Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5752 bp
Revised DNA sequence, length = 6269 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05077   555 -   575     CGA GTT CTG CGT GTT TGT GTA
     r NN05078  1290 -  1270     GCT TCT TCT CCC TGT GAT TTG
 2 : f NN05079  2899 -  2919     CAC ACC TCT TCA AGT ATT TCC
     r NN05080  4187 -  4167     AAT AAG GTC CAC AGA CAG GTT
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   856 -  1021      166-bp insertion (in the revised sequence)
 2 :  3143 -  3269      127-bp insertion (in the revised sequence)
 3 :  3759 -  3982      224-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 834 - 5873 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh04104               1 CAGCTCTGGCAGAAGCAACGGTGGCTTCGAGGGATGGCGGCGGCTGCAAC 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)      1 CAGCTCTGGCAGAAGCAACGGTGGCTTCGAGGGATGGCGGCGGCTGCAAC 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh04104              51 AGGACCTGCAGCATCCCAGAGGAACTGACTAAGACTTTGGAACAGAAACC 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)     51 AGGACCTGCAGCATCCCAGAGGAACTGACTAAGACTTTGGAACAGAAACC 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh04104             101 AGATGATGCACAATATTATCGTCAAAGAGCTTATTGTCACATTCTTCTTG 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    101 AGATGATGCACAATATTATCGTCAAAGAGCTTATTGTCACATTCTTCTTG 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh04104             151 GGAATTACTGTGGTGCAGATGCTAATTTCAGTGACTGGATTAAAAGGTGT 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    151 GGAATTACTGTGGTGCAGATGCTAATTTCAGTGACTGGATTAAAAGGTGT 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh04104             201 CGAAGCTCAGAATGGCTCGGAATCTGAGGTGTTTGTGGGGAAGTATGAGA 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    201 CGAAGCTCAGAATGGCTCGGAATCTGAGGTGTTTGTGGGGAAGTATGAGA 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh04104             251 CCCTCGTGTTTTACTGGCCCTCGCTGCTGTGCCTTGCCTTCCTGCTGGGC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    251 CCCTCGTGTTTTACTGGCCCTCGCTGCTGTGCCTTGCCTTCCTGCTGGGC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh04104             301 CGCTTCCTGCATATGTTTGTCAAGGCTCTGAGGGTGCACCTCGGCTGGGA 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    301 CGCTTCCTGCATATGTTTGTCAAGGCTCTGAGGGTGCACCTCGGCTGGGA 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh04104             351 GCTCCAGGTGGAAGAAAAATCTGTCCTGGAAGTGCACCAGGGAGAGCACG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    351 GCTCCAGGTGGAAGAAAAATCTGTCCTGGAAGTGCACCAGGGAGAGCACG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh04104             401 TCAAGCAGCTCCTGAGGATACCCCGCCCTCAAGAGAAAAAAAAGTCTTGG 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    401 TCAAGCAGCTCCTGAGGATACCCCGCCCTCAAGAGAAAAAAAAGTCTTGG 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh04104             451 TTCCAAACCAGGATATATGAGTGGGATCCCTGCTTTCAATTTCCAAGCAG 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    451 TTCCAAACCAGGATATATGAGTGGGATCCCTGCTTTCAATTTCCAAGCAG 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh04104             501 AATGATTGGAACCATTGTGTTGGCATTCATCTGCCTGTATCTTTTCATTG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    501 AATGATTGGAACCATTGTGTTGGCATTCATCTGCCTGTATCTTTTCATTG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh04104             551 TCATCGAGTTCTGCGTGTTTGTGTACGTGAGAGATGAGTTGGATGTGCTT 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    551 TCATCGAGTTCTGCGTGTTTGTGTACGTGAGAGATGAGTTGGATGTGCTT 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh04104             601 GAAAACAACCTGGAAAGCTACATCACCTTCACGAACCATTCAGGGGTCCT 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    601 GAAAACAACCTGGAAAGCTACATCACCTTCACGAACCATTCAGGGGTCCT 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh04104             651 GACCCCAGTCATCCTGCAGGTGAAAGAGCTGATCAGTGTCACCAAAGGAG 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    651 GACCCCAGTCATCCTGCAGGTGAAAGAGCTGATCAGTGTCACCAAAGGAG 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh04104             701 TCTGGGTGGCGACCATTTTGCCCGCGTATCTCACGTGTGTGAGCTATCTG 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    701 TCTGGGTGGCGACCATTTTGCCCGCGTATCTCACGTGTGTGAGCTATCTG 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh04104             751 TTCCACATTTTGGTCTGTTACAGAAAGCACATGAAGAGGCTATGGGCAGG 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    751 TTCCACATTTTGGTCTGTTACAGAAAGCACATGAAGAGGCTATGGGCAGG 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hh04104             801 AGATAAACATTTTCTTCCTTTGAAGTTCCATAACCCGGCCTCGTCGGAGA 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)    801 AGATAAACATTTTCTTCCTTTGAAGTTCCATAACCCGGCCTCGTCGGAGA 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hh04104             851 GCATG--------------------------------------------- 855
                        |||||                                             
hh04104(revised)    851 GCATGGTGGCCATTGCAAGGTACTCTGGCTGGCAAATAGCCTATATTCTG 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hh04104             856 -------------------------------------------------- 856
                                                                          
hh04104(revised)    901 TGGGGCTACCTCATCATTCACATGGTACAGAGCCTATGTGGCATGGCAAT 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh04104             856 -------------------------------------------------- 856
                                                                          
hh04104(revised)    951 CATGTACAGCCTGGTGCTACCCATCGTCCAAACCAGGGCCTGGAAATGCT 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh04104             856 ---------------------GAAAGCGTTCCACAACTTCAACTACTTTC 884
                                             |||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1001 GCAAGGGCTGGGCATTGGGATGAAAGCGTTCCACAACTTCAACTACTTTC 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh04104             885 TGTTCTTCTACAACGTGCTGCTGGGCCTGGGTGCCTGCCTTTCCAGGCTG 934
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1051 TGTTCTTCTACAACGTGCTGCTGGGCCTGGGTGCCTGCCTTTCCAGGCTG 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh04104             935 CTCATCAGTTGCCTCCTCGGCATGTGGCTGATTGCCCGCATCGACAGGAC 984
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1101 CTCATCAGTTGCCTCCTCGGCATGTGGCTGATTGCCCGCATCGACAGGAC 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh04104             985 CATCATGCAGAGTGGCTATGAGGGAGCAGACATGGGGTTCAGTGCATGGA 1034
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1151 CATCATGCAGAGTGGCTATGAGGGAGCAGACATGGGGTTCAGTGCATGGA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh04104            1035 TTGGGATGCTCTACATGGACCATTATCACATCAACCCTGTGCTTGTCAGC 1084
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1201 TTGGGATGCTCTACATGGACCATTATCACATCAACCCTGTGCTTGTCAGC 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh04104            1085 TTTTGCCACATCCTGATCACAAATCACAGGGAGAAGAAGCTGCAGCAGAG 1134
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1251 TTTTGCCACATCCTGATCACAAATCACAGGGAGAAGAAGCTGCAGCAGAG 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh04104            1135 CACCAAATACTGGTGCCTAAATCAATCGGCAGAGTCCCTTCGGATTTGCG 1184
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1301 CACCAAATACTGGTGCCTAAATCAATCGGCAGAGTCCCTTCGGATTTGCG 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh04104            1185 CCATGCGCGGCGGGGAGAACCGGCCTCCTGCTCGAGTTCAGAGCTCATCT 1234
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1351 CCATGCGCGGCGGGGAGAACCGGCCTCCTGCTCGAGTTCAGAGCTCATCT 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh04104            1235 GAGGAATTGGAATTGAGACACCAAAGCCTAGACGCGTTTCCTGGACGACG 1284
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1401 GAGGAATTGGAATTGAGACACCAAAGCCTAGACGCGTTTCCTGGACGACG 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh04104            1285 GCTTCCCGGCAGGGGCATCCAGCCAGCGGCCAAGATGTCGTCAGTGGGGA 1334
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1451 GCTTCCCGGCAGGGGCATCCAGCCAGCGGCCAAGATGTCGTCAGTGGGGA 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh04104            1335 AGGTGACCCAGGTTCCGAATGGGAAAGCCTACCAGCAGATCTTCCAGGCT 1384
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1501 AGGTGACCCAGGTTCCGAATGGGAAAGCCTACCAGCAGATCTTCCAGGCT 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh04104            1385 GAGGTGCAGCTGGTCCACTCCCTGGCGGCCACCAGGAAGCGGGCTGCAGA 1434
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1551 GAGGTGCAGCTGGTCCACTCCCTGGCGGCCACCAGGAAGCGGGCTGCAGA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh04104            1435 GCGTTCTGTGACCCTGAAGAGTGGCAGGATACCCATGATGAAGAAGGTGG 1484
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1601 GCGTTCTGTGACCCTGAAGAGTGGCAGGATACCCATGATGAAGAAGGTGG 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh04104            1485 AGACTCCTGAAGGGGAGGTGATGTCTCCCCGACAGCAGAAGTGGATGCAC 1534
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1651 AGACTCCTGAAGGGGAGGTGATGTCTCCCCGACAGCAGAAGTGGATGCAC 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh04104            1535 AGCCTCCCCAACGACTGGATCATGGAAAACCCTGTTCTCCACAGGGAAAA 1584
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1701 AGCCTCCCCAACGACTGGATCATGGAAAACCCTGTTCTCCACAGGGAAAA 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh04104            1585 GGAAAGAGCCAAGAGGGAAAAAGCCCGAGAGAGTGAGAACACCATCGCTG 1634
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1751 GGAAAGAGCCAAGAGGGAAAAAGCCCGAGAGAGTGAGAACACCATCGCTG 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh04104            1635 CCCGAGAAGTGCGGGGTCTCATGGATACTATAGTTCCTGAGAAGATAAGC 1684
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1801 CCCGAGAAGTGCGGGGTCTCATGGATACTATAGTTCCTGAGAAGATAAGC 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh04104            1685 ACCAGCACCTTTCAAAGGCAAGCAGAACACAAGAGGAAGAGCTACGAGAG 1734
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1851 ACCAGCACCTTTCAAAGGCAAGCAGAACACAAGAGGAAGAGCTACGAGAG 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh04104            1735 CGCTCTGGCCAGCTTTCAGGAGGAGATTGCGCAGGTGGGAAAGGAAATGG 1784
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1901 CGCTCTGGCCAGCTTTCAGGAGGAGATTGCGCAGGTGGGAAAGGAAATGG 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh04104            1785 AACCTCTCATCGTGGACACAGGGGGACTTTTTTTGAAGAAGCTGACTGAG 1834
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   1951 AACCTCTCATCGTGGACACAGGGGGACTTTTTTTGAAGAAGCTGACTGAG 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh04104            1835 TCTGATGAAGAAATGAACCGTCTCTTCCTAAAGGTGGAAAATGACACCAA 1884
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2001 TCTGATGAAGAAATGAACCGTCTCTTCCTAAAGGTGGAAAATGACACCAA 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh04104            1885 CCTTGAGGACTACACCATCCAAGCCCTGCTGGAGCTGTGGGATAAGGTGG 1934
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2051 CCTTGAGGACTACACCATCCAAGCCCTGCTGGAGCTGTGGGATAAGGTGG 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh04104            1935 CCGGGCGGTTACTGCTCCGGAAGCAGGAGATTAAGGAGCTGGATGAGGCC 1984
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2101 CCGGGCGGTTACTGCTCCGGAAGCAGGAGATTAAGGAGCTGGATGAGGCC 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh04104            1985 CTGCACTCGCTGGAGTTCTCCCGAACCGATAAACTAAAAAGCGTGTTGAA 2034
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2151 CTGCACTCGCTGGAGTTCTCCCGAACCGATAAACTAAAAAGCGTGTTGAA 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh04104            2035 GAAATATGCAGAAGTCATAGAGAAAACTTCCTACCTCATGCGGCCCGAAG 2084
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2201 GAAATATGCAGAAGTCATAGAGAAAACTTCCTACCTCATGCGGCCCGAAG 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh04104            2085 TGTACAGGCTGATAAATGAAGAAGCCATGGTCATGAACTATGCCCTGCTG 2134
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2251 TGTACAGGCTGATAAATGAAGAAGCCATGGTCATGAACTATGCCCTGCTG 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh04104            2135 GGCAACCGGAAGGCTCTCGCCCAGCTGTTTGTCAACCTGATGGAGTCCAC 2184
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2301 GGCAACCGGAAGGCTCTCGCCCAGCTGTTTGTCAACCTGATGGAGTCCAC 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh04104            2185 CCTGCAGCAGGAGCTGGACAGCCGCCACCGCTGGCAAGGCTTGGTGGACA 2234
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2351 CCTGCAGCAGGAGCTGGACAGCCGCCACCGCTGGCAAGGCTTGGTGGACA 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh04104            2235 CCTGGAAGGCTCTCAAGAAGGAGGCCCTGCTGCAGAGTTTCAGTGAGTTC 2284
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2401 CCTGGAAGGCTCTCAAGAAGGAGGCCCTGCTGCAGAGTTTCAGTGAGTTC 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh04104            2285 ATGGCCAGTGAGAGTATCCATACTCCCCCGGCTGTGACGAAGGAGCTAGA 2334
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2451 ATGGCCAGTGAGAGTATCCATACTCCCCCGGCTGTGACGAAGGAGCTAGA 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh04104            2335 GGTCATGCTGAAGACCCAGAACGTCCTGCAGCAAAGGCGGCTGAAGCATC 2384
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2501 GGTCATGCTGAAGACCCAGAACGTCCTGCAGCAAAGGCGGCTGAAGCATC 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh04104            2385 TCTGCACCATCTGTGACCTCCTGCCCCCCAGTTACAGCAAAACTCAGCTG 2434
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2551 TCTGCACCATCTGTGACCTCCTGCCCCCCAGTTACAGCAAAACTCAGCTG 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh04104            2435 ACTGAGTGGCATTCTTCCCTCAACTCCCTGAACAAGGAGCTAGACACCTA 2484
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2601 ACTGAGTGGCATTCTTCCCTCAACTCCCTGAACAAGGAGCTAGACACCTA 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh04104            2485 CCACGTGGACTGCATGATGTGGATCCGCCTGCTGTATGAGAAGACATGGC 2534
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2651 CCACGTGGACTGCATGATGTGGATCCGCCTGCTGTATGAGAAGACATGGC 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh04104            2535 AGGAGTGCCTGATGCATGTGCAGAATTGTAAGAAGCAGCTGCTGGACTGG 2584
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2701 AGGAGTGCCTGATGCATGTGCAGAATTGTAAGAAGCAGCTGCTGGACTGG 2750

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh04104            2585 AAAGCCTTCACTGAGGAGGAGGCAGAGACCCTGGTGAACCAGTTCTTCTT 2634
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2751 AAAGCCTTCACTGAGGAGGAGGCAGAGACCCTGGTGAACCAGTTCTTCTT 2800

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh04104            2635 CCAGATGGTGGGAGCACTCCAGGGCAAAGTGGAGGAGGACCTGGAGCTCT 2684
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2801 CCAGATGGTGGGAGCACTCCAGGGCAAAGTGGAGGAGGACCTGGAGCTCT 2850

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh04104            2685 TGGACAAATCCTTCGAGACTCTGGCAGATCAGACAGAGTGGCAGAGTTCA 2734
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2851 TGGACAAATCCTTCGAGACTCTGGCAGATCAGACAGAGTGGCAGAGTTCA 2900

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh04104            2735 CACCTCTTCAAGTATTTCCAGGAGGTGGTACAACTGTGGGAGGCACACCA 2784
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2901 CACCTCTTCAAGTATTTCCAGGAGGTGGTACAACTGTGGGAGGCACACCA 2950

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh04104            2785 GAGCGAGCTGTTGGTGCAGGAGCTGGAGCTGGAGAAGAGGATGGAGCAGC 2834
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   2951 GAGCGAGCTGTTGGTGCAGGAGCTGGAGCTGGAGAAGAGGATGGAGCAGC 3000

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh04104            2835 ACCGGCAGAAGCACAGCCTGGAGAGCCAGGTGCAGGAGGCCCACCTCGAT 2884
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3001 ACCGGCAGAAGCACAGCCTGGAGAGCCAGGTGCAGGAGGCCCACCTCGAT 3050

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh04104            2885 AGGCTCTTGGACCAACTGAGGCAGCAAAGTGACAAAGAAACACTGGCGTT 2934
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3051 AGGCTCTTGGACCAACTGAGGCAGCAAAGTGACAAAGAAACACTGGCGTT 3100

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh04104            2935 TCACCTGGAAAAGGTCAAAGATTATCTGAAGAACATGAAATC-------- 2976
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
hh04104(revised)   3101 TCACCTGGAAAAGGTCAAAGATTATCTGAAGAACATGAAATCCAGGTATG 3150

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh04104            2977 -------------------------------------------------- 2977
                                                                          
hh04104(revised)   3151 AATGTTTTCACACCCTCCTGACAAAGGAAGTGATGGAGTACCCAGCGATC 3200

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh04104            2977 -------------------------------------------------- 2977
                                                                          
hh04104(revised)   3201 ATGCTGAAAGAACTCAACTCCTACAGCTCTGCCCTCAGCCAATACTTCTT 3250

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh04104            2977 -------------------CAGAACTTGGCTGGAGAAGTCATTTTCAAAT 3007
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3251 TGTGCGTGAAATCTTTGAACAGAACTTGGCTGGAGAAGTCATTTTCAAAT 3300

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh04104            3008 TCAGGCAACCAGAAGCACATGAAAAACCCTCCCAGAAGAGAGTGAAAAAA 3057
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3301 TCAGGCAACCAGAAGCACATGAAAAACCCTCCCAGAAGAGAGTGAAAAAA 3350

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh04104            3058 CTGAGGAAGAAGCAAGGGTCTAAAGAGGACATGACCAGAAGTGAGGAAAG 3107
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3351 CTGAGGAAGAAGCAAGGGTCTAAAGAGGACATGACCAGAAGTGAGGAAAG 3400

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh04104            3108 CATAAGTAGTGGGACAAGTACTGCCAGGTCAGTAGAAGAGGTGGAAGAAG 3157
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3401 CATAAGTAGTGGGACAAGTACTGCCAGGTCAGTAGAAGAGGTGGAAGAAG 3450

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh04104            3158 AAAACGATCAAGAAATGGAGTCCTTCATAACTGAAGAGGTGCTGGGGCAG 3207
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3451 AAAACGATCAAGAAATGGAGTCCTTCATAACTGAAGAGGTGCTGGGGCAG 3500

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh04104            3208 CAGAAAAAATCTCCACTGCATGCTAAGATGGATGAGTCCAAAGAAGGCTC 3257
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3501 CAGAAAAAATCTCCACTGCATGCTAAGATGGATGAGTCCAAAGAAGGCTC 3550

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh04104            3258 TATTCAGGGACTGGAAGAAATGCAGGTTGAAAGAGAGGGCTCCTTAAACC 3307
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3551 TATTCAGGGACTGGAAGAAATGCAGGTTGAAAGAGAGGGCTCCTTAAACC 3600

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh04104            3308 CATCCCTGAATGAGGAGAATGTGAAGGGTCAAGGAGAAAAGAAGGAGGAG 3357
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3601 CATCCCTGAATGAGGAGAATGTGAAGGGTCAAGGAGAAAAGAAGGAGGAG 3650

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh04104            3358 TCAGAGGAGGAAGATGAGAAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGAAGCTGGA 3407
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3651 TCAGAGGAGGAAGATGAGAAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGAAGCTGGA 3700

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh04104            3408 GGAAGAGAAGGAGGAGAAGGAGGCACAGGAAGAGCAAGAGAGTTTATCTG 3457
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3701 GGAAGAGAAGGAGGAGAAGGAGGCACAGGAAGAGCAAGAGAGTTTATCTG 3750

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh04104            3458 TGGGTGAG------------------------------------------ 3465
                        ||||||||                                          
hh04104(revised)   3751 TGGGTGAGGAAGAAGACAAGGAAGAGGGTCTAGAGGAGATATACTATGAG 3800

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh04104            3466 -------------------------------------------------- 3466
                                                                          
hh04104(revised)   3801 GACATGGAGTCCTTCACAATCTCCAGTGGAAACACTTATTTTGTCTTTGT 3850

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh04104            3466 -------------------------------------------------- 3466
                                                                          
hh04104(revised)   3851 ACCCCTGGAAGAAGAGCATTGTAGGAAGTCCCATTCCACCTTCTCAGCCA 3900

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh04104            3466 -------------------------------------------------- 3466
                                                                          
hh04104(revised)   3901 TGTTCATCAACGACACTTCCAGTGCCAAGTTCATAGAACAAGTGACAATT 3950

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh04104            3466 --------------------------------ATTGTTTTCAGAGGGAGG 3483
                                                        ||||||||||||||||||
hh04104(revised)   3951 CCATCGAGACTAATTTTAGAAATTAAGAAACAATTGTTTTCAGAGGGAGG 4000

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh04104            3484 CAACTTTTCTCCTAAAGAAATCAATTCACTGTGTTCCCGACTGGAGAAGG 3533
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4001 CAACTTTTCTCCTAAAGAAATCAATTCACTGTGTTCCCGACTGGAGAAGG 4050

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh04104            3534 AAGCTGCCCGGATAGAGTTGGTTGAAAGTGTCATCATGCTCAACATGGAG 3583
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4051 AAGCTGCCCGGATAGAGTTGGTTGAAAGTGTCATCATGCTCAACATGGAG 4100

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh04104            3584 AAGTTGGAGAATGAGTACCTGGACCAGGCCAATGATGTCATCAACAAGTT 3633
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4101 AAGTTGGAGAATGAGTACCTGGACCAGGCCAATGATGTCATCAACAAGTT 4150

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh04104            3634 TGAAAGCAAATTCCATAACCTGTCTGTGGACCTTATTTTCATAGAGAAAA 3683
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4151 TGAAAGCAAATTCCATAACCTGTCTGTGGACCTTATTTTCATAGAGAAAA 4200

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh04104            3684 TCCAGCGGTTGCTGACGAATCTGCAAGTGAAAATCAAGTGCCAGGTGGCA 3733
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4201 TCCAGCGGTTGCTGACGAATCTGCAAGTGAAAATCAAGTGCCAGGTGGCA 4250

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh04104            3734 AAATCCAATTCGCAAACAAATGGATTAAATTTCTCTCTGCAACAGCTTCA 3783
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4251 AAATCCAATTCGCAAACAAATGGATTAAATTTCTCTCTGCAACAGCTTCA 4300

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh04104            3784 GAACAAGATAAAAACTTGTCAAGAGTCCAGGGGAGAGAAAACCACAGTGA 3833
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4301 GAACAAGATAAAAACTTGTCAAGAGTCCAGGGGAGAGAAAACCACAGTGA 4350

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh04104            3834 CCACAGAAGAACTCCTCAGCTTCGTCCAAACTTGGAAGGAAAAACTGAGC 3883
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4351 CCACAGAAGAACTCCTCAGCTTCGTCCAAACTTGGAAGGAAAAACTGAGC 4400

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh04104            3884 CAGAGGATTCAGTACCTTAACTGCAGCCTGGACAGGGTGTCCATGACTGA 3933
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4401 CAGAGGATTCAGTACCTTAACTGCAGCCTGGACAGGGTGTCCATGACTGA 4450

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh04104            3934 ACTGGTCTTTACCAACACCATCCTGAAGGACCAGGAGGAAGACAGTGACA 3983
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4451 ACTGGTCTTTACCAACACCATCCTGAAGGACCAGGAGGAAGACAGTGACA 4500

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh04104            3984 TCCTGACATCTTCAGAAGCCCTTGAAGAGGAGGCCAAGCTGGACGTGGTC 4033
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4501 TCCTGACATCTTCAGAAGCCCTTGAAGAGGAGGCCAAGCTGGACGTGGTC 4550

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh04104            4034 ACCCCTGAGTCCTTCACCCAGCTGAGCCGCGTGGGGAAGCCCCTGATTGA 4083
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4551 ACCCCTGAGTCCTTCACCCAGCTGAGCCGCGTGGGGAAGCCCCTGATTGA 4600

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh04104            4084 GGACCCAGCTGTGGATGTGATCAGGAAGCTCCTGCAACTTCCCAACACAA 4133
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4601 GGACCCAGCTGTGGATGTGATCAGGAAGCTCCTGCAACTTCCCAACACAA 4650

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh04104            4134 AATGGCCAACCCACCATTGTGACAAAGATCCGTCCCAGACAGGCTTCAAG 4183
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4651 AATGGCCAACCCACCATTGTGACAAAGATCCGTCCCAGACAGGCTTCAAG 4700

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh04104            4184 CGACATCGGTGCCAGCCAGAAAACTCTGGGAAGAAGGCTGTACCCAGTGC 4233
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4701 CGACATCGGTGCCAGCCAGAAAACTCTGGGAAGAAGGCTGTACCCAGTGC 4750

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh04104            4234 CAGTGCTACCTCTGCAGGCAGCCTCCAGACCACCCACCCACCTTTGTCCC 4283
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4751 CAGTGCTACCTCTGCAGGCAGCCTCCAGACCACCCACCCACCTTTGTCCC 4800

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh04104            4284 ACAGCTTCACACCGCACCCCAAGCCCAACAAAATGGAGAGAAAGTACCGG 4333
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4801 ACAGCTTCACACCGCACCCCAAGCCCAACAAAATGGAGAGAAAGTACCGG 4850

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh04104            4334 GTGCTTGGGGACAAGCCTCCCCCTGCTGCCGAGGATTTTAAGGGGATCAT 4383
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4851 GTGCTTGGGGACAAGCCTCCCCCTGCTGCCGAGGATTTTAAGGGGATCAT 4900

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh04104            4384 CTTGACCCTCCTCTGGGAGAGCAGTGAGAACCTGCTGACAGTCGCAGAGG 4433
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4901 CTTGACCCTCCTCTGGGAGAGCAGTGAGAACCTGCTGACAGTCGCAGAGG 4950

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh04104            4434 AGTTCTACCGTAAAGAAAAACGCCCAGTCACCAGGCCTGACTGCATGTGT 4483
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   4951 AGTTCTACCGTAAAGAAAAACGCCCAGTCACCAGGCCTGACTGCATGTGT 5000

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh04104            4484 GACACCTTTGACCAGTGCGCCGAGAACATTAGCAAAAAGATCCTGGAGTA 4533
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5001 GACACCTTTGACCAGTGCGCCGAGAACATTAGCAAAAAGATCCTGGAGTA 5050

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh04104            4534 TCAGAGCCAGGCAAATAAGTACCACAACTCCTGCCTCATAGAATTACGGA 4583
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5051 TCAGAGCCAGGCAAATAAGTACCACAACTCCTGCCTCATAGAATTACGGA 5100

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh04104            4584 TCCAGATCAGGAGATTTGAGGAGCTGCTGCCCCAAGTGTGTTGGCTGGTG 4633
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5101 TCCAGATCAGGAGATTTGAGGAGCTGCTGCCCCAAGTGTGTTGGCTGGTG 5150

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh04104            4634 ATGGAGAATTTCAAGGAACACCACTGGAAAAAGTTTTTCACCTCTGTGAA 4683
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5151 ATGGAGAATTTCAAGGAACACCACTGGAAAAAGTTTTTCACCTCTGTGAA 5200

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh04104            4684 GGAGATCCGAGGACAGTTCGAGGAACAGCAGAAGCGGCTGGAGAAAAGAA 4733
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5201 GGAGATCCGAGGACAGTTCGAGGAACAGCAGAAGCGGCTGGAGAAAAGAA 5250

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh04104            4734 AGGACAAAAATGCCCAGAAGCTCCATCTAAATCTTGGACACCCCGTACAT 4783
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5251 AGGACAAAAATGCCCAGAAGCTCCATCTAAATCTTGGACACCCCGTACAT 5300

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh04104            4784 TTCCAAGAAATGGAGTCTCTACACTTAAGTGAAGAGGAAAGGCAGGAAGA 4833
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5301 TTCCAAGAAATGGAGTCTCTACACTTAAGTGAAGAGGAAAGGCAGGAAGA 5350

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hh04104            4834 GCTGGACAGCATGATTAGGATGAACAAGGAGAAGCTGGAGGAATGTACCA 4883
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5351 GCTGGACAGCATGATTAGGATGAACAAGGAGAAGCTGGAGGAATGTACCA 5400

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hh04104            4884 GAAGGAATGGCCAGGTTTTCATAACCAACTTGGCCACCTTCACCGAGAAG 4933
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5401 GAAGGAATGGCCAGGTTTTCATAACCAACTTGGCCACCTTCACCGAGAAG 5450

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hh04104            4934 TTCCTACTGCAGTTGGATGAGGTGGTCACCATTGACGATGTCCAGGTTGC 4983
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5451 TTCCTACTGCAGTTGGATGAGGTGGTCACCATTGACGATGTCCAGGTTGC 5500

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hh04104            4984 AAGGATGGAGCCCCCCAAACAGAAATTATCAATGCTCATACGAAGGAAAC 5033
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5501 AAGGATGGAGCCCCCCAAACAGAAATTATCAATGCTCATACGAAGGAAAC 5550

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hh04104            5034 TCGCTGGGCTCTCCCTGAAGGAAGAGAGTGAGAAACCCCTGATTGAACGT 5083
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5551 TCGCTGGGCTCTCCCTGAAGGAAGAGAGTGAGAAACCCCTGATTGAACGT 5600

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hh04104            5084 GGAAGCAGGAAGTGGCCAGGGATCAAACCCACCGAAGTCACCATCCAAAA 5133
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5601 GGAAGCAGGAAGTGGCCAGGGATCAAACCCACCGAAGTCACCATCCAAAA 5650

                   5651          .         .         .         .         . 5700
hh04104            5134 CAAGATTCTTCTCCAGCCAACATCATCGATTTCCACCACCAAAACCACCC 5183
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5651 CAAGATTCTTCTCCAGCCAACATCATCGATTTCCACCACCAAAACCACCC 5700

                   5701          .         .         .         .         . 5750
hh04104            5184 TGGGCCACCTGGCGGCCGTGGAAGCCCGAGATGCTGTGTACCTGAAATAT 5233
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5701 TGGGCCACCTGGCGGCCGTGGAAGCCCGAGATGCTGTGTACCTGAAATAT 5750

                   5751          .         .         .         .         . 5800
hh04104            5234 TTAGCATCATTTGAGGAGGAGCTAAAGAGGATCCAGGATGACTGTACATC 5283
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5751 TTAGCATCATTTGAGGAGGAGCTAAAGAGGATCCAGGATGACTGTACATC 5800

                   5801          .         .         .         .         . 5850
hh04104            5284 TCAGATAAAGGAGGCTCAGCGCTGGAAGGACAGCTGGAAGCAGTCCCTGC 5333
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5801 TCAGATAAAGGAGGCTCAGCGCTGGAAGGACAGCTGGAAGCAGTCCCTGC 5850

                   5851          .         .         .         .         . 5900
hh04104            5334 ACACTATCCAAGGCCTGTATGTGTGACCCTCCGCCCCACCATGAATAAAC 5383
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5851 ACACTATCCAAGGCCTGTATGTGTGACCCTCCGCCCCACCATGAATAAAC 5900

                   5901          .         .         .         .         . 5950
hh04104            5384 ACTTTCTTATACAGACTCCTTCCCTGTCCATCTACCTGCCTACCTACTTT 5433
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5901 ACTTTCTTATACAGACTCCTTCCCTGTCCATCTACCTGCCTACCTACTTT 5950

                   5951          .         .         .         .         . 6000
hh04104            5434 CCGTCCATCCCTCCCTCCCTTCATCCCTCCACCCCTGCTCTGTGCCGGGC 5483
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   5951 CCGTCCATCCCTCCCTCCCTTCATCCCTCCACCCCTGCTCTGTGCCGGGC 6000

                   6001          .         .         .         .         . 6050
hh04104            5484 ACTGTAGCTTTACCAGCGAACAGGACACAGCATGGTCCCTGCCCACGTGG 5533
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6001 ACTGTAGCTTTACCAGCGAACAGGACACAGCATGGTCCCTGCCCACGTGG 6050

                   6051          .         .         .         .         . 6100
hh04104            5534 AGCCCTCTTCCCATGAGGAAGGCAAGCATGAAAGGGGAATTCCACTTGGT 5583
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6051 AGCCCTCTTCCCATGAGGAAGGCAAGCATGAAAGGGGAATTCCACTTGGT 6100

                   6101          .         .         .         .         . 6150
hh04104            5584 TAGCAGGGAGGGTGAGTACCAGGAATCAGTCACTTCAAATAGGCACCAGA 5633
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6101 TAGCAGGGAGGGTGAGTACCAGGAATCAGTCACTTCAAATAGGCACCAGA 6150

                   6151          .         .         .         .         . 6200
hh04104            5634 GCTTCAAAGGACATCACCTCCAAACAGCATGCTGGGCAGGGCACGTCATC 5683
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6151 GCTTCAAAGGACATCACCTCCAAACAGCATGCTGGGCAGGGCACGTCATC 6200

                   6201          .         .         .         .         . 6250
hh04104            5684 TTGAAAAATGAAATAAAGGTCATGGGAAAATGATATTTTAATTTAACAGA 5733
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6201 TTGAAAAATGAAATAAAGGTCATGGGAAAATGATATTTTAATTTAACAGA 6250

                   6251          .          6269
hh04104            5734 ATAAACAAGTATGGGTTAT 5752
                        |||||||||||||||||||
hh04104(revised)   6251 ATAAACAAGTATGGGTTAT 6269