Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC004168A_C01 KMC004168A_c01
(688 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_218397.1| similar to Hypothetical protein F28C1.3a [Caeno... 43 0.005
ref|NP_700545.1| rhoGAP protein [Plasmodium falciparum 3D7] gi|2... 42 0.008
ref|XP_159923.1| hypothetical protein XP_159923 [Mus musculus] g... 42 0.008
ref|NP_701307.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7... 42 0.010
emb|CAC42230.1| Krueppel-like protein [Plasmodium falciparum 3D7] 41 0.018
>ref|XP_218397.1| similar to Hypothetical protein F28C1.3a [Caenorhabditis elegans]
[Rattus norvegicus]
Length = 566
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.005
Identities = 17/19 (89%), Positives = 19/19 (99%)
Frame = -3
Query: 62 PYIYIYIYIYIYIYIYIIL 6
PYIYIYIYIYIYIYIY++L
Sbjct: 101 PYIYIYIYIYIYIYIYMVL 119
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.20
Identities = 16/18 (88%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = -2
Query: 57 YIYIYIYIYIYIYIYYSL 4
YIYIYIYIYIYIYIY L
Sbjct: 102 YIYIYIYIYIYIYIYMVL 119
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 102 YIYIYIYIYIYIYIY 116
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.44
Identities = 15/18 (83%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIIL 6
Y YIYIYIYIYIYIYI +
Sbjct: 100 YPYIYIYIYIYIYIYIYM 117
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/16 (93%), Positives = 15/16 (93%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIY 13
LY YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 99 LYPYIYIYIYIYIYIY 114
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.74
Identities = 14/23 (60%), Positives = 19/23 (81%)
Frame = -3
Query: 71 VSLPYIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
+S ++Y YIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 94 MSTVHLYPYIYIYIYIYIYIYIY 116
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.97
Identities = 17/29 (58%), Positives = 19/29 (64%), Gaps = 4/29 (13%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYI----YKGEKHPLSTW 88
YIYIYIYIYIYIY+ YK P + W
Sbjct: 104 YIYIYIYIYIYIYMVLGPYKVHTCPEAEW 132
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 103 IYIYIYIYIYIYIYM 117
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 100 YPYIYIYIYIYIYIY 114
Score = 33.9 bits (76), Expect = 2.2
Identities = 13/22 (59%), Positives = 18/22 (81%)
Frame = -2
Query: 66 SPLYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
S +++Y YIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 95 STVHLYPYIYIYIYIYIYIYIY 116
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 13/29 (44%), Positives = 20/29 (68%)
Frame = -3
Query: 89 PMLRGGVSLPYIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
P+ G + +++Y YIYIYIYIYI ++
Sbjct: 86 PVDPGSNPMSTVHLYPYIYIYIYIYIYIY 114
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 13/16 (81%), Positives = 15/16 (93%)
Frame = +3
Query: 12 NIYIYIYIYIYIYIYI 59
++Y YIYIYIYIYIYI
Sbjct: 98 HLYPYIYIYIYIYIYI 113
>ref|NP_700545.1| rhoGAP protein [Plasmodium falciparum 3D7]
gi|23494935|gb|AAN35269.1|AE014830_13 rhoGAP protein
[Plasmodium falciparum 3D7]
Length = 653
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.008
Identities = 18/19 (94%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYIYI LF
Sbjct: 131 YIYIYIYIYIYIYIYIYLF 149
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.018
Identities = 17/23 (73%), Positives = 20/23 (86%)
Frame = -2
Query: 69 FSPLYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
++ +YIYIYIYIYIYIYIY LF
Sbjct: 127 YTYMYIYIYIYIYIYIYIYIYLF 149
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.039
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIY++I LF
Sbjct: 135 YIYIYIYIYIYIYLFIYLF 153
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.039
Identities = 15/19 (78%), Positives = 18/19 (93%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYIY+ ++
Sbjct: 133 YIYIYIYIYIYIYIYLFIY 151
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.051
Identities = 15/19 (78%), Positives = 19/19 (99%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIY++IY++IILF
Sbjct: 139 YIYIYIYIYLFIYLFIILF 157
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 132 IYIYIYIYIYIYIYIYLFIY 151
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.11
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIY++ LF
Sbjct: 134 IYIYIYIYIYIYIYLFIYLF 153
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 131 YIYIYIYIYIYIYIY 145
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 133 YIYIYIYIYIYIYIY 147
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 13/20 (65%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIY++IY++ LF
Sbjct: 138 IYIYIYIYIYLFIYLFIILF 157
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y+YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 129 YMYIYIYIYIYIYIY 143
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 132 IYIYIYIYIYIYIYI 146
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.74
Identities = 13/20 (65%), Positives = 17/20 (85%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+Y Y+YIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 126 IYTYMYIYIYIYIYIYIYIY 145
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.97
Identities = 13/23 (56%), Positives = 19/23 (82%)
Frame = -3
Query: 71 VSLPYIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
+++ IY Y+YIYIYIYIYI ++
Sbjct: 121 LNITQIYTYMYIYIYIYIYIYIY 143
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.97
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 134 IYIYIYIYIYIYIYL 148
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIY++IY
Sbjct: 137 YIYIYIYIYIYLFIY 151
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIY++
Sbjct: 135 YIYIYIYIYIYIYLF 149
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
+YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 130 MYIYIYIYIYIYIYI 144
Score = 33.9 bits (76), Expect = 2.2
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y Y+YIYIYIYIYIY
Sbjct: 127 YTYMYIYIYIYIYIY 141
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.8
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIY++I
Sbjct: 136 IYIYIYIYIYIYLFI 150
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IY Y+YIYIYIYIYI
Sbjct: 126 IYTYMYIYIYIYIYI 140
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 12/15 (80%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIY++IY+
Sbjct: 138 IYIYIYIYIYLFIYL 152
Score = 32.3 bits (72), Expect = 6.3
Identities = 11/19 (57%), Positives = 17/19 (88%)
Frame = -1
Query: 58 IYIYIYIYIYIYIYILFSF 2
IYIYIYIY++IY++I+ +
Sbjct: 140 IYIYIYIYLFIYLFIILFY 158
Score = 32.3 bits (72), Expect = 6.3
Identities = 11/15 (73%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIY++IY++
Sbjct: 139 YIYIYIYIYLFIYLF 153
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 10/20 (50%), Positives = 17/20 (85%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIY++IY++I ++Y F
Sbjct: 142 IYIYIYLFIYLFIILFYFFF 161
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 11/19 (57%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIY++IY++I + F
Sbjct: 141 YIYIYIYLFIYLFIILFYF 159
>ref|XP_159923.1| hypothetical protein XP_159923 [Mus musculus]
gi|28490145|ref|XP_289151.1| hypothetical protein
XP_289151 [Mus musculus]
Length = 415
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.008
Identities = 19/29 (65%), Positives = 22/29 (75%)
Frame = -3
Query: 89 PMLRGGVSLPYIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
P LR + YIYIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 366 PKLRISHNYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 394
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.030
Identities = 16/18 (88%), Positives = 18/18 (99%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIIL 6
YIYIYIYIYIYIYIYI++
Sbjct: 384 YIYIYIYIYIYIYIYILI 401
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.030
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 380 YIYIYIYIYIYIYIYIYIY 398
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.030
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 378 YIYIYIYIYIYIYIYIYIY 396
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.067
Identities = 16/18 (88%), Positives = 17/18 (93%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIIL 6
YIYIYIYIYIYIYIYI +
Sbjct: 382 YIYIYIYIYIYIYIYIYI 399
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 375 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 394
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 379 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 398
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 377 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 396
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.15
Identities = 15/19 (78%), Positives = 17/19 (88%)
Frame = -2
Query: 57 YIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 374 YIYIYIYIYIYIYIYIYIY 392
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.20
Identities = 16/17 (94%), Positives = 16/17 (94%)
Frame = +3
Query: 9 NNIYIYIYIYIYIYIYI 59
N IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 373 NYIYIYIYIYIYIYIYI 389
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 380 YIYIYIYIYIYIYIY 394
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 376 YIYIYIYIYIYIYIY 390
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 384 YIYIYIYIYIYIYIY 398
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 378 YIYIYIYIYIYIYIY 392
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 382 YIYIYIYIYIYIYIY 396
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 379 IYIYIYIYIYIYIYI 393
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 385 IYIYIYIYIYIYIYI 399
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 383 IYIYIYIYIYIYIYI 397
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 381 IYIYIYIYIYIYIYI 395
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 377 IYIYIYIYIYIYIYI 391
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 387 IYIYIYIYIYIYILI 401
Score = 32.3 bits (72), Expect = 6.3
Identities = 14/17 (82%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = +1
Query: 7 RIIYIYIYIYIYIYIYI 57
RI + YIYIYIYIYIYI
Sbjct: 369 RISHNYIYIYIYIYIYI 385
>ref|NP_701307.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7]
gi|23496374|gb|AAN36031.1|AE014842_53 hypothetical
protein [Plasmodium falciparum 3D7]
Length = 505
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.010
Identities = 17/31 (54%), Positives = 22/31 (70%)
Frame = -2
Query: 93 FTHVERGCFSPLYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+ H+ + +YIYIYIYIYIYIYIY +F
Sbjct: 207 YVHIYIYIYLHIYIYIYIYIYIYIYIYMHMF 237
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 17/30 (56%), Positives = 22/30 (72%)
Frame = -2
Query: 102 LDYFTHVERGCFSPLYIYIYIYIYIYIYIY 13
+D + +V + L+IYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 202 VDIYIYVHIYIYIYLHIYIYIYIYIYIYIY 231
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 219 YIYIYIYIYIYIYIY 233
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.33
Identities = 14/31 (45%), Positives = 23/31 (74%)
Frame = -2
Query: 93 FTHVERGCFSPLYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+ +V+ + +YIYIY++IYIYIYIY ++
Sbjct: 199 YIYVDIYIYVHIYIYIYLHIYIYIYIYIYIY 229
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.44
Identities = 15/16 (93%), Positives = 16/16 (99%)
Frame = +3
Query: 12 NIYIYIYIYIYIYIYI 59
+IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 217 HIYIYIYIYIYIYIYI 232
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 13/18 (72%), Positives = 17/18 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIIL 6
YIYIYIYIYIYIY+++ +
Sbjct: 221 YIYIYIYIYIYIYMHMFV 238
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 220 IYIYIYIYIYIYIYM 234
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIY++IYIYIYIY
Sbjct: 211 YIYIYLHIYIYIYIY 225
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y++IYIYIYIYIYIY
Sbjct: 215 YLHIYIYIYIYIYIY 229
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIY++IYIYIYIYIY
Sbjct: 213 YIYLHIYIYIYIYIY 227
Score = 33.9 bits (76), Expect = 2.2
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIY++
Sbjct: 221 YIYIYIYIYIYIYMH 235
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.8
Identities = 13/16 (81%), Positives = 16/16 (99%)
Frame = +3
Query: 12 NIYIYIYIYIYIYIYI 59
+IYIYIY++IYIYIYI
Sbjct: 209 HIYIYIYLHIYIYIYI 224
Score = 33.1 bits (74), Expect = 3.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIY++IYIYIYIYI
Sbjct: 212 IYIYLHIYIYIYIYI 226
Score = 33.1 bits (74), Expect = 3.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
++IYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 216 LHIYIYIYIYIYIYI 230
Score = 33.1 bits (74), Expect = 3.7
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IY++IYIYIYIYIYI
Sbjct: 214 IYLHIYIYIYIYIYI 228
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 12/19 (63%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = -1
Query: 58 IYIYIYIYIYIYIYILFSF 2
IYIYIYIYIY+++++ SF
Sbjct: 224 IYIYIYIYIYMHMFVRISF 242
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 11/15 (73%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y++IYIYIY++IYIY
Sbjct: 207 YVHIYIYIYLHIYIY 221
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 11/15 (73%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIY++IYIYIY++IY
Sbjct: 205 YIYVHIYIYIYLHIY 219
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 12/19 (63%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = +2
Query: 2 KRE*YIYIYIYIYIYIYIY 58
K++ YIY+ IYIY++IYIY
Sbjct: 195 KKKIYIYVDIYIYVHIYIY 213
>emb|CAC42230.1| Krueppel-like protein [Plasmodium falciparum 3D7]
Length = 1266
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.018
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
Y+YIYIYIYIYIYIYI +F
Sbjct: 1209 YVYIYIYIYIYIYIYIYIF 1227
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.023
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 1211 YIYIYIYIYIYIYIYIFIY 1229
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.051
Identities = 16/19 (84%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYIYI+I L+
Sbjct: 1213 YIYIYIYIYIYIYIFIYLY 1231
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.088
Identities = 15/19 (78%), Positives = 17/19 (88%)
Frame = -2
Query: 57 YIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
Y+YIYIYIYIYIYIY +F
Sbjct: 1209 YVYIYIYIYIYIYIYIYIF 1227
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.11
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 1210 VYIYIYIYIYIYIYIYIFIY 1229
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.15
Identities = 15/20 (75%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYIYIYIYI+ L+
Sbjct: 1212 IYIYIYIYIYIYIYIFIYLY 1231
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.15
Identities = 17/23 (73%), Positives = 20/23 (86%), Gaps = 3/23 (13%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIY---YSLF 1
+YIYIYIYIYIYI+IY YSL+
Sbjct: 1214 IYIYIYIYIYIYIFIYLYIYSLY 1236
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.15
Identities = 14/19 (73%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYIYIYI+IY+ ++
Sbjct: 1215 YIYIYIYIYIYIFIYLYIY 1233
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 1211 YIYIYIYIYIYIYIY 1225
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.26
Identities = 14/19 (73%), Positives = 17/19 (88%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
Y Y+YIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 1207 YKYVYIYIYIYIYIYIYIY 1225
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.33
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y+YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 1209 YVYIYIYIYIYIYIY 1223
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.33
Identities = 14/19 (73%), Positives = 17/19 (88%)
Frame = -3
Query: 59 YIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
YIYIYIYI+IY+YIY + F
Sbjct: 1219 YIYIYIYIFIYLYIYSLYF 1237
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.44
Identities = 17/30 (56%), Positives = 19/30 (62%)
Frame = -1
Query: 103 VRLFYPC*EGVFLSLIYIYIYIYIYIYIYI 14
V + Y C IYIYIYIYIYIYI+I
Sbjct: 1199 VNMIYICIYKYVYIYIYIYIYIYIYIYIFI 1228
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 1212 IYIYIYIYIYIYIYI 1226
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 14/20 (70%), Positives = 17/20 (85%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YIYIYIYI+IY+YIY F
Sbjct: 1218 IYIYIYIYIFIYLYIYSLYF 1237
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.57
Identities = 14/17 (82%), Positives = 16/17 (93%)
Frame = +1
Query: 7 RIIYIYIYIYIYIYIYI 57
+ +YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 1208 KYVYIYIYIYIYIYIYI 1224
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.74
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYI+IY
Sbjct: 1215 YIYIYIYIYIYIFIY 1229
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.74
Identities = 13/20 (65%), Positives = 17/20 (85%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+Y Y+YIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 1206 IYKYVYIYIYIYIYIYIYIY 1225
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.74
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYIYIYI+
Sbjct: 1213 YIYIYIYIYIYIYIF 1227
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.97
Identities = 14/23 (60%), Positives = 19/23 (81%)
Frame = -3
Query: 71 VSLPYIYIYIYIYIYIYIYIILF 3
V++ YI IY Y+YIYIYIYI ++
Sbjct: 1199 VNMIYICIYKYVYIYIYIYIYIY 1221
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYI+IY+YIY
Sbjct: 1219 YIYIYIYIFIYLYIY 1233
Score = 34.7 bits (78), Expect = 1.3
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
YIYIYIYIYI+IY+Y
Sbjct: 1217 YIYIYIYIYIFIYLY 1231
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 13/19 (68%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = -1
Query: 58 IYIYIYIYIYIYIYILFSF 2
IYIYIYI+IY+YIY L+ +
Sbjct: 1220 IYIYIYIFIYLYIYSLYFY 1238
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.7
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYIYIYI+I
Sbjct: 1214 IYIYIYIYIYIYIFI 1228
Score = 33.9 bits (76), Expect = 2.2
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = +2
Query: 14 YIYIYIYIYIYIYIY 58
Y Y+YIYIYIYIYIY
Sbjct: 1207 YKYVYIYIYIYIYIY 1221
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.8
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +3
Query: 15 IYIYIYIYIYIYIYI 59
IYIYIYIYI+IY+YI
Sbjct: 1218 IYIYIYIYIFIYLYI 1232
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.8
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IYIYIYIYIYI+IY+
Sbjct: 1216 IYIYIYIYIYIFIYL 1230
Score = 32.7 bits (73), Expect = 4.8
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = +1
Query: 13 IYIYIYIYIYIYIYI 57
IY Y+YIYIYIYIYI
Sbjct: 1206 IYKYVYIYIYIYIYI 1220
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 12/20 (60%), Positives = 16/20 (80%)
Frame = -2
Query: 60 LYIYIYIYIYIYIYIYYSLF 1
+YI IY Y+YIYIYIY ++
Sbjct: 1202 IYICIYKYVYIYIYIYIYIY 1221
Score = 32.0 bits (71), Expect = 8.2
Identities = 14/19 (73%), Positives = 15/19 (78%)
Frame = +3
Query: 3 KENNIYIYIYIYIYIYIYI 59
K N IYI IY Y+YIYIYI
Sbjct: 1198 KVNMIYICIYKYVYIYIYI 1216
Database: nr
Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
Number of letters in database: 448,689,247
Number of sequences in database: 1,393,205
Lambda K H
0.318 0.135 0.401
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 608,094,079
Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 13887977
Number of successful extensions: 64279
Number of sequences better than 10.0: 148
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 42515
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 52925
length of database: 448,689,247
effective HSP length: 119
effective length of database: 282,897,852
effective search space used: 30835865868
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 12
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
