Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC000181A_C01 KCC000181A_c01
(617 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_300853.1| hypothetical protein XP_300853 [Homo sapiens] 42 0.009
ref|NP_064121.1| pr5 [Rat cytomegalovirus] gi|9800242|gb|AAF9911... 41 0.012
emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major] 41 0.012
ref|NP_872435.1| hypothetical protein FLJ35107 [Homo sapiens] gi... 41 0.016
ref|XP_283106.1| hypothetical protein XP_283106 [Mus musculus] 40 0.027
>ref|XP_300853.1| hypothetical protein XP_300853 [Homo sapiens]
Length = 252
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.009
Identities = 38/141 (26%), Positives = 60/141 (41%), Gaps = 4/141 (2%)
Frame = -1
Query: 581 SPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGR----PARCSPSPSWSNMLKARRNA 414
SP S+ +P +S S S S+ P ++ P+ SPS S S+ + +
Sbjct: 127 SPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSP 186
Query: 413 SSRLRTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAAR 234
SS + +S++ S SS S+SSS T+SP++ ++ S S +
Sbjct: 187 SSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSS-----------------SSPSSSSPSS 229
Query: 233 SCPGARCGWQTPPDPSP*CGP 171
SCP A G + S C P
Sbjct: 230 SCPSAALGRRPQSPQSSHCAP 250
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.17
Identities = 43/174 (24%), Positives = 71/174 (40%)
Frame = -1
Query: 581 SPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARRNASSRL 402
S + S+ P +S S S S+ P + + SPS S S + ++SS
Sbjct: 48 SSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSH------SSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSS 101
Query: 401 RTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAARSCPG 222
NS++ SS+SS S+SSS ++SP++ ++ S+ + S S + S
Sbjct: 102 SPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS--PSSSSSSPSSSSSS 159
Query: 221 ARCGWQTPPDPSP*CGPCHPGQWS*MSSADQHPCETEG*SPSRSRAQRPLRQSP 60
+ +P SP P SS++ P + S S + P SP
Sbjct: 160 SSSSSSSPSSSSPSSSGSSP------SSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSP 207
Score = 33.1 bits (74), Expect = 3.3
Identities = 34/136 (25%), Positives = 58/136 (42%), Gaps = 2/136 (1%)
Frame = -1
Query: 569 SAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARRNASSRLRTKF 390
S+ + P +S S S S+P ++ P+ S SPS S+ + +SS
Sbjct: 98 SSSSSPSSSNSSSSSS--SSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSS 155
Query: 389 LNSANVSSTSSE*STS--SSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAARSCPGAR 216
+S++ SS+SS S+S SSG++ ++ P ++ S + RS S + S
Sbjct: 156 SSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTS 215
Query: 215 CGWQTPPDPSP*CGPC 168
+ P S C
Sbjct: 216 SPSSSSPSSSSPSSSC 231
>ref|NP_064121.1| pr5 [Rat cytomegalovirus] gi|9800242|gb|AAF99116.1|AF232689_7 pr5
[rat cytomegalovirus Maastricht]
Length = 629
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
Identities = 40/141 (28%), Positives = 57/141 (40%), Gaps = 2/141 (1%)
Frame = -1
Query: 614 GTPRNPETRGRSPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNM 435
G+ R P T P +A + S C G + P G++ P R RC SP W
Sbjct: 497 GSARGPTTW---PASTAASCTTRRSSSTCRG--AARPRDGSSPTPARSGRCPWSPPWPRP 551
Query: 434 LKARRNASSRLRTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTR 255
A + +R +S++ SS + S+S + T P A+R + RC T R
Sbjct: 552 GSAAASTGRGIRGSSPSSSSRSSATGTDSSSGTWTGRPTGTASRSASRPA---RCTSTPR 608
Query: 254 RSQSAARSCPGAR--CGWQTP 198
S S+ P A C TP
Sbjct: 609 ASASSGGGTPRAATWCRRSTP 629
>emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 873
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
Identities = 45/181 (24%), Positives = 72/181 (38%), Gaps = 2/181 (1%)
Frame = -1
Query: 599 PETRGRSPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARR 420
P + +P S+ + P +S S S S P ++ P + +PS S S
Sbjct: 647 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS-----AP 701
Query: 419 NASSRLRTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSA 240
+ASS +SA +S+SS S+SSS S ++ P ++ SA + S S+
Sbjct: 702 SASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 761
Query: 239 A--RSCPGARCGWQTPPDPSP*CGPCHPGQWS*MSSADQHPCETEG*SPSRSRAQRPLRQ 66
A S A + P S P + +S+ P + +PS S + P
Sbjct: 762 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 821
Query: 65 S 63
S
Sbjct: 822 S 822
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.39
Identities = 40/170 (23%), Positives = 69/170 (40%)
Frame = -1
Query: 599 PETRGRSPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARR 420
P + +P S+ + P +S S S S P ++ P + +PS S S +
Sbjct: 709 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 768
Query: 419 NASSRLRTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSA 240
+A S +S++ S SS + SSS +++P+A + S+ ++ S+
Sbjct: 769 SAPS-------SSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 821
Query: 239 ARSCPGARCGWQTPPDPSP*CGPCHPGQWS*MSSADQHPCETEG*SPSRS 90
+ S P A + P S P S SS+ P + +PS S
Sbjct: 822 SSSAPSASS--SSAPSSSSSSAPSASSS-SASSSSSSAPSASSSSAPSSS 868
>ref|NP_872435.1| hypothetical protein FLJ35107 [Homo sapiens]
gi|21751020|dbj|BAC03887.1| unnamed protein product
[Homo sapiens] gi|33872427|gb|AAH16304.1| FLJ35107
protein [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.016
Identities = 40/141 (28%), Positives = 61/141 (42%), Gaps = 4/141 (2%)
Frame = -1
Query: 581 SPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGR----PARCSPSPSWSNMLKARRNA 414
SP S+ +P +S S S S+ P ++ P+ SPS S S+ + +
Sbjct: 128 SPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSP 187
Query: 413 SSRLRTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAAR 234
SS + +S++ S SS S+SSS T+SP+ P ++ S S S +
Sbjct: 188 SSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPST-SSPSSSSPS-----------SSSPSS 235
Query: 233 SCPGARCGWQTPPDPSP*CGP 171
SCP A G + S C P
Sbjct: 236 SCPSAALGRRPQSPQSSHCAP 256
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.51
Identities = 43/174 (24%), Positives = 71/174 (40%)
Frame = -1
Query: 581 SPLWSAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARRNASSRL 402
S + S+ P +S S S S+ P + S SPS S+ + ++SS
Sbjct: 48 SSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSS--------HSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSS 99
Query: 401 RTKFLNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAARSCPG 222
+ +S+N SS+SS S SSS ++S ++ ++ S+ + S S+ S
Sbjct: 100 SSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSS 159
Query: 221 ARCGWQTPPDPSP*CGPCHPGQWS*MSSADQHPCETEG*SPSRSRAQRPLRQSP 60
+ + P S P G S SS++ P + S S + P SP
Sbjct: 160 SSSSSSSSPSSS---SPSSSG--SSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSP 208
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.5
Identities = 42/173 (24%), Positives = 72/173 (41%), Gaps = 2/173 (1%)
Frame = -1
Query: 569 SAGAPPCASGSGRCSGFWGSTPPRGTAWHPGRPARCSPSPSWSNMLKARRNASSRLRTKF 390
S+ + P +S S S S+P ++ P+ S SPS S+
Sbjct: 99 SSSSSPSSSNSSSSSS--SSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSS---------------- 140
Query: 389 LNSANVSSTSSE*STSSSGTASPAACRRPWAARLSACCRCG*TTRRSQSAARSCPGARCG 210
+S++ S +SS S SSS ++S ++ P ++ S+ ++ S S++ S P +
Sbjct: 141 -SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSS 199
Query: 209 WQTPPDPSP*CGPCHPGQWS*MSSADQHPCETEG*S--PSRSRAQRPLRQSPR 57
+P SP S S + P + S PS + +RP QSP+
Sbjct: 200 SPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRP--QSPQ 250
>ref|XP_283106.1| hypothetical protein XP_283106 [Mus musculus]
Length = 166
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.027
Identities = 56/176 (31%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 2/176 (1%)
Frame = +3
Query: 9 HYRCRMHRHWLVDQPEAGALAQWALCSGA*RALTFCFTGMLVCGRHSTPLTWMARATSRR 188
H R R H+ WL AG SGA R+ T T T+ A AT+
Sbjct: 16 HPRLRPHQPWLRAPGPAG--------SGARRSPT-------------TAATYAAAATAEA 54
Query: 189 RIWRRLPTATGSRAATRSTL*APCCLATTAA--RRQARSPRAPASCWGGGAAGGR*SLGR 362
L A + L AP AA ARSPR P GG AAG
Sbjct: 55 AAAASLDALV---TANQDVLGAPTAATRVAAPAAATARSPRHP----GGRAAGAE----S 103
Query: 363 CGAHVCAVQELRTQPGGRVAAGLQHVRPGRRRAASRWATWMPRCPAWRCAAPKPAA 530
A + R + GGR A R GRR A A P CPA +AP PA+
Sbjct: 104 PAVGPPAARRRRARGGGRGAGPPCAARCGRRAARREDAGRRPHCPAR--SAPAPAS 157
