Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 4345 bp
Revised DNA sequence, length = 4344 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN04910  3376 -  3396     GTA GGC ATC TTC AGC ATT TAG
     r NN04911  3794 -  3774     TCA GCC CCT TCT TTT CCA TCA
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  3620 -  3620        1-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 3 - 3902 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hk03560               1 GGGATCTGCTAGAAGTTGGTCTTCCGCCAGGACTAGAGTTTCCTCGCGGT 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)      1 GGGATCTGCTAGAAGTTGGTCTTCCGCCAGGACTAGAGTTTCCTCGCGGT 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hk03560              51 AACAGCCTCCGTGGCCTCCGGAGGACCATGTCATTAGACTTTGGCAGTGT 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)     51 AACAGCCTCCGTGGCCTCCGGAGGACCATGTCATTAGACTTTGGCAGTGT 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hk03560             101 GGCACTACCAGTGCAAAATGAAGATGAAGAGTATGACGAAGAGGACTATG 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    101 GGCACTACCAGTGCAAAATGAAGATGAAGAGTATGACGAAGAGGACTATG 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hk03560             151 AAAGAGAGAAAGAGTTGCAGCAGTTACTCACAGACCTTCCCCATGACATG 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    151 AAAGAGAGAAAGAGTTGCAGCAGTTACTCACAGACCTTCCCCATGACATG 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hk03560             201 CTGGATGACGACCTCTCCTCTCCAGAGCTCCAGTATTCGGACTGCAGCGA 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    201 CTGGATGACGACCTCTCCTCTCCAGAGCTCCAGTATTCGGACTGCAGCGA 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hk03560             251 GGATGGCACAGACGGACAACCACATCATCCTGAGCAATTGGAGATGAGCT 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    251 GGATGGCACAGACGGACAACCACATCATCCTGAGCAATTGGAGATGAGCT 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hk03560             301 GGAATGAGCAAATGCTGCCCAAATCTCAAAGTGTAAATGGTCCCAGTTGT 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    301 GGAATGAGCAAATGCTGCCCAAATCTCAAAGTGTAAATGGTCCCAGTTGT 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hk03560             351 CAAGGTTTGGAACCGTATAATAAAGTGACATATAAACCTTATCAGTCTTC 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    351 CAAGGTTTGGAACCGTATAATAAAGTGACATATAAACCTTATCAGTCTTC 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hk03560             401 TGCCCAGAATAATGGCTCACCAGCCCAGGAGATAACAGGAAGTGACACAT 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    401 TGCCCAGAATAATGGCTCACCAGCCCAGGAGATAACAGGAAGTGACACAT 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hk03560             451 TCGAAGGCCTGCAACAACAATTTTTAGGAGCTAATGAGAACTCTGCAGAA 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    451 TCGAAGGCCTGCAACAACAATTTTTAGGAGCTAATGAGAACTCTGCAGAA 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hk03560             501 AATATGCAGATTATTCAACTTCAGGTTCTTAACAAAGCAAAAGAGAGACA 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    501 AATATGCAGATTATTCAACTTCAGGTTCTTAACAAAGCAAAAGAGAGACA 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hk03560             551 ACTGGAGAACTTAATTGAAAAGTTAAATGAAAGTGAACGTCAAATTCGAT 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    551 ACTGGAGAACTTAATTGAAAAGTTAAATGAAAGTGAACGTCAAATTCGAT 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hk03560             601 ATCTGAATCACCAGCTTGTAATAATAAAAGATGAAAAGGATGGTTTGACT 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    601 ATCTGAATCACCAGCTTGTAATAATAAAAGATGAAAAGGATGGTTTGACT 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hk03560             651 CTCAGCCTTCGAGAATCACAGAAACTCTTTCAGAATGGAAAAGAAAGAGA 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    651 CTCAGCCTTCGAGAATCACAGAAACTCTTTCAGAATGGAAAAGAAAGAGA 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hk03560             701 GATACAGCTTGAAGCTCAAATAAAAGCACTGGAGACTCAGATACAAGCAT 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    701 GATACAGCTTGAAGCTCAAATAAAAGCACTGGAGACTCAGATACAAGCAT 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hk03560             751 TAAAAGTCAATGAAGAACAGATGATCAAGAAGTCCAGAACAACTGAAATG 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    751 TAAAAGTCAATGAAGAACAGATGATCAAGAAGTCCAGAACAACTGAAATG 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hk03560             801 GCTCTGGAAAGCTTGAAGCAGCAGCTGGTGGACCTTCATCATTCTGAATC 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    801 GCTCTGGAAAGCTTGAAGCAGCAGCTGGTGGACCTTCATCATTCTGAATC 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hk03560             851 ACTTCAACGAGCTAGAGAACAGCATGAGAGCATTGTTATGGGCCTCACAA 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    851 ACTTCAACGAGCTAGAGAACAGCATGAGAGCATTGTTATGGGCCTCACAA 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hk03560             901 AGAAGTACGAAGAGCAAGTATTGTCCTTACAAAAGAATTTGGATGCCACA 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    901 AGAAGTACGAAGAGCAAGTATTGTCCTTACAAAAGAATTTGGATGCCACA 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hk03560             951 GTCACCGCACTTAAAGAACAGGAAGACATTTGCTCTCGTCTGAAAGATCA 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)    951 GTCACCGCACTTAAAGAACAGGAAGACATTTGCTCTCGTCTGAAAGATCA 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hk03560            1001 CGTGAAACAACTGGAAAGGAATCAAGAAGCAATCAAGTTAGAAAAGACTG 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1001 CGTGAAACAACTGGAAAGGAATCAAGAAGCAATCAAGTTAGAAAAGACTG 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hk03560            1051 AGATCATTAATAAGTTGACAAGAAGTCTAGAGGAGAGTCAAAAGCAGTGT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1051 AGATCATTAATAAGTTGACAAGAAGTCTAGAGGAGAGTCAAAAGCAGTGT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hk03560            1101 GCCCACTTGTTGCAGTCCGGGTCAGTACAAGAGGTGGCTCAGCTACAGTT 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1101 GCCCACTTGTTGCAGTCCGGGTCAGTACAAGAGGTGGCTCAGCTACAGTT 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hk03560            1151 CCAGCTGCAGCAAGCACAGAAGGCACATGCTATGAGTGCAAACATGAACA 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1151 CCAGCTGCAGCAAGCACAGAAGGCACATGCTATGAGTGCAAACATGAACA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hk03560            1201 AGGCTTTGCAAGAAGAATTAACAGAACTAAAAGATGAAATTTCTCTCTAT 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1201 AGGCTTTGCAAGAAGAATTAACAGAACTAAAAGATGAAATTTCTCTCTAT 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hk03560            1251 GAATCTGCTGCAAAACTAGGAATACATCCAAGTGACTCAGAAGGAGAATT 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1251 GAATCTGCTGCAAAACTAGGAATACATCCAAGTGACTCAGAAGGAGAATT 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hk03560            1301 AAATATAGAACTCACTGAATCGTATGTGGATTTGGGTATTAAAAAGGTCA 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1301 AAATATAGAACTCACTGAATCGTATGTGGATTTGGGTATTAAAAAGGTCA 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hk03560            1351 ACTGGAAAAAATCCAAAGTTACCAGCATTGTACAAGAAGAAGACCCAAAT 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1351 ACTGGAAAAAATCCAAAGTTACCAGCATTGTACAAGAAGAAGACCCAAAT 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hk03560            1401 GAAGAGCTTTCAAAAGATGAGTTCATTCTGAAGTTAAAGGCAGAAGTACA 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1401 GAAGAGCTTTCAAAAGATGAGTTCATTCTGAAGTTAAAGGCAGAAGTACA 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hk03560            1451 GCGTTTGCTGGGTAGCAACTCAATGAAGCGTCATCTGGTGTCTCAGTTAC 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1451 GCGTTTGCTGGGTAGCAACTCAATGAAGCGTCATCTGGTGTCTCAGTTAC 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hk03560            1501 AAAATGACCTCAAAGACTGTCATAAGAAAATTGAAGATCTCCACCAAGTG 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1501 AAAATGACCTCAAAGACTGTCATAAGAAAATTGAAGATCTCCACCAAGTG 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hk03560            1551 AAGAAGGATGAAAAAAGCATTGAGGTTGAGACTAAAACAGATACCTCAGA 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1551 AAGAAGGATGAAAAAAGCATTGAGGTTGAGACTAAAACAGATACCTCAGA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hk03560            1601 AAAACCAAAGAATCAATTATGGCCTGAGTCTTCTACTTCTGATGTTGTCA 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1601 AAAACCAAAGAATCAATTATGGCCTGAGTCTTCTACTTCTGATGTTGTCA 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hk03560            1651 GAGATGATATTCTGCTGCTTAAAAATGAAATTCAAGTTTTACAACAACAA 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1651 GAGATGATATTCTGCTGCTTAAAAATGAAATTCAAGTTTTACAACAACAA 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hk03560            1701 AATCAGGAACTTAAAGAAACTGAAGGAAAACTGAGAAATACAAATCAAGA 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1701 AATCAGGAACTTAAAGAAACTGAAGGAAAACTGAGAAATACAAATCAAGA 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hk03560            1751 CTTATGTAATCAAATGAGACAAATGGTACAAGATTTTGACCATGACAAAC 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1751 CTTATGTAATCAAATGAGACAAATGGTACAAGATTTTGACCATGACAAAC 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hk03560            1801 AAGAAGCTGTGGATAGGTGTGAAAGGACTTATCAGCAGCACCATGAAGCC 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1801 AAGAAGCTGTGGATAGGTGTGAAAGGACTTATCAGCAGCACCATGAAGCC 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hk03560            1851 ATGAAAACTCAAATACGTGAAAGCCTATTAGCAAAGCATGCTTTGGAGAA 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1851 ATGAAAACTCAAATACGTGAAAGCCTATTAGCAAAGCATGCTTTGGAGAA 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hk03560            1901 GCAGCAGCTCTTTGAGGCTTATGAGAGAACTCATTTGCAACTGAGGTCTG 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1901 GCAGCAGCTCTTTGAGGCTTATGAGAGAACTCATTTGCAACTGAGGTCTG 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hk03560            1951 AGTTGGATAAGTTGAATAAGGAGGTGACTGCTGTGCAGGAATGTTACCTA 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   1951 AGTTGGATAAGTTGAATAAGGAGGTGACTGCTGTGCAGGAATGTTACCTA 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hk03560            2001 GAAGTGTGCAGAGAGAAGGATAATCTAGAATTGACTCTCAGGAAGACCAC 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2001 GAAGTGTGCAGAGAGAAGGATAATCTAGAATTGACTCTCAGGAAGACCAC 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hk03560            2051 TGAAAAGGAGCAACAGACTCAGGAGAAGATCAAAGAAAAACTCATTCAAC 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2051 TGAAAAGGAGCAACAGACTCAGGAGAAGATCAAAGAAAAACTCATTCAAC 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hk03560            2101 AGCTTGAAAAGGAGTGGCAGTCTAAGCTGGATCAAACTATAAAGGCAATG 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2101 AGCTTGAAAAGGAGTGGCAGTCTAAGCTGGATCAAACTATAAAGGCAATG 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hk03560            2151 AAAAAGAAGACCTTAGATTGTGGCAGCCAAACTGACCAAGTAACCACCAG 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2151 AAAAAGAAGACCTTAGATTGTGGCAGCCAAACTGACCAAGTAACCACCAG 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hk03560            2201 TGATGTTATTTCCAAGAAAGAGATGGCAATTATGATAGAAGAGCAGAAGT 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2201 TGATGTTATTTCCAAGAAAGAGATGGCAATTATGATAGAAGAGCAGAAGT 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hk03560            2251 GCACAATCCAGCAAAACTTAGAACAAGAGAAGGACATAGCCATCAAGGGG 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2251 GCACAATCCAGCAAAACTTAGAACAAGAGAAGGACATAGCCATCAAGGGG 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hk03560            2301 GCTATGAAGAAACTCGAAATTGAATTGGAACTCAAACATTGTGAAAATAT 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2301 GCTATGAAGAAACTCGAAATTGAATTGGAACTCAAACATTGTGAAAATAT 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hk03560            2351 TACCAAACAGGTAGAAATAGCTGTGCAAAATGCTCATCAGCGATGGCTGG 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2351 TACCAAACAGGTAGAAATAGCTGTGCAAAATGCTCATCAGCGATGGCTGG 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hk03560            2401 GAGAACTACCAGAGCTGGCAGAGTATCAAGCACTTGTGAAGGCAGAACAG 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2401 GAGAACTACCAGAGCTGGCAGAGTATCAAGCACTTGTGAAGGCAGAACAG 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hk03560            2451 AAAAAGTGGGAAGAACAGCATGAGGTCTCTGTGAACAAAAGGATATCATT 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2451 AAAAAGTGGGAAGAACAGCATGAGGTCTCTGTGAACAAAAGGATATCATT 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hk03560            2501 TGCTGTTTCTGAAGCTAAAGAGAAATGGAAGAGTGAGCTTGAAAATATGA 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2501 TGCTGTTTCTGAAGCTAAAGAGAAATGGAAGAGTGAGCTTGAAAATATGA 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hk03560            2551 GGAAAAATATACTTCCTGGAAAGGAATTGGAAGAGAAGATTCATTCTCTT 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2551 GGAAAAATATACTTCCTGGAAAGGAATTGGAAGAGAAGATTCATTCTCTT 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hk03560            2601 CAGAAGGAACTTGAGTTAAAGAACGAAGAAGTCCCTGTGGTCATCAGGGC 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2601 CAGAAGGAACTTGAGTTAAAGAACGAAGAAGTCCCTGTGGTCATCAGGGC 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hk03560            2651 TGAGTTAGCTAAGGCTCGGAGTGAATGGAACAAAGAAAAGCAAGAAGAAA 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2651 TGAGTTAGCTAAGGCTCGGAGTGAATGGAACAAAGAAAAGCAAGAAGAAA 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hk03560            2701 TCCACAGAATCCAAGAACAAAATGAGCAAGATTACCGGCAATTTTTAGAT 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2701 TCCACAGAATCCAAGAACAAAATGAGCAAGATTACCGGCAATTTTTAGAT 2750

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hk03560            2751 GATCACCGAAATAAAATTAATGAGGTGCTTGCGGCAGCTAAAGAAGACTT 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2751 GATCACCGAAATAAAATTAATGAGGTGCTTGCGGCAGCTAAAGAAGACTT 2800

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hk03560            2801 TATGAAACAAAAAACTGAACTACTTCTTCAGAAGGAGACAGAATTACAAA 2850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2801 TATGAAACAAAAAACTGAACTACTTCTTCAGAAGGAGACAGAATTACAAA 2850

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hk03560            2851 CTTGTCTAGACCAGAGTCGTAGAGAATGGACTATGCAGGAAGCCAAGCGG 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2851 CTTGTCTAGACCAGAGTCGTAGAGAATGGACTATGCAGGAAGCCAAGCGG 2900

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hk03560            2901 ATCCAACTGGAAATCTATCAGTATGAGGAAGACATCCTGACTGTACTTGG 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2901 ATCCAACTGGAAATCTATCAGTATGAGGAAGACATCCTGACTGTACTTGG 2950

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hk03560            2951 GGTTCTTTTAAGTGATACCCAAAAGGAGCACATCAGTGATTCTGAGGACA 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   2951 GGTTCTTTTAAGTGATACCCAAAAGGAGCACATCAGTGATTCTGAGGACA 3000

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hk03560            3001 AGCAGCTTTTGGAAATCATGTCGACTTGTTCTTCAAAATGGATGTCTGTG 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3001 AGCAGCTTTTGGAAATCATGTCGACTTGTTCTTCAAAATGGATGTCTGTG 3050

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hk03560            3051 CAATATTTTGAAAAACTAAAGGGCTGCATACAGAAAGCATTTCAAGATAC 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3051 CAATATTTTGAAAAACTAAAGGGCTGCATACAGAAAGCATTTCAAGATAC 3100

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hk03560            3101 ACTTCCTCTGCTTGTAGAAAACGCTGACCCAGAATGGAAAAAGAGAAATA 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3101 ACTTCCTCTGCTTGTAGAAAACGCTGACCCAGAATGGAAAAAGAGAAATA 3150

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hk03560            3151 TGGCCGAGCTCTCTAAGGATTCTGCCAGCCAGGGCACTGGCCAAGGAGAC 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3151 TGGCCGAGCTCTCTAAGGATTCTGCCAGCCAGGGCACTGGCCAAGGAGAC 3200

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hk03560            3201 CCTGGACCTGCTGCTGGACACCATGCTCAGCCCTTGGCCTTACAAGCAAC 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3201 CCTGGACCTGCTGCTGGACACCATGCTCAGCCCTTGGCCTTACAAGCAAC 3250

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hk03560            3251 AGAAGCAGAAGCTGATAAGAAAAAGGTCCTTGAAATTAAGGATTTATGCT 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3251 AGAAGCAGAAGCTGATAAGAAAAAGGTCCTTGAAATTAAGGATTTATGCT 3300

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hk03560            3301 GTGGACACTGCTTCCAAGAACTTGAAAAGGCAAAGCAGGAATGTCAAGAT 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3301 GTGGACACTGCTTCCAAGAACTTGAAAAGGCAAAGCAGGAATGTCAAGAT 3350

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hk03560            3351 CTGAAAGGAAAACTGGAGAAATGCTGTAGGCATCTTCAGCATTTAGAAAG 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3351 CTGAAAGGAAAACTGGAGAAATGCTGTAGGCATCTTCAGCATTTAGAAAG 3400

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hk03560            3401 GAAGCACAAAGCTGTAGTGGAAAAAATTGGAGAAGAGAATAATAAAGTTG 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3401 GAAGCACAAAGCTGTAGTGGAAAAAATTGGAGAAGAGAATAATAAAGTTG 3450

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hk03560            3451 TTGAAGAATTAATAGAAGAAAACAACGACATGAAGAATAAATTGGAAGAA 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3451 TTGAAGAATTAATAGAAGAAAACAACGACATGAAGAATAAATTGGAAGAA 3500

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hk03560            3501 TTGCAAACACTTTGTAAAACACCACCAAGGTCATTGTCAGCAGGGGCCAT 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3501 TTGCAAACACTTTGTAAAACACCACCAAGGTCATTGTCAGCAGGGGCCAT 3550

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hk03560            3551 TGAAAATGCTTGCCTGCCATGCAGTGGGGGAGCCTTGGAAGAACTTCGTG 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3551 TGAAAATGCTTGCCTGCCATGCAGTGGGGGAGCCTTGGAAGAACTTCGTG 3600

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hk03560            3601 GGCAGTACATTAAAGCTGTAAAAAAAAATTAAATGTGACATGCTTCGTTA 3650
                        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3601 GGCAGTACATTAAAGCTGT-AAAAAAAATTAAATGTGACATGCTTCGTTA 3649

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hk03560            3651 TATTCAGGAGAGTAAGGAACGAGCTGCAGAAATGGTAAAAGCAGAGGTAC 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3650 TATTCAGGAGAGTAAGGAACGAGCTGCAGAAATGGTAAAAGCAGAGGTAC 3699

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hk03560            3701 TGCGAGAACGTCAAGAAACCGCCCGAAAGATGCGCAAATATTATTTGATT 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3700 TGCGAGAACGTCAAGAAACCGCCCGAAAGATGCGCAAATATTATTTGATT 3749

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hk03560            3751 TGCCTCCAACAGATTTTGCAGGATGATGGAAAAGAAGGGGCTGAGAAAAA 3800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3750 TGCCTCCAACAGATTTTGCAGGATGATGGAAAAGAAGGGGCTGAGAAAAA 3799

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hk03560            3801 GATTATGAATGCTGCTAGCAAACTTGCTACAATGGCAAAATTACTGGAAA 3850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3800 GATTATGAATGCTGCTAGCAAACTTGCTACAATGGCAAAATTACTGGAAA 3849

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hk03560            3851 CACCTATTTCTAGTAAGTCCCAAAGCAAAACTACACAGTCAGGTATGTCA 3900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3850 CACCTATTTCTAGTAAGTCCCAAAGCAAAACTACACAGTCAGGTATGTCA 3899

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hk03560            3901 AAGTGAGTCGCCAAATGGTTTTTCTATCTTTTCTTCTTTAGCTATTTAAT 3950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3900 AAGTGAGTCGCCAAATGGTTTTTCTATCTTTTCTTCTTTAGCTATTTAAT 3949

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hk03560            3951 ATTTTCAGTATGAAGAAGGCAGGGAAGGTAAGGAGTGAGAGTTAATTTGT 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   3950 ATTTTCAGTATGAAGAAGGCAGGGAAGGTAAGGAGTGAGAGTTAATTTGT 3999

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hk03560            4001 GAAGTTTTGTATGTTTTACTTAAACTAGAAGTTTACGCAAAAAGAGTACA 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4000 GAAGTTTTGTATGTTTTACTTAAACTAGAAGTTTACGCAAAAAGAGTACA 4049

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hk03560            4051 CAGTTTCCAATTTAAGTAGGCAGACTGAGCATGCCCATCAGTTTCCTATT 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4050 CAGTTTCCAATTTAAGTAGGCAGACTGAGCATGCCCATCAGTTTCCTATT 4099

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hk03560            4101 GCTGCTTCCATCCCTCGAAATGATAGAAAAGATTTTAAACAGCAAATAAA 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4100 GCTGCTTCCATCCCTCGAAATGATAGAAAAGATTTTAAACAGCAAATAAA 4149

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hk03560            4151 GAATGAGAAAAAGAAGAAATTATAAGTGGGTTTTAAAAAGTTGCAGTGGG 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4150 GAATGAGAAAAAGAAGAAATTATAAGTGGGTTTTAAAAAGTTGCAGTGGG 4199

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hk03560            4201 CCAGGCATCATGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4200 CCAGGCATCATGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 4249

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hk03560            4251 TGGGAGGATCCCTTGATCCCAGGAATTTGAGGTTGCAGTAAGCTATGATT 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4250 TGGGAGGATCCCTTGATCCCAGGAATTTGAGGTTGCAGTAAGCTATGATT 4299

                   4301          .         .         .         .      4345
hk03560            4301 GTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGGCCCTGTCTC 4345
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk03560(revised)   4300 GTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGGCCCTGTCTC 4344