Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC008648A_C01 KMC008648A_c01
(650 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major] 55 6e-07
pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] ... 55 8e-07
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major] 54 1e-06
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens] 54 2e-06
ref|NP_596690.1| hypothetical serine-rich secreted protein [Schi... 52 5e-06
>emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 873
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-07
Identities = 50/146 (34%), Positives = 68/146 (46%), Gaps = 6/146 (4%)
Frame = +3
Query: 192 ATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSL 371
AT E S+ S P+ SS+S+SS S + A + SSSS P S
Sbjct: 608 ATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 667
Query: 372 SPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSP------APSLSLDSPPTSL 533
S S+S+++A SS+ PS S+ SA S S A S S S APS S S P+S
Sbjct: 668 SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 727
Query: 534 SFDSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
S +P + S PS ++ S + S
Sbjct: 728 SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 753
Score = 55.1 bits (131), Expect = 8e-07
Identities = 53/144 (36%), Positives = 70/144 (47%), Gaps = 3/144 (2%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSS-SASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ SS+ SASS S + A S+ SSSS P
Sbjct: 707 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS 766
Query: 366 SLSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSF 539
S S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 767 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSSSSS 823
Query: 540 DSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS ++ S + S
Sbjct: 824 SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 847
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-06
Identities = 44/130 (33%), Positives = 63/130 (47%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
+S+ S P+ S+ SASS S + + SSSS P S S SSS+++A
Sbjct: 688 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 747
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
+S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P + S PS
Sbjct: 748 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS--SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 805
Query: 582 ERTSSSVARS 611
++ S + S
Sbjct: 806 SSSAPSASSS 815
Score = 52.0 bits (123), Expect = 7e-06
Identities = 42/130 (32%), Positives = 64/130 (48%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
+S+ S P+ SS+ ++S S + A S+ SSSS P S S SSS+++A
Sbjct: 734 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 793
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
+S+ PS S+ SA + S ++ S S APS S S P+S S +P + S S
Sbjct: 794 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSASSSS 853
Query: 582 ERTSSSVARS 611
S+ + S
Sbjct: 854 SSAPSASSSS 863
Score = 51.2 bits (121), Expect = 1e-05
Identities = 46/141 (32%), Positives = 66/141 (46%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS S
Sbjct: 692 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 751
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SS+++A +S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 752 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 810
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS ++ S + S
Sbjct: 811 SASSSSAPSSSSSSAPSASSS 831
Score = 50.8 bits (120), Expect = 2e-05
Identities = 46/141 (32%), Positives = 66/141 (46%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA+ + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS S
Sbjct: 630 SASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 689
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SS+++A +S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 690 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 748
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 749 SASSSSAPSSSSSAPSASSSS 769
Score = 50.1 bits (118), Expect = 3e-05
Identities = 53/144 (36%), Positives = 69/144 (47%), Gaps = 3/144 (2%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSS-SASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ SS+ SASS S + A S+ SSSS P
Sbjct: 645 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS 704
Query: 366 SLSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSF 539
S S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 705 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSS-SS 760
Query: 540 DSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 761 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 784
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-04
Identities = 45/132 (34%), Positives = 68/132 (51%), Gaps = 2/132 (1%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSS-SASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA 398
SS+ S P+ SS+ S+SS S + A + SSSS P S +P +SS++A
Sbjct: 726 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 785
Query: 399 -AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPS 575
+ SS+ PS S+ SA S S ++ + S APS S S P++ S +P + S PS
Sbjct: 786 PS--SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS 843
Query: 576 RKERTSSSVARS 611
++SS + S
Sbjct: 844 ASSSSASSSSSS 855
Score = 45.4 bits (106), Expect = 6e-04
Identities = 43/117 (36%), Positives = 59/117 (49%), Gaps = 1/117 (0%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSS-LGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P
Sbjct: 754 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 813
Query: 366 SLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLS 536
S S SSS+++A +S+ PS S+ SA S S +S+ S S APS S S P+S S
Sbjct: 814 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA-PSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSS 869
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 46/139 (33%), Positives = 64/139 (45%), Gaps = 3/139 (2%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S S S+S+++A
Sbjct: 742 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 801
Query: 402 ---GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYP 572
SSAP S S S+ S +P++S S APS S S P++ S A S
Sbjct: 802 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS---SSSAPSSSSSSAPSASSSS----ASSSSS 854
Query: 573 SRKERTSSSVARSKGVFPA 629
S +SSS S P+
Sbjct: 855 SAPSASSSSAPSSSSSAPS 873
>pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] - Leishmania
major (fragment) gi|5420389|emb|CAB46680.1|
proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 383
Score = 55.1 bits (131), Expect = 8e-07
Identities = 48/146 (32%), Positives = 69/146 (46%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + + SSSS P S
Sbjct: 94 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 153
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SSS+++A +S+ PS S+ SA S S +S+ S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 154 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA-PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 212
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARSKGVFP 626
+ S PS SS + + + P
Sbjct: 213 SASSSSAPSSSSSAPSSSSTTTTMDP 238
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-06
Identities = 48/139 (34%), Positives = 65/139 (46%), Gaps = 9/139 (6%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA- 398
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S +P +SS++A
Sbjct: 67 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 126
Query: 399 --------AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFL 554
A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S +P
Sbjct: 127 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSA 183
Query: 555 ADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 184 SSSSAPSSSSSAPSASSSS 202
Score = 51.2 bits (121), Expect = 1e-05
Identities = 45/130 (34%), Positives = 64/130 (48%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
+S+ S P+ SS+ ++S S + A S+ SSSS P S S SSS++A
Sbjct: 59 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 118
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
SS+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P + S PS
Sbjct: 119 SASSS-SAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 176
Query: 582 ERTSSSVARS 611
++ S + S
Sbjct: 177 SSSAPSASSS 186
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05
Identities = 53/144 (36%), Positives = 70/144 (47%), Gaps = 3/144 (2%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 79 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 137
Query: 369 LS-PFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSF 539
S P SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 138 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSS-SS 193
Query: 540 DSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS ++ S + S
Sbjct: 194 SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 217
Score = 49.3 bits (116), Expect = 4e-05
Identities = 46/141 (32%), Positives = 65/141 (45%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + + SSSS P S
Sbjct: 2 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 61
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SSS+++A +S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 62 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS--SSAPSASSSSAPSS-SSSAP 118
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 119 SASSSSAPSSSSSAPSASSSS 139
Score = 47.8 bits (112), Expect = 1e-04
Identities = 54/154 (35%), Positives = 71/154 (46%), Gaps = 13/154 (8%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSS-LGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P
Sbjct: 17 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 76
Query: 366 SLSPFSSSTTA--AGRSSAP----KLPSDSNDSAFVSDSPA------SSLSLDSPAPSLS 509
S S SSS++A A SSAP PS S+ SA S S A S+ S S APS S
Sbjct: 77 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS 136
Query: 510 LDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
S P+S S +P + S PS ++ S + S
Sbjct: 137 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 170
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.002
Identities = 42/125 (33%), Positives = 60/125 (47%), Gaps = 6/125 (4%)
Frame = +3
Query: 255 SSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA--AGRSSAPKLP 428
SS+ +SS S + A + SSSS P S +P +SS++A + SSAP
Sbjct: 1 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 60
Query: 429 SDSNDSAFVSDSPASSL----SLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRKERTSS 596
S S S+ S +P++S S S APS S S P+S S +P + S PS S
Sbjct: 61 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 119
Query: 597 SVARS 611
+ + S
Sbjct: 120 ASSSS 124
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.18
Identities = 41/126 (32%), Positives = 56/126 (43%), Gaps = 10/126 (7%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTT-A 398
SS+ S P+ SS+ +SS + + + SS S+SS S +P SSS+ +
Sbjct: 143 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS-----SSAPSSSSSAPS 197
Query: 399 AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDS---------PAPSLSLDSPPTSLSFDSPF 551
A SSAP S S SA S +P+SS S S P P L S +S S +
Sbjct: 198 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSSSSTTTTMDPTPDPVLPSSSSSSSHADTY 257
Query: 552 LADLSY 569
D Y
Sbjct: 258 FYDRLY 263
>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
Length = 1325
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-06
Identities = 47/141 (33%), Positives = 68/141 (47%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 829 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 887
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SSS+++A +S+ PS S+ SA + S ++ S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 888 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 947
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 948 SASSSSAPSSSSSAPSASSSS 968
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-06
Identities = 49/144 (34%), Positives = 69/144 (47%), Gaps = 4/144 (2%)
Frame = +3
Query: 192 ATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSL 371
AT E S+ S P+ SS+S+SS S + A + SSSS P S
Sbjct: 655 ATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 714
Query: 372 SPFSSSTTA-AGRSSAPKLPSD---SNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSF 539
+P +SS++A + SSAP S S+ S+ S S +S+ S S APS S S P+S S
Sbjct: 715 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 774
Query: 540 DSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 775 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 798
Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-06
Identities = 48/139 (34%), Positives = 65/139 (46%), Gaps = 9/139 (6%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA- 398
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S +P +SS++A
Sbjct: 695 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 754
Query: 399 --------AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFL 554
A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S +P
Sbjct: 755 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSA 810
Query: 555 ADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 811 SSSSAPSSSSSAPSASSSS 829
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-06
Identities = 52/143 (36%), Positives = 68/143 (47%), Gaps = 2/143 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 953 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 1012
Query: 369 LSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 1013 SSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSSSSSS 1067
Query: 543 SPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 1068 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 1090
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-06
Identities = 52/143 (36%), Positives = 69/143 (47%), Gaps = 2/143 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 814 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 872
Query: 369 LS-PFSSSTT-AAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
S P SSS+ +A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 873 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSSSSSS 929
Query: 543 SPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS ++ S + S
Sbjct: 930 APSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 952
Score = 51.6 bits (122), Expect = 9e-06
Identities = 48/141 (34%), Positives = 67/141 (47%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 737 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 796
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSP 548
S SSS+++A +S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P
Sbjct: 797 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS--SSAPSASSSSAPSS-SSSAP 853
Query: 549 FLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+ S PS S+ + S
Sbjct: 854 SASSSSAPSSSSSAPSASSSS 874
Score = 51.6 bits (122), Expect = 9e-06
Identities = 52/142 (36%), Positives = 68/142 (47%), Gaps = 12/142 (8%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA- 398
+S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S S SSS++A
Sbjct: 779 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 838
Query: 399 -AGRSSAP----KLPSDSNDSAFVSDSPA------SSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDS 545
A SSAP PS S+ SA S S A S+ S S APS S S P+S S +
Sbjct: 839 SASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 898
Query: 546 PFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
P + S PS ++ S + S
Sbjct: 899 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 920
Score = 50.1 bits (118), Expect = 3e-05
Identities = 50/143 (34%), Positives = 66/143 (45%), Gaps = 2/143 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + + SSSS P S
Sbjct: 722 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 781
Query: 369 LSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 782 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSS-SSS 836
Query: 543 SPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 837 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 859
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05
Identities = 49/142 (34%), Positives = 70/142 (48%), Gaps = 1/142 (0%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSS-LGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P
Sbjct: 859 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 918
Query: 366 SLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDS 545
S S SSS+++A +S+ PS S+ SA S S +S+ S S APS S S P+S S +
Sbjct: 919 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA-PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSA 976
Query: 546 PFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
P + S PS ++ S + S
Sbjct: 977 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 998
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05
Identities = 44/130 (33%), Positives = 62/130 (46%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SS+ +SS S + + SSSS P S S SSS+++A
Sbjct: 893 SSSSSAPSASSSSAPSSS------SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 946
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
+S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P + S PS
Sbjct: 947 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS--SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 1004
Query: 582 ERTSSSVARS 611
S+ + S
Sbjct: 1005 SSAPSASSSS 1014
Score = 49.3 bits (116), Expect = 4e-05
Identities = 51/133 (38%), Positives = 66/133 (49%), Gaps = 3/133 (2%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSS-SASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA 398
+S+ S P+ SS+ SASS S + A S+ SSSS P S S SSS++A
Sbjct: 917 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 976
Query: 399 --AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYP 572
A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S +P + S P
Sbjct: 977 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSSAP 1031
Query: 573 SRKERTSSSVARS 611
S S+ + S
Sbjct: 1032 SSSSSAPSASSSS 1044
Score = 48.9 bits (115), Expect = 6e-05
Identities = 44/130 (33%), Positives = 64/130 (48%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
+S+ S P+ SS+ ++S S + A S+ SSSS P S S SSS+++A
Sbjct: 933 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 992
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
+S+ PS S+ + S S A S S S APS S S P+S S +P + S PS
Sbjct: 993 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS--SSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSSAPSSS 1049
Query: 582 ERTSSSVARS 611
S+ + S
Sbjct: 1050 SSAPSASSSS 1059
Score = 47.4 bits (111), Expect = 2e-04
Identities = 52/143 (36%), Positives = 70/143 (48%), Gaps = 2/143 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA+ + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 677 SASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 735
Query: 369 LSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 736 SSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSS-SSS 790
Query: 543 SPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS ++ S + S
Sbjct: 791 APSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 813
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-04
Identities = 49/143 (34%), Positives = 69/143 (47%), Gaps = 2/143 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 707 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 765
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSND--SAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
S SSS+++A +S+ PS S+ SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 766 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSS-SSS 821
Query: 543 SPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 822 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 844
Score = 46.6 bits (109), Expect = 3e-04
Identities = 47/135 (34%), Positives = 68/135 (49%), Gaps = 5/135 (3%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSS-LGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA 398
SS+ S P+ SS+ +SS S + A S+ SSSS P S +P +SS++A
Sbjct: 771 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 830
Query: 399 -AGRSSAPKLPSD---SNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLS 566
+ SSAP S S+ S+ S S +S+ S S APS S S P+S S +P + S
Sbjct: 831 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSS 889
Query: 567 YPSRKERTSSSVARS 611
PS ++ S + S
Sbjct: 890 APSSSSSSAPSASSS 904
Score = 46.2 bits (108), Expect = 4e-04
Identities = 46/135 (34%), Positives = 66/135 (48%), Gaps = 5/135 (3%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S S S+S+++A
Sbjct: 941 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 1000
Query: 402 --GRSSAPKLPSD---SNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLS 566
SSAP S S+ S+ S S +S+ S S APS S S P+S S +P + S
Sbjct: 1001 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSS 1059
Query: 567 YPSRKERTSSSVARS 611
PS ++ S + S
Sbjct: 1060 APSSSSSSAPSASSS 1074
Score = 45.8 bits (107), Expect = 5e-04
Identities = 42/114 (36%), Positives = 55/114 (47%), Gaps = 9/114 (7%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTA- 398
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S +P +SS++A
Sbjct: 987 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 1046
Query: 399 --------AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLS 536
A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 1047 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSSSS 1096
Score = 45.4 bits (106), Expect = 6e-04
Identities = 46/138 (33%), Positives = 65/138 (46%), Gaps = 8/138 (5%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SS+ +SS S + A + SSSS P S S S+S+++A
Sbjct: 847 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 906
Query: 402 ---GRSSAPK-----LPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLA 557
SSAP PS S+ SA + S ++ S S APS S S P+S S +P +
Sbjct: 907 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSAS 965
Query: 558 DLSYPSRKERTSSSVARS 611
S PS S+ + S
Sbjct: 966 SSSAPSSSSSAPSASSSS 983
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 51/144 (35%), Positives = 67/144 (46%), Gaps = 3/144 (2%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSS-SASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLF 365
SA + +S+ S P+ SS+ SASS S + + SSSS P
Sbjct: 752 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 811
Query: 366 SLSPFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSF 539
S S SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S APS S S P+S S
Sbjct: 812 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSS-SS 865
Query: 540 DSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
+P + S PS S+ + S
Sbjct: 866 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 889
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
Identities = 43/130 (33%), Positives = 62/130 (47%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SS+ +SS + + + SS S+SS S +P SSS+ +
Sbjct: 909 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS-----SSAPSSSSSAPS 963
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRK 581
SS+ S S SA S +P+SS S APS S S P+S S +P + S PS
Sbjct: 964 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS---SSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSSAPSSS 1019
Query: 582 ERTSSSVARS 611
S+ + S
Sbjct: 1020 SSAPSASSSS 1029
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.88
Identities = 48/135 (35%), Positives = 63/135 (46%), Gaps = 9/135 (6%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
SA + +S+ S P+ S+ SASS S + A S+ SSSS P S
Sbjct: 999 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 1057
Query: 369 LS-PFSSSTTA--AGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPS---LSLDSP--- 521
S P SSS++A A SSAP S S SA S +P+SS S S + S D P
Sbjct: 1058 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASSSSAPSSSSSFLSGSGSDGGCHSDVPYYT 1116
Query: 522 PTSLSFDSPFLADLS 566
PT ++ FL+ S
Sbjct: 1117 PTQVAHSMRFLSGFS 1131
>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-06
Identities = 49/153 (32%), Positives = 70/153 (45%)
Frame = +3
Query: 171 NKGLYKSATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSS 350
++ + S+ ++ + SS+ S P+ SSSS SS S SS+S
Sbjct: 42 SRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSS-----------HSSSSPSSSSSTS 90
Query: 351 LPFLFSLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTS 530
P S S SSS +++ SS+ S S+ S+ S SP+SS S S + S S SP +S
Sbjct: 91 SPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSS 150
Query: 531 LSFDSPFLADLSYPSRKERTSSSVARSKGVFPA 629
S SP + S S SSS S G P+
Sbjct: 151 SS--SPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPS 181
Score = 51.6 bits (122), Expect = 9e-06
Identities = 51/146 (34%), Positives = 70/146 (47%), Gaps = 5/146 (3%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSL-----GSSSSL 353
S+T + + SS+ S P+ SSSS+SS S + + SS SSSS
Sbjct: 87 SSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 146
Query: 354 PFLFSLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSL 533
P S SP SSS++++ SS+P S S+ + S S SS S S +PS S SP
Sbjct: 147 PSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSS-NSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRS 205
Query: 534 SFDSPFLADLSYPSRKERTSSSVARS 611
S S + S PS +SSS + S
Sbjct: 206 SSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSS 231
Score = 47.8 bits (112), Expect = 1e-04
Identities = 47/127 (37%), Positives = 61/127 (48%), Gaps = 1/127 (0%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SSSS+SS S + + SS SSSS P S SP SSS++++
Sbjct: 86 SSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSS-NSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSS 144
Query: 402 GR-SSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSR 578
SS+ PS S+ S+ S S SS S S S S + S S SP + S R
Sbjct: 145 SSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPR 204
Query: 579 KERTSSS 599
SSS
Sbjct: 205 SSSPSSS 211
Score = 46.2 bits (108), Expect = 4e-04
Identities = 41/106 (38%), Positives = 54/106 (50%), Gaps = 3/106 (2%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S P+ SSSS+SS S + + SS SS+S P S SP SSS++ +
Sbjct: 148 SSSSSSPSSSSSSSSSSSS-----SPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPS 202
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPA---PSLSLDSPPTS 530
RSS+P S S S S +SS S SP+ PS +L P S
Sbjct: 203 PRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQS 248
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.001
Identities = 38/107 (35%), Positives = 50/107 (46%), Gaps = 2/107 (1%)
Frame = +3
Query: 315 GCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAAGRSSAPKLP--SDSNDSAFVSDSPASSLSLD 488
G G S SSSS L S SS +++ SS+P S S S+ S SP+SS S
Sbjct: 31 GSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTS 90
Query: 489 SPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRKERTSSSVARSKGVFPA 629
SP+ S S S + S +S + S PS +SSS S P+
Sbjct: 91 SPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPS 137
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
Identities = 49/147 (33%), Positives = 70/147 (47%), Gaps = 1/147 (0%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSS-SSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLF 365
S++ + + SS+ S P+ SS SS+SS S + + SS SSSS P
Sbjct: 112 SSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPS-- 169
Query: 366 SLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDS 545
S SP SS ++ + +S+P S S S+ S SP SS SP+ S S S P++ S S
Sbjct: 170 SSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSS----SPSSSSSSTSSPSTSSPSS 225
Query: 546 PFLADLSYPSRKERTSSSVARSKGVFP 626
S PS +SS + + G P
Sbjct: 226 ------SSPSSSSPSSSCPSAALGRRP 246
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.004
Identities = 51/130 (39%), Positives = 65/130 (49%), Gaps = 11/130 (8%)
Frame = +3
Query: 255 SSSSASSEL-GRWLSFTLAFFGCGKSSLGS--SSSLPFL--FSLSPFSSSTT----AAGR 407
SSSS+ S L LS ++ SS S SSS P S SP SSS+T ++
Sbjct: 38 SSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSS 97
Query: 408 SSAPKLPSDSN-DSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPF-LADLSYPSRK 581
SS+ PS SN S+ S SP+SS S S +PS S SP +S S S + S PS
Sbjct: 98 SSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 157
Query: 582 ERTSSSVARS 611
+SSS + S
Sbjct: 158 SSSSSSSSSS 167
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
Identities = 41/123 (33%), Positives = 56/123 (45%), Gaps = 5/123 (4%)
Frame = +3
Query: 258 SSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDS 437
S S+SS LS ++ SS SSS S SP SS ++++ SS+ S
Sbjct: 35 SRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSS 94
Query: 438 NDSAFVSDSPASS-----LSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRKERTSSSV 602
+ S+ S SP+SS S SP+ S S S S S SP + S S +SSS
Sbjct: 95 SSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSP 154
Query: 603 ARS 611
+ S
Sbjct: 155 SSS 157
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.88
Identities = 31/100 (31%), Positives = 48/100 (48%)
Frame = +3
Query: 222 SSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFSLSPFSSSTTAA 401
SS+ S + SSS+ S G S + + SS SSSS P S SP SSS++ +
Sbjct: 157 SSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTS 216
Query: 402 GRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSP 521
S++ S + S+ S P+++L +P S +P
Sbjct: 217 SPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQSPQSSHCAP 256
>ref|NP_596690.1| hypothetical serine-rich secreted protein [Schizosaccharomyces
pombe] gi|7493381|pir||T39903 serine-rich protein -
fission yeast (Schizosaccharomyces pombe)
gi|3873550|emb|CAA22127.1| hypothetical serine-rich
secreted protein [Schizosaccharomyces pombe]
Length = 534
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-06
Identities = 49/147 (33%), Positives = 72/147 (48%), Gaps = 10/147 (6%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
S++ + + + ST S+P+ SSSS SS L S + A SS+ SSSS S
Sbjct: 224 SSSSSTLTSSSLSTSSIPSTSSSSSSTSSSLSSSSSSSTASSSSSSSSIISSSSSS---S 280
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASS----LSLDSPAPSLSLDSPPT--- 527
SP S+S+T + SS+ P+ ++ + S S +SS LS S + S S S PT
Sbjct: 281 SSPTSTSSTISSSSSSSSSPTSTSSTISSSSSSSSSFSSTLSSSSMSSSSSFSSSPTSSS 340
Query: 528 ---SLSFDSPFLADLSYPSRKERTSSS 599
S S SP + S + ++SSS
Sbjct: 341 STISSSSSSPSSSSFSSTTSSSKSSSS 367
Score = 52.0 bits (123), Expect = 7e-06
Identities = 53/150 (35%), Positives = 75/150 (49%), Gaps = 2/150 (1%)
Frame = +3
Query: 189 SATITDMMTEFSSTISLPTYMFSSSSASSELGRWLSFTLAFFGCGKSSLGSSSSLPFLFS 368
S+TI+ + SS S + + SSSS+SS LS SS+ SSSS FS
Sbjct: 287 SSTISSSSSSSSSPTSTSSTISSSSSSSSSFSSTLS---------SSSMSSSSS----FS 333
Query: 369 LSPFSSSTTAAGRSSAPKLPSDSN--DSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFD 542
SP SSS+T + SS+P S S+ S+ S S +S++S S S +L S +S S
Sbjct: 334 SSPTSSSSTISSSSSSPSSSSFSSTTSSSKSSSSFSSTVSSSSSTSSSTLTSSSSSSSRP 393
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+ + S S + +SSS + S V AF
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S+T + + + T + +Y+ SSS S+SS S TL SS+ S SSS
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SLS SSS+TA+ SS+ + S S+ S S SP S+ S S + S S TS +
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S + S+ S +S S + S
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S+ S+ + SSS +SS+ T + F SS +SSS P + S S + S+ A
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Query: 405 RSSAPKLPSDSNDSAFVSDSPASSLSLDSPAPSLSLDSPPTSLSFDSPFLADLSYPSRKE 584
+S+ L S S S+ S SP+SS S + SLS S P++ S S + LS S
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SSS + S
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+ S+ + T SS+ S + FSS+++SS+ S T++ SS SSSS
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S S SSS ++ SS+ K S SAF +S +S S S + SL SL S P
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+I+ S ++ T+ SSS SS S + + F S+ +S+S +L S S
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SSS++ + SS+ S + S+ S S +SS + S + S S + +S S S
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S+T + + + SS+ S + FSS++ +S +LS SS+ SSSS P
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S SSST + S +PS S+ S+ S S +SS S + + S S S +S
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Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
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