Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC002951A_C01 KCC002951A_c01
(500 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [... 51 6e-07
ref|NP_727743.1| CG32611-PB [Drosophila melanogaster] gi|2283270... 53 2e-06
ref|NP_727651.1| CG32642-PC [Drosophila melanogaster] gi|2283312... 52 4e-06
pir||T45462 membrane glycoprotein [imported] - equine herpesviru... 52 4e-06
sp|P14328|SP96_DICDI Spore coat protein SP96 gi|84145|pir||S0763... 51 7e-06
>pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [imported] -
Boreogadus saida gi|2078483|gb|AAC60129.1| antifreeze
glycopeptide AFGP polyprotein precursor
Length = 507
Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-06
Identities = 46/123 (37%), Positives = 59/123 (47%), Gaps = 8/123 (6%)
Frame = +2
Query: 122 PSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS-----TPAWSSARVWLAL 286
P+ R +PA L A T A P A+ ++ A A+ TPA + A
Sbjct: 254 PARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPAT 313
Query: 287 PA-ARRALTRSEARVSF--CRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACR 457
PA A A T + A + R TPA + T A AATAAT AATAA+A+ AAT A
Sbjct: 314 PATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATAAT--AATAATAATAATPARA 371
Query: 458 SRA 466
+RA
Sbjct: 372 ARA 374
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-05
Identities = 48/128 (37%), Positives = 62/128 (47%), Gaps = 4/128 (3%)
Frame = +2
Query: 122 PSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAA 295
P+ R +PA A T A A P+ A PA+ TPA ++A A AA
Sbjct: 95 PARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPA-TAATPATAATAA 153
Query: 296 RRALTRSEARVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRAW 469
A + + A + AT TPA T A AA AAT A AATAA+A+ AAT+A + A
Sbjct: 154 TAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAATAATAATAATAATAATAA 213
Query: 470 AAR*LARS 493
A AR+
Sbjct: 214 TAATPARA 221
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
Identities = 46/114 (40%), Positives = 59/114 (51%), Gaps = 4/114 (3%)
Frame = +2
Query: 122 PSGRLRLCSPADGL-PLRRATTVAAPPPRRRASAPS-SWA*PASTPAWSSARVWLALPAA 295
P+ R +PA P AT A A+A + + A A+TPA ++A A AA
Sbjct: 332 PARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPA-TAATAATAATAA 390
Query: 296 RRALTRSEARVSFCRVGAT-TTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
A + AR + AT TPA T A AATAAT A AATAA+A+ AAT+A
Sbjct: 391 TAATAATPARAARAATPATPATPATPATPATAATAATAATAATAATAATAATAA 444
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
Identities = 38/107 (35%), Positives = 51/107 (47%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
+PA A T A P RA+ P++ A+T A ++ A PA +
Sbjct: 238 TPATAATAATAPTAATPARAARAATPAT----AATLATAATPATPATPATAATDATAATA 293
Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
+ R TPA + T A ATAAT AATAA+A+ AAT A +RA
Sbjct: 294 ATPARAATPATPATAATPATPATAAT--AATAATAATAATPARAARA 338
Score = 48.9 bits (115), Expect(2) = 6e-07
Identities = 41/99 (41%), Positives = 52/99 (52%), Gaps = 2/99 (2%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEARVSFCRVGAT 352
A T A P RA+ P++ A A+T A ++ A PA A RA T +
Sbjct: 362 AATAATPARAARAATPATAA-TAATAATAATAATAATPARAARAATPATPATP----ATP 416
Query: 353 TTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
TPA + T A AATAAT A AATAA+A+ A T A +RA
Sbjct: 417 ATPATAATAATAATAATAATAATAATAATAPTPARAARA 455
Score = 48.9 bits (115), Expect(2) = 3e-06
Identities = 44/112 (39%), Positives = 55/112 (48%), Gaps = 2/112 (1%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
+PA A T A P + P++ A PA TPA ++ A AA A + AR
Sbjct: 280 TPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPA-TPATAAT----AATAATAATAATPAR 334
Query: 326 VSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRAWAA 475
+ AT TPA + T A AATAAT A AAT A A+ AAT A + A A
Sbjct: 335 AARAATPATAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATAATA 386
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-05
Identities = 39/93 (41%), Positives = 51/93 (53%), Gaps = 1/93 (1%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
A T A P RA+ P++ A+TPA ++ A AA A + AR + AT
Sbjct: 89 AATAATPARAARAATPAT----AATPATAAT----AATAATAATAETPARAATPATAAT- 139
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
PA + T A AATAAT A +ATAA+A+ AAT A
Sbjct: 140 -PATAATPATAATAATAATSATAATAARAATPA 171
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
Identities = 42/120 (35%), Positives = 56/120 (46%), Gaps = 13/120 (10%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEA 322
+PA T A A+ P++ A A+T A ++ A PA A RA T + A
Sbjct: 48 TPATAATAATEATAATAATPATAATPATAATAATTAATAATAATAATPARAARAATPATA 107
Query: 323 RVSFCRVGATT--------TPAASTTTALAATAATTA----AATAASASAAATSACRSRA 466
A T TPA + T A AAT AT A AATAA+A+ +AT+A +RA
Sbjct: 108 ATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAATPATAATAATAATSATAATAARA 167
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
Identities = 45/119 (37%), Positives = 56/119 (46%), Gaps = 12/119 (10%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA----ARRALTR 313
+PA A T A RA+ P++ A PA TPA ++ A PA A A T
Sbjct: 145 TPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPA-TPATAARAARAATPATAATAATAATA 203
Query: 314 SEARVSFCRVGATT--------TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
+ A + A T TPA + T A AAT AT AATAA+A AAT A +RA
Sbjct: 204 ATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPAT--AATAATAPTAATPARAARA 260
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-04
Identities = 45/144 (31%), Positives = 61/144 (42%), Gaps = 20/144 (13%)
Frame = +2
Query: 107 VLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWL 280
+LV P+ R +PA A T A + ++ A PA+ TPA ++
Sbjct: 23 LLVARPAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAATAATPATAATPATAATAATT 82
Query: 281 ALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAAT-----------------T 406
A AA A + AR + AT TPA + T A AATAAT T
Sbjct: 83 AATAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPAT 142
Query: 407 AAATAASASAAATSACRSRAWAAR 478
AA A +A+AA + + A AAR
Sbjct: 143 AATPATAATAATAATSATAATAAR 166
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-04
Identities = 39/93 (41%), Positives = 49/93 (51%), Gaps = 1/93 (1%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
A T A P RA+ P++ A+TPA ++A A AA A + AR +
Sbjct: 326 AATAATPARAARAATPAT----AATPA-TAATAATAATAATAATAATPARAA-----RAA 375
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSA 451
TPA + T A AATAAT A AAT A A+ AAT A
Sbjct: 376 TPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPA 408
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 38/113 (33%), Positives = 50/113 (43%), Gaps = 3/113 (2%)
Frame = +2
Query: 137 RLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRAS--APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALT 310
R +PA A T A A+ A + A A+TPA + A PA
Sbjct: 187 RAATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAATAA 246
Query: 311 RSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAA-ATAASASAAATSACRSRA 466
+ + R TPA + T A AAT AT A ATAA+ + AAT+A +RA
Sbjct: 247 TAPTAATPARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPARA 299
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-04
Identities = 44/110 (40%), Positives = 55/110 (50%), Gaps = 9/110 (8%)
Frame = +2
Query: 164 PLRRAT-----TVAAP--PPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEA 322
P R AT T A P P +A ++ A A+TPA +AR AA A + A
Sbjct: 296 PARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAATAATPA-RAARAATPATAATPATAATAA 354
Query: 323 RVSFCRVGATT-TPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
+ AT TPA + A ATAAT A AATAA+A+ AAT A +RA
Sbjct: 355 TAATAATAATAATPARAARAATPATAATAATAATAATAATAATPARAARA 404
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-04
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (46%), Gaps = 8/119 (6%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAARRALTRSE 319
+PA A T A RA+ P++ A PA+ TPA ++ A AA A +
Sbjct: 109 TPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAATPATAAT----AATAATSATAATA 164
Query: 320 ARVSFCRVGAT-TTPAASTTTALAATAAT-----TAAATAASASAAATSACRSRAWAAR 478
AR + AT TPA + A AAT AT TAA A +A+AA + + A AAR
Sbjct: 165 ARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAAR 223
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-04
Identities = 40/102 (39%), Positives = 51/102 (49%), Gaps = 5/102 (4%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
A T A P RA+ P++ A PA TPA + A AA A + A + AT
Sbjct: 392 AATAATPARAARAATPATPATPA-TPATPAT----AATAATAATAATAATAATAATAATA 446
Query: 356 -TPAASTTTALAATAATTAAA----TAASASAAATSACRSRA 466
TPA + A AT AT A A TAA+A+ AAT+A +RA
Sbjct: 447 PTPARAARAATPATGATPATAPTAGTAATAATAATAATPARA 488
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 36/103 (34%), Positives = 47/103 (44%), Gaps = 2/103 (1%)
Frame = +2
Query: 164 PLRRATTVAAPPPRRRAS-APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCR 340
P R AT A P A+ A ++ A A+T A ++ A PA R
Sbjct: 128 PARAATPATAATPATAATPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAAR 187
Query: 341 VGATTTPAASTTTALAATAATTA-AATAASASAAATSACRSRA 466
T A + T A AATAAT A AATAA+ + AA +A + A
Sbjct: 188 AATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATA 230
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 34/99 (34%), Positives = 46/99 (46%), Gaps = 2/99 (2%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PAS--TPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGA 349
A T A P RA+ P++ PA+ TPA ++ A R+ + +
Sbjct: 212 AATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLAT 271
Query: 350 TTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
TPA T A AAT AT AATAA+ + AAT A + A
Sbjct: 272 AATPATPATPATAATDAT--AATAATPARAATPATPATA 308
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.002
Identities = 41/106 (38%), Positives = 52/106 (48%), Gaps = 12/106 (11%)
Frame = +2
Query: 170 RRATTVAAPPPRRRAS----APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFC 337
R AT AP P A+ A ++ A A+TPA +AR AA A + A +
Sbjct: 223 RAATPATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPA-RAARAATPATAATLATAATPATPATP 281
Query: 338 RVGAT-------TTPAASTTTALAATAATTAA-ATAASASAAATSA 451
AT TPA + T A ATAAT A ATAA+A+ AAT+A
Sbjct: 282 ATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAA 327
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.012
Identities = 29/85 (34%), Positives = 40/85 (46%), Gaps = 11/85 (12%)
Frame = +2
Query: 245 STPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAAT------- 403
S+P + ++ +A PAA + T A + T A AATAAT
Sbjct: 14 SSPRYEQHQLLVARPAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAATAATPATAATP 73
Query: 404 ----TAAATAASASAAATSACRSRA 466
TAA TAA+A+ AAT+A +RA
Sbjct: 74 ATAATAATTAATAATAATAATPARA 98
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
Identities = 38/107 (35%), Positives = 50/107 (46%), Gaps = 5/107 (4%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPA-ARRALTRSEA 322
+PA RA A P +A ++ A A+T A ++ A PA A RA T + A
Sbjct: 175 TPATPATAARAARAATPA----TAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATA 230
Query: 323 RVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTA----AATAASASAAATSA 451
TPA + T A A TAAT A AAT A+A+ AT+A
Sbjct: 231 PTP----ATAATPATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLATAA 273
Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.6
Identities = 29/84 (34%), Positives = 36/84 (42%), Gaps = 2/84 (2%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRR--RASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGA 349
AT AP P R RA+ P++ A PA+ P +A A AA A
Sbjct: 441 ATAATAPTPARAARAATPATGATPATAPTAGTAAT--AATAATAA--------------- 483
Query: 350 TTTPAASTTTALAATAATTAAATA 421
TPA ++T A AAT T A A
Sbjct: 484 --TPARASTPATAATPVTAATPAA 505
Score = 25.4 bits (54), Expect(2) = 6e-07
Identities = 15/56 (26%), Positives = 22/56 (38%)
Frame = +3
Query: 12 THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAPQLTGCRSVAP 179
T +P+ A TA A P R +P T A + A+ +A T + P
Sbjct: 277 TPATPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPATPATAATAATAATAATAATP 332
Score = 23.1 bits (48), Expect(2) = 3e-06
Identities = 14/46 (30%), Positives = 19/46 (40%)
Frame = +3
Query: 12 THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAP 149
T +P+ A TAP A P R T P + T A+ + P
Sbjct: 235 TAATPATAATAATAPTAATPARAARAAT--PATAATLATAATPATP 278
>ref|NP_727743.1| CG32611-PB [Drosophila melanogaster] gi|22832707|gb|AAF48333.2|
CG32611-PB [Drosophila melanogaster]
Length = 1103
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-06
Identities = 43/116 (37%), Positives = 58/116 (49%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
SPA L AT A A+A +S ST A S+A A AA A + S
Sbjct: 110 SPAAALDATAATQAATATATATAAAATS----TSTSATSAA----ATAAATAATSASTTA 161
Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAAR*LARS 493
+ TTT A+TTTA ATAAT+ AAT++S+S + +A + A +A +A S
Sbjct: 162 TAAAGSSNTTTTTAATTTATCATAATSTAATSSSSSVTSAAAAAAAAASASGVAHS 217
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.23
Identities = 24/71 (33%), Positives = 32/71 (44%), Gaps = 9/71 (12%)
Frame = +1
Query: 256 MELGAGLASSACGAAGSNTLGGS---CQLLSCGGDDNSGRINNNSFGGNGGN------NG 408
+E + A++A GSN+L GS C S +N+ NNNS N N +
Sbjct: 328 VEPKSAAAATAAQQGGSNSLSGSSNACHTNSSSNSNNNNNNNNNSSSNNNNNTSSGKTSA 387
Query: 409 GSNGGFGFSSG 441
SNGG S G
Sbjct: 388 SSNGGTASSGG 398
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.88
Identities = 23/50 (46%), Positives = 30/50 (60%), Gaps = 1/50 (2%)
Frame = +2
Query: 347 ATTTPAASTTTALAATAAT-TAAATAASASAAATSACRSRAWAAR*LARS 493
A +PAA+ A AAT TA ATAA+A++ +TSA + A AA A S
Sbjct: 107 AADSPAAALDATAATQAATATATATAAAATSTSTSATSAAATAAATAATS 156
>ref|NP_727651.1| CG32642-PC [Drosophila melanogaster] gi|22833124|gb|AAN09643.1|
CG32642-PC [Drosophila melanogaster]
Length = 381
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
Identities = 38/103 (36%), Positives = 52/103 (49%)
Frame = +2
Query: 158 GLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFC 337
G P + ATT AA +A ++ A +T A ++A A A A T + A +
Sbjct: 235 GYPTKYATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAA 291
Query: 338 RVGATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
A TT AA+TT A A TTAA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 292 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTA 334
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-04
Identities = 45/129 (34%), Positives = 59/129 (44%), Gaps = 16/129 (12%)
Frame = +2
Query: 128 GRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*-----PASTPAWSSARVWLA--- 283
G + SP+ + A APPP + S PSS+ PA +S A A
Sbjct: 157 GPYPVASPSYSVSYPAAPAAYAPPPPKYPSPPSSYPVYAKPVPAYAAVYSYADTTKAPST 216
Query: 284 ---LPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAA 439
+A T+S + ATTT A A+TTTA TAATT AA TAA+ +AA
Sbjct: 217 GSTTASATTGTTKSNRYPGYPTKYATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 276
Query: 440 ATSACRSRA 466
T+A + A
Sbjct: 277 TTTAATTTA 285
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 34/96 (35%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 1/96 (1%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALP-AARRALTRSEARVSFCRVGAT 352
ATT AA +A ++ A + ++A A AA A T + A + A
Sbjct: 276 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTAA 335
Query: 353 TTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRS 460
TT AA+TT A A TTAA T A+ + AAT+A S
Sbjct: 336 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAAPS 371
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-04
Identities = 31/94 (32%), Positives = 42/94 (43%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A + ++A A AA + A +
Sbjct: 281 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 340
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACR 457
T A+TTTA TAATT AAT +A+ AA S R
Sbjct: 341 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAAPSVSR 374
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
Identities = 40/102 (39%), Positives = 53/102 (51%), Gaps = 5/102 (4%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A +T A ++A A A A T + A + ATT
Sbjct: 266 ATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTAATT 322
Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
T A A+TTTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 323 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 364
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-04
Identities = 40/102 (39%), Positives = 53/102 (51%), Gaps = 5/102 (4%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A +T A ++A A A A T + A + ATT
Sbjct: 271 ATTTAATTTAATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTAATTTAATT 327
Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAAT--AASASAAATSACRSRA 466
T A A+TTTA TAATT AAT AA+ +AA T+A + A
Sbjct: 328 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTAA 369
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-04
Identities = 37/101 (36%), Positives = 50/101 (48%), Gaps = 4/101 (3%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A A+T A ++ A T + + ATT
Sbjct: 256 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 313
Query: 356 TPA--ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
T A A+TTTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 314 TAATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 354
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.004
Identities = 40/109 (36%), Positives = 53/109 (47%), Gaps = 2/109 (1%)
Frame = +2
Query: 146 SPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEAR 325
+P+ G ATT R P+ +A +T A ++A A A A T + A
Sbjct: 213 APSTGSTTASATT-GTTKSNRYPGYPTKYA--TTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAAT 267
Query: 326 VSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
+ A TT AA TTTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 268 TTAATTTAATTTAA-TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 315
>pir||T45462 membrane glycoprotein [imported] - equine herpesvirus 1
gi|2114321|dbj|BAA20037.1| membrane glycoprotein [Equine
herpesvirus 1]
Length = 866
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-06
Identities = 43/152 (28%), Positives = 63/152 (41%), Gaps = 1/152 (0%)
Frame = +2
Query: 14 PPITFSTR-TSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVA 190
PP T S+ TSTH T SP S + PS S +P +T
Sbjct: 57 PPTTSSSPPTSTH---TSSPSSTSTQSSSTAATSSSAPS----TASSTTSIPTSTSTETT 109
Query: 191 APPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAAS 370
P + P++ +T A ++A A AA + + A + TTTP ++
Sbjct: 110 TTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTST 169
Query: 371 TTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
TTT T TTA+ T + +AA T+A + A
Sbjct: 170 TTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTA 201
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
Identities = 49/153 (32%), Positives = 67/153 (43%), Gaps = 5/153 (3%)
Frame = +2
Query: 23 TFSTRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPP 202
T +T T+T P T +P S + + + ATT AA
Sbjct: 151 TTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTT 210
Query: 203 RRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPA---AST 373
+A ++ A +T A ++A A A A T S A + ATTT A A+T
Sbjct: 211 AATTTAATTTA-ATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAAT 267
Query: 374 TTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
TTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 268 TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 300
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
Identities = 34/99 (34%), Positives = 45/99 (45%), Gaps = 2/99 (2%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A + SSA AA + A +
Sbjct: 217 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 276
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
T A+TTTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 277 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 315
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-04
Identities = 39/144 (27%), Positives = 55/144 (38%)
Frame = +2
Query: 17 PITFSTRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAP 196
P T ST T T T + + + + + ATT AA
Sbjct: 179 PTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT 238
Query: 197 PPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTT 376
+A +S A A+T ++ A A T + A + A TT AA+TT
Sbjct: 239 T----TAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTT 294
Query: 377 TALAATAATTAAATAASASAAATS 448
A A TTAA T A+ + AAT+
Sbjct: 295 AATTTAATTTAATTTAATTTAATT 318
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.001
Identities = 33/102 (32%), Positives = 49/102 (47%), Gaps = 5/102 (4%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
A+T A+ + ++ + P +T S+ A T ++ + ATT
Sbjct: 140 ASTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATT 199
Query: 356 TPA---ASTTTALAATAATTAAA--TAASASAAATSACRSRA 466
T A A+TTTA TAATT AA TAA+ +AA T+A + A
Sbjct: 200 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 241
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.004
Identities = 28/90 (31%), Positives = 40/90 (44%)
Frame = +2
Query: 179 TTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTT 358
TT A A+ ++ A+T ++ A A T + A + A TT
Sbjct: 239 TTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 298
Query: 359 PAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATS 448
AA+TT A A TTAA T A+ + AAT+
Sbjct: 299 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 328
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.021
Identities = 33/100 (33%), Positives = 49/100 (49%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A A+T A ++ A T + G+T+
Sbjct: 281 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTS 338
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAA 475
T AST+T A+T AT+A T+ S SAAAT++ + AA
Sbjct: 339 TTGASTSTPSAST-ATSATPTSTSTSAAATTSTPTPTSAA 377
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.027
Identities = 34/99 (34%), Positives = 45/99 (45%)
Frame = +2
Query: 179 TTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTT 358
TT ++PP S+PSS ST + S+A + P+ + T S TTT
Sbjct: 59 TTSSSPPTSTHTSSPSS----TSTQSSSTAATSSSAPSTASSTTSIPTSTS--TETTTTT 112
Query: 359 PAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWAA 475
P ASTTT TAA T +AA T+A + A A
Sbjct: 113 PTASTTTPTTTTAAPT--------TAATTTAVTTAASTA 143
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.027
Identities = 39/154 (25%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 2/154 (1%)
Frame = +2
Query: 17 PITFSTRTSTHRP--QTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVA 190
P + ST T+T P T +P + + + + A+ AT +
Sbjct: 101 PTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTAASTSAE-TTTATATATS 159
Query: 191 APPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAAS 370
P S ++ A + P +S A A T + A + A TT AA+
Sbjct: 160 TPTTTTPTSTTTTTA-TTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTT-----AATTTAAT 213
Query: 371 TTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRAWA 472
TT A A TTAA T A+ + AAT+ + + A
Sbjct: 214 TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSA 247
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.047
Identities = 34/99 (34%), Positives = 44/99 (44%), Gaps = 4/99 (4%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A A+T A ++ A T + + ATT
Sbjct: 251 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 308
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATA----ASASAAATSACRS 460
T A+TTTA TAATT AAT S S + T A S
Sbjct: 309 T--AATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTS 345
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.080
Identities = 26/92 (28%), Positives = 44/92 (47%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATT 355
ATT AA +A ++ A A+T A ++ A T + + ATT
Sbjct: 266 ATTTAATTTAATTTAATTTA--ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 323
Query: 356 TPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSA 451
T A +T + + + +TT A+T+ +++ ATSA
Sbjct: 324 TAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSA 355
Score = 35.0 bits (79), Expect(2) = 0.005
Identities = 29/100 (29%), Positives = 45/100 (45%), Gaps = 3/100 (3%)
Frame = +2
Query: 176 ATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRAL---TRSEARVSFCRVG 346
+T +A P SA ++ + P T A +SA P + T SEA
Sbjct: 350 STATSATPTSTSTSAAATTSTPTPTSAATSAESTTEAPTSTPTTDTTTPSEATT------ 403
Query: 347 ATTTPAASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSACRSRA 466
ATT+P ++T +A +A TTA T + S +++ S A
Sbjct: 404 ATTSPESTTVSASTTSATTTAFTTESHTSPDSSTGSTSTA 443
Score = 25.8 bits (55), Expect(2) = 0.005
Identities = 16/56 (28%), Positives = 22/56 (38%)
Frame = +3
Query: 12 THRSPSALAPPPTAPKLARPGRCFSPTTMAPTFSCTARQGASASAPQLTGCRSVAP 179
T + + A TA + TT +PT T+ GAS S P + S P
Sbjct: 302 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSATP 357
>sp|P14328|SP96_DICDI Spore coat protein SP96 gi|84145|pir||S07638 spore coat protein
SP96 precursor - slime mold (Dictyostelium discoideum)
gi|295736|emb|CAA34508.1| spore coat protein sp96
[Dictyostelium discoideum]
Length = 600
Score = 51.2 bits (121), Expect = 7e-06
Identities = 43/142 (30%), Positives = 63/142 (44%), Gaps = 1/142 (0%)
Frame = +2
Query: 29 STRTSTHRPQTRSPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRR 208
S+ S + SP S S PS S A P A++ ++P
Sbjct: 447 SSSASGSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSS-----SAASSSPSSSASSSSSPSSSA 501
Query: 209 RAS-APSSWA*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTAL 385
+S APSS A +S P+ S++ + +A A T + ++ T T A+T T
Sbjct: 502 SSSSAPSSSASSSSAPSSSASSSSASSSSASSAATTAATTIATTAATTTATTTATTATTT 561
Query: 386 AATAATTAAATAASASAAATSA 451
A T ATT AAT A+ +AA T+A
Sbjct: 562 ATTTATTTAATIATTTAATTTA 583
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.009
Identities = 42/143 (29%), Positives = 59/143 (40%), Gaps = 6/143 (4%)
Frame = +2
Query: 65 SPRSLLFSDDNGPDVLVYCPSGRLRLCSP----ADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSW 232
S S + S +G PS SP A P A + + +S+PSS
Sbjct: 441 SGSSAVSSSASGSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSASSSSSPSSS 500
Query: 233 A*PASTPAWSSARVWLALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTPAASTTTALAATAATTA- 409
A +S P+ S++ + A + + S A S ATT TTA TA TTA
Sbjct: 501 ASSSSAPSSSAS----SSSAPSSSASSSSASSSSASSAATTAATTIATTAATTTATTTAT 556
Query: 410 -AATAASASAAATSACRSRAWAA 475
A T A+ +A T+A + AA
Sbjct: 557 TATTTATTTATTTAATIATTTAA 579
Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.5
Identities = 32/125 (25%), Positives = 64/125 (50%), Gaps = 3/125 (2%)
Frame = +2
Query: 101 PDVLVYCPSGRLRLCSPADGLPLRRATTVAAPPPRRRASAPSSWA*PASTPAWSSARVWL 280
P + CP+G + + + L R TT A +S + + + A SS+
Sbjct: 394 PCSVAQCPTGYVCVAQNNVAVSLPRPTTTTGSTSDSSALGSTSESSASGSSAVSSSASGS 453
Query: 281 ALPAARRALTRSEARVSFCRVGATTTP---AASTTTALAATAATTAAATAASASAAATSA 451
+ AA + + S A S A+++P AAS++ + +A+++++ +++A+S+SA ++SA
Sbjct: 454 S--AASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSAASSSPSSSASSSSSPSSSASSSSAPSSSA 511
Query: 452 CRSRA 466
S A
Sbjct: 512 SSSSA 516