) fj01953 (564 aa) initn: 387 init1: 263 opt: 346 Z-score: 393.6 bits: 83.6 E(): 8.4e-17 Smith-Waterman score: 452; 29.096% identity (58.192% similar) in 354 aa overlap (10-334:171-507) 10 20 30 KIAA00 KIRTMLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRS : .::: :: : :. : .. KIAA14 GSKCKGQLLIFGATNWDLIGRKEVPKQQAAYRNLGQ-----NLWG----PHRYGCLAGVR 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 KIAA00 VKEVACGG--NHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLGH--EREGNKPEQIGALADQHIIHVAC :. :. :. ::... .:.... : : :::::: .. . :. : .:. . :. .:: KIAA14 VRTVVSGSCAAHSLLITTEGKLWSWGRNEKGQLGHGDTKRVEAPRLIEGLSHEVIVSAAC 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 KIAA00 GESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSVAVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLA :..:.:::.. :..:..: .. ::::: . :.: : :. : : : ...:: . KIAA14 GRNHTLALTETGSVFAFGENKMGQLGLGNQTDAVPSPAQIM-YNGQPITKMACGAEFSMI 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 KIAA00 LAADGQFFTWGKNSHGQLGL---GK--------EFPSQASPQRV-----RSLEG----IP . :.....: .:::: :: :. . :.:: .. .: .: KIAA14 MDCKGNLYSFGCPEYGQLGHNSDGKFIARAQRIEYDCELVPRRVAIFIEKTKDGQILPVP 320 330 340 350 360 370 200 210 220 230 240 250 KIAA00 ---LAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLRT--QKVVY . .:: :. :...:. . ::.::... :.:: ...::. : :::. . . KIAA14 NVVVRDVACGANHTLVLDSQKRVFSWGFGGYGRLGHAEQKDEMVPRLVKLFDFPGRGASQ 380 390 400 410 420 430 260 270 280 290 300 310 KIAA00 ISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACGRQHT : : . .... ::.: .:: . : .. . :. : .: : .. ..:::.. KIAA14 IYAGYTCSFAVSEVGGLFFWGATNT------SRESTMYPKAVQDLCGWRIRSLACGKSSI 440 450 460 470 480 320 330 340 350 360 370 KIAA00 LAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYHIVKQ .. . : . .. . :.:: : KIAA14 IVAADESTISWG-PSPTFGELGYGDHKPKSSTAAQEVKTLDGIFSEQVAMGYSHSLVIAR 490 500 510 520 530 540 1054 residues in 1 query sequences 1986451 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:05:19 2008 done: Thu Dec 18 15:05:20 2008 Total Scan time: 0.690 Total Display time: 0.370 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]