Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC000857A_C01 KMC000857A_c01
(518 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens] 52 4e-06
ref|NP_705464.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7... 52 4e-06
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens] 51 9e-06
gb|EAA20872.1| hypothetical protein [Plasmodium yoelii yoelii] 50 2e-05
ref|NP_703783.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7... 50 2e-05
>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
Length = 252
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
Identities = 45/105 (42%), Positives = 56/105 (52%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
+++ S H S S+T+S S SS ++ + SS SPS SSSS
Sbjct: 71 SSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSS------- 123
Query: 382 SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S SS S S SPSSS+ S S SPS SSSPS S SS++SS PS
Sbjct: 124 SSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPS 168
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-05
Identities = 40/84 (47%), Positives = 51/84 (60%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S+ +SS SS + ++P + S+ SPS SSSS S S SS+ S S SPSSS+
Sbjct: 63 SSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSS-SSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSS 121
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
S S SPS SSSPS S SS++SS
Sbjct: 122 SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 145
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 37/84 (44%), Positives = 49/84 (58%), Gaps = 3/84 (3%)
Frame = +1
Query: 259 TSSSGCSSLFQDYVITTPI---FLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
+SSS S+ ++++ I + SSPS SPSSSS S S S+ S + SPSSS+
Sbjct: 37 SSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSS 96
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
S S SPS +SS S S SS +SS
Sbjct: 97 SSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSS 120
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-04
Identities = 40/84 (47%), Positives = 47/84 (55%), Gaps = 1/84 (1%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPS-SSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSS 426
S+ +SSS SS ++P + SS S S S SSS S S SPSS+ S S SSS
Sbjct: 133 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSS 192
Query: 427 TWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAAS 498
S S SPS SSSPS S SS +S
Sbjct: 193 PSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSS 216
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 42/105 (40%), Positives = 54/105 (51%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
+++ S + S S ++SSS SS + + SS SPS SSSS S S
Sbjct: 100 SSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 159
Query: 382 SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S SS+ S S S SS+ S SPS +SSPS S SS +SS PS
Sbjct: 160 SSSSSSSPSSSSPSSSGS---SPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPS 201
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 42/104 (40%), Positives = 53/104 (50%), Gaps = 4/104 (3%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
N++ S S S+++S S SS ++ + SS SPS SSSS S S
Sbjct: 107 NSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSS 166
Query: 382 ----SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
SPSS+GS S +SS S S SPS SSSPS SS +SS
Sbjct: 167 PSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSS 210
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.006
Identities = 43/91 (47%), Positives = 49/91 (53%), Gaps = 2/91 (2%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSC-S*FSPSST-GSYSYSPSS 423
+A S SS I + L+ S PS S SSSS S S SPSS+ S S S SS
Sbjct: 28 NALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSS 87
Query: 424 STWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
ST S S S S SSSPS S SS++SS PS
Sbjct: 88 STSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPS 118
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.009
Identities = 44/106 (41%), Positives = 52/106 (48%)
Frame = +1
Query: 199 RNAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS* 378
R+++ S R S + S+ SSS SS SSPS S SSS S S
Sbjct: 36 RSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSS------------PSSSPSSSSPSSSHSSSSP 83
Query: 379 FSPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S SST S S S SSS+ S S S S SSS S SS++SS PS
Sbjct: 84 SSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPS 129
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
Identities = 39/89 (43%), Positives = 48/89 (53%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S+++SSS SS ++ + SS S SPSSSS S S S S+ S S S SS +
Sbjct: 121 SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPS 180
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S S SPS SSSPS S SS + PS
Sbjct: 181 SSNS-SPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPS 208
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.14
Identities = 39/82 (47%), Positives = 47/82 (56%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S++ SSSG S + ++P + SS SPS SSSS S SPSS+ S + SPSSS
Sbjct: 169 SSSPSSSGSSPSSSN---SSP---SSSSSSPSSSSSSPSPRS-SSPSSSSSSTSSPSSS- 220
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAA 495
SPS SSSPS S SAA
Sbjct: 221 -----SPS--SSSPSSSCPSAA 235
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.23
Identities = 39/87 (44%), Positives = 49/87 (55%), Gaps = 5/87 (5%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSS-SMYSCS*FSPSSTGS----YSYS 414
S+++SS SS ++P + SS SPSSS S S S SPSS+ S S S
Sbjct: 147 SSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSS 206
Query: 415 PSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAA 495
PSSS+ S S SPS SSSPS S S++
Sbjct: 207 PSSSSSSTS-SPS--SSSPSSSSPSSS 230
>ref|NP_705464.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7]
gi|23615709|emb|CAD52701.1| hypothetical protein
[Plasmodium falciparum 3D7]
Length = 734
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
Identities = 25/57 (43%), Positives = 36/57 (62%)
Frame = -1
Query: 497 EAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDD 327
E +D++ + DDD+ E D D + DEE + E + +E +N E+E DDEE D DGDD
Sbjct: 355 EEYDDKDDDKDDDEEEEDDDEEDDDEEDDDEEDDDEEDDNDEEEDDDDEEEDDDGDD 411
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.016
Identities = 21/71 (29%), Positives = 37/71 (51%), Gaps = 8/71 (11%)
Frame = -1
Query: 515 DGMIYDEAAEDQEYEGDDDQRE--------GDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYM 360
+G E ++ +YE D+++R+ D D D+ D+E E + + D+ E + E
Sbjct: 328 NGEELQEETQEDKYEDDEEERDINDNYEEYDDKDDDKDDDEEEEDDDEEDDDEEDDDEED 387
Query: 359 DDEEGDGDGDD 327
DDEE D D ++
Sbjct: 388 DDEEDDNDEEE 398
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.027
Identities = 22/55 (40%), Positives = 30/55 (54%), Gaps = 3/55 (5%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDD---DQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEG 345
DE ED + E DD D E D + D DEE + + E D+ + E+E D+EEG
Sbjct: 367 DEEEEDDDEEDDDEEDDDEEDDDEEDDNDEEEDDDDEEEDDDGDDEEEEEDEEEG 421
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.061
Identities = 23/69 (33%), Positives = 37/69 (53%), Gaps = 5/69 (7%)
Frame = -1
Query: 518 EDGMIYDEAAED-----QEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDD 354
ED DE D +EY+ DD ++ D + + DEE + E E DE ++ E++ D+
Sbjct: 338 EDKYEDDEEERDINDNYEEYDDKDDDKDDDEEEEDDDEEDDDE-EDDDEEDDDEEDDNDE 396
Query: 353 EEGDGDGDD 327
EE D D ++
Sbjct: 397 EEDDDDEEE 405
>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-06
Identities = 46/105 (43%), Positives = 57/105 (53%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
+++ S H S S+T+S S SS ++P SS S S S SS S S
Sbjct: 71 SSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSS---SSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSS 127
Query: 382 SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
SPSS+ S SPSSS+ S S SPS SSSPS S SS++SS PS
Sbjct: 128 SPSSSSS---SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPS 169
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-05
Identities = 38/84 (45%), Positives = 49/84 (58%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S+ +SS SS + ++P + +S S SSSS S S SS+ S S SPSSS+
Sbjct: 63 SSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSS 122
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
S S SPS SSSPS S SS++SS
Sbjct: 123 SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 146
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-04
Identities = 40/89 (44%), Positives = 48/89 (52%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S+++SSS S ++P + S S S SSSS S S SPSS+ S S S SSS
Sbjct: 109 SSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSP 168
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S S PS SSPS S SS +SS PS
Sbjct: 169 SSSS--PSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPS 195
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-04
Identities = 40/84 (47%), Positives = 47/84 (55%), Gaps = 1/84 (1%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPS-SSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSS 426
S+ +SSS SS ++P + SS S S S SSS S S SPSS+ S S SSS
Sbjct: 134 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSS 193
Query: 427 TWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAAS 498
S S SPS SSSPS S SS +S
Sbjct: 194 PSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSS 217
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 42/104 (40%), Positives = 53/104 (50%), Gaps = 4/104 (3%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
N++ S S S+++S S SS ++ + SS SPS SSSS S S
Sbjct: 108 NSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSS 167
Query: 382 ----SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
SPSS+GS S +SS S S SPS SSSPS SS +SS
Sbjct: 168 PSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSS 211
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 42/105 (40%), Positives = 54/105 (51%)
Frame = +1
Query: 202 NAAQSERHKDISKLRWSATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*F 381
+++ S + S S ++SSS SS + + SS SPS SSSS S S
Sbjct: 101 SSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 160
Query: 382 SPSSTGSYSYSPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S SS+ S S S SS+ S SPS +SSPS S SS +SS PS
Sbjct: 161 SSSSSSSPSSSSPSSSGS---SPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPS 202
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.006
Identities = 38/85 (44%), Positives = 49/85 (56%), Gaps = 4/85 (4%)
Frame = +1
Query: 259 TSSSGCSSLFQDYVITTPI---FLAKSSPSPSPSSSSMYSC-S*FSPSSTGSYSYSPSSS 426
+SSS S+ ++++ I + SSPS S SSSS S S SPSS+ S S SSS
Sbjct: 37 SSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSS 96
Query: 427 TWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS 501
+ S S SPS +SS S S SS +SS
Sbjct: 97 SSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSS 121
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
Identities = 39/89 (43%), Positives = 48/89 (53%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS*FSPSSTGSYSYSPSSST 429
S+++SSS SS ++ + SS S SPSSSS S S S S+ S S S SS +
Sbjct: 122 SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPS 181
Query: 430 WS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
S S SPS SSSPS S SS + PS
Sbjct: 182 SSNS-SPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPS 209
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.061
Identities = 39/88 (44%), Positives = 50/88 (56%), Gaps = 6/88 (6%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSCS------*FSPSSTGSYSY 411
S+++SSS SS ++ + S+ SPS SSSS S S SPSS+ S +
Sbjct: 157 SSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTS 216
Query: 412 SPSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAA 495
SPS+S+ S S SPS SSSPS S SAA
Sbjct: 217 SPSTSSPS-SSSPS--SSSPSSSCPSAA 241
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.080
Identities = 41/92 (44%), Positives = 48/92 (51%), Gaps = 3/92 (3%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSSSMYSC-S*FSPSSTGSYSYSPSSS 426
+A S SS I + L+ S PS S SSSS S S SPSS+ S S SSS
Sbjct: 28 NALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSS 87
Query: 427 TWS--*S*SPSL*SSSPSYS*SSAASS*IIPS 516
+ S S S S SSSPS S SS++SS PS
Sbjct: 88 STSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPS 119
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.18
Identities = 39/88 (44%), Positives = 50/88 (56%), Gaps = 5/88 (5%)
Frame = +1
Query: 250 SATTSSSGCSSLFQDYVITTPIFLAKSSPSPSPSSS-SMYSCS*FSPSSTGS----YSYS 414
S+++SS SS ++P + SS SPSSS S S S SPSS+ S S S
Sbjct: 148 SSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSS 207
Query: 415 PSSSTWS*S*SPSL*SSSPSYS*SSAAS 498
PSSS+ S S SPS +SSPS S S++S
Sbjct: 208 PSSSSSSTS-SPS--TSSPSSSSPSSSS 232
>gb|EAA20872.1| hypothetical protein [Plasmodium yoelii yoelii]
Length = 391
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-05
Identities = 25/63 (39%), Positives = 39/63 (61%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDDFA 321
DE E+++ + D+D E D D D DEE +Y+ E D+GE+ + + DD+ D DG++
Sbjct: 248 DEDDEEEDEDEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDDED-DDGEDDDDDEEDDDGEDDDGEEEE 306
Query: 320 KKI 312
KKI
Sbjct: 307 KKI 309
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-04
Identities = 21/58 (36%), Positives = 35/58 (60%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDD 327
+E E+ E E DDD+ E D + + DE+ E E E DE ++++ + DD++ + D DD
Sbjct: 223 EEEDEEDENEDDDDEEEDDDEEEDEDEDDEEEDEDEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDD 280
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.002
Identities = 22/61 (36%), Positives = 36/61 (58%), Gaps = 1/61 (1%)
Frame = -1
Query: 506 IYDEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQ-VDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGD 330
+ +E ED+ + DD++ + D + D+ D+E E E E D+ E+ + E DDEE D D +
Sbjct: 222 VEEEDEEDENEDDDDEEEDDDEEEDEDEDDEEEDEDEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDDE 281
Query: 329 D 327
D
Sbjct: 282 D 282
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.004
Identities = 19/56 (33%), Positives = 35/56 (61%), Gaps = 2/56 (3%)
Frame = -1
Query: 488 EDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEY--EYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDD 327
+D E E DD++ + D D ++ DE+ + + + DE ++ E++ DDE+ DG+ DD
Sbjct: 234 DDDEEEDDDEEEDEDEDDEEEDEDEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDDEDDDGEDDD 289
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.006
Identities = 19/58 (32%), Positives = 34/58 (57%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDD 327
+E +D+E + D+D E D D D+ D+E + + + DE ++ + E D E+ D D +D
Sbjct: 237 EEEDDDEEEDEDEDDEEEDEDEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDDEDDDGEDDDDDEED 294
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.047
Identities = 23/58 (39%), Positives = 33/58 (56%), Gaps = 1/58 (1%)
Frame = -1
Query: 497 EAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMD-DEEGDGDGDD 327
E E+ E E ++D+ E D D ++ D+E E DE E+ E+E D DE+ D D DD
Sbjct: 217 EEMEEVEEEDEEDENEDDDDEEEDDDEEE------DEDEDDEEEDEDEDEDDDEDDDD 268
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.88
Identities = 17/54 (31%), Positives = 30/54 (55%), Gaps = 7/54 (12%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPV-------DEGENQEQEYM 360
DE +D E + D+D + + DYD D++GE + + D+GE +E++ M
Sbjct: 257 DEDEDDDEDDDDEDDDDEEDDYDDEDDDGEDDDDDEEDDDGEDDDGEEEEKKIM 310
>ref|NP_703783.1| hypothetical protein [Plasmodium falciparum 3D7]
gi|23498444|emb|CAD50395.1| hypothetical protein
[Plasmodium falciparum 3D7]
Length = 1864
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-05
Identities = 28/61 (45%), Positives = 41/61 (66%), Gaps = 2/61 (3%)
Frame = -1
Query: 503 YDEAAEDQEYEGD-DDQREG-DYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGD 330
YDE E +EYE + +D+ EG D D+ ++EGE E E DEGE++E++ +DEE D + D
Sbjct: 438 YDEVEEGEEYEDENEDENEGEDEGEDEGEDEGEDEGE--DEGEDEEEDEEEDEEEDEEED 495
Query: 329 D 327
D
Sbjct: 496 D 496
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
Identities = 28/72 (38%), Positives = 38/72 (51%), Gaps = 2/72 (2%)
Frame = -1
Query: 473 EGDDDQRE-GDYDYDQVDEEGEYE-YEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDDFAKKIGVVI 300
E DD++ E G Y VD EGE + Y+ V+EGE E E D+ EG+ +G+D + G
Sbjct: 417 ESDDERNEAGRY----VDCEGENKKYDEVEEGEEYEDENEDENEGEDEGEDEGEDEGEDE 472
Query: 299 T*SWKSDEHPDE 264
DE DE
Sbjct: 473 GEDEGEDEEEDE 484
Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.5
Identities = 17/58 (29%), Positives = 36/58 (61%)
Frame = -1
Query: 500 DEAAEDQEYEGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDGDD 327
+EA + EG++ + + + ++ ++E E E E DEGE++ ++ +D EG+ +G+D
Sbjct: 423 NEAGRYVDCEGENKKYDEVEEGEEYEDENEDENEGEDEGEDEGEDEGED-EGEDEGED 479
Score = 30.8 bits (68), Expect = 9.8
Identities = 15/62 (24%), Positives = 30/62 (48%), Gaps = 5/62 (8%)
Frame = -1
Query: 497 EAAEDQEY-----EGDDDQREGDYDYDQVDEEGEYEYEPVDEGENQEQEYMDDEEGDGDG 333
E+ E++EY + + E YD D +++G+ D+ + + D ++ + DG
Sbjct: 641 ESNEEEEYALIRKRNNKENEEEGYDGDDNNKDGDDNNNDGDDNNDGDDNNNDGDDNNNDG 700
Query: 332 DD 327
DD
Sbjct: 701 DD 702
Database: nr
Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
Number of letters in database: 448,689,247
Number of sequences in database: 1,393,205
Lambda K H
0.318 0.135 0.401
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 448,205,418
Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 10581194
Number of successful extensions: 99196
Number of sequences better than 10.0: 2336
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 49989
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 77256
length of database: 448,689,247
effective HSP length: 115
effective length of database: 288,470,672
effective search space used: 16442828304
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 12
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
