Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC003538A_C01 KMC003538A_c01
(564 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|AAO51254.1| similar to Plasmodium falciparum. Hypothetical pr... 45 6e-04
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens] 44 0.001
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens] 44 0.002
sp|P87179|YB1E_SCHPO Protein C30B4.01c in chromosome II gi|74915... 43 0.002
dbj|BAA78501.1| serine repeat antigen [Plasmodium falciparum] 43 0.002
>gb|AAO51254.1| similar to Plasmodium falciparum. Hypothetical protein
[Dictyostelium discoideum]
Length = 1123
Score = 45.1 bits (105), Expect = 6e-04
Identities = 39/114 (34%), Positives = 62/114 (54%)
Frame = +2
Query: 140 IMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS 319
+++ S +P+T+ +++ + S + SS + SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S
Sbjct: 389 LIKDSSQPSTSTSTSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 448
Query: 320 *ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPSLCK*ISYFINFRRSSSND 481
+SS + SS S T L + PKS SL S IN + +++N+
Sbjct: 449 SSSSSSSSSSSSSSSSQPT--LNQHSKYIPKSLHSSLS---SIPINNKENNNNN 497
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.17
Identities = 31/97 (31%), Positives = 49/97 (49%)
Frame = +2
Query: 92 IRKKTIASLHTKGSYCIMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSE 271
I+ + S T S S +++ +S+++ S + SS + SS++ SS SSSS
Sbjct: 390 IKDSSQPSTSTSTSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 449
Query: 272 SSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSI 382
SS SSS SS+S ++ K+ S S L+SI
Sbjct: 450 SSSSSSSSSSSSSSSQPTLNQHSKYIPKSLHSSLSSI 486
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.17
Identities = 30/92 (32%), Positives = 44/92 (47%)
Frame = +2
Query: 233 SSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPK 412
S+++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SS + SS S +S ++ +
Sbjct: 403 STSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 462
Query: 413 SPSPSLCK*ISYFINFRRSSSNDTGLLYDLNN 508
S P+L + Y SS + + NN
Sbjct: 463 SSQPTLNQHSKYIPKSLHSSLSSIPINNKENN 494
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.1
Identities = 29/84 (34%), Positives = 41/84 (48%), Gaps = 1/84 (1%)
Frame = +2
Query: 179 SANTCSFN-LISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*G 355
S +T + N LI S++ +S SSSS SS SSS SS+S S +SS +
Sbjct: 380 SNSTSNLNDLIKDSSQPSTSTSTSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 439
Query: 356 SSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
SS S +S ++ + S S S
Sbjct: 440 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 463
Score = 32.7 bits (73), Expect = 3.2
Identities = 31/103 (30%), Positives = 48/103 (46%), Gaps = 11/103 (10%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDS-----------SAAESSESSSSESSISSSDSS 298
++ P + S+ T S N+I+S N + S + S+ +SSS SS SSS SS
Sbjct: 359 TLSPAQSAISSPTLS-NIINSNSNSTSNLNDLIKDSSQPSTSTSTSTSSSSSSSSSSSSS 417
Query: 299 NSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+S S +SS + SS S +S ++ + S S S
Sbjct: 418 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 460
>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 36/109 (33%), Positives = 55/109 (50%), Gaps = 3/109 (2%)
Frame = +2
Query: 110 ASLHTKGSYCIMRISIKPTT---TITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSI 280
+S H+ S S P++ T + +++ S + SS + SS++ SS SSS SS
Sbjct: 66 SSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSS 125
Query: 281 SSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
SSS SS+S P S +SS + SS +S ++ +P S SPS
Sbjct: 126 SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPS 174
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 34/96 (35%), Positives = 52/96 (53%), Gaps = 4/96 (4%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S++ S + SS + +S+ SS SSSS SS SSS+SS+S S +SS
Sbjct: 62 SSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSS 121
Query: 332 EGLK----HA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SSPS +S ++ P + SPS S
Sbjct: 122 SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 157
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 34/94 (36%), Positives = 50/94 (53%), Gaps = 3/94 (3%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S+++ + SS + SS++ S SSSS SS SSS SS+S P S + S
Sbjct: 115 SSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPS 174
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLT---SILATLPRKAPKSPSP 424
GSSPS S ++ P + SPSP
Sbjct: 175 SS-----GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSP 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 31/88 (35%), Positives = 48/88 (54%)
Frame = +2
Query: 164 TTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLK 343
+++I S+++ S + SS + SS+ SS SSS S+ S S SS+S S +SS
Sbjct: 52 SSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSS 111
Query: 344 HA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SSPS +S ++ P + SPS S
Sbjct: 112 SSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 139
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.009
Identities = 34/92 (36%), Positives = 48/92 (51%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S ++ S + SS SS+ SS SSS SS SSS+SS S S +SS
Sbjct: 144 SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS------SSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 197
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
SSPS +S ++ +P S SPS
Sbjct: 198 SSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPS 229
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.015
Identities = 34/92 (36%), Positives = 50/92 (53%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S ++ S + SS S++ SS SSSS SS SSS S +S P S SS
Sbjct: 126 SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSP------SSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSS 179
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
++ SS S S ++ P +P+S SPS
Sbjct: 180 PSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSP--SPRSSSPS 209
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.020
Identities = 31/92 (33%), Positives = 49/92 (52%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S+++ S + SS + SS + S S+SS SS SSS SS+S P +SS
Sbjct: 151 SSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPS---SSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSS 207
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SSPS + ++ +P S PS
Sbjct: 208 PSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPS 239
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.058
Identities = 34/94 (36%), Positives = 50/94 (53%), Gaps = 2/94 (2%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSN-SDLPDS*AS 328
S +++ +S+N+ S + SS + SS++ S SSSS SS SSS SS+ S S +S
Sbjct: 97 SSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSS 156
Query: 329 SEGLKHA*GSSPSLLT-SILATLPRKAPKSPSPS 427
S + SSPS + S + P + SPS S
Sbjct: 157 SSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSS 190
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.38
Identities = 36/112 (32%), Positives = 57/112 (50%), Gaps = 6/112 (5%)
Frame = +2
Query: 110 ASLHTKGSYCIMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSES----- 274
+S H+ S + P+++ +S+++ S + +S + SS+ SS SSSS S
Sbjct: 75 SSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSS-SSSSPSSSSSSSSSSPSSSS 133
Query: 275 -SISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
S SSS SS+S P S +SS + SS S +S ++ P + SPS S
Sbjct: 134 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSS--SSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSS 183
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.49
Identities = 30/92 (32%), Positives = 43/92 (46%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S +++ +S++ S + SS SS+ SS SSSS S SSS S +S S +SS
Sbjct: 106 SSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSS 165
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SS S + P + SPS S
Sbjct: 166 SSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 197
Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.9
Identities = 30/86 (34%), Positives = 44/86 (50%)
Frame = +2
Query: 176 TSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*G 355
+S+ + S + SS + SS++ S SSSS S SSS SS+S S ++S +
Sbjct: 170 SSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPS 229
Query: 356 SSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPSLC 433
SS + A L R+ P+SP S C
Sbjct: 230 SSSPSSSCPSAALGRR-PQSPQSSHC 254
>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
Length = 252
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 31/88 (35%), Positives = 48/88 (54%)
Frame = +2
Query: 164 TTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLK 343
+++ +S ++ S + SS + SS++ SS SSS SS SSS SS+S P S +SS
Sbjct: 86 SSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 145
Query: 344 HA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SS +S ++ +P S SPS
Sbjct: 146 PSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPS 173
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
Identities = 34/94 (36%), Positives = 50/94 (53%), Gaps = 3/94 (3%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S+++ + SS + SS++ S SSSS SS SSS SS+S P S + S
Sbjct: 114 SSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPS 173
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLT---SILATLPRKAPKSPSP 424
GSSPS S ++ P + SPSP
Sbjct: 174 SS-----GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSP 202
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.003
Identities = 34/95 (35%), Positives = 51/95 (52%), Gaps = 3/95 (3%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSES---SISSSDSSNSDLPDS* 322
S P+++ +S++ S + SS + +S+ SS SSSS S S SSS SS+S S
Sbjct: 62 SSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSS 121
Query: 323 ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+SS + SSPS +S ++ P + SPS S
Sbjct: 122 SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 156
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.004
Identities = 33/92 (35%), Positives = 50/92 (53%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S+++ S + SS + S ++ SS SSS SS SSS SS+S P S +SS
Sbjct: 100 SSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 159
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SS S +S + P + SPS S
Sbjct: 160 SSSSSSSPSSSSPSSS--GSSPSSSNSSPSSS 189
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.005
Identities = 34/102 (33%), Positives = 52/102 (50%)
Frame = +2
Query: 122 TKGSYCIMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSN 301
+ S I+ SI ++ +S+++ S SS + S++ SS S SS SS SS SS+
Sbjct: 39 SSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSP--SSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSS 96
Query: 302 SDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
S S +SS + SSPS +S ++ P + SPS S
Sbjct: 97 SSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 138
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.009
Identities = 34/92 (36%), Positives = 48/92 (51%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S ++ S + SS SS+ SS SSS SS SSS+SS S S +SS
Sbjct: 143 SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS------SSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 196
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
SSPS +S ++ +P S SPS
Sbjct: 197 SSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSSSPS 228
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.015
Identities = 34/92 (36%), Positives = 50/92 (53%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S P+++ +S ++ S + SS S++ SS SSSS SS SSS S +S P S SS
Sbjct: 125 SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSP------SSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSS 178
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
++ SS S S ++ P +P+S SPS
Sbjct: 179 PSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSP--SPRSSSPS 208
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.13
Identities = 34/99 (34%), Positives = 51/99 (51%), Gaps = 5/99 (5%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSES-SSSESSISSSDSSNSDLPDS*AS 328
S P+++ +S+++ S + SS + SS + S+ S SSS SS SSS SS S S +S
Sbjct: 150 SSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSS 209
Query: 329 SEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKA----PKSPSPSLC 433
S + SS +S ++ P A P+SP S C
Sbjct: 210 SSSSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQSPQSSHC 248
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.49
Identities = 30/92 (32%), Positives = 43/92 (46%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S +++ +S++ S + SS SS+ SS SSSS S SSS S +S S +SS
Sbjct: 105 SSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSS 164
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
+ SS S + P + SPS S
Sbjct: 165 SSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSS 196
>sp|P87179|YB1E_SCHPO Protein C30B4.01c in chromosome II gi|7491580|pir||T40167
hypothetical protein SPBC30B4.01c - fission yeast
(Schizosaccharomyces pombe) (fragment)
gi|3417427|emb|CAA20314.1| putative glucoamylase
[Schizosaccharomyces pombe]
Length = 344
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.002
Identities = 37/108 (34%), Positives = 54/108 (49%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S TTT + +++ S + SS + SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SS
Sbjct: 116 SSSTTTTTSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 175
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPSLCK*ISYFINFRRSSS 475
+ +S S +S ++ + PS S S FI SS+
Sbjct: 176 SSVPITSSTSSSHSSSSSSSSSSSSSSRPSSS-----SSFITTMSSST 218
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.004
Identities = 28/60 (46%), Positives = 36/60 (59%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S TTT TS ++ S + SS + SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SS
Sbjct: 115 SSSSTTTTTSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 174
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.005
Identities = 32/93 (34%), Positives = 48/93 (51%)
Frame = +2
Query: 149 ISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*AS 328
+S ++ TS+++ S SS S++ SS SSSS SS SSS SS+S S +S
Sbjct: 97 VSSSSVSSTTSSSSSSSPSSSSTTTTTSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 156
Query: 329 SEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPS 427
S + SS S +S +++P + S S S
Sbjct: 157 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSVPITSSTSSSHS 189
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.020
Identities = 36/109 (33%), Positives = 55/109 (50%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S+ TT+ +S+++ S + ++ + SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SS
Sbjct: 101 SVSSTTSSSSSSSPSSSSTTTTTSP-SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 159
Query: 332 EGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPSLCK*ISYFINFRRSSSN 478
+ SS S +S + S S S S + R SSS+
Sbjct: 160 SSSSSSSSSSSSSSSSSSVPITSSTSSSHSSSSSSSSSSSSSSRPSSSS 208
>dbj|BAA78501.1| serine repeat antigen [Plasmodium falciparum]
Length = 261
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.002
Identities = 28/63 (44%), Positives = 36/63 (56%)
Frame = +2
Query: 233 SSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPK 412
SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SS + SS S +S +LP P
Sbjct: 176 SSSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESLPANGPD 235
Query: 413 SPS 421
SP+
Sbjct: 236 SPT 238
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.009
Identities = 27/69 (39%), Positives = 43/69 (62%)
Frame = +2
Query: 164 TTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASSEGLK 343
+++ +S+++ S + SS ++ SS++ SS SSSS SS SSS SS+S S +SSE L
Sbjct: 171 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESLP 230
Query: 344 HA*GSSPSL 370
SP++
Sbjct: 231 ANGPDSPTV 239
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.058
Identities = 26/76 (34%), Positives = 42/76 (55%)
Frame = +2
Query: 92 IRKKTIASLHTKGSYCIMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSE 271
+ KK L + G+ S +++ +S+++ S + SS + SS++ SS SSSS
Sbjct: 153 LEKKKYVKLPSNGTTGEQSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 212
Query: 272 SSISSSDSSNSDLPDS 319
SS SSS SS+S +S
Sbjct: 213 SSSSSSSSSSSSSSES 228
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.29
Identities = 23/64 (35%), Positives = 38/64 (58%)
Frame = +2
Query: 152 SIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSESSISSSDSSNSDLPDS*ASS 331
S +++ +S+++ + + SS + SS++ SS SSSS SS SSS SS+ LP + S
Sbjct: 177 SSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESLPANGPDS 236
Query: 332 EGLK 343
+K
Sbjct: 237 PTVK 240
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.49
Identities = 31/97 (31%), Positives = 46/97 (46%), Gaps = 1/97 (1%)
Frame = +2
Query: 143 MRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSESSSSES-SISSSDSSNSDLPDS 319
+R ++K T S + S +L K S+ +SSSS S S SSS SS+S +S
Sbjct: 133 LRTTLKKTNNAISFESNSGSLEKKKYVKLPSNGTTGEQSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSNS 192
Query: 320 *ASSEGLKHA*GSSPSLLTSILATLPRKAPKSPSPSL 430
+SS + SS S +S ++ + S S SL
Sbjct: 193 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESL 229
Score = 32.3 bits (72), Expect = 4.2
Identities = 25/82 (30%), Positives = 43/82 (51%), Gaps = 2/82 (2%)
Frame = +2
Query: 80 KLHYIRKKTIASLHTKGSYCIMRISIKPTTTITSANTCSFNLISSKVNHFDSSAAESSES 259
K Y++ + + + S S +++ +S++ S + SS + SS++ SS S
Sbjct: 155 KKKYVKLPSNGTTGEQSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 214
Query: 260 SSSESSISSSDSSN--SDLPDS 319
SSS SS SSS S + ++ PDS
Sbjct: 215 SSSSSSSSSSSSESLPANGPDS 236
Database: nr
Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
Number of letters in database: 448,689,247
Number of sequences in database: 1,393,205
Lambda K H
0.318 0.135 0.401
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 426,744,756
Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 8747233
Number of successful extensions: 99932
Number of sequences better than 10.0: 1263
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 45848
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 74436
length of database: 448,689,247
effective HSP length: 116
effective length of database: 287,077,467
effective search space used: 20382500157
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 12
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
