Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC009911A_C01 KMC009911A_c01
(525 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
emb|CAA07228.1| hypothetical protein [Cicer arietinum] 149 2e-35
dbj|BAB01283.1| emb|CAA07228.1~gene_id:MMJ24.8~similar to unknow... 114 9e-25
ref|NP_566820.1| expressed protein; protein id: At3g27530.1 [Ara... 114 9e-25
gb|AAL07004.1| AT3g27530/MMJ24_7 [Arabidopsis thaliana] gi|24111... 114 9e-25
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens] 57 1e-07
>emb|CAA07228.1| hypothetical protein [Cicer arietinum]
Length = 129
Score = 149 bits (376), Expect = 2e-35
Identities = 77/90 (85%), Positives = 82/90 (90%)
Frame = -1
Query: 525 LENEVKALKREGHSAFPDVEAIKAEAREEAQKESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARLL 346
LENEVKAL+ EG S FPDVEAIKAEAREEA KESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARLL
Sbjct: 40 LENEVKALRGEGVSTFPDVEAIKAEAREEALKESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARLL 99
Query: 345 ELGEDVDKLLEGVGDDVEAAEDVEDDEDDE 256
ELGEDVD+LLEG+GDD AAED +D+ED E
Sbjct: 100 ELGEDVDQLLEGIGDDAGAAEDGDDEEDAE 129
>dbj|BAB01283.1| emb|CAA07228.1~gene_id:MMJ24.8~similar to unknown protein
[Arabidopsis thaliana]
Length = 924
Score = 114 bits (284), Expect = 9e-25
Identities = 59/87 (67%), Positives = 71/87 (80%), Gaps = 1/87 (1%)
Frame = -1
Query: 525 LENEVKALKR-EGHSAFPDVEAIKAEAREEAQKESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARL 349
LE EVK+LK E FPD+EAIK E R+EAQKESE ELNDLLVCLGQE+SKV++LSA+L
Sbjct: 838 LEQEVKSLKGGESPMQFPDIEAIKEEVRKEAQKESEDELNDLLVCLGQEESKVEKLSAKL 897
Query: 348 LELGEDVDKLLEGVGDDVEAAEDVEDD 268
+ELG DVDKLLE +GD+ EA + E+D
Sbjct: 898 IELGVDVDKLLEDIGDESEAQAESEED 924
>ref|NP_566820.1| expressed protein; protein id: At3g27530.1 [Arabidopsis thaliana]
Length = 914
Score = 114 bits (284), Expect = 9e-25
Identities = 59/87 (67%), Positives = 71/87 (80%), Gaps = 1/87 (1%)
Frame = -1
Query: 525 LENEVKALKR-EGHSAFPDVEAIKAEAREEAQKESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARL 349
LE EVK+LK E FPD+EAIK E R+EAQKESE ELNDLLVCLGQE+SKV++LSA+L
Sbjct: 828 LEQEVKSLKGGESPMQFPDIEAIKEEVRKEAQKESEDELNDLLVCLGQEESKVEKLSAKL 887
Query: 348 LELGEDVDKLLEGVGDDVEAAEDVEDD 268
+ELG DVDKLLE +GD+ EA + E+D
Sbjct: 888 IELGVDVDKLLEDIGDESEAQAESEED 914
>gb|AAL07004.1| AT3g27530/MMJ24_7 [Arabidopsis thaliana] gi|24111295|gb|AAN46771.1|
At3g27530/MMJ24_7 [Arabidopsis thaliana]
Length = 505
Score = 114 bits (284), Expect = 9e-25
Identities = 59/87 (67%), Positives = 71/87 (80%), Gaps = 1/87 (1%)
Frame = -1
Query: 525 LENEVKALKR-EGHSAFPDVEAIKAEAREEAQKESEGELNDLLVCLGQEQSKVDRLSARL 349
LE EVK+LK E FPD+EAIK E R+EAQKESE ELNDLLVCLGQE+SKV++LSA+L
Sbjct: 419 LEQEVKSLKGGESPMQFPDIEAIKEEVRKEAQKESEDELNDLLVCLGQEESKVEKLSAKL 478
Query: 348 LELGEDVDKLLEGVGDDVEAAEDVEDD 268
+ELG DVDKLLE +GD+ EA + E+D
Sbjct: 479 IELGVDVDKLLEDIGDESEAQAESEED 505
>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
Length = 252
Score = 57.0 bits (136), Expect = 1e-07
Identities = 44/90 (48%), Positives = 59/90 (64%), Gaps = 1/90 (1%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SS SSSS SS++STSSP+ SSS S+SSPSSSN + S S+ S +S S SSPS S
Sbjct: 76 SSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSS--SSPSSSSSSSSSSPSSSSS 133
Query: 437 A-SSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+ SS +S+ +S S ++ PS S+ +S S
Sbjct: 134 SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 163
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-06
Identities = 38/89 (42%), Positives = 55/89 (61%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SS SSS++SS++S+SSP+ SSS S+SSPSSS+ + S S+ S +S S S S S
Sbjct: 101 SSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSS 160
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS +S +S S + PS ++ S S
Sbjct: 161 SSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSS 189
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
Identities = 36/80 (45%), Positives = 52/80 (65%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSSSSS+SS++S SS +PSSS S+ S S+S+ + S S+ S + RS S S S
Sbjct: 154 SSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSS 213
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPS 496
SS +S+ +S+S ++ CPS
Sbjct: 214 TSSPSSSSPSSSSPSSSCPS 233
Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-06
Identities = 43/96 (44%), Positives = 57/96 (58%), Gaps = 7/96 (7%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSP-------TPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFS 415
SSSSSSS SS+ S+SSP +PSSS STSSPSSS+ + S S P ++ S S
Sbjct: 58 SSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSS------SSPSSSNSSSS 111
Query: 416 SPSLSF*ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
S S S SS +S+ +S S ++ PS S+ +S S
Sbjct: 112 SSSSS--PSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 145
Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-06
Identities = 41/89 (46%), Positives = 54/89 (60%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSSSSS SS++S+SS +PSS S+SSPSSS+ + S S S +S S SS S S
Sbjct: 110 SSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS--SSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSP 167
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS S+ +S S + PS S+ S S
Sbjct: 168 SSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 196
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-05
Identities = 37/87 (42%), Positives = 56/87 (63%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSS SS++S++S+SS +PSSS S+SS S S+ + S S+ S S S SSPS S
Sbjct: 99 SSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSS 158
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
+SS +S+ +S+S ++ S S+ +S
Sbjct: 159 SSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSS 185
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-05
Identities = 40/89 (44%), Positives = 54/89 (59%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SS SSSS+SS++S SS SSS S+SSPSSS+ + S S S +S S SS S S
Sbjct: 90 SSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS- 148
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS S+ +S+S ++ PS S +S S
Sbjct: 149 SSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGS 177
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-05
Identities = 40/90 (44%), Positives = 55/90 (60%), Gaps = 1/90 (1%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSSS S S++ SS PSSS S+SSPSSS + S S+ S +S S SSPS S
Sbjct: 38 SSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSS 97
Query: 437 ASSLA-SAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS + S+ +S+S ++ PS S+ +S S
Sbjct: 98 SSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS 127
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-05
Identities = 39/89 (43%), Positives = 57/89 (63%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSSS S+SS++S+SSP+ SSS +SS SSS+ + S S+ S P +S S SS S S
Sbjct: 112 SSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSS---SSPSSSSSSSSSSSSSPS 168
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS +S+ + +S N+ S S+ +S S
Sbjct: 169 SSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSS 197
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-05
Identities = 38/87 (43%), Positives = 55/87 (62%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSS+SS SS++S+SS +PSSS S+SS SSS+ + S S+ S P +S S SS S S
Sbjct: 85 SSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPS-SSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSS 143
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
+S +S+ S+S ++ S S +S
Sbjct: 144 SSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSS 170
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 36/87 (41%), Positives = 54/87 (61%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSSS SS+SS++S+S + SSS S+SS SSS+ S S+ S +S S SSPS S
Sbjct: 113 SSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSP 172
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
+SS +S +++S ++ S S+ +S
Sbjct: 173 SSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSS 199
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 38/89 (42%), Positives = 52/89 (57%), Gaps = 2/89 (2%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPS--SSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLS 430
SSSSSSS+S ++S+SSP+ SSS S+SS S SS+ S + S S S SSPS S
Sbjct: 137 SSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 196
Query: 431 F*ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
+ S S+ +S+S + PS S +S
Sbjct: 197 SSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSS 225
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-04
Identities = 41/91 (45%), Positives = 55/91 (60%), Gaps = 4/91 (4%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHT----SRSFSSPS 424
SSSSSS +SS++S+SS +PSSS S+ S SSS+ + S S+ S P + S S SSPS
Sbjct: 129 SSSSSSPSSSSSSSSS-SPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPS 187
Query: 425 LSF*ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
S SS S+ +S S + PS S+ TS
Sbjct: 188 SS---SSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTS 215
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
Identities = 39/92 (42%), Positives = 57/92 (61%), Gaps = 3/92 (3%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLAL--SLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLS 430
SSS SS+ ++S+SS +PSSS S+SSPSSS+ + S S+ S +S S SSPS S
Sbjct: 47 SSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSS 106
Query: 431 F*ASSLASAF-IASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS +S+ +S+S ++ PS S+ S S
Sbjct: 107 NSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 138
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-04
Identities = 40/91 (43%), Positives = 55/91 (59%), Gaps = 4/91 (4%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSS----AASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPS 424
SS SSSS+SS ++S+SSP+ SSS S+SSPSSS+ + S S+ S +S S SSPS
Sbjct: 115 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPS-SSSSSSSSSSSSPSSSSPS 173
Query: 425 LSF*ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
S S S+ +S S ++ PS S+ S
Sbjct: 174 SS---GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPS 201
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.003
Identities = 29/64 (45%), Positives = 40/64 (62%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
SSS SS +SS +S SS + S S S+SSPS + + S S+ S P +S S SSPS S
Sbjct: 173 SSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSSSPSSSCP 232
Query: 437 ASSL 448
+++L
Sbjct: 233 SAAL 236
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.006
Identities = 33/84 (39%), Positives = 48/84 (56%)
Frame = +2
Query: 266 SSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF*ASS 445
S S SS++S+ S SS LS+S PSSS+ + S S+ S +S S SSPS S SS
Sbjct: 32 SGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSS 91
Query: 446 LASAFIASTSGNAECPSLFSAFTS 517
+S+ +S+S + S S+ +S
Sbjct: 92 PSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSS 115
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.013
Identities = 28/52 (53%), Positives = 36/52 (68%), Gaps = 6/52 (11%)
Frame = +2
Query: 254 HSSSSSSSTSSAASTSSPTP------SSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCP 391
+SS SSSS+S ++S+SSP+P SSS STSSPSSS + S S+ SCP
Sbjct: 183 NSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSS--SPSSSSPSSSCP 232
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.028
Identities = 33/87 (37%), Positives = 49/87 (55%)
Frame = +2
Query: 263 SSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF*AS 442
S SSS+SS + SS SSS+ +SS SSS+ + S S+ S +S SS S S +S
Sbjct: 35 SRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSS 94
Query: 443 SLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
S +S+ + +S N+ S S+ +S S
Sbjct: 95 SSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSS 121
Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.7
Identities = 27/89 (30%), Positives = 46/89 (51%)
Frame = +2
Query: 257 SSSSSSSTSSAASTSSPTPSSSLSTSSPSSSNLALSLSTLLCSCPRHTSRSFSSPSLSF* 436
S S S+ + + P S + S SSS+ ++ S++L S +S S SSPS S
Sbjct: 11 SISGSTKCRCGSRIAGPNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPS 70
Query: 437 ASSLASAFIASTSGNAECPSLFSAFTSFS 523
+SS +S+ +S+ ++ S S+ +S S
Sbjct: 71 SSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSS 99
Database: nr
Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
Number of letters in database: 448,689,247
Number of sequences in database: 1,393,205
Lambda K H
0.318 0.135 0.401
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 412,450,557
Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 8564322
Number of successful extensions: 118096
Number of sequences better than 10.0: 1730
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 52552
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 87456
length of database: 448,689,247
effective HSP length: 115
effective length of database: 288,470,672
effective search space used: 17019769648
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 12
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
