Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 8001 bp
Revised DNA sequence, length = 6505 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05530   921 -   941     CCC TTG GAG TAT CAG ATT CAC
     r NN05531  3203 -  3183     TGC AGC AGC TTT GGT GGA TGA
 2 : f NN05532  4507 -  4527     TGG GAC CCT TAT TCT GAC CTT
     r NN05533  5587 -  5567     AGC TTC CTC CGG ATG ATT GAC
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   983 -  2839     1857-bp deletion  (in the revised sequence)
 2 :  4855 -  4925       71-bp insertion (in the revised sequence)
 3 :  5033 -  5322      290-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 97 - 2799 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hf00341               1 GACAGATTTCAATGTCTGTTGAAGGCCCCCCCACACCCTCCTTCAGTGCC 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)      1 GACAGATTTCAATGTCTGTTGAAGGCCCCCCCACACCCTCCTTCAGTGCC 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hf00341              51 GGGGGCATGGAGGGATATCTTGGGCTCCTGCTGTTTTTTAAAATGATGCG 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)     51 GGGGGCATGGAGGGATATCTTGGGCTCCTGCTGTTTTTTAAAATGATGCG 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hf00341             101 AGCTCATCTCCTGTCCTGGGTGTGAACGAGTATATCTTACCAGGGATGTA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    101 AGCTCATCTCCTGTCCTGGGTGTGAACGAGTATATCTTACCAGGGATGTA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hf00341             151 ACTGAACATTTTTTTCTGCATTGTGTTCCTACTGAGCAACCCAAGATGGC 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    151 ACTGAACATTTTTTTCTGCATTGTGTTCCTACTGAGCAACCCAAGATGGC 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hf00341             201 CAGGAACTGCTCTGAGTGCAAGGAGAAGAGGGCAGCACATATCCTCTGCA 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    201 CAGGAACTGCTCTGAGTGCAAGGAGAAGAGGGCAGCACATATCCTCTGCA 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hf00341             251 CCTACTGCAATCGCTGGCTGTGCAGCTCTTGCACAGAGGAACACCGACAC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    251 CCTACTGCAATCGCTGGCTGTGCAGCTCTTGCACAGAGGAACACCGACAC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hf00341             301 AGCCCTGTCCCCGGGGGCCCATTCTTTCCTCGGGCCCAGAAGGGATCTCC 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    301 AGCCCTGTCCCCGGGGGCCCATTCTTTCCTCGGGCCCAGAAGGGATCTCC 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hf00341             351 AGGAGTGAATGGTGGTCCCGGAGACTTCACCTTGTATTGTCCTCTACACA 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    351 AGGAGTGAATGGTGGTCCCGGAGACTTCACCTTGTATTGTCCTCTACACA 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hf00341             401 CACAGGAAGTACTCAAGCTATTCTGTGAGACATGTGATATGCTCACTTGC 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    401 CACAGGAAGTACTCAAGCTATTCTGTGAGACATGTGATATGCTCACTTGC 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hf00341             451 CATAGCTGCCTAGTGGTGGAACACAAAGAACACAGGTGCAGACATGTTGA 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    451 CATAGCTGCCTAGTGGTGGAACACAAAGAACACAGGTGCAGACATGTTGA 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hf00341             501 AGAAGTTTTGCAAAACCAGAGGATGCTTCTGGAAGGTGTGACTACACAGG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    501 AGAAGTTTTGCAAAACCAGAGGATGCTTCTGGAAGGTGTGACTACACAGG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hf00341             551 TGGCACATAAGAAATCCAGTCTACAGACATCTGCAAAGCAAATTGAGGAC 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    551 TGGCACATAAGAAATCCAGTCTACAGACATCTGCAAAGCAAATTGAGGAC 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hf00341             601 AGGATTTTTGAAGTGAAGCATCAGCATAGGAAGGTGGAAAACCAGATCAA 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    601 AGGATTTTTGAAGTGAAGCATCAGCATAGGAAGGTGGAAAACCAGATCAA 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hf00341             651 AATGGCCAAGATGGTTCTGATGAATGAGCTGAACAAACAGGCCAATGGGC 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    651 AATGGCCAAGATGGTTCTGATGAATGAGCTGAACAAACAGGCCAATGGGC 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hf00341             701 TAATAGAGGAATTAGAGGGGATTACTAATGAGAGAAAGCGGAAGCTGGAA 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    701 TAATAGAGGAATTAGAGGGGATTACTAATGAGAGAAAGCGGAAGCTGGAA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hf00341             751 CAGCAGTTACAGAGCATCATGGTTCTCAACCGTCAGTTTGAGCATGTGCA 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    751 CAGCAGTTACAGAGCATCATGGTTCTCAACCGTCAGTTTGAGCATGTGCA 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hf00341             801 GAATTTCATCAACTGGGCTGTCTGCAGCAAAACCAGTGTCCCTTTTCTTT 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    801 GAATTTCATCAACTGGGCTGTCTGCAGCAAAACCAGTGTCCCTTTTCTTT 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hf00341             851 TCAGCAAAGAGCTGATTGTGTTTCAGATGCAGCGATTGCTGGAGACAAGT 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    851 TCAGCAAAGAGCTGATTGTGTTTCAGATGCAGCGATTGCTGGAGACAAGT 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hf00341             901 TGTAACACAGATCCTGGCTCCCCTTGGAGTATCAGATTCACCTGGGAGCC 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    901 TGTAACACAGATCCTGGCTCCCCTTGGAGTATCAGATTCACCTGGGAGCC 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hf00341             951 TAACTTCTGGACCAAGCAGCTAGCTTCTCTTGGTGAGCTTGGACCCACCC 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
hf00341(revised)    951 TAACTTCTGGACCAAGCAGCTAGCTTCTCTTG------------------ 982

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hf00341            1001 ACCCAGGCCTACCCACCCTGTGGGCTTTGACTTAATTGCTTACCTTACTG 1050
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hf00341            1051 GGTAGGTCAGCATATGCCCAAGAGAAAGCACTCTCTGGGACTGCCAGTGG 1100
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hf00341            1101 TCATGGAATCATTCAGCAAACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 1150
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hf00341            1151 GGGGGAAGAGGAGAGGATGAGGAATTAAATAACAGTGGCAATATAGGACT 1200
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hf00341            1201 TTGTATCAGGATGAGTTGAAATCTGAGTTTACCATTCTGTGTAAATGTCC 1250
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hf00341            1251 TGTTACATTGGTTTTATTGCTGAGGAGGAGACAAGACAGTCACCCTGCTC 1300
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hf00341            1301 TCCGGAATGCTGTATGGCAGTACAGATGAATGTGTGTCTCTGTGGTCACA 1350
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hf00341            1351 CAAAGGTATACACGTGTGGGCACAAGCAGGGGTATCTCAGCAACAGTGAG 1400
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hf00341            1401 ACTGCGTGTGCATGTTTGTGTCACACAGACATATCCTTTCGAGTTGAGAT 1450
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hf00341            1451 GTAAGCAGATAATTCATGGCCTTGTGCATTTTTCTTCCCTGCTGCAATCA 1500
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hf00341            1501 TTTGCTGGCATTCAGTCTTTAGGCAGAATGTAGACAGCTTGAAGTTGTGC 1550
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hf00341            1551 CTGTGTTGACAGCCTAACGAGTGTTAAACTGATGGCCAGCTGCTGCCTTC 1600
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hf00341            1601 ATTTGAGGCTGTTAATCTTATTGAAAATTTGTTGAACTTGGCAAAGTGAC 1650
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hf00341            1651 AAATGATATGTAGGTTTATTTCTTTTCTTCCCTCTTTCCTTTGATTTAAC 1700
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hf00341            1701 TCAGCAGACCTTTGATGGCCACCTACTCTTGTTTAGGCCCCATGCTGAGC 1750
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hf00341            1751 ACCAAAGAACCAATGGTGAATAAAACACATTTTCCTTAAGGAGCTCAGAC 1800
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hf00341            1801 TTCTTCTAAGTAAGTCTCACCAAAATAATGAGAGGAAGGAGTCATTAGAC 1850
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hf00341            1851 TGAGTTAGCCATAGATCTACTTGTGCACAAGGGACCTAGAGGCCTCAGGG 1900
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hf00341            1901 GGCAGTGCCGGTGCCTGGCACTGACCTGGTGTATTAGTCCATTCTCGCAT 1950
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hf00341            1951 TATTGTGAAGAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTT 2000
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hf00341            2001 AATTGGCTCATGATTCTGCAGGATGTACAGGAAGCATGATCCTGGAACCT 2050
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hf00341            2051 GCTCGGCTTCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGACAGAAGGTG 2100
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hf00341            2101 AAGACGCACATCACATGGACAGAGCAGCAAGAAACAGAGCAAGGGGGAGG 2150
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hf00341            2151 TGTTACACACTTTAAAGAAATCAGGTCTCACGAGACCTCTATCACAAGAA 2200
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hf00341            2201 CAGCACCAAAGGGACGGTGCTAAACCACTCATGAGGGATCCGCCCCCACG 2250
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hf00341            2251 ATCCAGTCACCTCCCACCAGGCCCCACCTCCAACACTGGGGATTACAATT 2300
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hf00341            2301 CAACATGAGATTTGGGCGGGGACACAGCTCCAAACTGTATCACCTGGTAT 2350
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hf00341            2351 TAGAGCTTCCCCACTCTCTTCCGTCCTACTTGCTCAACACACAGTTCCCC 2400
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hf00341            2401 ACACCTGTATCTGGGAACTTGTTCATTGGTCCCAGGCATGGCTCTCTACC 2450
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hf00341            2451 CTTTGCTACTTTCTAGCATACTCCCTCCCAACCCCAAAGTTGATTCTTTT 2500
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hf00341            2501 TGTGAGAGTCTGATTGGGCTGTTCTGTTGGAAAAAAATGAGTGGGTGCTA 2550
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hf00341            2551 TTTGAGAGAGCTTGTGGTTTCCCTAGTGGGACAGAAACAGAGTCAGGGCT 2600
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hf00341            2601 GAGCATCTGGTAAAAGCTGAACTAATTTCTCAAATATCCTAGGCCCCCAA 2650
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hf00341            2651 AGCAGGTGCATACAGGTGCTATTACTGGCAGCATTCTAGACCGAGTCTAG 2700
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hf00341            2701 GAGATCAAGGGTTGAGTTTCTTAATCTCTGTTCCTGGTACAGGATTGTTG 2750
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hf00341            2751 AATGAGGTTCTTTTGTCCCAGGAGCAGGAAGTAGCAAGGTGGGAGCAACT 2800
                                                                          
hf00341(revised)    983 -------------------------------------------------- 983

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hf00341            2801 TGAAAAACTTTTGAAAAACTCTCTATTCTGCATTTTCAGGCTGCATAACT 2850
                                                               |||||||||||
hf00341(revised)    983 ---------------------------------------GCTGCATAACT 993

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hf00341            2851 ACTGAAGGTGGACAAATGTCCAGGGCAGATGCTCCTGCTTATGGAGGCTT 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)    994 ACTGAAGGTGGACAAATGTCCAGGGCAGATGCTCCTGCTTATGGAGGCTT 1043

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hf00341            2901 ACAGGGGTCATCACCCTTTTATCAAAGCCACCAGTCTCCAGTGGCTCAGC 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1044 ACAGGGGTCATCACCCTTTTATCAAAGCCACCAGTCTCCAGTGGCTCAGC 1093

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hf00341            2951 AAGAGGCTCTTAGCCACCCCTCACACAAGTTCCAGTCTCCAGCAGTGTGC 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1094 AAGAGGCTCTTAGCCACCCCTCACACAAGTTCCAGTCTCCAGCAGTGTGC 1143

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hf00341            3001 TCCTCATCTGTGTGCTGCTCCCACTGCTCCCCAGTCTCGCCTTCCCTCAA 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1144 TCCTCATCTGTGTGCTGCTCCCACTGCTCCCCAGTCTCGCCTTCCCTCAA 1193

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hf00341            3051 AGGCCAGGTCCCCCCACCCAGCATACACCCAGCCCACAGCTTCAGGCAGC 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1194 AGGCCAGGTCCCCCCACCCAGCATACACCCAGCCCACAGCTTCAGGCAGC 1243

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hf00341            3101 CCCCTGAGATGGTGCCCCAGCAGCTGGGGTCTCTGCAGTGCTCTGCCCTG 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1244 CCCCTGAGATGGTGCCCCAGCAGCTGGGGTCTCTGCAGTGCTCTGCCCTG 1293

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hf00341            3151 CTGCCCAGGGAGAAAGAGCTGGCCTGCAGCCCTCATCCACCAAAGCTGCT 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1294 CTGCCCAGGGAGAAAGAGCTGGCCTGCAGCCCTCATCCACCAAAGCTGCT 1343

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hf00341            3201 GCAGCCCTGGCTGGAAACCCAGCCCCCCGTGGAGCAGGAGAGCACATCCC 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1344 GCAGCCCTGGCTGGAAACCCAGCCCCCCGTGGAGCAGGAGAGCACATCCC 1393

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hf00341            3251 AGCGGCTGGGGCAGCAGCTGACTTCCCAGCCCGTGTGCATTGTCCCCCCA 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1394 AGCGGCTGGGGCAGCAGCTGACTTCCCAGCCCGTGTGCATTGTCCCCCCA 1443

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hf00341            3301 CAGGATGTTCAGCAAGGAGCCCATGCCCAGCCCACCTTACAGACACCCTC 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1444 CAGGATGTTCAGCAAGGAGCCCATGCCCAGCCCACCTTACAGACACCCTC 1493

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hf00341            3351 TATCCAAGTCCAGTTTGGCCACCACCAGAAGCTGAAGCTCAGTCACTTTC 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1494 TATCCAAGTCCAGTTTGGCCACCACCAGAAGCTGAAGCTCAGTCACTTTC 1543

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hf00341            3401 AGCAGCAGCCACAGCAGCAGCTACCACCTCCACCACCACCCCTCCCCCAT 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1544 AGCAGCAGCCACAGCAGCAGCTACCACCTCCACCACCACCCCTCCCCCAT 1593

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hf00341            3451 CCCCCACCTCCCCTTCCCCCTCCCCCACAGCAGCCACACCCACCTCTTCC 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1594 CCCCCACCTCCCCTTCCCCCTCCCCCACAGCAGCCACACCCACCTCTTCC 1643

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hf00341            3501 TCCATCCCAGCATCTGGCTTCTAGTCAGCACGAGAGCCCTCCTGGCCCTG 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1644 TCCATCCCAGCATCTGGCTTCTAGTCAGCACGAGAGCCCTCCTGGCCCTG 1693

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hf00341            3551 CCTGTTCTCAGAACATGGACATAATGCATCACAAGTTTGAGCTGGAGGAA 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1694 CCTGTTCTCAGAACATGGACATAATGCATCACAAGTTTGAGCTGGAGGAA 1743

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hf00341            3601 ATGCAGAAGGACTTGGAGCTTCTTCTCCAGGCTCAACAGCCCAGCCTGCA 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1744 ATGCAGAAGGACTTGGAGCTTCTTCTCCAGGCTCAACAGCCCAGCCTGCA 1793

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hf00341            3651 ACTGAGTCAGACCAAATCTCCTCAGCATCTTCAGCAAACCATTGTGGGGC 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1794 ACTGAGTCAGACCAAATCTCCTCAGCATCTTCAGCAAACCATTGTGGGGC 1843

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hf00341            3701 AGATCAACTACATCGTGAGGCAGCCAGCACCTGTCCAGTCCCAGAGCCAG 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1844 AGATCAACTACATCGTGAGGCAGCCAGCACCTGTCCAGTCCCAGAGCCAG 1893

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hf00341            3751 GAGGAGACCCTGCAGGCTACAGATGAGCCCCCAGCATCTCAGGGCTCAAA 3800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1894 GAGGAGACCCTGCAGGCTACAGATGAGCCCCCAGCATCTCAGGGCTCAAA 1943

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hf00341            3801 GCCGGCTCTCCCTCTTGACAAGAATACTGCTGCTGCCTTGCCCCAGGCGT 3850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1944 GCCGGCTCTCCCTCTTGACAAGAATACTGCTGCTGCCTTGCCCCAGGCGT 1993

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hf00341            3851 CTGGGGAAGAAACCCCTCTCAGTGTCCCCCCAGTGGACAGCACCATCCAG 3900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   1994 CTGGGGAAGAAACCCCTCTCAGTGTCCCCCCAGTGGACAGCACCATCCAG 2043

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hf00341            3901 CACTCCTCTCCAAATGTGGTGAGAAAGCACTCCACCTCGCTGAGCATCAT 3950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2044 CACTCCTCTCCAAATGTGGTGAGAAAGCACTCCACCTCGCTGAGCATCAT 2093

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hf00341            3951 GGGCTTTTCCAACACTCTGGAGATGGAGTTGTCATCTACCAGGTTGGAGA 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2094 GGGCTTTTCCAACACTCTGGAGATGGAGTTGTCATCTACCAGGTTGGAGA 2143

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hf00341            4001 GGCCCCTAGAGCCACAGATCCAGAGTGTGAGCAACCTGACAGCTGGTGCC 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2144 GGCCCCTAGAGCCACAGATCCAGAGTGTGAGCAACCTGACAGCTGGTGCC 2193

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hf00341            4051 CCCCAGGCAGTACCAAGCCTGCTGAGTGCTCCCCCCAAAATGGTGTCCAG 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2194 CCCCAGGCAGTACCAAGCCTGCTGAGTGCTCCCCCCAAAATGGTGTCCAG 2243

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hf00341            4101 CCTGACAAGTGTTCAAAACCAGGCCATGCCCAGCCTGACAACCAGTCACC 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2244 CCTGACAAGTGTTCAAAACCAGGCCATGCCCAGCCTGACAACCAGTCACC 2293

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hf00341            4151 TACAGACTGTGCCCAGCCTTGTGCATAGCACATTCCAGTCCATGCCCAAC 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2294 TACAGACTGTGCCCAGCCTTGTGCATAGCACATTCCAGTCCATGCCCAAC 2343

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hf00341            4201 CTGATAAGTGACTCCCCTCAGGCTATGGCAAGCCTGGCAAGTGATCACCC 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2344 CTGATAAGTGACTCCCCTCAGGCTATGGCAAGCCTGGCAAGTGATCACCC 2393

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hf00341            4251 TCAGGCTGGGCCCAGCCTAATGTCTGGTCACACCCAGGCTGTGCCGAGTC 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2394 TCAGGCTGGGCCCAGCCTAATGTCTGGTCACACCCAGGCTGTGCCGAGTC 2443

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hf00341            4301 TGGCAACTTGTCCTCTGCAGAGCATCCCTCCAGTTTCTGACATGCAGCCA 4350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2444 TGGCAACTTGTCCTCTGCAGAGCATCCCTCCAGTTTCTGACATGCAGCCA 2493

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hf00341            4351 GAAACTGGGTCCAGCTCCAGTTCTGGCCGAACTTCAGGGAGCCTGTGTCC 4400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2494 GAAACTGGGTCCAGCTCCAGTTCTGGCCGAACTTCAGGGAGCCTGTGTCC 2543

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hf00341            4401 CAGAGATGGGGCTGATCCCTCCCTGGAGAATGCTCTGTGTAAGGTAAGTC 4450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2544 CAGAGATGGGGCTGATCCCTCCCTGGAGAATGCTCTGTGTAAGGTAAGTC 2593

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hf00341            4451 CTGGGGAAATGCTATCCAAACTTCCTTTGTTCATCATTGGGCAAAAGATT 4500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2594 CTGGGGAAATGCTATCCAAACTTCCTTTGTTCATCATTGGGCAAAAGATT 2643

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hf00341            4501 GGCCACTGGGACCCTTATTCTGACCTTAGCTTAACAGTTCTGAGACCACT 4550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2644 GGCCACTGGGACCCTTATTCTGACCTTAGCTTAACAGTTCTGAGACCACT 2693

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hf00341            4551 AATGACAACCATGTCTGAGTTCTTTGATTCTTGTCGACATTTCACTTTTG 4600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2694 AATGACAACCATGTCTGAGTTCTTTGATTCTTGTCGACATTTCACTTTTG 2743

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hf00341            4601 AAAGATGGAAAGTGAGGATTCCACTCGCTTCACTGACTTACTGGGACAAG 4650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2744 AAAGATGGAAAGTGAGGATTCCACTCGCTTCACTGACTTACTGGGACAAG 2793

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hf00341            4651 GTCCCATAGTCCCCGGTCTGGATGCTCCCAAGGACTTGGCCATCCCCTCA 4700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2794 GTCCCATAGTCCCCGGTCTGGATGCTCCCAAGGACTTGGCCATCCCCTCA 2843

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hf00341            4701 GAACTGGAGGAGCCAATTAACCTCTCTGTGAAGAAACCTCCACTGGCGCC 4750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2844 GAACTGGAGGAGCCAATTAACCTCTCTGTGAAGAAACCTCCACTGGCGCC 2893

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hf00341            4751 AGTGGTCAGCACGTCTACAGCTCTGCAGCAGTACCAGAACCCAAAAGAGT 4800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2894 AGTGGTCAGCACGTCTACAGCTCTGCAGCAGTACCAGAACCCAAAAGAGT 2943

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hf00341            4801 GTGAGAATTTTGAACAAGGAGCCCTAGAGCTGGATGCAAAAGAGAACCAG 4850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   2944 GTGAGAATTTTGAACAAGGAGCCCTAGAGCTGGATGCAAAAGAGAACCAG 2993

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hf00341            4851 AGCA---------------------------------------------- 4854
                        ||||                                              
hf00341(revised)   2994 AGCATCAGAGCCTTCAATAGTGAGCATAAGATTCCCTATGTGCGACTGGA 3043

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hf00341            4855 -------------------------TCAGGAGAGATGCCTGTGTTCAAAC 4879
                                                 |||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3044 GCGACTCAAGATCTGTGCTGCCTCCTCAGGAGAGATGCCTGTGTTCAAAC 3093

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hf00341            4880 TGAAGCCACAGAAGAATGATCAGGATGGGAGCTTCCTGCTGATCATCGAG 4929
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3094 TGAAGCCACAGAAGAATGATCAGGATGGGAGCTTCCTGCTGATCATCGAG 3143

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hf00341            4930 TGTGGCACTGAGTCCTCCAGCATGTCCATTAA------------------ 4961
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
hf00341(revised)   3144 TGTGGCACTGAGTCCTCCAGCATGTCCATTAAGGTCAGCCAGGACAGACT 3193

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hf00341            4962 -------------------------------------------------- 4962
                                                                          
hf00341(revised)   3194 GTCTGAGGCCACCCAGGCCCCAGGTCTGGAGGGAAGAAAGGTCACTGTCA 3243

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hf00341            4962 -------------------------------------------------- 4962
                                                                          
hf00341(revised)   3244 CTTCTTTGGCTGGGCAGCGGCCACCAGAAGTGGAGGGCACATCTCCTGAA 3293

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hf00341            4962 -------------------------------------------------- 4962
                                                                          
hf00341(revised)   3294 GAACACAGACTCATTCCTCGAACCCCAGGAGCCAAGAAGGGCCCCCCAGC 3343

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hf00341            4962 -------------------------------------------------- 4962
                                                                          
hf00341(revised)   3344 CCCAATAGAGAATGAGGACTTCTGTGCTGTTTGCCTCAATGGCGGAGAGT 3393

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hf00341            4962 -------------------------------------------------- 4962
                                                                          
hf00341(revised)   3394 TACTGTGCTGTGACCGCTGCCCCAAAGTGTTCCACCTCTCCTGCCATGTG 3443

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hf00341            4962 ----------------------GGGGAGAGTGGGTGTGTACCTTGTGCCG 4989
                                              ||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3444 CCAGCCTTGCTCAGCTTCCCAGGGGGAGAGTGGGTGTGTACCTTGTGCCG 3493

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hf00341            4990 CAGCCTGACCCAGCCCGAGATGGAGTACGACTGTGAGAATGCCTGCTATA 5039
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3494 CAGCCTGACCCAGCCCGAGATGGAGTACGACTGTGAGAATGCCTGCTATA 3543

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hf00341            5040 ACCAGCCTGGAATGCGGGCATCTCCTGGCCTAAGCATGTATGACCAGAAG 5089
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3544 ACCAGCCTGGAATGCGGGCATCTCCTGGCCTAAGCATGTATGACCAGAAG 3593

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hf00341            5090 AAGTGTGAGAAGCTGGTATTGTCCTTGTGCTGCAATAACCTCAGCCTGCC 5139
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3594 AAGTGTGAGAAGCTGGTATTGTCCTTGTGCTGCAATAACCTCAGCCTGCC 3643

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hf00341            5140 CTTCCATGAACCTGTCAGCCCCCTGGCCCGGCATTATTACCAGATTATCA 5189
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3644 CTTCCATGAACCTGTCAGCCCCCTGGCCCGGCATTATTACCAGATTATCA 3693

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hf00341            5190 AGAGGCCCATGGACCTGTCAATCATCCGGAGGAAGCTGCAAAAGAAGGAC 5239
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3694 AGAGGCCCATGGACCTGTCAATCATCCGGAGGAAGCTGCAAAAGAAGGAC 3743

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hf00341            5240 CCAGCTCACTATACCACCCCAGAGGAGGTGGTATCAGATGTGCGCCTCAT 5289
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3744 CCAGCTCACTATACCACCCCAGAGGAGGTGGTATCAGATGTGCGCCTCAT 3793

                   5651          .         .         .         .         . 5700
hf00341            5290 GTTCTGGAACTGTGCTAAGTTCAATTATCCTGACTCCGAGGTTGCAGAGG 5339
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3794 GTTCTGGAACTGTGCTAAGTTCAATTATCCTGACTCCGAGGTTGCAGAGG 3843

                   5701          .         .         .         .         . 5750
hf00341            5340 CTGGCCGCTGCCTGGAAGTGTTCTTTGAGGGCTGGTTGAAGGAGATCTAC 5389
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3844 CTGGCCGCTGCCTGGAAGTGTTCTTTGAGGGCTGGTTGAAGGAGATCTAC 3893

                   5751          .         .         .         .         . 5800
hf00341            5390 CCGGAGAAACGGTTTGCCCAGCCAAGGCAGGAGGACTCAGACTCCGAGGA 5439
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3894 CCGGAGAAACGGTTTGCCCAGCCAAGGCAGGAGGACTCAGACTCCGAGGA 3943

                   5801          .         .         .         .         . 5850
hf00341            5440 GGTGTCTAGTGAGAGTGGATGTTCCACTCCCCAGGGCTTCCCGTGGCCTC 5489
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3944 GGTGTCTAGTGAGAGTGGATGTTCCACTCCCCAGGGCTTCCCGTGGCCTC 3993

                   5851          .         .         .         .         . 5900
hf00341            5490 CCTACATGCAGGAGGGCATCCAACCCAAGAGGCGGCGACGACATATGGAG 5539
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   3994 CCTACATGCAGGAGGGCATCCAACCCAAGAGGCGGCGACGACATATGGAG 4043

                   5901          .         .         .         .         . 5950
hf00341            5540 AATGAAAGAGCAAAAAGAATGTCATTTCGCCTGGCCAACAGCATCTCTCA 5589
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4044 AATGAAAGAGCAAAAAGAATGTCATTTCGCCTGGCCAACAGCATCTCTCA 4093

                   5951          .         .         .         .         . 6000
hf00341            5590 GGTGTGAGAGCCAAAAGGAGACTGGGCACTCTGGCAGCTGTTGTCCCATA 5639
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4094 GGTGTGAGAGCCAAAAGGAGACTGGGCACTCTGGCAGCTGTTGTCCCATA 4143

                   6001          .         .         .         .         . 6050
hf00341            5640 CTGTCGACCATTCCTCCCCATCTTGCAGCTTATCCTCTTCAGAGTGTGGA 5689
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4144 CTGTCGACCATTCCTCCCCATCTTGCAGCTTATCCTCTTCAGAGTGTGGA 4193

                   6051          .         .         .         .         . 6100
hf00341            5690 TGGTAGATGAGTCTTGTTGAACTGTGTAGTGCTCTTCTTTGCCATTTGCA 5739
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4194 TGGTAGATGAGTCTTGTTGAACTGTGTAGTGCTCTTCTTTGCCATTTGCA 4243

                   6101          .         .         .         .         . 6150
hf00341            5740 TCTACAGCATTTATTTAGGAGCCGTAGTACATCCACTACAGAGAAGATTT 5789
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4244 TCTACAGCATTTATTTAGGAGCCGTAGTACATCCACTACAGAGAAGATTT 4293

                   6151          .         .         .         .         . 6200
hf00341            5790 CAGTAATAAACAGGAAAGAGGAAGGTATTTATTATTACCAGAGTAATCAG 5839
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4294 CAGTAATAAACAGGAAAGAGGAAGGTATTTATTATTACCAGAGTAATCAG 4343

                   6201          .         .         .         .         . 6250
hf00341            5840 ATGTATAGGCTCCACTTGACAAGACCACACCTGGTTAGGCTCGGGAAAAC 5889
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4344 ATGTATAGGCTCCACTTGACAAGACCACACCTGGTTAGGCTCGGGAAAAC 4393

                   6251          .         .         .         .         . 6300
hf00341            5890 CTACTTTCCTTGGTGAATTTTTTTCTGCCTGGGAAAGCAGACCCGTCTAA 5939
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4394 CTACTTTCCTTGGTGAATTTTTTTCTGCCTGGGAAAGCAGACCCGTCTAA 4443

                   6301          .         .         .         .         . 6350
hf00341            5940 CCTTTTAGTGTCCAGGGCTCAGGAGCCATGTATACATCTGAACTCCTCCT 5989
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4444 CCTTTTAGTGTCCAGGGCTCAGGAGCCATGTATACATCTGAACTCCTCCT 4493

                   6351          .         .         .         .         . 6400
hf00341            5990 GGGCTCAGAAGTGGGTAAAAGAAGGGAGAGAGGTTTAGACATATGGCAGG 6039
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4494 GGGCTCAGAAGTGGGTAAAAGAAGGGAGAGAGGTTTAGACATATGGCAGG 4543

                   6401          .         .         .         .         . 6450
hf00341            6040 ACTGTGATCCCTGGCCCAGCACAGCCAAAGACTGTCACTGTTTGCCTTTG 6089
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4544 ACTGTGATCCCTGGCCCAGCACAGCCAAAGACTGTCACTGTTTGCCTTTG 4593

                   6451          .         .         .         .         . 6500
hf00341            6090 CTTGTCCTGTCTGGATAGAGGCACCTGCCATGTGCAGACTAGTGGAGGCT 6139
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4594 CTTGTCCTGTCTGGATAGAGGCACCTGCCATGTGCAGACTAGTGGAGGCT 4643

                   6501          .         .         .         .         . 6550
hf00341            6140 TCTAGAGGCCATAGGTCTCAATTTGTGCCTATTTGGGTTCTAACGGTTTT 6189
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4644 TCTAGAGGCCATAGGTCTCAATTTGTGCCTATTTGGGTTCTAACGGTTTT 4693

                   6551          .         .         .         .         . 6600
hf00341            6190 CAGGGTATTTGTTTTGCATAGTCACTTTCCTGATGTTGACATAGGTGGCT 6239
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4694 CAGGGTATTTGTTTTGCATAGTCACTTTCCTGATGTTGACATAGGTGGCT 4743

                   6601          .         .         .         .         . 6650
hf00341            6240 GCTGTGAAAATGCTGTGGATGGTGTGACATTCTTGACTGAGCTGGGTGGC 6289
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4744 GCTGTGAAAATGCTGTGGATGGTGTGACATTCTTGACTGAGCTGGGTGGC 4793

                   6651          .         .         .         .         . 6700
hf00341            6290 TGTGGAGAGACCACTTAAATCTTCTGGTTCAGATTTCACTTACAGACTTA 6339
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4794 TGTGGAGAGACCACTTAAATCTTCTGGTTCAGATTTCACTTACAGACTTA 4843

                   6701          .         .         .         .         . 6750
hf00341            6340 GTAAGATGTCCACTTCAGAGCCCGCCCTCTGTGCTACTTACTCTGGGCTA 6389
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4844 GTAAGATGTCCACTTCAGAGCCCGCCCTCTGTGCTACTTACTCTGGGCTA 4893

                   6751          .         .         .         .         . 6800
hf00341            6390 ATCACACTTCTTTAGGGTGAGAACCTGCCTTCCTAGAAGTGACTGTTGGT 6439
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4894 ATCACACTTCTTTAGGGTGAGAACCTGCCTTCCTAGAAGTGACTGTTGGT 4943

                   6801          .         .         .         .         . 6850
hf00341            6440 GCTTGTCAGTGGCCATACCCTTCATCATCCTCATTCAGAGGTATGGATCG 6489
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4944 GCTTGTCAGTGGCCATACCCTTCATCATCCTCATTCAGAGGTATGGATCG 4993

                   6851          .         .         .         .         . 6900
hf00341            6490 TGAGTTCTGCTTGTGAATACTGTGAGACAGCTGCTGTCTGCTTCAGGTCC 6539
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   4994 TGAGTTCTGCTTGTGAATACTGTGAGACAGCTGCTGTCTGCTTCAGGTCC 5043

                   6901          .         .         .         .         . 6950
hf00341            6540 AGAGTTCCATGGGTGGAGAGAGTAACCCACAACCAGCTCACTCCTCTGGG 6589
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5044 AGAGTTCCATGGGTGGAGAGAGTAACCCACAACCAGCTCACTCCTCTGGG 5093

                   6951          .         .         .         .         . 7000
hf00341            6590 CCTCTCCTCCTGCTTAAAGATTCTAGTTCTCAACCTCTCCAAGTTCATGA 6639
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5094 CCTCTCCTCCTGCTTAAAGATTCTAGTTCTCAACCTCTCCAAGTTCATGA 5143

                   7001          .         .         .         .         . 7050
hf00341            6640 GCCAAAGATCAGAAGTGAGTCTTCTGACCAGCCCGCCTCCAGGCTGTCTA 6689
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5144 GCCAAAGATCAGAAGTGAGTCTTCTGACCAGCCCGCCTCCAGGCTGTCTA 5193

                   7051          .         .         .         .         . 7100
hf00341            6690 CAGCCCCAAAAAAGCCAACACTTTTCTGGCAGCCCTTTTTGTTGGAGGTT 6739
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5194 CAGCCCCAAAAAAGCCAACACTTTTCTGGCAGCCCTTTTTGTTGGAGGTT 5243

                   7101          .         .         .         .         . 7150
hf00341            6740 AGAGAAGGCCTCAGGGACCAACAGGGGCCAGATCTAGACATTCCTGGGGG 6789
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5244 AGAGAAGGCCTCAGGGACCAACAGGGGCCAGATCTAGACATTCCTGGGGG 5293

                   7151          .         .         .         .         . 7200
hf00341            6790 AAGTTTGTCTAAGGTGGACAGGGGGAAAAATCAAGAGGCAAAAAGCCAGT 6839
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5294 AAGTTTGTCTAAGGTGGACAGGGGGAAAAATCAAGAGGCAAAAAGCCAGT 5343

                   7201          .         .         .         .         . 7250
hf00341            6840 GTCCTTTGGTGACCATGAAGCAACCTCAGAGCCTTAGTTCTCCTAGAATG 6889
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5344 GTCCTTTGGTGACCATGAAGCAACCTCAGAGCCTTAGTTCTCCTAGAATG 5393

                   7251          .         .         .         .         . 7300
hf00341            6890 CAGAGAGAAGCATTCTGGAAGCCATGGGAACAGGAGCTCGAGGCTGCATC 6939
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5394 CAGAGAGAAGCATTCTGGAAGCCATGGGAACAGGAGCTCGAGGCTGCATC 5443

                   7301          .         .         .         .         . 7350
hf00341            6940 CTGAATGCATCTGCATGGCCCTCGCAGGGTGTTTGTGAGGATACTGGAGG 6989
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5444 CTGAATGCATCTGCATGGCCCTCGCAGGGTGTTTGTGAGGATACTGGAGG 5493

                   7351          .         .         .         .         . 7400
hf00341            6990 TCAGGCTACCTCCCAAGCAAGGGCTTGGTTGAGAAGGAACCCATTGCTCA 7039
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5494 TCAGGCTACCTCCCAAGCAAGGGCTTGGTTGAGAAGGAACCCATTGCTCA 5543

                   7401          .         .         .         .         . 7450
hf00341            7040 TATTGTTGGGGGAGCTATGAACCTGACATGTCAGTGGCCAGGACTGAGAC 7089
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5544 TATTGTTGGGGGAGCTATGAACCTGACATGTCAGTGGCCAGGACTGAGAC 5593

                   7451          .         .         .         .         . 7500
hf00341            7090 AGCTCTCCCTGGTCCTGTCATTGCATGGCTAATTTCAGGGGAGTCTGAGG 7139
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5594 AGCTCTCCCTGGTCCTGTCATTGCATGGCTAATTTCAGGGGAGTCTGAGG 5643

                   7501          .         .         .         .         . 7550
hf00341            7140 TCATGGCTTTATTTTTGCTAACAGATGAAGTTCAAGGATGTTCTTGTTTG 7189
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5644 TCATGGCTTTATTTTTGCTAACAGATGAAGTTCAAGGATGTTCTTGTTTG 5693

                   7551          .         .         .         .         . 7600
hf00341            7190 TAGGGCCTTTGCTAATGAGCAGTTTTTTAATTAGAAAACATTTCTTCTCT 7239
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5694 TAGGGCCTTTGCTAATGAGCAGTTTTTTAATTAGAAAACATTTCTTCTCT 5743

                   7601          .         .         .         .         . 7650
hf00341            7240 CTTTGTGAGTTGATGGTATTGCTCATTTCCTTCTCTACCCAACCTGAGAG 7289
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5744 CTTTGTGAGTTGATGGTATTGCTCATTTCCTTCTCTACCCAACCTGAGAG 5793

                   7651          .         .         .         .         . 7700
hf00341            7290 ATCATCTTCACTTTAAAGCAAACCATGCCCCTTGGCTTGCCATTCTTTCA 7339
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5794 ATCATCTTCACTTTAAAGCAAACCATGCCCCTTGGCTTGCCATTCTTTCA 5843

                   7701          .         .         .         .         . 7750
hf00341            7340 GCAGCACATGCCACGTTCTAAGCAGATGGGCTTCCGTGATCCCGTTTTCT 7389
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5844 GCAGCACATGCCACGTTCTAAGCAGATGGGCTTCCGTGATCCCGTTTTCT 5893

                   7751          .         .         .         .         . 7800
hf00341            7390 AGTTTGGGGTAACTGAGTCTTGAATGCTTTACTAGTCCGGCAATCTTTGG 7439
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5894 AGTTTGGGGTAACTGAGTCTTGAATGCTTTACTAGTCCGGCAATCTTTGG 5943

                   7801          .         .         .         .         . 7850
hf00341            7440 ACTTAGGCTTCTGCCCTTTGAGACTCACATGACTTTCTGGTTTGGGGTCT 7489
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5944 ACTTAGGCTTCTGCCCTTTGAGACTCACATGACTTTCTGGTTTGGGGTCT 5993

                   7851          .         .         .         .         . 7900
hf00341            7490 GGTCATTTCCCTTTCAATTTTTGAATCTCCTTCTCTGTTCAGTTGGCTTG 7539
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   5994 GGTCATTTCCCTTTCAATTTTTGAATCTCCTTCTCTGTTCAGTTGGCTTG 6043

                   7901          .         .         .         .         . 7950
hf00341            7540 GCAAAGTACCCTCTGTTCTCATGTCACTAATTCCTGCTCTAGGTCATCTT 7589
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6044 GCAAAGTACCCTCTGTTCTCATGTCACTAATTCCTGCTCTAGGTCATCTT 6093

                   7951          .         .         .         .         . 8000
hf00341            7590 TCCTTTGTGCAGCCCACATTCCCACCATCCTGTGAACTTTGTTGTACTTG 7639
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6094 TCCTTTGTGCAGCCCACATTCCCACCATCCTGTGAACTTTGTTGTACTTG 6143

                   8001          .         .         .         .         . 8050
hf00341            7640 GTGTTGGGCAACTGGTGAGTGTTGTGACAGGCTCAGACCTGATCCTTCCT 7689
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6144 GTGTTGGGCAACTGGTGAGTGTTGTGACAGGCTCAGACCTGATCCTTCCT 6193

                   8051          .         .         .         .         . 8100
hf00341            7690 CAGGAGCAATTGGAGACCACAAATTTAAAGCAGAAATACCTGTTAAAAGC 7739
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6194 CAGGAGCAATTGGAGACCACAAATTTAAAGCAGAAATACCTGTTAAAAGC 6243

                   8101          .         .         .         .         . 8150
hf00341            7740 TTGGCTTTCCTTATATGAGTGAGGCTCCCAGCTTGGGTGTGGCCTCCTGG 7789
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6244 TTGGCTTTCCTTATATGAGTGAGGCTCCCAGCTTGGGTGTGGCCTCCTGG 6293

                   8151          .         .         .         .         . 8200
hf00341            7790 GCTCACGGATCAGCTTGCTGGGCCAGAGGGGGTCTTAGTAATGTGCTAGA 7839
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6294 GCTCACGGATCAGCTTGCTGGGCCAGAGGGGGTCTTAGTAATGTGCTAGA 6343

                   8201          .         .         .         .         . 8250
hf00341            7840 GAGACACATGCTCCCTTCTCATCGTAGAGAGCCTGCATGCTGAGAGGCTC 7889
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6344 GAGACACATGCTCCCTTCTCATCGTAGAGAGCCTGCATGCTGAGAGGCTC 6393

                   8251          .         .         .         .         . 8300
hf00341            7890 CCTTTACACACCTGCCTCTCGCTGGCTTTTCCTTTAGACCTAGCCACCAG 7939
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6394 CCTTTACACACCTGCCTCTCGCTGGCTTTTCCTTTAGACCTAGCCACCAG 6443

                   8301          .         .         .         .         . 8350
hf00341            7940 TGTTTTGAATCATGGTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCAAAAACCAGAACAT 7989
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hf00341(revised)   6444 TGTTTTGAATCATGGTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCAAAAACCAGAACAT 6493

                   8351          .   8362
hf00341            7990 GACTTAGAAATT 8001
                        ||||||||||||
hf00341(revised)   6494 GACTTAGAAATT 6505