KCC002352A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC002352A_C01 KCC002352A_c01
aagAGGGAAGGCTTTACAATCCCACGGGGAACGCCCAAGGCAACTTCTGCCCAGGCAAAC
GGCCGACCAGGGTCTTTCGTGCTTCAAGCACCGACCATCCATGAATCCGCGTCCGTCATC
TCTGCCACTGAATCGCTCGTGCATCAACATCCAGCGTCAGCGATAGCCCCGCATCGCACA
GCCTTGCTTTCAAGCTCCTTTCGGGCTGATACGGTACCTTTACGCACCGGCGTGACATCC
TACTCTACCAGCGCAGCAGTATACCCCAATGTTCAGCCCCCCACACGCTGCACCGCCCGC
ATTGCACACGGTATCAGCCAAAAAACAATGGCTTTCACAGCCGCCTCATCTAGTGCTACG
TATGATGTCCGGGTCCATCTACTCTCCTGGCGTGGCCCTTGCCCTTGCAGCTGCAGCGGT
GCCCTGCtctgctgctccggccactagctctctcggccatgcaacctatccgccagtgca
cccacagttcgtcatttgcacacggcg


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC002352A_C01 KCC002352A_c01
         (507 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

gb|AAL67588.1|AC018929_10 putative hydroxyproline-rich glycoprot...    43  0.003
ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24...    38  0.083
gb|AAH16896.1| WASP family 1 [Mus musculus]                            38  0.083
gb|AAL75574.1|AF467773_1 Wave1/Scar [Mus musculus]                     37  0.11
ref|NP_114083.1| WASP family 1 [Mus musculus] gi|9931546|gb|AAG0...    37  0.11

>gb|AAL67588.1|AC018929_10 putative hydroxyproline-rich glycoprotein [Oryza sativa]
           gi|31433674|gb|AAP55158.1| putative hydroxyproline-rich
           glycoprotein [Oryza sativa (japonica cultivar-group)]
          Length = 464

 Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.003
 Identities = 35/136 (25%), Positives = 52/136 (37%), Gaps = 4/136 (2%)
 Frame = +2

Query: 89  HRP----SMNPRPSSLPLNRSCINIQRQR*PRIAQPCFQAPFGLIRYLYAPA*HPTLPAQ 256
           HRP       P+P S+ L       Q+ R P I+ P  + P         P  +  +P  
Sbjct: 252 HRPLPPQHQQPKPPSMRL-------QKIRPPPISTPVARPP---------PVHNHQIPNP 295

Query: 257 QYTPMFSPPHAAPPALHTVSAKKQWLSQPPHLVLRMMSGSIYSPGVALALAAAAVPCSAA 436
            + P F  P    P    +     W   P    +R++  S++S     A AAAA   +AA
Sbjct: 296 NHNPAFHRPPPPQPMPMPMPGPPVWADSPVTAYMRILENSLFSATPPGAAAAAAAAAAAA 355

Query: 437 PATSSLGHATYPPVHP 484
               +  H  +PP  P
Sbjct: 356 TGQQAPPHHPHPPPPP 371

>ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24413110|emb|CAD47188.1|
            Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316]
          Length = 1310

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.083
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 53/110 (47%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 727  TSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSAS 786

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   +    T  +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 787  TSASMSASTSASTSASTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSAS 834

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.083
 Identities = 30/116 (25%), Positives = 54/116 (45%), Gaps = 6/116 (5%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 823  TSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 882

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC------TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T P  +  TS STSA+   +    T        +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 883  TSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 938

 Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.11
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 55/112 (48%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++++   +A +S+S  A 
Sbjct: 739  TSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSAS 798

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T    +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 799  TSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 850

 Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.11
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 54/110 (48%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++++   +A  S+S  A 
Sbjct: 867  TSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 926

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA++  +    T  +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 927  TSASTSASTSASTSASMSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSAS 974

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.18
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 54/110 (48%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T + +    +++I+   +A +S+S  A 
Sbjct: 979  TSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSAS 1038

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS S SA+   +    T  +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1039 TSASTSASTSASMSASTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSAS 1086

 Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.24
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 54/110 (48%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 1043 TSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 1102

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T  +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1103 TSSSTSASTSASTSASTSASMSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSAS 1150

 Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.24
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 53/112 (46%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T +      +++++   +A  S+S  A 
Sbjct: 1007 TSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 1066

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   +    T    +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1067 TSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSAS 1118

 Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.24
 Identities = 30/110 (27%), Positives = 55/110 (49%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T + +    +++ +P  +A  S+S  A 
Sbjct: 839  TSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSAS 898

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA++  +    T  +A ++   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 899  T----SASTSASTSASMSASTSAST--SASMSASTSASTSASTSASTSAS 942

 Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.24
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 54/110 (48%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 703  TSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 762

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA++  ++   T  +A ++   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 763  TSASTSASTSASTSASMSASMSAST--SASMSASTSASTSASTSASTSAS 810

 Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.31
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 54/112 (47%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    S    + +   SAS+ ++T +      +++++   ++  S+S  A 
Sbjct: 1143 TSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSAS 1202

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T    +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1203 TSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSAS 1254

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.41
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 54/112 (47%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 847  TSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSAS 906

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA++  +    T    +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 907  TSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 958

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.41
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 53/110 (47%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T + +    +++++   +A  S+S  A 
Sbjct: 987  TSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSAS 1046

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   +       +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1047 TSASMSASTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSAS 1094

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.41
 Identities = 28/107 (26%), Positives = 52/107 (48%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T + +    +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 1018 STSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA 1077

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS STSA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1078 STSASTSASTSASTSASTSAST--SASTSSSTSASTSASTSASTSAS 1122

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.41
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31  TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
           T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 663 TSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 722

Query: 211 TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
           T    +  TS STSA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 723 TSASTSASTSASTSASTSASTSAST--SASTSASTSASTSASTSASTSAS 770

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.54
 Identities = 36/152 (23%), Positives = 66/152 (42%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T + +    +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 1035 TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSAS 1094

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSATYDVRVHLLSW 390
            T    +  TS STSA+   +    T  +A ++   S  T A  +AS+SA+        S 
Sbjct: 1095 TSASTSASTSSSTSASTSASTSAST--SASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTS-ASM 1151

Query: 391  RGPCPCSCSGALLCCSGH*LSRPCNLSASAPT 486
                  S S ++   +   +S   + S SA T
Sbjct: 1152 SASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSAST 1183

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.54
 Identities = 29/113 (25%), Positives = 53/113 (46%), Gaps = 6/113 (5%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS  ++T S      +++ +   +A +S+S  A T  
Sbjct: 1074 STSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA 1133

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPT------RCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS STSA+   ++   T        +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1134 SMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSAS 1186

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.54
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 52/112 (45%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 903  TSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSAS 962

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   +    T    +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 963  TSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 1014

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.54
 Identities = 28/116 (24%), Positives = 56/116 (48%), Gaps = 6/116 (5%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS+ ++T +      +++++   ++  S+S  A 
Sbjct: 1107 TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSAS 1166

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPT------RCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T        +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1167 TSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSAS 1222

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.54
 Identities = 29/112 (25%), Positives = 53/112 (46%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 935  TSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSAS 994

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T    +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 995  TSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSAS 1046

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.70
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 795  TSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAS 854

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 855  TSTSTSASTSASTSASTSASMSAST--SASTSPSTSASTSASTSASTSAS 902

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.70
 Identities = 27/107 (25%), Positives = 52/107 (48%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 946  STSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSA 1005

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS S SA+   ++   T  +A ++   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1006 STSASTSASMSASTSASISAST--SASMSASTSASTSASTSASTSAS 1050

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.70
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 53/110 (47%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 699  TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 758

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++      +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 759  TSASTSASTSASTSASTSASMS--ASMSASTSASMSASTSASTSASTSAS 806

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.92
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 53/110 (47%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T + +    +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 755  TSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSAS 814

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T  +A  +   S  T A T+ S+SA+
Sbjct: 815  TSASMSASTSASTSASTSASMSAST--SASTSASTSASTSASTSTSTSAS 862

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.92
 Identities = 28/107 (26%), Positives = 51/107 (47%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 822  STSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSA 881

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS STSA+   +    T  +A  +  +S  T A T+AS SA+
Sbjct: 882  STSPSTSASTSASTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASMSAS 926

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.92
 Identities = 36/149 (24%), Positives = 63/149 (42%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 662  STSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSA 721

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSATYDVRVHLLSWRGP 399
              +  TS STSA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+        S    
Sbjct: 722  STSASTSASTSASTSASTSAST--SASTSASTSASTSASTSASTSASTSA-----STSAS 774

Query: 400  CPCSCSGALLCCSGH*LSRPCNLSASAPT 486
               S S ++   +   +S   + S SA T
Sbjct: 775  TSASMSASMSASTSASMSASTSASTSAST 803

 Score = 33.9 bits (76), Expect = 1.2
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 51/110 (45%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++  +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 803  TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSAS 862

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS S SA+   +  P T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 863  TSASTSASTSASMSASTSASTSPST--SASTSASTSASTSASTSASTSAS 910

 Score = 33.9 bits (76), Expect = 1.2
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 763  TSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSAS 822

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS S SA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 823  TSASTSASTSASMSASTSASTSAST--SASTSASTSTSTSASTSASTSAS 870

 Score = 33.9 bits (76), Expect = 1.2
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 51/110 (45%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 731  TSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSAS 790

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
                 +  TS STSA+   +    T  +A ++   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 791  MSASTSASTSASTSASTSASTSAST--SASMSASTSASTSASTSASMSAS 838

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.6
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 50/110 (45%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +   S+S  A 
Sbjct: 807  TSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSAS 866

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STSA+  P+    T  +A  +   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 867  TSASTSASMSASTSASTSPSTSAST--SASTSASTSASTSASTSASMSAS 914

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.6
 Identities = 28/112 (25%), Positives = 53/112 (47%), Gaps = 2/112 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 687  TSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 746

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   +    T    +A ++  +S  T A  +AS+SA+
Sbjct: 747  TSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSAS 798

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.6
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 767  TSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 826

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STSA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 827  TSASTSASMSASTSASTSASTSAST--SASTSTSTSASTSASTSASTSAS 874

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.6
 Identities = 36/154 (23%), Positives = 66/154 (42%), Gaps = 2/154 (1%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 883  TSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAS 942

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC--TARIAHGISQKTMAFTAASSSATYDVRVHLL 384
                 +  TS STSA++  +    T    +A  +   S  T A T+AS+SA+    +   
Sbjct: 943  MSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMS-A 1001

Query: 385  SWRGPCPCSCSGALLCCSGH*LSRPCNLSASAPT 486
            S       S S ++   +   +S   + S SA T
Sbjct: 1002 STSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSAST 1035

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.6
 Identities = 29/110 (26%), Positives = 50/110 (45%)
 Frame = +1

Query: 31  TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
           T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 675 TSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAS 734

Query: 211 TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
           T    +  TS STSA+   +    T  +A  +   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 735 TSASTSASTSASTSASTSASTSAST--SASTSASTSASTSASTSASMSAS 782

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.7
 Identities = 32/110 (29%), Positives = 54/110 (49%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA       S  + A T   SAS+ ++T + +    +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 1003 TSASTSAST-----SASMSAST---SASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSAS 1054

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA++  +    T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1055 TSASTSASTSASTSASMSASTSAST--SASTSASTSASTSASTSASTSAS 1102

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.7
 Identities = 27/110 (24%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T + +    +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 963  TSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSAS 1022

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
                 +   S STSA+   +    T  +A ++   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1023 ISASTSASMSASTSASTSASTSAST--SASMSASTSASTSASTSASTSAS 1070

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.7
 Identities = 27/110 (24%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 1095 TSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSAS 1154

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STSA++  +    T  +A  +  +S  T + T+AS SA+
Sbjct: 1155 TSSSTSASMSASTSASMSASTSAST--SASTSASMSASTSSSTSASMSAS 1202

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 3.5
 Identities = 26/107 (24%), Positives = 51/107 (47%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS  ++T + +    +++ +   +A +S+S  A T  
Sbjct: 786  STSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA 845

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS STS +   +    T  +A  +  +S  T A T+ S+SA+
Sbjct: 846  STSASTSASTSTSTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSPSTSAS 890

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 3.5
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 49/110 (44%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS   +T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 855  TSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSAS 914

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STSA+   +    T  +A ++   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 915  TSASTSASMSASTSASTSASTSAST--SASMSASTSASTSASTSASMSAS 962

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 3.5
 Identities = 27/110 (24%), Positives = 52/110 (46%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A +S+S  A 
Sbjct: 1083 TSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSAS 1142

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STS++   ++   T  +A ++   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 1143 TSASTSASMSASTSSSTSASMSAST--SASMSASTSASTSASTSASMSAS 1190

 Score = 32.0 bits (71), Expect = 4.5
 Identities = 28/113 (24%), Positives = 51/113 (44%), Gaps = 6/113 (5%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS+ ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 1026 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSA 1085

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRC------TARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS STSA+   +    T        +A  +  +S  T A T+AS SA+
Sbjct: 1086 STSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 1138

 Score = 32.0 bits (71), Expect = 4.5
 Identities = 27/107 (25%), Positives = 50/107 (46%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 962  STSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSA 1021

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +  TS S SA+   +    T  +A  +  +S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1022 SISASTSASMSASTSASTSAST--SASTSASMSASTSASTSASTSAS 1066

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 5.9
 Identities = 28/110 (25%), Positives = 53/110 (47%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  + SA  +    +    + +   SAS+ ++T + +    +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 995  TSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSAS 1054

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS STSA+   ++   T  +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 1055 T----SASTSASTSASTSASMSAST--SASTSASTSASTSASTSASTSAS 1098

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 5.9
 Identities = 26/110 (23%), Positives = 50/110 (44%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    + +  + +   SAS  ++  +      +++++   +A +S+S  A 
Sbjct: 1155 TSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSAS 1214

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +   S STSA++       T  +   +   S  T A T++SSS T
Sbjct: 1215 TSASTSASMSASTSASMSATTSAST--SVSTSASTSASTSASTSSSSSVT 1262

 Score = 31.2 bits (69), Expect = 7.7
 Identities = 27/110 (24%), Positives = 50/110 (44%)
 Frame = +1

Query: 31   TPKATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRAD 210
            T  +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A 
Sbjct: 707  TSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 766

Query: 211  TVPLRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
            T    +  TS S SA++  +       +A  +   S  T A T+AS+SA+
Sbjct: 767  TSASTSASTSASMSASM--SASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSAS 814

 Score = 31.2 bits (69), Expect = 7.7
 Identities = 24/112 (21%), Positives = 51/112 (45%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    + +  + +   SAS+ ++T + +    +++ +   +A +S+S  A    
Sbjct: 1174 STSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSA 1233

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSATYDVRV 375
              +  TS STSA+   +    T  ++ +    S K   ++A  S+   D  V
Sbjct: 1234 TTSASTSVSTSASTSASTSASTSSSSSVTSN-SSKEKVYSALPSTGDQDYSV 1284

 Score = 31.2 bits (69), Expect = 7.7
 Identities = 27/107 (25%), Positives = 49/107 (45%)
 Frame = +1

Query: 40   ATSAQANGRPGSFVLQAPTIHESASVISATESLVHQHPASAIAPHRTALLSSSFRADTVP 219
            +TSA  +    +    + +   SAS  ++T +      +++ +   +A  S+S  A T  
Sbjct: 718  STSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSA 777

Query: 220  LRTGVTSYSTSAAVYPNVQPPTRCTARIAHGISQKTMAFTAASSSAT 360
              +   S STSA++  +    T  +A  +   S  T A T+AS SA+
Sbjct: 778  SMSASMSASTSASMSASTSAST--SASTSASTSASTSASTSASMSAS 822

>gb|AAH16896.1| WASP family 1 [Mus musculus]
          Length = 559

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.083
 Identities = 37/111 (33%), Positives = 43/111 (38%), Gaps = 8/111 (7%)
 Frame = +2

Query: 185 CFQAPFGLIRYLYAPA*HPTLPAQQYTPMFSPPHAAPP------ALHTVSAKKQWLSQPP 346
           C  +  GLI         P  PA   TP+F  P + PP      AL T S +    S PP
Sbjct: 296 CISSATGLIEN------RPQSPAAGRTPVFVSPTSPPPPPPLPSALSTSSLRASMTSTPP 349

Query: 347 HLVLRMMSGSIYSPGVALALAAAAVPCSAAPATSSLG--HATYPPVHPQFV 493
             V          P  A AL A AVP   AP   + G  H   PP+ P  V
Sbjct: 350 PPV------PPPPPPPATALQAPAVPPPPAPLQIAPGVLHPAPPPIAPPLV 394

>gb|AAL75574.1|AF467773_1 Wave1/Scar [Mus musculus]
          Length = 559

 Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.11
 Identities = 37/111 (33%), Positives = 42/111 (37%), Gaps = 8/111 (7%)
 Frame = +2

Query: 185 CFQAPFGLIRYLYAPA*HPTLPAQQYTPMF------SPPHAAPPALHTVSAKKQWLSQPP 346
           C  +  GLI         P  PA   TP+F       PP   P AL T S +    S PP
Sbjct: 296 CISSATGLIEN------RPQSPAAGRTPVFVSPTPPPPPPPLPSALSTSSLRASMTSTPP 349

Query: 347 HLVLRMMSGSIYSPGVALALAAAAVPCSAAPATSSLG--HATYPPVHPQFV 493
             V          P  A AL A AVP   AP   + G  H   PP+ P  V
Sbjct: 350 PPV------PPPPPPPATALQAPAVPPPPAPLQIAPGVLHPAPPPIAPPLV 394

>ref|NP_114083.1| WASP family 1 [Mus musculus] gi|9931546|gb|AAG02214.1|AF290877_1
           WAVE-1 [Mus musculus] gi|31419773|gb|AAH53423.1| WASP
           family 1 [Mus musculus]
          Length = 559

 Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.11
 Identities = 37/111 (33%), Positives = 42/111 (37%), Gaps = 8/111 (7%)
 Frame = +2

Query: 185 CFQAPFGLIRYLYAPA*HPTLPAQQYTPMF------SPPHAAPPALHTVSAKKQWLSQPP 346
           C  +  GLI         P  PA   TP+F       PP   P AL T S +    S PP
Sbjct: 296 CISSATGLIEN------RPQSPAAGRTPVFVSPTPPPPPPPLPSALSTSSLRASMTSTPP 349

Query: 347 HLVLRMMSGSIYSPGVALALAAAAVPCSAAPATSSLG--HATYPPVHPQFV 493
             V          P  A AL A AVP   AP   + G  H   PP+ P  V
Sbjct: 350 PPV------PPPPPPPATALQAPAVPPPPAPLQIAPGVLHPAPPPIAPPLV 394



EST assemble image


clone accession position
1 MX205c01_r BP089327 1 302
2 HCL045c03_r AV642082 4 165
3 HCL021a06_r AV640706 5 378
4 LC078c04_r AV624477 92 507




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute