Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 3666 bp
Revised DNA sequence, length = 3760 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN07049   122 -   142     GCG GTC TTC GTG GTG TTC GTG
     r NN07050   864 -   844     CGT TCT CGA GCT GCC CTA TCT
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   571 -   664       94-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 2 - 1588 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
ha03111               1 GCGGAGCCGGCTTCGGGACTGCGGAGACTACACACCGAGCGAGCGCCTGG 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)      1 GCGGAGCCGGCTTCGGGACTGCGGAGACTACACACCGAGCGAGCGCCTGG 50

                     51          .         .         .         .         . 100
ha03111              51 GCCCGAAGGGAGCGATGCTGTGGTTCCAGGGCGCCATTCCGGCCGCCATC 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)     51 GCCCGAAGGGAGCGATGCTGTGGTTCCAGGGCGCCATTCCGGCCGCCATC 100

                    101          .         .         .         .         . 150
ha03111             101 GCGACGGCCAAAAGGAGCGGCGCGGTCTTCGTGGTGTTCGTGGCAGGTGA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    101 GCGACGGCCAAAAGGAGCGGCGCGGTCTTCGTGGTGTTCGTGGCAGGTGA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
ha03111             151 TGATGAACAGTCTACACAGATGGCTGCAAGTTGGGAAGATGATAAAGTTA 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    151 TGATGAACAGTCTACACAGATGGCTGCAAGTTGGGAAGATGATAAAGTTA 200

                    201          .         .         .         .         . 250
ha03111             201 CAGAAGCATCTTCAAACAGTTTTGTTGCTATTAAAATCGATACCAAAAGT 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    201 CAGAAGCATCTTCAAACAGTTTTGTTGCTATTAAAATCGATACCAAAAGT 250

                    251          .         .         .         .         . 300
ha03111             251 GAAGCCTGCCTACAGTTTTCACAAATCTATCCTGTAGTGTGTGTTCCATC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    251 GAAGCCTGCCTACAGTTTTCACAAATCTATCCTGTAGTGTGTGTTCCATC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
ha03111             301 CAGTTTCTTTATTGGAGACAGTGGAATTCCCTTGGAAGTAATAGCAGGAA 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    301 CAGTTTCTTTATTGGAGACAGTGGAATTCCCTTGGAAGTAATAGCAGGAA 350

                    351          .         .         .         .         . 400
ha03111             351 GTGTTTCTGCAGATGAGCTTGTTACAAGAATTCACAAGGTCCGACAGATG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    351 GTGTTTCTGCAGATGAGCTTGTTACAAGAATTCACAAGGTCCGACAGATG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
ha03111             401 CATTTGCTAAAAAGTGAAACATCAGTAGCAAATGGCAGTCAGTCAGAAAG 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    401 CATTTGCTAAAAAGTGAAACATCAGTAGCAAATGGCAGTCAGTCAGAAAG 450

                    451          .         .         .         .         . 500
ha03111             451 TTCAGTGTCTACTCCATCTGCGTCATTTGAACCTAACAACACTTGTGAAA 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    451 TTCAGTGTCTACTCCATCTGCGTCATTTGAACCTAACAACACTTGTGAAA 500

                    501          .         .         .         .         . 550
ha03111             501 ACTCTCAGTCCAGAAATGCAGAGCTTTGTGAGATACCACCCACTTCTGAT 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    501 ACTCTCAGTCCAGAAATGCAGAGCTTTGTGAGATACCACCCACTTCTGAT 550

                    551          .         .         .         .         . 600
ha03111             551 ACAAAGTCAGATACTGCAAC------------------------------ 570
                        ||||||||||||||||||||                              
ha03111(revised)    551 ACAAAGTCAGATACTGCAACAGGAGGAGAAAGTGCAGGCCATGCCACTTC 600

                    601          .         .         .         .         . 650
ha03111             571 -------------------------------------------------- 571
                                                                          
ha03111(revised)    601 CTCTCAGGAGCCTAGTGGATGCTCAGATCAGAGACCTGCAGAGGACCTCA 650

                    651          .         .         .         .         . 700
ha03111             571 --------------AGACTAACAAAAAAACTTGAAGAAAGGAGAGAAGAG 606
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    651 ACATCCGAGTGGAAAGACTAACAAAAAAACTTGAAGAAAGGAGAGAAGAG 700

                    701          .         .         .         .         . 750
ha03111             607 AAAAGAAAAGAGGAAGAACAGAGAGAAATTAAGAAGGAAATTGAGAGGAG 656
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    701 AAAAGAAAAGAGGAAGAACAGAGAGAAATTAAGAAGGAAATTGAGAGGAG 750

                    751          .         .         .         .         . 800
ha03111             657 AAAAACTGGAAAAGAAATGTTGGATTATAAAAGAAAACAAGAAGAAGAAT 706
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    751 AAAAACTGGAAAAGAAATGTTGGATTATAAAAGAAAACAAGAAGAAGAAT 800

                    801          .         .         .         .         . 850
ha03111             707 TAACAAAAAGAATGCTGGAGGAAAGAAACAGAGAGAAAGCAGAAGATAGG 756
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    801 TAACAAAAAGAATGCTGGAGGAAAGAAACAGAGAGAAAGCAGAAGATAGG 850

                    851          .         .         .         .         . 900
ha03111             757 GCAGCTCGAGAACGTATAAAACAGCAGATTGCATTGGACCGTGCAGAGAG 806
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    851 GCAGCTCGAGAACGTATAAAACAGCAGATTGCATTGGACCGTGCAGAGAG 900

                    901          .         .         .         .         . 950
ha03111             807 AGCTGCTCGTTTTGCAAAGACAAAGGAAGAAGTAGAGGCTGCCAAAGCTG 856
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    901 AGCTGCTCGTTTTGCAAAGACAAAGGAAGAAGTAGAGGCTGCCAAAGCTG 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
ha03111             857 CTGCCTTGCTAGCAAAACAGGCAGAAATGGAAGTCAAGAGGGAATCTTAT 906
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)    951 CTGCCTTGCTAGCAAAACAGGCAGAAATGGAAGTCAAGAGGGAATCTTAT 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
ha03111             907 GCAAGAGAAAGAAGCACTGTTGCAAGAATTCAATTCCGTCTTCCTGATGG 956
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1001 GCAAGAGAAAGAAGCACTGTTGCAAGAATTCAATTCCGTCTTCCTGATGG 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
ha03111             957 TTCTTCCTTTACAAATCAGTTCCCTTCTGATGCTCCTCTAGAAGAGGCAA 1006
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1051 TTCTTCCTTTACAAATCAGTTCCCTTCTGATGCTCCTCTAGAAGAGGCAA 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
ha03111            1007 GGCAGTTTGCTGCACAGACTGTTGGCAACACTTACGGTAATTTTTCGTTA 1056
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1101 GGCAGTTTGCTGCACAGACTGTTGGCAACACTTACGGTAATTTTTCGTTA 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
ha03111            1057 GCAACCATGTTTCCCAGGAGGGAATTTACCAAAGAAGATTATAAAAAGAA 1106
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1151 GCAACCATGTTTCCCAGGAGGGAATTTACCAAAGAAGATTATAAAAAGAA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
ha03111            1107 GTTACTGGATTTGGAACTTGCCCCAAGCGCTTCGGTGGTACTGTTGCCAG 1156
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1201 GTTACTGGATTTGGAACTTGCCCCAAGCGCTTCGGTGGTACTGTTGCCAG 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
ha03111            1157 CAGGAAGACCAACTGCATCCATTGTACACTCTTCCAGCGGAGACATTTGG 1206
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1251 CAGGAAGACCAACTGCATCCATTGTACACTCTTCCAGCGGAGACATTTGG 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
ha03111            1207 ACCTTGTTGGGAACAGTGCTTTATCCATTCCTTGCCATCTGGAGATTAAT 1256
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1301 ACCTTGTTGGGAACAGTGCTTTATCCATTCCTTGCCATCTGGAGATTAAT 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
ha03111            1257 TAGCAATTTCTTGTTTAGTAATCCGCCTCCCACACAGACTTCAGTGAGAG 1306
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1351 TAGCAATTTCTTGTTTAGTAATCCGCCTCCCACACAGACTTCAGTGAGAG 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
ha03111            1307 TAACATCGTCAGAACCCCCAAACCCTGCATCATCTAGCAAATCAGAAAAA 1356
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1401 TAACATCGTCAGAACCCCCAAACCCTGCATCATCTAGCAAATCAGAAAAA 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
ha03111            1357 AGGGAACCAGTGAGAAAAAGAGTGCTGGAAAAACGTGGAGACGACTTTAA 1406
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1451 AGGGAACCAGTGAGAAAAAGAGTGCTGGAAAAACGTGGAGACGACTTTAA 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
ha03111            1407 AAAGGAGGGGAAAATTTATAGATTAAGGACTCAAGATGATGGTGAAGATG 1456
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1501 AAAGGAGGGGAAAATTTATAGATTAAGGACTCAAGATGATGGTGAAGATG 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
ha03111            1457 AAAACAACACTTGGAATGGAAATTCCACTCAACAGATGTAGTGTGACAAG 1506
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1551 AAAACAACACTTGGAATGGAAATTCCACTCAACAGATGTAGTGTGACAAG 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
ha03111            1507 TATAATATGTGCAATAATCATTGTTTCTCTTATGATTTAATTCAACTAAA 1556
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1601 TATAATATGTGCAATAATCATTGTTTCTCTTATGATTTAATTCAACTAAA 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
ha03111            1557 ATTCTACTGGAGAAGTGGGACTGCTTTATATTTTCCAACTGGTCTATAAA 1606
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1651 ATTCTACTGGAGAAGTGGGACTGCTTTATATTTTCCAACTGGTCTATAAA 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
ha03111            1607 ATGTCTCTTTATTCCTGCTTAGTGGGTGTGGGTTGAAGGTGTTTAACTCA 1656
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1701 ATGTCTCTTTATTCCTGCTTAGTGGGTGTGGGTTGAAGGTGTTTAACTCA 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
ha03111            1657 GAAAAGTAAAGACAGGAAATAACTCTCTGCTAGGTCCTTGCTTATATGGC 1706
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1751 GAAAAGTAAAGACAGGAAATAACTCTCTGCTAGGTCCTTGCTTATATGGC 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
ha03111            1707 AACCACTGCTAGAACCCTAAAAGAACCAAAAATCTGCCACAGCCTGCCTC 1756
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1801 AACCACTGCTAGAACCCTAAAAGAACCAAAAATCTGCCACAGCCTGCCTC 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
ha03111            1757 CATCAGCTTCTTATTTAGTATTTCATATGCCCATTAGCCCTATGCTTCAG 1806
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1851 CATCAGCTTCTTATTTAGTATTTCATATGCCCATTAGCCCTATGCTTCAG 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
ha03111            1807 ATGACACGTTTTGTTTAGAGCTACTTTGCTCCAAGACTCTTAAGCCCAAA 1856
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1901 ATGACACGTTTTGTTTAGAGCTACTTTGCTCCAAGACTCTTAAGCCCAAA 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
ha03111            1857 GTAACTGGTATGTCACTGAGTAACTTGACTCGGTGTCAGAGCATTTTAAC 1906
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   1951 GTAACTGGTATGTCACTGAGTAACTTGACTCGGTGTCAGAGCATTTTAAC 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
ha03111            1907 TAGCCACTCAGATGAGAATTTATGTTTAACTTCTCTTTTTACTCATCAGC 1956
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2001 TAGCCACTCAGATGAGAATTTATGTTTAACTTCTCTTTTTACTCATCAGC 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
ha03111            1957 TGCAAGCAAAATCTTGTAGTTTTTAATCTTAAACACTGAATAAAAAAACT 2006
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2051 TGCAAGCAAAATCTTGTAGTTTTTAATCTTAAACACTGAATAAAAAAACT 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
ha03111            2007 TTCCCCTAAATTGGAATGATCTTAGTTTTGCTTTGAGTTTTGTTATCTAG 2056
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2101 TTCCCCTAAATTGGAATGATCTTAGTTTTGCTTTGAGTTTTGTTATCTAG 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
ha03111            2057 CATCTTTTTGTTGCACAGGGCTCTATTGAGGTCCTATGTCTCTGATTTTT 2106
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2151 CATCTTTTTGTTGCACAGGGCTCTATTGAGGTCCTATGTCTCTGATTTTT 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
ha03111            2107 TTTTTTCCCCAGTATTGCCCTGGAGCTGTCTCTGGAAAGTAGCTGGCGAG 2156
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2201 TTTTTTCCCCAGTATTGCCCTGGAGCTGTCTCTGGAAAGTAGCTGGCGAG 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
ha03111            2157 GTTACCTTAACTATCACTGAAGAAAGAAATTTTCTGACACACTGATGGCA 2206
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2251 GTTACCTTAACTATCACTGAAGAAAGAAATTTTCTGACACACTGATGGCA 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
ha03111            2207 TGTGACTTGTCTCCTAAGTCAGTGAGGCATCACTTTGTTTGCATAAAGTA 2256
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2301 TGTGACTTGTCTCCTAAGTCAGTGAGGCATCACTTTGTTTGCATAAAGTA 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
ha03111            2257 TACGGTTTGTTAAGGCCTTTGTTCTTGTGAGATGCAAAACAGCTGCTAGT 2306
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2351 TACGGTTTGTTAAGGCCTTTGTTCTTGTGAGATGCAAAACAGCTGCTAGT 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
ha03111            2307 CTGCAACCTAGTTTTCCCTCTCACCTTTAACTGACGTTTTGTCCTCAATA 2356
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2401 CTGCAACCTAGTTTTCCCTCTCACCTTTAACTGACGTTTTGTCCTCAATA 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
ha03111            2357 ATTACACAAGGACCTAGAGTACCTATAGGACAAAAAGTATAGAATAAAAA 2406
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2451 ATTACACAAGGACCTAGAGTACCTATAGGACAAAAAGTATAGAATAAAAA 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
ha03111            2407 TATGCCTTTAGTCATTTGGTTTTTCTTAAAAAGTTGAGATTCTTAATCTG 2456
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2501 TATGCCTTTAGTCATTTGGTTTTTCTTAAAAAGTTGAGATTCTTAATCTG 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
ha03111            2457 ACTTACATGTTACTTTATCCGTATGTCTTTGTTAGTGGAGACCGCTAAAC 2506
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2551 ACTTACATGTTACTTTATCCGTATGTCTTTGTTAGTGGAGACCGCTAAAC 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
ha03111            2507 TAATGATGTTTGAAAACAGTTCCTCTGTTTTAGATTGGAAGATAGCACTC 2556
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2601 TAATGATGTTTGAAAACAGTTCCTCTGTTTTAGATTGGAAGATAGCACTC 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
ha03111            2557 TAGAGTGGACATACGGAAAGACTGTGACTTTATTTTGTAATGGGAGGAAG 2606
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2651 TAGAGTGGACATACGGAAAGACTGTGACTTTATTTTGTAATGGGAGGAAG 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
ha03111            2607 AAATTTTCTCAGAGCAAACTTTCTATTTTTTACCTGTGAAATAACAGTGA 2656
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2701 AAATTTTCTCAGAGCAAACTTTCTATTTTTTACCTGTGAAATAACAGTGA 2750

                   2751          .         .         .         .         . 2800
ha03111            2657 CTTTTTAAAATGGTGACAGTGTTGGCAAGGAAACAGCAACACAGGCTGCG 2706
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2751 CTTTTTAAAATGGTGACAGTGTTGGCAAGGAAACAGCAACACAGGCTGCG 2800

                   2801          .         .         .         .         . 2850
ha03111            2707 CTGTTGGTAGGAGTGAAAACCAGTATAATTCTTCTGAAAAACATTTATCA 2756
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2801 CTGTTGGTAGGAGTGAAAACCAGTATAATTCTTCTGAAAAACATTTATCA 2850

                   2851          .         .         .         .         . 2900
ha03111            2757 GAAACTTAAAATATTTCATACCGTTTGATCCAGTAGCTTCTTCTAAATCA 2806
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2851 GAAACTTAAAATATTTCATACCGTTTGATCCAGTAGCTTCTTCTAAATCA 2900

                   2901          .         .         .         .         . 2950
ha03111            2807 TAAATGCAGACAATGTTTAGGTAAAGACATACTCATTAAGTGTTATTTAT 2856
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2901 TAAATGCAGACAATGTTTAGGTAAAGACATACTCATTAAGTGTTATTTAT 2950

                   2951          .         .         .         .         . 3000
ha03111            2857 TTTACTCAAGAACTGGAAACCAACTAAATGCCTTCTATAGAAGTAATTTT 2906
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   2951 TTTACTCAAGAACTGGAAACCAACTAAATGCCTTCTATAGAAGTAATTTT 3000

                   3001          .         .         .         .         . 3050
ha03111            2907 TGATGAGGAGAAATGGTACAATACTAATTAACAACTTGGTTTAACATGTT 2956
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3001 TGATGAGGAGAAATGGTACAATACTAATTAACAACTTGGTTTAACATGTT 3050

                   3051          .         .         .         .         . 3100
ha03111            2957 TACTGAGCATCTGTTAAGTGTTGGGGGAAAAAGCAGCAGGATCCAGAGCT 3006
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3051 TACTGAGCATCTGTTAAGTGTTGGGGGAAAAAGCAGCAGGATCCAGAGCT 3100

                   3101          .         .         .         .         . 3150
ha03111            3007 ATAGGTACAGTGTGATCTCAGCTTTGCAAACACATTTTCTACATAGATAG 3056
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3101 ATAGGTACAGTGTGATCTCAGCTTTGCAAACACATTTTCTACATAGATAG 3150

                   3151          .         .         .         .         . 3200
ha03111            3057 TACTAGGTATTAATAGATATGTAAAGAAAGAAATCACACCATTAATAATG 3106
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3151 TACTAGGTATTAATAGATATGTAAAGAAAGAAATCACACCATTAATAATG 3200

                   3201          .         .         .         .         . 3250
ha03111            3107 GTAAGATTGGTTTATGTGATTTTAGTGGTATTTTTGGCACCCTTATATAT 3156
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3201 GTAAGATTGGTTTATGTGATTTTAGTGGTATTTTTGGCACCCTTATATAT 3250

                   3251          .         .         .         .         . 3300
ha03111            3157 GTTTTCCAAACTTTCAGCAGTGATATTATTTCCATAACTTAAAAAGTGAG 3206
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3251 GTTTTCCAAACTTTCAGCAGTGATATTATTTCCATAACTTAAAAAGTGAG 3300

                   3301          .         .         .         .         . 3350
ha03111            3207 TTTGAAAAAGAAAATCTCCAGCAAGCATCTCATTTAAATAAAGGTTTGTC 3256
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3301 TTTGAAAAAGAAAATCTCCAGCAAGCATCTCATTTAAATAAAGGTTTGTC 3350

                   3351          .         .         .         .         . 3400
ha03111            3257 ATCTTTAAAAATACAGCAATATGTGACTTTTTAAAAAAGCTGTCAAATAG 3306
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3351 ATCTTTAAAAATACAGCAATATGTGACTTTTTAAAAAAGCTGTCAAATAG 3400

                   3401          .         .         .         .         . 3450
ha03111            3307 GTGTGACCCTACTAATAATTATTAGAAATACATTTAAAAACATCGAGTAC 3356
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3401 GTGTGACCCTACTAATAATTATTAGAAATACATTTAAAAACATCGAGTAC 3450

                   3451          .         .         .         .         . 3500
ha03111            3357 CTCAAGTCAGTTTGCCTTGAAAAATATCAAATATAACTCTTAGAGAAATG 3406
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3451 CTCAAGTCAGTTTGCCTTGAAAAATATCAAATATAACTCTTAGAGAAATG 3500

                   3501          .         .         .         .         . 3550
ha03111            3407 TACATAAAAGAATGCTTCGTAATTTTGGAGTAGGAGGTTCCCTCCTCAAT 3456
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3501 TACATAAAAGAATGCTTCGTAATTTTGGAGTAGGAGGTTCCCTCCTCAAT 3550

                   3551          .         .         .         .         . 3600
ha03111            3457 TTTGTATTTTTAAAAAGTACATGGTAAAAAAAAAAATTCACAACAGTATA 3506
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3551 TTTGTATTTTTAAAAAGTACATGGTAAAAAAAAAAATTCACAACAGTATA 3600

                   3601          .         .         .         .         . 3650
ha03111            3507 TAAGGCTGTAAAATGAGAATTCTGCCCCCTCACCTCTTACCCCAGTACTA 3556
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3601 TAAGGCTGTAAAATGAGAATTCTGCCCCCTCACCTCTTACCCCAGTACTA 3650

                   3651          .         .         .         .         . 3700
ha03111            3557 TTCTCCAGAGGTAATCTATTAACAATTTCTTATGTAATTTTCAAGAAATT 3606
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3651 TTCTCCAGAGGTAATCTATTAACAATTTCTTATGTAATTTTCAAGAAATT 3700

                   3701          .         .         .         .         . 3750
ha03111            3607 TGTATGCGTATATAAGCAAATATGTAATCTTTATTTTTTAAATAAATGGG 3656
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ha03111(revised)   3701 TGTATGCGTATATAAGCAAATATGTAATCTTTATTTTTTAAATAAATGGG 3750

                   3751          . 3760
ha03111            3657 ATCATATTAT 3666
                        ||||||||||
ha03111(revised)   3751 ATCATATTAT 3760