KCC002951A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC002951A_C01 KCC002951A_c01
ttCAGCTCTTCACCCACCGATCACCTTCAGCACTCGCACCTCCACCCACCGCCCCCAAAC
TCGCTCGCCCAGGTCGCTGCTTTTCTCCGACGACAATGGCCCCGACGTTCTCGTGTACTG
CCCGTCAGGGCGCCTCCGCCTCTGCTCCCCAGCTGACGGGCTGCCGCTCCGTCGCGCCAC
TACCGTCGCAGCACCACCACCAAGGCGCCGCGCAAGCGCACCTTCCTCGTGGGCATGACC
CGCTTCGACGCCCGCATGGAGCTCGGCGCGGGTCTGGCTAGCTCTGCCTGCGGCGCGGCG
GGCTCTAACACGCTCGGAGGCTCGTGTCAGCTTCTGTCGTGTGGGGGCGACGACAACTCC
GGCCGCATCAACAACAACAGCTTTGGCGGCAACGGCGGCAACAACGGCGGCAGCAACGGC
GGCTTCGGCTTCAGCAGCGGCGACTTCGGCATGCCGGAGTCGCGCATGGGCCGCGCGCTG
ATTGGCGCGTTCGCGCTGAC


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC002951A_C01 KCC002951A_c01
         (500 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [...    51  6e-07
ref|NP_727743.1| CG32611-PB [Drosophila melanogaster] gi|2283270...    53  2e-06
ref|NP_727651.1| CG32642-PC [Drosophila melanogaster] gi|2283312...    52  4e-06
pir||T45462 membrane glycoprotein [imported] - equine herpesviru...    52  4e-06
sp|P14328|SP96_DICDI Spore coat protein SP96 gi|84145|pir||S0763...    51  7e-06

>pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [imported] -
           Boreogadus saida gi|2078483|gb|AAC60129.1| antifreeze
           glycopeptide AFGP polyprotein precursor
          Length = 507

 Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-06
 Identities = 46/123 (37%), Positives = 59/123 (47%), Gaps = 8/123 (6%)
 Frame = +2

Query: 122 PSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS-----TPAWSSARVWLAL 286
           P+   R  +PA    L  A T A P     A+  ++ A  A+     TPA  +     A 
Sbjct: 254 PARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPAT 313

Query: 287 PA-ARRALTRSEARVSF--CRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACR 457
           PA A  A T + A  +    R     TPA + T A AATAAT  AATAA+A+ AAT A  
Sbjct: 314 PATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATAAT--AATAATAATAATPARA 371

Query: 458 SRA 466
           +RA
Sbjct: 372 ARA 374

 Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-05
 Identities = 48/128 (37%), Positives = 62/128 (47%), Gaps = 4/128 (3%)
 Frame = +2

Query: 122 PSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAA 295
           P+   R  +PA       A T A       A  P+  A PA+  TPA ++A    A  AA
Sbjct: 95  PARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPA-TAATPATAATAA 153

Query: 296 RRALTRSEARVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRAW 469
             A + + A  +     AT  TPA   T A AA AAT A AATAA+A+ AAT+A  + A 
Sbjct: 154 TAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAATAATAATAATAATAATAA 213

Query: 470 AAR*LARS 493
            A   AR+
Sbjct: 214 TAATPARA 221

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
 Identities = 46/114 (40%), Positives = 59/114 (51%), Gaps = 4/114 (3%)
 Frame = +2

Query: 122 PSGRLRLCSPADGL-PLRRATTVAAPPPRRRASAPS-SWA*PASTPAWSSARVWLALPAA 295
           P+   R  +PA    P   AT   A      A+A + + A  A+TPA ++A    A  AA
Sbjct: 332 PARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPA-TAATAATAATAA 390

Query: 296 RRALTRSEARVSFCRVGAT-TTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
             A   + AR +     AT  TPA   T A AATAAT A AATAA+A+ AAT+A
Sbjct: 391 TAATAATPARAARAATPATPATPATPATPATAATAATAATAATAATAATAATAA 444

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
 Identities = 38/107 (35%), Positives = 51/107 (47%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
           +PA       A T A P    RA+ P++    A+T A ++     A PA       +   
Sbjct: 238 TPATAATAATAPTAATPARAARAATPAT----AATLATAATPATPATPATAATDATAATA 293

Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
            +  R     TPA + T A  ATAAT  AATAA+A+ AAT A  +RA
Sbjct: 294 ATPARAATPATPATAATPATPATAAT--AATAATAATAATPARAARA 338

 Score = 48.9 bits (115), Expect(2) = 6e-07
 Identities = 41/99 (41%), Positives = 52/99 (52%), Gaps = 2/99 (2%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEARVSFCRVGAT 352
           A T A P    RA+ P++ A  A+T A ++     A PA A RA T +            
Sbjct: 362 AATAATPARAARAATPATAA-TAATAATAATAATAATPARAARAATPATPATP----ATP 416

Query: 353 TTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
            TPA + T A AATAAT A AATAA+A+ A T A  +RA
Sbjct: 417 ATPATAATAATAATAATAATAATAATAATAPTPARAARA 455

 Score = 48.9 bits (115), Expect(2) = 3e-06
 Identities = 44/112 (39%), Positives = 55/112 (48%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
           +PA       A T A P      + P++ A PA TPA ++     A  AA  A   + AR
Sbjct: 280 TPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPA-TPATAAT----AATAATAATAATPAR 334

Query: 326 VSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRAWAA 475
            +     AT  TPA + T A AATAAT A AAT A A+ AAT A  + A  A
Sbjct: 335 AARAATPATAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATAATA 386

 Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-05
 Identities = 39/93 (41%), Positives = 51/93 (53%), Gaps = 1/93 (1%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           A T A P    RA+ P++    A+TPA ++     A  AA  A   + AR +     AT 
Sbjct: 89  AATAATPARAARAATPAT----AATPATAAT----AATAATAATAETPARAATPATAAT- 139

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
            PA + T A AATAAT A +ATAA+A+ AAT A
Sbjct: 140 -PATAATPATAATAATAATSATAATAARAATPA 171

 Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
 Identities = 42/120 (35%), Positives = 56/120 (46%), Gaps = 13/120 (10%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEA 322
           +PA         T A       A+ P++ A  A+T A ++     A PA A RA T + A
Sbjct: 48  TPATAATAATEATAATAATPATAATPATAATAATTAATAATAATAATPARAARAATPATA 107

Query: 323 RVSFCRVGATT--------TPAASTTTALAATAATTA----AATAASASAAATSACRSRA 466
                   A T        TPA + T A AAT AT A    AATAA+A+ +AT+A  +RA
Sbjct: 108 ATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAATPATAATAATAATSATAATAARA 167

 Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
 Identities = 45/119 (37%), Positives = 56/119 (46%), Gaps = 12/119 (10%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA----ARRALTR 313
           +PA       A T A      RA+ P++ A PA TPA ++     A PA    A  A T 
Sbjct: 145 TPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPA-TPATAARAARAATPATAATAATAATA 203

Query: 314 SEARVSFCRVGATT--------TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
           + A  +     A T        TPA + T A AAT AT  AATAA+A  AAT A  +RA
Sbjct: 204 ATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPAT--AATAATAPTAATPARAARA 260

 Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-04
 Identities = 45/144 (31%), Positives = 61/144 (42%), Gaps = 20/144 (13%)
 Frame = +2

Query: 107 VLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWL 280
           +LV  P+   R  +PA       A T A        +  ++ A PA+  TPA ++     
Sbjct: 23  LLVARPAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAATAATPATAATPATAATAATT 82

Query: 281 ALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAAT-----------------T 406
           A  AA  A   + AR +     AT  TPA + T A AATAAT                 T
Sbjct: 83  AATAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPAT 142

Query: 407 AAATAASASAAATSACRSRAWAAR 478
           AA  A +A+AA  +   + A AAR
Sbjct: 143 AATPATAATAATAATSATAATAAR 166

 Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-04
 Identities = 39/93 (41%), Positives = 49/93 (51%), Gaps = 1/93 (1%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           A T A P    RA+ P++    A+TPA ++A    A  AA  A   + AR +        
Sbjct: 326 AATAATPARAARAATPAT----AATPA-TAATAATAATAATAATAATPARAA-----RAA 375

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
           TPA + T A AATAAT A AAT A A+ AAT A
Sbjct: 376 TPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPA 408

 Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
 Identities = 38/113 (33%), Positives = 50/113 (43%), Gaps = 3/113 (2%)
 Frame = +2

Query: 137 RLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRAS--APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALT 310
           R  +PA       A T A       A+  A  + A  A+TPA +      A PA      
Sbjct: 187 RAATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAATAA 246

Query: 311 RSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAA-ATAASASAAATSACRSRA 466
            +    +  R     TPA + T A AAT AT A  ATAA+ + AAT+A  +RA
Sbjct: 247 TAPTAATPARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPARA 299

 Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-04
 Identities = 44/110 (40%), Positives = 55/110 (50%), Gaps = 9/110 (8%)
 Frame = +2

Query: 164 PLRRAT-----TVAAP--PPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEA 322
           P R AT     T A P  P     +A ++ A  A+TPA  +AR      AA  A   + A
Sbjct: 296 PARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAATAATPA-RAARAATPATAATPATAATAA 354

Query: 323 RVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
             +     AT  TPA +   A  ATAAT A AATAA+A+ AAT A  +RA
Sbjct: 355 TAATAATAATAATPARAARAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARA 404

 Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-04
 Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (46%), Gaps = 8/119 (6%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAARRALTRSE 319
           +PA       A T A      RA+ P++ A PA+  TPA ++     A  AA  A   + 
Sbjct: 109 TPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAATPATAAT----AATAATSATAATA 164

Query: 320 ARVSFCRVGAT-TTPAASTTTALAATAAT-----TAAATAASASAAATSACRSRAWAAR 478
           AR +     AT  TPA +   A AAT AT     TAA  A +A+AA  +   + A AAR
Sbjct: 165 ARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAAR 223

 Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-04
 Identities = 40/102 (39%), Positives = 51/102 (49%), Gaps = 5/102 (4%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           A T A P    RA+ P++ A PA TPA  +     A  AA  A   + A  +     AT 
Sbjct: 392 AATAATPARAARAATPATPATPA-TPATPAT----AATAATAATAATAATAATAATAATA 446

Query: 356 -TPAASTTTALAATAATTAAA----TAASASAAATSACRSRA 466
            TPA +   A  AT AT A A    TAA+A+ AAT+A  +RA
Sbjct: 447 PTPARAARAATPATGATPATAPTAGTAATAATAATAATPARA 488

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
 Identities = 36/103 (34%), Positives = 47/103 (44%), Gaps = 2/103 (1%)
 Frame = +2

Query: 164 PLRRATTVAAPPPRRRAS-APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCR 340
           P R AT   A  P   A+ A ++ A  A+T A ++     A PA               R
Sbjct: 128 PARAATPATAATPATAATPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAAR 187

Query: 341 VGATTTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
                T A + T A AATAAT A AATAA+ + AA +A  + A
Sbjct: 188 AATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATA 230

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
 Identities = 34/99 (34%), Positives = 46/99 (46%), Gaps = 2/99 (2%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGA 349
           A T A P    RA+ P++   PA+  TPA ++        A      R+    +   +  
Sbjct: 212 AATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLAT 271

Query: 350 TTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
             TPA   T A AAT AT  AATAA+ + AAT A  + A
Sbjct: 272 AATPATPATPATAATDAT--AATAATPARAATPATPATA 308

 Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.002
 Identities = 41/106 (38%), Positives = 52/106 (48%), Gaps = 12/106 (11%)
 Frame = +2

Query: 170 RRATTVAAPPPRRRAS----APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFC 337
           R AT   AP P   A+    A ++ A  A+TPA  +AR      AA  A   + A  +  
Sbjct: 223 RAATPATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPA-RAARAATPATAATLATAATPATPATP 281

Query: 338 RVGAT-------TTPAASTTTALAATAATTAA-ATAASASAAATSA 451
              AT        TPA + T A  ATAAT A  ATAA+A+ AAT+A
Sbjct: 282 ATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAA 327

 Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.012
 Identities = 29/85 (34%), Positives = 40/85 (46%), Gaps = 11/85 (12%)
 Frame = +2

Query: 245 STPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAAT------- 403
           S+P +   ++ +A PAA           +        T A + T A AATAAT       
Sbjct: 14  SSPRYEQHQLLVARPAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAATAATPATAATP 73

Query: 404 ----TAAATAASASAAATSACRSRA 466
               TAA TAA+A+ AAT+A  +RA
Sbjct: 74  ATAATAATTAATAATAATAATPARA 98

 Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
 Identities = 38/107 (35%), Positives = 50/107 (46%), Gaps = 5/107 (4%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEA 322
           +PA      RA   A P      +A ++ A  A+T A ++     A PA A RA T + A
Sbjct: 175 TPATPATAARAARAATPA----TAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATA 230

Query: 323 RVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTA----AATAASASAAATSA 451
                      TPA + T A A TAAT A    AAT A+A+  AT+A
Sbjct: 231 PTP----ATAATPATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLATAA 273

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.6
 Identities = 29/84 (34%), Positives = 36/84 (42%), Gaps = 2/84 (2%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRR--RASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGA 349
           AT   AP P R  RA+ P++ A PA+ P   +A    A  AA  A               
Sbjct: 441 ATAATAPTPARAARAATPATGATPATAPTAGTAAT--AATAATAA--------------- 483

Query: 350 TTTPAASTTTALAATAATTAAATA 421
             TPA ++T A AAT  T A   A
Sbjct: 484 --TPARASTPATAATPVTAATPAA 505

 Score = 25.4 bits (54), Expect(2) = 6e-07
 Identities = 15/56 (26%), Positives = 22/56 (38%)
 Frame = +3

Query: 12  THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAPQLTGCRSVAP 179
           T  +P+  A   TA   A P R  +P T A   +      A+ +A   T   +  P
Sbjct: 277 TPATPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAATAATP 332

 Score = 23.1 bits (48), Expect(2) = 3e-06
 Identities = 14/46 (30%), Positives = 19/46 (40%)
 Frame = +3

Query: 12  THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAP 149
           T  +P+  A   TAP  A P R     T  P  + T    A+ + P
Sbjct: 235 TAATPATAATAATAPTAATPARAARAAT--PATAATLATAATPATP 278

>ref|NP_727743.1| CG32611-PB [Drosophila melanogaster] gi|22832707|gb|AAF48333.2|
           CG32611-PB [Drosophila melanogaster]
          Length = 1103

 Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-06
 Identities = 43/116 (37%), Positives = 58/116 (49%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
           SPA  L    AT  A       A+A +S     ST A S+A    A  AA  A + S   
Sbjct: 110 SPAAALDATAATQAATATATATAAAATS----TSTSATSAA----ATAAATAATSASTTA 161

Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAAR*LARS 493
            +      TTT  A+TTTA  ATAAT+ AAT++S+S  + +A  + A +A  +A S
Sbjct: 162 TAAAGSSNTTTTTAATTTATCATAATSTAATSSSSSVTSAAAAAAAAASASGVAHS 217

 Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.23
 Identities = 24/71 (33%), Positives = 32/71 (44%), Gaps = 9/71 (12%)
 Frame = +1

Query: 256 MELGAGLASSACGAAGSNTLGGS---CQLLSCGGDDNSGRINNNSFGGNGGN------NG 408
           +E  +  A++A    GSN+L GS   C   S    +N+   NNNS   N  N      + 
Sbjct: 328 VEPKSAAAATAAQQGGSNSLSGSSNACHTNSSSNSNNNNNNNNNSSSNNNNNTSSGKTSA 387

Query: 409 GSNGGFGFSSG 441
            SNGG   S G
Sbjct: 388 SSNGGTASSGG 398

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.88
 Identities = 23/50 (46%), Positives = 30/50 (60%), Gaps = 1/50 (2%)
 Frame = +2

Query: 347 ATTTPAASTTTALAATAAT-TAAATAASASAAATSACRSRAWAAR*LARS 493
           A  +PAA+     A  AAT TA ATAA+A++ +TSA  + A AA   A S
Sbjct: 107 AADSPAAALDATAATQAATATATATAAAATSTSTSATSAAATAAATAATS 156

>ref|NP_727651.1| CG32642-PC [Drosophila melanogaster] gi|22833124|gb|AAN09643.1|
           CG32642-PC [Drosophila melanogaster]
          Length = 381

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
 Identities = 38/103 (36%), Positives = 52/103 (49%)
 Frame = +2

Query: 158 GLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFC 337
           G P + ATT AA       +A ++ A   +T A ++A    A  A   A T + A  +  
Sbjct: 235 GYPTKYATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAA 291

Query: 338 RVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
              A TT AA+TT A    A TTAA TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 292 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTA 334

 Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
 Identities = 45/129 (34%), Positives = 59/129 (44%), Gaps = 16/129 (12%)
 Frame = +2

Query: 128 GRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*-----PASTPAWSSARVWLA--- 283
           G   + SP+  +    A    APPP +  S PSS+       PA    +S A    A   
Sbjct: 157 GPYPVASPSYSVSYPAAPAAYAPPPPKYPSPPSSYPVYAKPVPAYAAVYSYADTTKAPST 216

Query: 284 ---LPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAA 439
                +A    T+S     +    ATTT A   A+TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA
Sbjct: 217 GSTTASATTGTTKSNRYPGYPTKYATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 276

Query: 440 ATSACRSRA 466
            T+A  + A
Sbjct: 277 TTTAATTTA 285

 Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
 Identities = 34/96 (35%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 1/96 (1%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALP-AARRALTRSEARVSFCRVGAT 352
           ATT AA       +A ++ A   +    ++A    A   AA  A T + A  +     A 
Sbjct: 276 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTAA 335

Query: 353 TTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRS 460
           TT AA+TT A    A TTAA T A+ + AAT+A  S
Sbjct: 336 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAAPS 371

 Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-04
 Identities = 31/94 (32%), Positives = 42/94 (43%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A   +    ++A    A  AA      + A  +        
Sbjct: 281 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 340

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACR 457
           T  A+TTTA   TAATT AAT  +A+ AA S  R
Sbjct: 341 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAAPSVSR 374

 Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
 Identities = 40/102 (39%), Positives = 53/102 (51%), Gaps = 5/102 (4%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A   +T A ++A    A  A   A T + A  +     ATT
Sbjct: 266 ATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTAATT 322

Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
           T A   A+TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 323 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 364

 Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-04
 Identities = 40/102 (39%), Positives = 53/102 (51%), Gaps = 5/102 (4%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A   +T A ++A    A  A   A T + A  +     ATT
Sbjct: 271 ATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTAATTTAATT 327

Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAAT--AASASAAATSACRSRA 466
           T A   A+TTTA   TAATT AAT  AA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 328 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAA 369

 Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-04
 Identities = 37/101 (36%), Positives = 50/101 (48%), Gaps = 4/101 (3%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A  A+T A ++            A T +    +     ATT
Sbjct: 256 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 313

Query: 356 TPA--ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
           T A  A+TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 314 TAATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 354

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.004
 Identities = 40/109 (36%), Positives = 53/109 (47%), Gaps = 2/109 (1%)
 Frame = +2

Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
           +P+ G     ATT       R    P+ +A   +T A ++A    A  A   A T + A 
Sbjct: 213 APSTGSTTASATT-GTTKSNRYPGYPTKYA--TTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAAT 267

Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
            +     A TT AA TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 268 TTAATTTAATTTAA-TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 315

>pir||T45462 membrane glycoprotein [imported] - equine herpesvirus 1
           gi|2114321|dbj|BAA20037.1| membrane glycoprotein [Equine
           herpesvirus 1]
          Length = 866

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
 Identities = 43/152 (28%), Positives = 63/152 (41%), Gaps = 1/152 (0%)
 Frame = +2

Query: 14  PPITFSTR-TSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVA 190
           PP T S+  TSTH   T SP S      +        PS      S    +P   +T   
Sbjct: 57  PPTTSSSPPTSTH---TSSPSSTSTQSSSTAATSSSAPS----TASSTTSIPTSTSTETT 109

Query: 191 APPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAAS 370
              P    + P++     +T A ++A    A  AA  +   + A  +      TTTP ++
Sbjct: 110 TTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTST 169

Query: 371 TTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
           TTT    T  TTA+ T  + +AA T+A  + A
Sbjct: 170 TTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTA 201

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
 Identities = 49/153 (32%), Positives = 67/153 (43%), Gaps = 5/153 (3%)
 Frame = +2

Query: 23  TFSTRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPP 202
           T +T T+T  P T +P S   +            +      +         ATT AA   
Sbjct: 151 TTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTT 210

Query: 203 RRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPA---AST 373
               +A ++ A   +T A ++A    A  A   A T S A  +     ATTT A   A+T
Sbjct: 211 AATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAAT 267

Query: 374 TTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
           TTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 268 TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 300

 Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
 Identities = 34/99 (34%), Positives = 45/99 (45%), Gaps = 2/99 (2%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A   +    SSA       AA      + A  +        
Sbjct: 217 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 276

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
           T  A+TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 277 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 315

 Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
 Identities = 39/144 (27%), Positives = 55/144 (38%)
 Frame = +2

Query: 17  PITFSTRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAP 196
           P T ST T T    T +  +   +            +      +         ATT AA 
Sbjct: 179 PTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT 238

Query: 197 PPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTT 376
                 +A +S A  A+T   ++        A   A T + A  +     A TT AA+TT
Sbjct: 239 T----TAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTT 294

Query: 377 TALAATAATTAAATAASASAAATS 448
            A    A TTAA T A+ + AAT+
Sbjct: 295 AATTTAATTTAATTTAATTTAATT 318

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
 Identities = 33/102 (32%), Positives = 49/102 (47%), Gaps = 5/102 (4%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           A+T A+       +  ++ + P +T   S+            A T ++   +     ATT
Sbjct: 140 ASTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATT 199

Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
           T A   A+TTTA   TAATT AA  TAA+ +AA T+A  + A
Sbjct: 200 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 241

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.004
 Identities = 28/90 (31%), Positives = 40/90 (44%)
 Frame = +2

Query: 179 TTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTT 358
           TT A       A+  ++    A+T   ++        A   A T + A  +     A TT
Sbjct: 239 TTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 298

Query: 359 PAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATS 448
            AA+TT A    A TTAA T A+ + AAT+
Sbjct: 299 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 328

 Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
 Identities = 33/100 (33%), Positives = 49/100 (49%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A  A+T A ++            A T +         G+T+
Sbjct: 281 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTS 338

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAA 475
           T  AST+T  A+T AT+A  T+ S SAAAT++  +   AA
Sbjct: 339 TTGASTSTPSAST-ATSATPTSTSTSAAATTSTPTPTSAA 377

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.027
 Identities = 34/99 (34%), Positives = 45/99 (45%)
 Frame = +2

Query: 179 TTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTT 358
           TT ++PP     S+PSS     ST + S+A    + P+   + T      S      TTT
Sbjct: 59  TTSSSPPTSTHTSSPSS----TSTQSSSTAATSSSAPSTASSTTSIPTSTS--TETTTTT 112

Query: 359 PAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAA 475
           P ASTTT    TAA T        +AA T+A  + A  A
Sbjct: 113 PTASTTTPTTTTAAPT--------TAATTTAVTTAASTA 143

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.027
 Identities = 39/154 (25%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 2/154 (1%)
 Frame = +2

Query: 17  PITFSTRTSTHRP--QTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVA 190
           P + ST T+T  P   T +P +   +            +      + A+      AT  +
Sbjct: 101 PTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTAASTSAE-TTTATATATS 159

Query: 191 APPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAAS 370
            P      S  ++ A   + P  +S        A   A T + A  +     A TT AA+
Sbjct: 160 TPTTTTPTSTTTTTA-TTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTT-----AATTTAAT 213

Query: 371 TTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWA 472
           TT A    A TTAA T A+ + AAT+   + + A
Sbjct: 214 TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSA 247

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.047
 Identities = 34/99 (34%), Positives = 44/99 (44%), Gaps = 4/99 (4%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A  A+T A ++            A T +    +     ATT
Sbjct: 251 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 308

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATA----ASASAAATSACRS 460
           T  A+TTTA   TAATT AAT      S S + T A  S
Sbjct: 309 T--AATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTS 345

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.080
 Identities = 26/92 (28%), Positives = 44/92 (47%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
           ATT AA       +A ++ A  A+T A ++            A T +    +     ATT
Sbjct: 266 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 323

Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSA 451
           T A +T +  + + +TT A+T+  +++ ATSA
Sbjct: 324 TAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSA 355

 Score = 35.0 bits (79), Expect(2) = 0.005
 Identities = 29/100 (29%), Positives = 45/100 (45%), Gaps = 3/100 (3%)
 Frame = +2

Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRAL---TRSEARVSFCRVG 346
           +T  +A P     SA ++ + P  T A +SA      P +       T SEA        
Sbjct: 350 STATSATPTSTSTSAAATTSTPTPTSAATSAESTTEAPTSTPTTDTTTPSEATT------ 403

Query: 347 ATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
           ATT+P ++T +A   +A TTA  T +  S  +++   S A
Sbjct: 404 ATTSPESTTVSASTTSATTTAFTTESHTSPDSSTGSTSTA 443

 Score = 25.8 bits (55), Expect(2) = 0.005
 Identities = 16/56 (28%), Positives = 22/56 (38%)
 Frame = +3

Query: 12  THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAPQLTGCRSVAP 179
           T  + +  A   TA          + TT +PT   T+  GAS S P  +   S  P
Sbjct: 302 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSATP 357

>sp|P14328|SP96_DICDI Spore coat protein SP96 gi|84145|pir||S07638 spore coat protein
           SP96 precursor - slime mold  (Dictyostelium discoideum)
           gi|295736|emb|CAA34508.1| spore coat protein sp96
           [Dictyostelium discoideum]
          Length = 600

 Score = 51.2 bits (121), Expect = 7e-06
 Identities = 43/142 (30%), Positives = 63/142 (44%), Gaps = 1/142 (0%)
 Frame = +2

Query: 29  STRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRR 208
           S+  S     + SP S   S           PS      S A   P   A++ ++P    
Sbjct: 447 SSSASGSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSS-----SAASSSPSSSASSSSSPSSSA 501

Query: 209 RAS-APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTAL 385
            +S APSS A  +S P+ S++    +  +A  A T +   ++      T T  A+T T  
Sbjct: 502 SSSSAPSSSASSSSAPSSSASSSSASSSSASSAATTAATTIATTAATTTATTTATTATTT 561

Query: 386 AATAATTAAATAASASAAATSA 451
           A T ATT AAT A+ +AA T+A
Sbjct: 562 ATTTATTTAATIATTTAATTTA 583

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.009
 Identities = 42/143 (29%), Positives = 59/143 (40%), Gaps = 6/143 (4%)
 Frame = +2

Query: 65  SPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSP----ADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSW 232
           S  S + S  +G       PS      SP    A   P   A + +       +S+PSS 
Sbjct: 441 SGSSAVSSSASGSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSASSSSSPSSS 500

Query: 233 A*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTA- 409
           A  +S P+ S++    +  A   + + S A  S     ATT      TTA   TA TTA 
Sbjct: 501 ASSSSAPSSSAS----SSSAPSSSASSSSASSSSASSAATTAATTIATTAATTTATTTAT 556

Query: 410 -AATAASASAAATSACRSRAWAA 475
            A T A+ +A  T+A  +   AA
Sbjct: 557 TATTTATTTATTTAATIATTTAA 579

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.5
 Identities = 32/125 (25%), Positives = 64/125 (50%), Gaps = 3/125 (2%)
 Frame = +2

Query: 101 PDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWL 280
           P  +  CP+G + +      + L R TT         A   +S +  + + A SS+    
Sbjct: 394 PCSVAQCPTGYVCVAQNNVAVSLPRPTTTTGSTSDSSALGSTSESSASGSSAVSSSASGS 453

Query: 281 ALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTP---AASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSA 451
           +  AA  + + S A  S     A+++P   AAS++ + +A+++++ +++A+S+SA ++SA
Sbjct: 454 S--AASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSASSSSSPSSSASSSSAPSSSA 511

Query: 452 CRSRA 466
             S A
Sbjct: 512 SSSSA 516



EST assemble image


clone accession position
1 LC058c01_r AV623048 1 506
2 MX219f06_r BP090149 3 206
3 LCL026h10_r AV627449 7 461
4 MX002c11_r BP086124 28 418




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute