Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5876 bp
Revised DNA sequence, length = 6018 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN06087  1177 -  1197     CTG CCC GCT GGA AAC TAA CCT
     r NN06088  2642 -  2622     CTC CCC ATT GGA TAC TGT CTT
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  1670 -  1826      157-bp insertion (in the revised sequence)
 2 :  2091 -  2105       15-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 198 - 3839 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh11961               1 ATTCCCCCTCCTCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGGCCGGGGCCCCA 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)      1 ATTCCCCCTCCTCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGGCCGGGGCCCCA 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh11961              51 GCGCGGGCCGGGAGGGGGCACGGCGGAGGCCACGGAGGCAGGCGCGGGAG 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)     51 GCGCGGGCCGGGAGGGGGCACGGCGGAGGCCACGGAGGCAGGCGCGGGAG 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh11961             101 AAGACCGCGCTCCGCTTCCCGGGCCGCGCCGACCTGCTCGGCGGCCTGCC 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    101 AAGACCGCGCTCCGCTTCCCGGGCCGCGCCGACCTGCTCGGCGGCCTGCC 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh11961             151 CGCCCGCGCCCAGGGGCCCCGAACGGTGGGGCCGGGCAGGCGGCTGAGGC 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    151 CGCCCGCGCCCAGGGGCCCCGAACGGTGGGGCCGGGCAGGCGGCTGAGGC 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh11961             201 CTGTCCCCTCAGTTCCCAGGTGCCATGAGGAAGCCTCGTCGGAAGTCCCG 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    201 CTGTCCCCTCAGTTCCCAGGTGCCATGAGGAAGCCTCGTCGGAAGTCCCG 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh11961             251 GCAGAATGCCGAGGGCCGGCGTTCCCCGTCCCCCTACAGTCTCAAGTGCT 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    251 GCAGAATGCCGAGGGCCGGCGTTCCCCGTCCCCCTACAGTCTCAAGTGCT 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh11961             301 CACCCACCCGGGAGACCCTGACATATGCCCAGGCCCAGCGGATTGTCGAG 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    301 CACCCACCCGGGAGACCCTGACATATGCCCAGGCCCAGCGGATTGTCGAG 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh11961             351 GTAGACATTGATGGACGCCTGCATCGTATCAGCATCTATGACCCACTCAA 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    351 GTAGACATTGATGGACGCCTGCATCGTATCAGCATCTATGACCCACTCAA 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh11961             401 AATCATTACTGAAGATGAGCTAACTGCCCAGGATATCACCGAATGCAATA 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    401 AATCATTACTGAAGATGAGCTAACTGCCCAGGATATCACCGAATGCAATA 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh11961             451 GTAACAAGGAAAACAGTGAACAGCCTCAGTTCCCTGGCAAGTCCAAGAAA 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    451 GTAACAAGGAAAACAGTGAACAGCCTCAGTTCCCTGGCAAGTCCAAGAAA 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh11961             501 CCCTCATCCAAGGGCAAAAAGAAGGAATCCTGCTCCAAGCATGCATCTGG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    501 CCCTCATCCAAGGGCAAAAAGAAGGAATCCTGCTCCAAGCATGCATCTGG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh11961             551 TACTTCCTTCCACCTCCCACAGCCCAGCTTCCGTATGGTGGACTCAGGCA 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    551 TACTTCCTTCCACCTCCCACAGCCCAGCTTCCGTATGGTGGACTCAGGCA 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh11961             601 TCCAGCCAGAAGCACCCCCGCTGCCTGCTGCCTACTACCGCTACATTGAG 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    601 TCCAGCCAGAAGCACCCCCGCTGCCTGCTGCCTACTACCGCTACATTGAG 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh11961             651 AAGCCACCTGAAGACCTGGATGCAGAGGTAGAGTATGACATGGATGAGGA 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    651 AAGCCACCTGAAGACCTGGATGCAGAGGTAGAGTATGACATGGATGAGGA 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh11961             701 GGACCTTGCCTGGCTGGACATGGTGAATGAAAAACGGCGAGTAGATGGGC 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    701 GGACCTTGCCTGGCTGGACATGGTGAATGAAAAACGGCGAGTAGATGGGC 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh11961             751 ACAGTTTGGTGTCTGCAGATACCTTTGAGCTGCTGGTAGACCGGCTTGAG 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    751 ACAGTTTGGTGTCTGCAGATACCTTTGAGCTGCTGGTAGACCGGCTTGAG 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hh11961             801 AAAGAGTCATACTTGGAGAGTCGCAGCAGTGGGGCCCAACAGTCACTCAT 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    801 AAAGAGTCATACTTGGAGAGTCGCAGCAGTGGGGCCCAACAGTCACTCAT 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hh11961             851 CGATGAAGACGCTTTCTGCTGTGTGTGCCTGGATGATGAATGTCACAATA 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    851 CGATGAAGACGCTTTCTGCTGTGTGTGCCTGGATGATGAATGTCACAATA 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hh11961             901 GCAATGTTATTCTCTTCTGTGACATCTGCAACCTGGCTGTACACCAGGAG 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    901 GCAATGTTATTCTCTTCTGTGACATCTGCAACCTGGCTGTACACCAGGAG 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh11961             951 TGCTATGGCGTCCCATACATCCCTGAGGGCCAGTGGCTATGCCGCTGCTG 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)    951 TGCTATGGCGTCCCATACATCCCTGAGGGCCAGTGGCTATGCCGCTGCTG 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh11961            1001 CCTGCAGTCTCCCTCCCGGCCTGTGGATTGCATCCTTTGCCCCAATAAGG 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1001 CCTGCAGTCTCCCTCCCGGCCTGTGGATTGCATCCTTTGCCCCAATAAGG 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh11961            1051 GTGGCGCCTTCAAACAGACCAGTGATGGGCACTGGGCCCATGTGGTGTGT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1051 GTGGCGCCTTCAAACAGACCAGTGATGGGCACTGGGCCCATGTGGTGTGT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh11961            1101 GCCATCTGGATCCCTGAAGTCTGCTTTGCTAACACCGTGTTCTTGGAACC 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1101 GCCATCTGGATCCCTGAAGTCTGCTTTGCTAACACCGTGTTCTTGGAACC 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh11961            1151 TATTGAGGGCATTGACAATATCCCGCCTGCCCGCTGGAAACTAACCTGCT 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1151 TATTGAGGGCATTGACAATATCCCGCCTGCCCGCTGGAAACTAACCTGCT 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh11961            1201 ATATCTGCAAGCAGAAAGGGCTAGGTGCAGCCATCCAGTGCCATAAGGTG 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1201 ATATCTGCAAGCAGAAAGGGCTAGGTGCAGCCATCCAGTGCCATAAGGTG 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh11961            1251 AACTGCTACACAGCATTCCATGTGACATGTGCACAGCGGGCTGGGCTCTT 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1251 AACTGCTACACAGCATTCCATGTGACATGTGCACAGCGGGCTGGGCTCTT 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh11961            1301 CATGAAGATTGAGCCCATGCGCGAAACCAGCCTCAATGGCACCATCTTTA 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1301 CATGAAGATTGAGCCCATGCGCGAAACCAGCCTCAATGGCACCATCTTTA 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh11961            1351 CAGTGCGCAAGACTGCCTACTGTGAGGCCCACTCGCCACCAGGTGCGGCC 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1351 CAGTGCGCAAGACTGCCTACTGTGAGGCCCACTCGCCACCAGGTGCGGCC 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh11961            1401 ACTGCTAGGAGGAAGGGCGACTCCCCTAGAAGCATCAGTGAGACTGGCGA 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1401 ACTGCTAGGAGGAAGGGCGACTCCCCTAGAAGCATCAGTGAGACTGGCGA 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh11961            1451 TGAGGAAGGGCTGAAGGAGGGTGATGGAGAGGAGGAAGAAGAGGAAGAGG 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1451 TGAGGAAGGGCTGAAGGAGGGTGATGGAGAGGAGGAAGAAGAGGAAGAGG 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh11961            1501 TGGAGGAAGAAGAGCAGGAAGCTCAAGGCGGGGTGAGTGGCTCCCTCAAG 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1501 TGGAGGAAGAAGAGCAGGAAGCTCAAGGCGGGGTGAGTGGCTCCCTCAAG 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh11961            1551 GGAGTGCCCAAGAAAAGCAAGATGAGTTTGAAGCAGAAGATCAAGAAGGA 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1551 GGAGTGCCCAAGAAAAGCAAGATGAGTTTGAAGCAGAAGATCAAGAAGGA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh11961            1601 GCCAGAGGAAGCAGGCCAAGACACACCCTCCACTCTCCCCATGCTTGCTG 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1601 GCCAGAGGAAGCAGGCCAAGACACACCCTCCACTCTCCCCATGCTTGCTG 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh11961            1651 TCCCACAGATACCCTCTTA------------------------------- 1669
                        |||||||||||||||||||                               
hh11961(revised)   1651 TCCCACAGATACCCTCTTACAGGTTGAACAAGATCTGTAGTGGTCTCTCC 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh11961            1670 -------------------------------------------------- 1670
                                                                          
hh11961(revised)   1701 TTTCAGAGGAAAAACCAGTTTATGCAGCGGCTTCACAATTATTGGCTGTT 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh11961            1670 -------------------------------------------------- 1670
                                                                          
hh11961(revised)   1751 GAAGCGGCAGGCACGGAATGGTGTCCCTCTTATCCGGCGCTTGCACTCCC 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh11961            1670 --------------------------CAGCGAGAGCAGGATGAGAAGACA 1693
                                                  ||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1801 ATCTGCAGTCCCAAAGAAACGCTGAGCAGCGAGAGCAGGATGAGAAGACA 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh11961            1694 AGTGCAGTGAAGGAGGAGCTGAAGTATTGGCAGAAGCTCCGGCATGACTT 1743
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1851 AGTGCAGTGAAGGAGGAGCTGAAGTATTGGCAGAAGCTCCGGCATGACTT 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh11961            1744 GGAGCGGGCGCGGCTGCTGATTGAGCTGATTCGGAAGAGAGAGAAGCTCA 1793
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1901 GGAGCGGGCGCGGCTGCTGATTGAGCTGATTCGGAAGAGAGAGAAGCTCA 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh11961            1794 AACGAGAGCAGGTCAAAGTCCAGCAGGCTGCCATGGAGCTGGAGCTGATG 1843
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   1951 AACGAGAGCAGGTCAAAGTCCAGCAGGCTGCCATGGAGCTGGAGCTGATG 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh11961            1844 CCATTCAATGTTCTGTTGAGGACAACACTGGACCTGCTGCAGGAGAAGGA 1893
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2001 CCATTCAATGTTCTGTTGAGGACAACACTGGACCTGCTGCAGGAGAAGGA 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh11961            1894 TCCTGCACACATCTTCGCAGAACCAGTCAACTTGAGTGAGGTTTTATATG 1943
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
hh11961(revised)   2051 TCCTGCACACATCTTCGCAGAACCAGTCAACTTGAGTGAG---------- 2090

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh11961            1944 TTTAGGTTCCAGATTACCTGGAATTCATATCCAAGCCAATGGATTTTTCT 1993
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2091 -----GTTCCAGATTACCTGGAATTCATATCCAAGCCAATGGATTTTTCT 2135

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh11961            1994 ACTATGAGGCGGAAGCTGGAGTCCCACCTGTACCGCACCTTGGAGGAGTT 2043
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2136 ACTATGAGGCGGAAGCTGGAGTCCCACCTGTACCGCACCTTGGAGGAGTT 2185

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh11961            2044 TGAGGAGGACTTTAACCTTATAGTTACCAACTGCATGAAGTATAATGCTA 2093
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2186 TGAGGAGGACTTTAACCTTATAGTTACCAACTGCATGAAGTATAATGCTA 2235

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh11961            2094 AAGACACAATTTTCCACCGAGCAGCTGTCCGCCTGCGGGACCTGGGAGGG 2143
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2236 AAGACACAATTTTCCACCGAGCAGCTGTCCGCCTGCGGGACCTGGGAGGG 2285

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh11961            2144 GCCATCCTACGGCACGCCCGGCGGCAGGCAGAGAACATCGGCTATGACCC 2193
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2286 GCCATCCTACGGCACGCCCGGCGGCAGGCAGAGAACATCGGCTATGACCC 2335

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh11961            2194 CGAGAGGGGCACTCACCTGCCCGAGTCACCCAAATTGGAAGACTTTTACC 2243
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2336 CGAGAGGGGCACTCACCTGCCCGAGTCACCCAAATTGGAAGACTTTTACC 2385

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh11961            2244 GCTTCTCCTGGGAAGACGTGGACAACATCCTCATCCCAGAGAACCGGGCC 2293
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2386 GCTTCTCCTGGGAAGACGTGGACAACATCCTCATCCCAGAGAACCGGGCC 2435

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh11961            2294 CATTTGTCCCCAGAGGTGCAGCTGAAGGAGCTGCTGGAGAAACTGGACCT 2343
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2436 CATTTGTCCCCAGAGGTGCAGCTGAAGGAGCTGCTGGAGAAACTGGACCT 2485

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh11961            2344 GGTGAGCGCCATGCGGTCCAGTGGGGCCCGCACCCGTCGTGTCCGCCTGC 2393
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2486 GGTGAGCGCCATGCGGTCCAGTGGGGCCCGCACCCGTCGTGTCCGCCTGC 2535

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh11961            2394 TACGCCGGGAGATCAATGCCCTTCGGCAGAAGCTGGCACAGCCACCACCA 2443
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2536 TACGCCGGGAGATCAATGCCCTTCGGCAGAAGCTGGCACAGCCACCACCA 2585

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh11961            2444 CCACAGCCACCATCACTCAACAAGACAGTATCCAATGGGGAGCTGCCAGC 2493
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2586 CCACAGCCACCATCACTCAACAAGACAGTATCCAATGGGGAGCTGCCAGC 2635

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh11961            2494 AGGGCCCCAGGGGGATGCAGCTGTGCTGGAGCAGGCCTTGCAGGAGGAGC 2543
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2636 AGGGCCCCAGGGGGATGCAGCTGTGCTGGAGCAGGCCTTGCAGGAGGAGC 2685

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh11961            2544 CAGAAGACGATGGGGACAGAGATGACTCCAAACTGCCTCCTCCGCCAACC 2593
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2686 CAGAAGACGATGGGGACAGAGATGACTCCAAACTGCCTCCTCCGCCAACC 2735

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh11961            2594 CTGGAGCCCACTGGGCCTGCACCTTCCTTGTCTGAGCAAGAATCCCCCCC 2643
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2736 CTGGAGCCCACTGGGCCTGCACCTTCCTTGTCTGAGCAAGAATCCCCCCC 2785

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh11961            2644 GGAGCCCCCTACTCTGAAACCCATTAATGATAGCAAACCTCCAAGCAGGT 2693
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2786 GGAGCCCCCTACTCTGAAACCCATTAATGATAGCAAACCTCCAAGCAGGT 2835

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh11961            2694 TCCTAAAGCCCAGAAAGGTGGAAGAAGATGAGCTCTTGGAAAAATCACCA 2743
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2836 TCCTAAAGCCCAGAAAGGTGGAAGAAGATGAGCTCTTGGAAAAATCACCA 2885

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh11961            2744 CTGCAGCTAGGGAATGAGCCTTTGCAACGCTTGCTCAGTGACAATGGCAT 2793
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2886 CTGCAGCTAGGGAATGAGCCTTTGCAACGCTTGCTCAGTGACAATGGCAT 2935

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh11961            2794 CAACAGACTATCCCTCATGGCCCCTGACACCCCGGCCGGTACCCCACTTA 2843
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2936 CAACAGACTATCCCTCATGGCCCCTGACACCCCGGCCGGTACCCCACTTA 2985

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh11961            2844 GTGGTGTGGGTCGCCGCACATCAGTCCTCTTCAAGAAGGCCAAGAATGGG 2893
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   2986 GTGGTGTGGGTCGCCGCACATCAGTCCTCTTCAAGAAGGCCAAGAATGGG 3035

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh11961            2894 GTTAAGCTACAGAGAAGCCCAGACAGGGTCCTGGAGAATGGCGAGGACCA 2943
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3036 GTTAAGCTACAGAGAAGCCCAGACAGGGTCCTGGAGAATGGCGAGGACCA 3085

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh11961            2944 TGGTGTGGCAGGCTCTCCTGCCTCTCCAGCCAGCATCGAGGAAGAGCGCC 2993
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3086 TGGTGTGGCAGGCTCTCCTGCCTCTCCAGCCAGCATCGAGGAAGAGCGCC 3135

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh11961            2994 ACTCCCGGAAGCGGCCAAGGAGCAGGAGCTGTAGTGAGAGCGAAGGGGAG 3043
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3136 ACTCCCGGAAGCGGCCAAGGAGCAGGAGCTGTAGTGAGAGCGAAGGGGAG 3185

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh11961            3044 AGGTCCCCCCAGCAGGAGGAAGAGACAGGCATGACCAACGGCTTTGGAAA 3093
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3186 AGGTCCCCCCAGCAGGAGGAAGAGACAGGCATGACCAACGGCTTTGGAAA 3235

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh11961            3094 ACACACCGAAAGCGGGTCTGACTCTGAATGTAGTTTGGGTCTCAGTGGTG 3143
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3236 ACACACCGAAAGCGGGTCTGACTCTGAATGTAGTTTGGGTCTCAGTGGTG 3285

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh11961            3144 GACTGGCATTTGAAGCTTGCAGTGGTCTGACGCCCCCCAAACGCAGCCGT 3193
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3286 GACTGGCATTTGAAGCTTGCAGTGGTCTGACGCCCCCCAAACGCAGCCGT 3335

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh11961            3194 GGGAAGCCAGCCCTGTCTCGAGTGCCCTTCCTGGAAGGTGTGAACGGAGA 3243
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3336 GGGAAGCCAGCCCTGTCTCGAGTGCCCTTCCTGGAAGGTGTGAACGGAGA 3385

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh11961            3244 CTCTGACTACAATGGCTCAGGCAGAAGCCTCCTGCTGCCCTTTGAAGACC 3293
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3386 CTCTGACTACAATGGCTCAGGCAGAAGCCTCCTGCTGCCCTTTGAAGACC 3435

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh11961            3294 GCGGAGACCTGAAGCCCTTGGAGCTGGTGTGGGCCAAGTGCCGAGGCTAC 3343
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3436 GCGGAGACCTGAAGCCCTTGGAGCTGGTGTGGGCCAAGTGCCGAGGCTAC 3485

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh11961            3344 CCCTCCTACCCTGCCTTGATCATCGATCCCAAGATGCCCCGGGAGGGCCT 3393
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3486 CCCTCCTACCCTGCCTTGATCATCGATCCCAAGATGCCCCGGGAGGGCCT 3535

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh11961            3394 CCTGCACAATGGCGTTCCCATCCCTGTCCCCCCGCTGGACGTGCTGAAGC 3443
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3536 CCTGCACAATGGCGTTCCCATCCCTGTCCCCCCGCTGGACGTGCTGAAGC 3585

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh11961            3444 TGGGAGAGCAGAAACAGGCAGAGGCTGGAGAGAAGCTCTTCCTTGTCCTC 3493
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3586 TGGGAGAGCAGAAACAGGCAGAGGCTGGAGAGAAGCTCTTCCTTGTCCTC 3635

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh11961            3494 TTCTTTGACAACAAGCGCACCTGGCAGTGGCTTCCAAGGGACAAAGTCCT 3543
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3636 TTCTTTGACAACAAGCGCACCTGGCAGTGGCTTCCAAGGGACAAAGTCCT 3685

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh11961            3544 GCCCTTGGGTGTGGAAGACACCGTGGACAAGCTCAAGATGCTGGAAGGCC 3593
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3686 GCCCTTGGGTGTGGAAGACACCGTGGACAAGCTCAAGATGCTGGAAGGCC 3735

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh11961            3594 GCAAGACCAGCATCCGCAAGTCAGTGCAGGTGGCCTATGACCGTGCGATG 3643
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3736 GCAAGACCAGCATCCGCAAGTCAGTGCAGGTGGCCTATGACCGTGCGATG 3785

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh11961            3644 ATCCACCTGAGCAGAGTCCGGGGGCCCCACTCCTTCGTCACTTCCAGCTA 3693
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3786 ATCCACCTGAGCAGAGTCCGGGGGCCCCACTCCTTCGTCACTTCCAGCTA 3835

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh11961            3694 CCTGTAAGGGCAGGGCTGGCCTGCATCCGCTTGCCCTGCCCCCATCCCGC 3743
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3836 CCTGTAAGGGCAGGGCTGGCCTGCATCCGCTTGCCCTGCCCCCATCCCGC 3885

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh11961            3744 AGGGCACAGAGAAGCCTCTTCTGCCCCTGCCAGATGTATGGCCGGCAGCT 3793
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3886 AGGGCACAGAGAAGCCTCTTCTGCCCCTGCCAGATGTATGGCCGGCAGCT 3935

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh11961            3794 TCCCCCTCTCATGGTAGGCCAGGGACTGGGCTTTCTCCCCACTAAGGGCA 3843
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3936 TCCCCCTCTCATGGTAGGCCAGGGACTGGGCTTTCTCCCCACTAAGGGCA 3985

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh11961            3844 AGGCCCCAGTTTTGACCAATCGCATGGTTCTCCTGGCAGGCCTGCTGTGT 3893
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   3986 AGGCCCCAGTTTTGACCAATCGCATGGTTCTCCTGGCAGGCCTGCTGTGT 4035

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh11961            3894 GCCAAAAACTCCCACCCAAGGTCCCTCAGGGGATATTTCACTGAAGAACC 3943
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4036 GCCAAAAACTCCCACCCAAGGTCCCTCAGGGGATATTTCACTGAAGAACC 4085

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh11961            3944 AGTTAGAAGTAGAAACAGCTGTGGGGCTTGGGCCCAGCTTAGGAGATTGC 3993
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4086 AGTTAGAAGTAGAAACAGCTGTGGGGCTTGGGCCCAGCTTAGGAGATTGC 4135

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh11961            3994 CCAGATGGCAAGAGGTCCTGGGCTCCTTCTTGAGGGGCTGCCTGGCCCGC 4043
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4136 CCAGATGGCAAGAGGTCCTGGGCTCCTTCTTGAGGGGCTGCCTGGCCCGC 4185

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh11961            4044 TCCATCCTACTCCCACTAACTACACCTCAGGGCGGGTGAGGTTCCGACAC 4093
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4186 TCCATCCTACTCCCACTAACTACACCTCAGGGCGGGTGAGGTTCCGACAC 4235

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh11961            4094 TGATCCCAGAGATGCCGTGGATACGCCAGGGTCCCAGGGGGAATCTCCCC 4143
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4236 TGATCCCAGAGATGCCGTGGATACGCCAGGGTCCCAGGGGGAATCTCCCC 4285

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh11961            4144 AAGCTCACACTCTCTCCCGCTTATCGCCTATTCTCACACCTCTTCTCGGT 4193
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4286 AAGCTCACACTCTCTCCCGCTTATCGCCTATTCTCACACCTCTTCTCGGT 4335

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh11961            4194 CCCATCTTCTGCACCCATTGCCCAGTCTTGCTTTCTCTTTCCCATATTCC 4243
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4336 CCCATCTTCTGCACCCATTGCCCAGTCTTGCTTTCTCTTTCCCATATTCC 4385

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh11961            4244 TTTTCTTTTTCTCTTGTGCCAAACTGACAGAAACCGTCACCACACTGGTC 4293
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4386 TTTTCTTTTTCTCTTGTGCCAAACTGACAGAAACCGTCACCACACTGGTC 4435

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh11961            4294 TTTTTCTTTAATGTCTCATTCCCCTTGAGGCCAGCTGCTATGCCAGGTGG 4343
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4436 TTTTTCTTTAATGTCTCATTCCCCTTGAGGCCAGCTGCTATGCCAGGTGG 4485

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh11961            4344 TGTCTCTGCCAGGCTCCTCAGGCCCAGACAGAGGCCAGCCCACAACCTAT 4393
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4486 TGTCTCTGCCAGGCTCCTCAGGCCCAGACAGAGGCCAGCCCACAACCTAT 4535

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh11961            4394 GACCCCCTCCCCCAGGACACCACCTCCCACCCACAGACCTTCCCTTTAGC 4443
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4536 GACCCCCTCCCCCAGGACACCACCTCCCACCCACAGACCTTCCCTTTAGC 4585

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh11961            4444 TGTTGACACAACTTCCCAGCTCTGCAAGTGTGCCCCCTGGATCAAGGCGG 4493
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4586 TGTTGACACAACTTCCCAGCTCTGCAAGTGTGCCCCCTGGATCAAGGCGG 4635

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh11961            4494 GTCCCCTCTTGTTTTTTTCTTTGCTGCCACGAGGTGGTCCAAGCCTTCAG 4543
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4636 GTCCCCTCTTGTTTTTTTCTTTGCTGCCACGAGGTGGTCCAAGCCTTCAG 4685

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh11961            4544 GGTGGGCTCCTATCAGGCTGGGTGTGCGAGTGTCCATCTGTCCACATGGA 4593
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4686 GGTGGGCTCCTATCAGGCTGGGTGTGCGAGTGTCCATCTGTCCACATGGA 4735

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh11961            4594 TGTCGAGGGTGGTTTGTGTGGAGCTGTGCTCGTCAGCTGGGTCTGCCCTC 4643
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4736 TGTCGAGGGTGGTTTGTGTGGAGCTGTGCTCGTCAGCTGGGTCTGCCCTC 4785

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh11961            4644 TTCCCCCTTTTCTCCTTCTTCTCTCCTCATGGACTTTTTCTGCAATTGCA 4693
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4786 TTCCCCCTTTTCTCCTTCTTCTCTCCTCATGGACTTTTTCTGCAATTGCA 4835

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh11961            4694 GTCTTAAGCTTCACTCTCCACCACCTGGATGGCATGGCGCCTGCCACCAA 4743
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4836 GTCTTAAGCTTCACTCTCCACCACCTGGATGGCATGGCGCCTGCCACCAA 4885

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh11961            4744 ACATCTTCCTGGCCTGCGCTCTGCCCTGCCCTGCCTAGCCTCTGCTACTC 4793
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4886 ACATCTTCCTGGCCTGCGCTCTGCCCTGCCCTGCCTAGCCTCTGCTACTC 4935

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh11961            4794 CCACTTCCCAACTCCAGGGAATGCATTACTTTTATTTCAAACCCTCTGCC 4843
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4936 CCACTTCCCAACTCCAGGGAATGCATTACTTTTATTTCAAACCCTCTGCC 4985

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh11961            4844 TCCTTCCTTCTTTCTCTTCAACCCCCTCCCCACCTTCACCTTCTCAAAAA 4893
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   4986 TCCTTCCTTCTTTCTCTTCAACCCCCTCCCCACCTTCACCTTCTCAAAAA 5035

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh11961            4894 TGGAAGGAAAAAAAAACTGTGAATGGGGAATGCTGACTGACAAACCAACA 4943
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5036 TGGAAGGAAAAAAAAACTGTGAATGGGGAATGCTGACTGACAAACCAACA 5085

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh11961            4944 CAACTTTCAGAGGCTTCAGTGTCTGTTCTCTGGACATTTCTTTTCACCTC 4993
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5086 CAACTTTCAGAGGCTTCAGTGTCTGTTCTCTGGACATTTCTTTTCACCTC 5135

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh11961            4994 CTGAGCACCAAAGTCGCAGGGCCAGTTGCAGGCCGCTGATTGCCATGTTG 5043
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5136 CTGAGCACCAAAGTCGCAGGGCCAGTTGCAGGCCGCTGATTGCCATGTTG 5185

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh11961            5044 ATTTTTAACCTGATATTCTTTTTAATTGTTTTAAATTTTTCATAGGGGAG 5093
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5186 ATTTTTAACCTGATATTCTTTTTAATTGTTTTAAATTTTTCATAGGGGAG 5235

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh11961            5094 TTTTGGACAAAACAGTCACTGGGGAGATCACTGCCATTTTTACACACTTG 5143
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5236 TTTTGGACAAAACAGTCACTGGGGAGATCACTGCCATTTTTACACACTTG 5285

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh11961            5144 ACTTTTTAAAAATACAACCAACCAACCACCACAACTTCTTATACATTTGG 5193
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5286 ACTTTTTAAAAATACAACCAACCAACCACCACAACTTCTTATACATTTGG 5335

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hh11961            5194 GACATGAGCCAGAGTTTAAAAGGGAACCAACAAAACACTATAACTTAAAA 5243
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5336 GACATGAGCCAGAGTTTAAAAGGGAACCAACAAAACACTATAACTTAAAA 5385

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hh11961            5244 GGATGGGGTTTTGGATTTTGTATAATAATAAAAACAATACAGCATATGGC 5293
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5386 GGATGGGGTTTTGGATTTTGTATAATAATAAAAACAATACAGCATATGGC 5435

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hh11961            5294 TAGGGAAGGACATGGTGTATATAATTGTAAAATACTGTTCTAAATTATTC 5343
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5436 TAGGGAAGGACATGGTGTATATAATTGTAAAATACTGTTCTAAATTATTC 5485

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hh11961            5344 AGGCCTATAGTTTCCATTACTGGAGTCCTCCATTGTGTGGCCACACAGTG 5393
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5486 AGGCCTATAGTTTCCATTACTGGAGTCCTCCATTGTGTGGCCACACAGTG 5535

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hh11961            5394 TCGTTGATTTAAAGGAGCCAGTGCTTCCCCTCTCCCCAGGTAGTTGGTCA 5443
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5536 TCGTTGATTTAAAGGAGCCAGTGCTTCCCCTCTCCCCAGGTAGTTGGTCA 5585

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hh11961            5444 GCTGTGGACTCTGTGACCTTTGTCTAAACCTGTGTTGTAAGATCTTGGGA 5493
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5586 GCTGTGGACTCTGTGACCTTTGTCTAAACCTGTGTTGTAAGATCTTGGGA 5635

                   5651          .         .         .         .         . 5700
hh11961            5494 CTTCCTCTCTTTCTATGTCTATCTCTTCCCCCCAACACTTTCTCTTCTTA 5543
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5636 CTTCCTCTCTTTCTATGTCTATCTCTTCCCCCCAACACTTTCTCTTCTTA 5685

                   5701          .         .         .         .         . 5750
hh11961            5544 GTCTCTCTCTTTATTTTTCAATCTCTGAATATTTTAGTCTCTCTCTGAGT 5593
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5686 GTCTCTCTCTTTATTTTTCAATCTCTGAATATTTTAGTCTCTCTCTGAGT 5735

                   5751          .         .         .         .         . 5800
hh11961            5594 CTCATTTTTTAAAATGCTCTTTTAGAACGGGAAACGGCTCAGATCCTGCT 5643
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5736 CTCATTTTTTAAAATGCTCTTTTAGAACGGGAAACGGCTCAGATCCTGCT 5785

                   5801          .         .         .         .         . 5850
hh11961            5644 GTGGCACGGGGCCTATGTGTCTCTGTCGCGTCTGCTGTGAAGCACATGAT 5693
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5786 GTGGCACGGGGCCTATGTGTCTCTGTCGCGTCTGCTGTGAAGCACATGAT 5835

                   5851          .         .         .         .         . 5900
hh11961            5694 GCTCTATTTATTGTAGAGAGTGACTTTATTTGCTTTCTAGAATTGTTTAT 5743
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5836 GCTCTATTTATTGTAGAGAGTGACTTTATTTGCTTTCTAGAATTGTTTAT 5885

                   5901          .         .         .         .         . 5950
hh11961            5744 AACAGATGGTATAAGAGAGGTAATAAACAGAGAAAAATCTATGCTTGTAA 5793
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5886 AACAGATGGTATAAGAGAGGTAATAAACAGAGAAAAATCTATGCTTGTAA 5935

                   5951          .         .         .         .         . 6000
hh11961            5794 AGAATACAAAAGTTAATTTTACCTACTATAATATGACTGTCTGAAACTTA 5843
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5936 AGAATACAAAAGTTAATTTTACCTACTATAATATGACTGTCTGAAACTTA 5985

                   6001          .         .         .    6033
hh11961            5844 TTTTCTCTCTGAGAAATAAATGTTCTAATGGGC 5876
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||
hh11961(revised)   5986 TTTTCTCTCTGAGAAATAAATGTTCTAATGGGC 6018