KMC018620A_c01
[Fasta Sequence]
[Nr Search]
[EST assemble image]
Fasta Sequence
>KMC018620A_C01 KMC018620A_c01
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aaaCCGTTGCTAATGTGTGTATTTGCATCAGATAAAAACCGTCGGTAATACATTAATCTT
TTTTAAGCCTGCAAAAAGTGTACGGACAAGTAACATTTTCCAACTTCCAAACACTAACAA
CCTGATCATTTTAAAAGGGTAAAAAGAAAAAAGACAATTGTGGTAAGACAAGGTTCTGGT
GCTCAGACTCAGAGACAGAGAGAAAGAGATGGAAGCTCAAAGTAACCATCACCAAAAATG
TCTCTACTCCCACTTTCCTTGCACCTGCTTGGTCTTGTAAAATTTGTCATCTCCGTCTCA
TCCTCCACGTTCTCAACACCACACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTCTCTGTTTCAATT
TCAGTTTCACTTTCTTCTTCCACTTCATCATCACTTTCATCATCATTAATATCATCATCA
TCACTCCATTCCTCAACAACTTCTTCTTCCTCATCAACAACTTCATCATCATCACCATCA
TCAGAAAGACCCTCCTCCTCAAACAGGTGCAGCCTGAGCCTGCCATCACCACGCTCTGCA
TGAAAACAAGGGCGTGGTGAAGGTGAAGCAACAGCTTCCAAAATGAGCCTACCACCTTCA
CGATGAGGCCTCACACGAACCCCACCAAAATCAGTGATTGAAGTCA
Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC018620A_C01 KMC018620A_c01
(706 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|NP_192190.1| hypothetical protein; protein id: At4g02810.1 [... 77 2e-13
ref|NP_197427.1| putative protein; protein id: At5g19260.1 [Arab... 75 7e-13
gb|AAO50865.1| similar to Leishmania major. Ppg3 [Dictyostelium ... 74 2e-12
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens] 74 3e-12
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens] 73 3e-12
>ref|NP_192190.1| hypothetical protein; protein id: At4g02810.1 [Arabidopsis
thaliana] gi|25407156|pir||G85035 hypothetical protein
AT4g02810 [imported] - Arabidopsis thaliana
gi|4263526|gb|AAD15352.1| hypothetical protein
[Arabidopsis thaliana] gi|7269766|emb|CAB77766.1|
hypothetical protein [Arabidopsis thaliana]
Length = 271
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S+ F R V+ ++E GRL+++A+ SP CF +ER +GRLRL L + S D
Sbjct: 122 SVNGFNNSRMVKSYKEDGRLVVQAIRVCSPPRCFVSERREGRLRLCLSQNSLNSQDA--- 178
Query: 524 EVVDEEEEVVEEWSDDDDINDDESDDEVEEESETEIETEKEEEEEEECGVENVEDETEMT 345
EE EE +DD + +E ++E EEE E E E E+EEEEEEE E + E
Sbjct: 179 ------EEEFEEEDEDDQYDAEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEEGIVGNNE-- 230
Query: 344 NF----------TRPS-RCKESG 309
NF RP RC E+G
Sbjct: 231 NFEGKSGNKKVSNRPKRRCNENG 253
>ref|NP_197427.1| putative protein; protein id: At5g19260.1 [Arabidopsis thaliana]
Length = 288
Score = 75.5 bits (184), Expect = 7e-13
Identities = 44/127 (34%), Positives = 66/127 (51%)
Frame = -3
Query: 704 TSITDFGGVRVRPHREGGRLILEAVASPSPRPCFHAERGDGRLRLHLFEEEGLSDDGDDD 525
T++ F +++RPHRE GRL++ A +P CF A+R +GRLRL + + D +
Sbjct: 171 TTMRGFQCIQMRPHRENGRLVMTATNAPPRNGCFQADRSNGRLRLSILK--------DSN 222
Query: 524 EVVDEEEEVVEEWSDDDDINDDESDDEVEEESETEIETEKEEEEEEECGVENVEDETEMT 345
E V+ EEE +E E EE E E E E++E+E+E G+ENV+
Sbjct: 223 EFVENEEETIE--------------PEETEEYEEEEEEEEDEDEDEVMGIENVQVSRRCV 268
Query: 344 NFTRPSR 324
R +R
Sbjct: 269 QGDRENR 275
>gb|AAO50865.1| similar to Leishmania major. Ppg3 [Dictyostelium discoideum]
Length = 374
Score = 73.9 bits (180), Expect = 2e-12
Identities = 53/109 (48%), Positives = 68/109 (61%), Gaps = 2/109 (1%)
Frame = +1
Query: 328 LGLVKF--VISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTT 501
LG+ F ++ SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++
Sbjct: 54 LGVASFLNILDTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 113
Query: 502 SSSSSTTSSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMS 648
SSSSS++SSSS SS SSS+ S S S S+ +++S S
Sbjct: 114 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 162
Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
Identities = 53/106 (50%), Positives = 65/106 (61%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 267 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 326
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*G 669
S SS SSS+ S S S S+ +++S S S G
Sbjct: 327 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSG 372
Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
Identities = 53/110 (48%), Positives = 67/110 (60%)
Frame = +1
Query: 319 LHLLGLVKFVISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSST 498
L++L S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS+
Sbjct: 60 LNILDTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 119
Query: 499 TSSSSSTTSSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMS 648
+SSSSS++SSSS SS SSS+ S S S S+ +++S S
Sbjct: 120 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 169
Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
Identities = 51/92 (55%), Positives = 60/92 (64%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 282 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 341
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGE 627
S SS SSS+ S S S S+ GE
Sbjct: 342 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGE 373
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 75 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 134
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 76 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 135
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 72 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 131
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 79 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 138
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
Sbjct: 139 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 177
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 74 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 133
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMS 648
S SS SSS+ S S S S+ +++S S
Sbjct: 134 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 172
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-11
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 80 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 139
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-11
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 93 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 152
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 82 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 141
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 89 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 148
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 90 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 149
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 92 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 151
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 117 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 176
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 95 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 154
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMS 648
S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 169 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 228
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S SS SSS+ S S S S+ +++S S
Sbjct: 229 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 267
Score = 65.1 bits (157), Expect = 9e-10
Identities = 44/71 (61%), Positives = 51/71 (70%)
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S SSS+ S+ SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS++SSS
Sbjct: 304 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 363
Query: 532 SPSSERPSSSN 564
S SS S N
Sbjct: 364 SSSSSSSSGEN 374
>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
Length = 252
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S SSS+ S+P SSSSSSS S S S S SS+SSS SSS SSSS S ++SSSSS++SSS
Sbjct: 108 SSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS--SPSSSSSSSSSSSS 165
Query: 532 SPSSERPSSSNRC-SLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SPSS PSSS S S SP S+ + + + S P S T +P S
Sbjct: 166 SPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSS 220
Score = 69.7 bits (169), Expect = 4e-11
Identities = 54/104 (51%), Positives = 65/104 (61%), Gaps = 1/104 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSS-SSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSS 528
S SSS+ S+ HSSSS SSS S S S SSS+SSS SSS SSSS SS +SSSSS++SS
Sbjct: 68 SPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS 127
Query: 529 SSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
S SS PSSS+ S S PS S+ +++S S PS
Sbjct: 128 PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS---SPSSSSSSSSSSSSSPS 168
Score = 68.6 bits (166), Expect = 8e-11
Identities = 51/115 (44%), Positives = 67/115 (57%)
Frame = +1
Query: 349 ISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSS 528
I SSS+ S+P SS SSSS S S S S SS+SS+ S S SSSS S ++S+SSS++SS
Sbjct: 55 IPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSS 114
Query: 529 SSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SSPSS SSS+ S S SP S+ +++S S S + + P S
Sbjct: 115 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSS 169
Score = 68.6 bits (166), Expect = 8e-11
Identities = 56/105 (53%), Positives = 67/105 (63%), Gaps = 4/105 (3%)
Frame = +1
Query: 358 SSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSS--SSSTTSSS 531
SSS+ S+P SSSSSSS S S S S SSS+SSS SSS SSSS SS++SS SSS++SSS
Sbjct: 85 SSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSS 144
Query: 532 SP--SSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
SP SS PSSS+ S S S S+ G + +S S P S
Sbjct: 145 SPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSS-SSPSSSGSSPSSSNSSPSS 188
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-10
Identities = 53/103 (51%), Positives = 61/103 (58%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SS+ S+P SSSSSSS S S S SSS SSS SSS SSSS SS+ SSS S+ SSS
Sbjct: 126 SSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSS---SSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSS 182
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
+ S SSS S S PSPRS+ +T+S S PS
Sbjct: 183 NSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSS--SPSSSSSSTSSPSSSSPS 223
Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-10
Identities = 60/137 (43%), Positives = 74/137 (53%), Gaps = 7/137 (5%)
Frame = +1
Query: 271 GSSK*PSPKMSLLPLSLHLLGLVKFVISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSI--SVSLSSST 444
GS S S+L S+ L + S SSS S+P SSS SSS S S S S +SS
Sbjct: 34 GSRSSSSSSRSILSSSI-LSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSP 92
Query: 445 SSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSSSPSSERPSS-----SNRCSLSLPSPRSA*KQ 609
SSS SSS S SS +SS++SSSSS +SSSS SS PSS S+ S S SP S+
Sbjct: 93 SSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSS 152
Query: 610 GRGEGEATASKMSLPPS 660
+++S S P S
Sbjct: 153 PSSSSSSSSSSSSSPSS 169
Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-10
Identities = 52/104 (50%), Positives = 64/104 (61%), Gaps = 1/104 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+P SS+SSSS S S S SSS+SSS SSS SSS SS++SSSS ++SSS
Sbjct: 94 SSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSS--SSSPSSSSSSSSSSPSSSSS 151
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSL-SLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
SPSS SSS+ S S SP S+ + +S S P S
Sbjct: 152 SPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSS 195
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-09
Identities = 54/107 (50%), Positives = 64/107 (59%), Gaps = 1/107 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSST-TSS 528
S SSS S+ SSSSS+S S S S SSS SSS SSS SSSS SS++SSSSS +SS
Sbjct: 73 SPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSS 132
Query: 529 SSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*G 669
SSPSS SSS+ S S SP S+ +++S S PS G
Sbjct: 133 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS---SSSSSSSSSSPSSSSPSSSG 176
Score = 58.2 bits (139), Expect = 1e-07
Identities = 53/118 (44%), Positives = 63/118 (52%), Gaps = 4/118 (3%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTT--- 522
S SSS+ S SSS S S+ S S SSS SSS SSS S SS HSS++ SSSS+T
Sbjct: 35 SRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSS--SPSSSHSSSSPSSSSSTSSP 92
Query: 523 -SSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SSSS SS PSSSN S S S S+ + +S S P S + + P S
Sbjct: 93 SSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSS--SSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 148
Score = 52.0 bits (123), Expect = 8e-06
Identities = 43/78 (55%), Positives = 50/78 (63%), Gaps = 8/78 (10%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSV------SISVSLSSSTSSSLSSSLISS--SSLHSSTTSS 507
S SSS+ S+P SSS SSS S S S S SS +SSS S S SS SS SST+S
Sbjct: 158 SSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSP 217
Query: 508 SSSTTSSSSPSSERPSSS 561
SSS+ SSSSPSS PS++
Sbjct: 218 SSSSPSSSSPSSSCPSAA 235
Score = 50.1 bits (118), Expect = 3e-05
Identities = 41/93 (44%), Positives = 52/93 (55%), Gaps = 5/93 (5%)
Frame = +1
Query: 385 SSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTT-SSSSPSS----ER 549
S S SS S S S+ SS SSS+ SS SSSS SS +SSS S++ SSSSPSS
Sbjct: 32 SGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSS 91
Query: 550 PSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMS 648
PSSS+ S S PS ++ +++S S
Sbjct: 92 PSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSS 124
Score = 47.0 bits (110), Expect = 3e-04
Identities = 40/99 (40%), Positives = 51/99 (51%), Gaps = 1/99 (1%)
Frame = +1
Query: 400 SSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTS-SSSPSSERPSSSNRCSL 576
S S S S S S SSS+ SS I SSS SS+ SSS S++S SSS SS PSSS+ S
Sbjct: 32 SGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSS 91
Query: 577 SLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
S S+ +++S S P S + + P S
Sbjct: 92 PSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 130
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.12
Identities = 32/64 (50%), Positives = 38/64 (59%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SS+ S+P SSSSS S S S S SSS++SS SSS SSSS SS S++ S
Sbjct: 184 SSPSSSSSSPSSSSSSPS-PRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQS 242
Query: 532 SPSS 543
SS
Sbjct: 243 PQSS 246
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 32/93 (34%), Positives = 43/93 (45%), Gaps = 4/93 (4%)
Frame = +1
Query: 427 SLSSSTSSSLSSSLISSSSLHS----STTSSSSSTTSSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPR 594
S+S ST S + ++L S S++SSS S SSS SS PSSS+ S SP
Sbjct: 11 SISGSTKCRCGSRIAGPNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPS 70
Query: 595 SA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
S+ ++S S PS T +P S
Sbjct: 71 SS--------SPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSS 95
>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 73.2 bits (178), Expect = 3e-12
Identities = 57/115 (49%), Positives = 69/115 (59%), Gaps = 1/115 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+P SSSSSSS S S S S SS+SSS SSS SSSS S ++SSSSS++SSS
Sbjct: 109 SSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS--SPSSSSSSSSSSSS 166
Query: 532 SPSSERPSSSNRC-SLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SPSS PSSS S S SP S+ + + + S P S T +P S
Sbjct: 167 SPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTS 221
Score = 72.0 bits (175), Expect = 7e-12
Identities = 50/103 (48%), Positives = 64/103 (61%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ HSSSS SS S + S S SSS+SSS S S +SSS SS++ SSSS++SSS
Sbjct: 68 SHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSS 127
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
SPSS S S+ S S SP S+ +++S S P S
Sbjct: 128 SPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSS 170
Score = 68.9 bits (167), Expect = 6e-11
Identities = 55/114 (48%), Positives = 65/114 (56%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ HSSSS SS S S S SSSTSS SSS SSSS SS+ SSSSS SSS
Sbjct: 59 SSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSS--SSS 116
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SPSS SSS+ S S SP S+ +++S S S + + P S
Sbjct: 117 SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSS 170
Score = 67.4 bits (163), Expect = 2e-10
Identities = 58/129 (44%), Positives = 67/129 (50%)
Frame = +1
Query: 274 SSK*PSPKMSLLPLSLHLLGLVKFVISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSS 453
SS S S P S H S SS + S+ SSSSS S S S S S SSS SSS
Sbjct: 62 SSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSS 121
Query: 454 LSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEAT 633
SSS S SS SS +SSSSS++SS S SS PSSS+ S S S S+ G +
Sbjct: 122 SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSS-SSPSSSGSSP 180
Query: 634 ASKMSLPPS 660
+S S P S
Sbjct: 181 SSSNSSPSS 189
Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-10
Identities = 52/104 (50%), Positives = 64/104 (61%), Gaps = 1/104 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+P SS+SSSS S S S SSS+SSS SSS SSS SS++SSSS ++SSS
Sbjct: 95 SSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSS--SSSPSSSSSSSSSSPSSSSS 152
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSL-SLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
SPSS SSS+ S S SP S+ + +S S P S
Sbjct: 153 SPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSS 196
Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-10
Identities = 53/115 (46%), Positives = 66/115 (57%), Gaps = 1/115 (0%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ SS SSS+ S S S S SS+SSS SSS SSSS SS++SSSSS+ SSS
Sbjct: 91 SPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSS 150
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTP-PKS 693
S S SSS+ S S PS S G + +S S S + +P P+S
Sbjct: 151 SSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRS 205
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-09
Identities = 55/118 (46%), Positives = 69/118 (57%), Gaps = 4/118 (3%)
Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSS---SSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTT 522
S SSS+ S+P SSSSS SS S S S S SSS+ SS SSS SSSS SS++ SSS ++
Sbjct: 120 SSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSS 179
Query: 523 SSSSPSSERPSSSN-RCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SSS SS SSS+ S S PSPRS+ +T+S + PS + + P S
Sbjct: 180 PSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSS--SPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSS 235
Score = 63.2 bits (152), Expect = 3e-09
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Frame = +1
Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+ S SSSSS S S S SSS SSS SS SSSS SS++S SSS+ SSS
Sbjct: 117 SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSS 176
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
S +SS S S PS S+ R +++S + PS + + P S
Sbjct: 177 GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSS 230
Score = 62.8 bits (151), Expect = 5e-09
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Frame = +1
Query: 358 SSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSS--TTSSS 531
SS + S+P SSSS+SS S S S S SSS SSS SSS SSSS SS++SSSSS +SSS
Sbjct: 76 SSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPS-SSSS 134
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*G 669
SPSS SSS+ S S SP S+ +++S S PS G
Sbjct: 135 SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS---SSSSSSSSSSPSSSSPSSSG 177
Score = 61.6 bits (148), Expect = 1e-08
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Frame = +1
Query: 346 VISVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTS 525
++S S + S P SSSSSSS S S S S SS+ SS S S SS+S SS++SSSSS++
Sbjct: 45 ILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSP 104
Query: 526 SSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPS 660
SSS SS SSS+ S S S S +++S S P S
Sbjct: 105 SSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 149
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Query: 352 SVSSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTTSSS 531
S SSS+ S+P SSSSS S S S S S SSS SSS SS SS S +S+ SSSSS+ SSS
Sbjct: 138 SSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 197
Query: 532 SPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
S S SSS S S S S +++ S P + G P+S
Sbjct: 198 SSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQSPQS 251
Score = 59.3 bits (142), Expect = 5e-08
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Frame = +1
Query: 358 SSSTFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSSSSSTT----- 522
S S+ S+ S SSS S SI S SSS+S S S S S SS HSS++ SSSS+T
Sbjct: 35 SRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSS 94
Query: 523 SSSSPSSERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
SSSS SS PSSSN S S S S+ + +S S P S + + P S
Sbjct: 95 SSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSS--SSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 149
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Query: 364 STFSTPHSSSSSSSFSVSISVSLSSSTSSSLSSSLISSSSLHSSTTSS-SSSTTSSSSPS 540
S + P++ S S S S S S S +SS LSSS+ SSSS SS +SS SSS+ SSS S
Sbjct: 22 SRIAGPNALGSGGSRSSSSS-SRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSS 80
Query: 541 SERPSSSNRCSLSLPSPRSA*KQGRGEGEATASKMSLPPSR*GLTRTPPKS 693
S SSS+ S S S S+ +++S S P S + + P S
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S SS+ S+P SSSSS SS S S S SS ++SS SSS SSSS SS S++
Sbjct: 185 SSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGR 244
Query: 520 TSSSSPSS 543
S SS
Sbjct: 245 RPQSPQSS 252
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.9
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Sbjct: 11 SISGSTKCRCGSRIAGPNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHS 70
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Sbjct: 71 SSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSS 106
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Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
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Lotus japonicus
Kazusa DNA Research Institute