KCC002225A_c02
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Fasta Sequence
>KCC002225A_C02 KCC002225A_c02
caaaactgctccacaggtaCCAGTACCTGATTAAGCCCAGCCGTGAGGCCTGGATCAACT
GCGCCTCGCCCGGCTTTTTCTACGACCTGTGCGGCGACGTGATCCAGCCCTCGGCCGTGG
ACTTCCCCCGCGCCATTAACATCTACGTGGTCGGCGAGCAGCCGCCCACCGACTGGGTTG
GCTACGCCTTCGCGCCCGGCGCCACCGACGACCCTTTCTACGGCCACATGGGCCTGACCT
GGACCACCCTGTCCACGGACGGCGTCAACAACCGTGCCAACTTCGAGTCGGGCGCCTCAG
CCCTGGTGCACGAGACCATGCACCACCTGGGCATGGCGCACACCTTTGCCGACGGCGAGT
GCGTTGACGACGATGCCTCGACCGGTGTCACTGACACGCCCGAGAGCAGCGGCCCTGTGT
GGAGCCAGCCGTGGGCCCAGAAGGCCTACATCGGCTGCATGAACGCCTGGAACAAGGTGC
TGACATCCAACTGGGACACCGCCAACCGCCAGGCCTCCCTGCGCGTGGGCATTCCCACCA
CCGACGTGAACCCCGCATTCGACTCGTGCCCAAGCGGCAGTGGCTCTGATGAGACCGCCA
ACTATATCACCTACACCTACGACATCTGCCTGCTGGCCATGGGCCACCTGACCTCGGGCC
AGATCACTGCGATGCACCAGATCACCGCCGACAACAACCCCACGCTGTACGCCTGGGGCC
AGTACTACGCTCAGAACCCGCCCGCCGGCTACACGCCACCGGTCG


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC002225A_C02 KCC002225A_c02
         (765 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

gb|AAK60544.1|AF382191_1 hydroxyproline rich glycoprotein Vsp6 [...   527  e-149
gb|AAK83527.1| hydroxyproline-rich glycoprotein VSP4 [Chlamydomo...   473  e-132
gb|AAA59163.1| mucin                                                   96  5e-19
gb|AAA59875.1| mucin                                                   96  5e-19
pir||A43932 mucin 2 precursor, intestinal - human (fragments)          96  5e-19

>gb|AAK60544.1|AF382191_1 hydroxyproline rich glycoprotein Vsp6 [Chlamydomonas reinhardtii]
          Length = 955

 Score =  527 bits (1357), Expect = e-149
 Identities = 244/249 (97%), Positives = 245/249 (97%)
 Frame = +3

Query: 18   YQYLIKPSREAWINCASPGFFYDLCGDVIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP 197
            YQYLIKPSR+ WINCASPGFFYDLCGDVIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP
Sbjct: 429  YQYLIKPSRDRWINCASPGFFYDLCGDVIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP 488

Query: 198  GATDDPFYGHMGLTWTTLSTDGVNNRANFESGASALVHETMHHLGMAHTFADGECVDDDA 377
            G TDDPFYGHMGLTWTTLSTDGVNNRANFESGASALVHETMHHLGMAHTFA GECVDDDA
Sbjct: 489  GRTDDPFYGHMGLTWTTLSTDGVNNRANFESGASALVHETMHHLGMAHTFAVGECVDDDA 548

Query: 378  STGVTDTPESSGPVWSQPWAQKAYIGCMNAWNKVLTSNWDTANRQASLRVGIPTTDVNPA 557
            STGVTDTPESSGPVWSQPWAQKAYIGCMNAWNKVLTSNWDTANRQASLRVGIPTTDVNPA
Sbjct: 549  STGVTDTPESSGPVWSQPWAQKAYIGCMNAWNKVLTSNWDTANRQASLRVGIPTTDVNPA 608

Query: 558  FDSCPSGSGSDETANYITYTYDICLLAMGHLTSGQITAMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN 737
            FDSCPSGSGSDETANYITYTYDIC LAMGHLTSGQITAMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN
Sbjct: 609  FDSCPSGSGSDETANYITYTYDICQLAMGHLTSGQITAMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN 668

Query: 738  PPAGYTPPV 764
            PPAGYTPPV
Sbjct: 669  PPAGYTPPV 677

>gb|AAK83527.1| hydroxyproline-rich glycoprotein VSP4 [Chlamydomonas reinhardtii]
          Length = 991

 Score =  473 bits (1217), Expect = e-132
 Identities = 214/249 (85%), Positives = 231/249 (91%)
 Frame = +3

Query: 18   YQYLIKPSREAWINCASPGFFYDLCGDVIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP 197
            +QY IKPSR+AWINCASPGFFYDLCG+VIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP
Sbjct: 447  FQYSIKPSRDAWINCASPGFFYDLCGEVIQPSAVDFPRAINIYVVGEQPPTDWVGYAFAP 506

Query: 198  GATDDPFYGHMGLTWTTLSTDGVNNRANFESGASALVHETMHHLGMAHTFADGECVDDDA 377
            G TDDPFYGHMGLTWTT STDGVNNRA++ESGASALVHETMHHLGM HTF+DG C DDDA
Sbjct: 507  GRTDDPFYGHMGLTWTTFSTDGVNNRASYESGASALVHETMHHLGMMHTFSDGTCGDDDA 566

Query: 378  STGVTDTPESSGPVWSQPWAQKAYIGCMNAWNKVLTSNWDTANRQASLRVGIPTTDVNPA 557
             + V+DTP ++GPVWSQPWAQKAYI CMNAW+K L++NWDTANRQASLRVGIP  D N A
Sbjct: 567  PS-VSDTPSTNGPVWSQPWAQKAYIACMNAWSKSLSANWDTANRQASLRVGIPANDANSA 625

Query: 558  FDSCPSGSGSDETANYITYTYDICLLAMGHLTSGQITAMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN 737
            FDSCPS +G+DETANYITYTYDICLL +GHLTSGQ+ AMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN
Sbjct: 626  FDSCPSSAGADETANYITYTYDICLLVLGHLTSGQVVAMHQITADNNPTLYAWGQYYAQN 685

Query: 738  PPAGYTPPV 764
            PPAGYTPPV
Sbjct: 686  PPAGYTPPV 694

>gb|AAA59163.1| mucin
          Length = 1270

 Score = 96.3 bits (238), Expect = 5e-19
 Identities = 89/254 (35%), Positives = 113/254 (44%), Gaps = 6/254 (2%)
 Frame = +1

Query: 10   STGTST*LSPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP 189
            S  T+T  +P   P +T P P  +TT     ++P P T+P+P  ST   ++ PPT     
Sbjct: 798  SPPTTTTTTP---PPTTTPSPPITTT-----TTPLPTTTPSPPIST--TTTPPPT----- 842

Query: 190  SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALT 369
            + P+PPTT  +     P PP   T +TT P  +  P P  T P T  A  T LP     T
Sbjct: 843  TTPSPPTTTPSPPTTTPSPP---TTTTTTPPPTTTPSPPMTTPITPPASTTTLPP----T 895

Query: 370  TMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT---ARPPCAWAFPP 540
            T P P + T          +  P  PT+   TP T     T  PPT   + PP     PP
Sbjct: 896  TTPSPPTTTTTTPP----PTTTPSPPTTTPITPPT---STTTLPPTTTPSPPPTTTTTPP 948

Query: 541  PT*TPHSTRAQAAVALMRPPTI---SPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCT 711
            PT TP    +        PPTI   +P PTT+   P  T         T SPPTTTP   
Sbjct: 949  PTTTP----SPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT-TTTPPPTTTPSPPTTTPITP 1003

Query: 712  PGASTTLRTRPPAT 753
            P ++TTL   PP T
Sbjct: 1004 PTSTTTL---PPTT 1014

 Score = 92.0 bits (227), Expect = 9e-18
 Identities = 80/257 (31%), Positives = 97/257 (37%), Gaps = 24/257 (9%)
 Frame = +1

Query: 55   STAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPAPPTTL------ 216
            +T P P  STT     ++P P T+P+P T+T S  +  P+   T +   PPTT       
Sbjct: 826  TTTPSPPISTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPSPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPMT 880

Query: 217  -------STATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTM 375
                   ST T      P P T +TT P  +  P P  T P T     T LP  +  +  
Sbjct: 881  TPITPPASTTTLPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPP 940

Query: 376  PRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*T-PGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPP---P 543
            P   +   P        +  P  PT    T P T    P  T  T  PP     PP   P
Sbjct: 941  PTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTP 1000

Query: 544  T*TPHSTRAQAAVALMRPP---TISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTP---- 702
               P ST          PP   T +P PTT+   P  T P       T  PPTTTP    
Sbjct: 1001 ITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPI 1060

Query: 703  RCTPGASTTLRTRPPAT 753
              TP   TT  T P  T
Sbjct: 1061 TTTPSPPTTTMTTPSPT 1077

 Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-16
 Identities = 84/262 (32%), Positives = 108/262 (41%), Gaps = 22/262 (8%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTST-----WSASSRPPTGLATP--- 189
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T      S ++ PPT   +P   
Sbjct: 888  STTTLPPTTTPSPPTTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPT 942

Query: 190  --SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASA 363
              + P P TT S  T   P PP   T +TT P  +  P P    P TT     P  T S 
Sbjct: 943  TTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPP---TITTTTPPPTTTPSP----PTTTTTTPPPTTTPSP 995

Query: 364  LTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPC----AWA 531
             TT P    +T P +      +  P  P +   TP       T +PPT   P        
Sbjct: 996  PTTTP----ITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTT---TPSPPTTTTPSPPITTTT 1048

Query: 532  FPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPPTIS---PTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTT-- 696
             PPPT TP S           PPT +   P+PTT+   P  T     S      PPTT  
Sbjct: 1049 TPPPTTTPSSP----ITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMT 1104

Query: 697  --TPRCTPG-ASTTLRTRPPAT 753
              +P  TP   +TT+ T PP T
Sbjct: 1105 TPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTT 1126

 Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-12
 Identities = 71/233 (30%), Positives = 100/233 (42%), Gaps = 11/233 (4%)
 Frame = +1

Query: 49   PGSTAPRPAFSTTCAA---T*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPA-----P 204
            P +T P P  +TT +    T ++P P T+P+P T+T   ++ PPT   TPS P      P
Sbjct: 948  PPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT--TTTPPPT--TTPSPPTTTPITP 1003

Query: 205  PTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPT---ASALTTM 375
            PT+ +T        P P T +T  PT++ +P    T         TP PT   +S +TT 
Sbjct: 1004 PTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTT 1063

Query: 376  PRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TP 555
            P P + T    +           PT+   +P T    P+ T   + PP     P PT TP
Sbjct: 1064 PSPPTTTMTTPS-----------PTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTP 1112

Query: 556  HSTRAQAAVALMRPPTISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCTP 714
                         PPT + +P T+   P +  P   S   T +P  TTP C P
Sbjct: 1113 SPPTTTMTTL---PPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTTP--TTP-CVP 1159

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
 Identities = 79/254 (31%), Positives = 99/254 (38%), Gaps = 17/254 (6%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP----SRPA 201
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T   +  PPT   T     + P+
Sbjct: 927  STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTT---TPSPPTITTTTPPPTTTPS 978

Query: 202  PPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPR 381
            PPTT +T       P  P T   T PTS+    P  T         TP P     TT P 
Sbjct: 979  PPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPP-----TTTPS 1033

Query: 382  PVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TPHS 561
            P + T P           P   T+    P T    P  T P+  P      P PT TP S
Sbjct: 1034 PPTTTTP----------SPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSP-PTTTMTTPSPTTTPSS 1082

Query: 562  -----TRAQAAVALMRPPT--ISPTPTTSACWPWAT----*PRARS--LRCTRSPPTTTP 702
                 T   +      PPT   +P+PTT+   P  T     P   S  L  T  PP+ TP
Sbjct: 1083 PITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITP 1142

Query: 703  RCTPGASTTLRTRP 744
                  STT  T P
Sbjct: 1143 PTFSPFSTTTPTTP 1156

 Score = 60.5 bits (145), Expect = 3e-08
 Identities = 56/177 (31%), Positives = 76/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTW------SASSRPPTGLATPSR 195
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T       + ++ PPT   TPS 
Sbjct: 1006 STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPT--TTPSS 1058

Query: 196  P-----APPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTAS 360
            P     +PPTT  T       P  P T +TT P+S+  P P  T   T     TP P  +
Sbjct: 1059 PITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPIT-TTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTT 1117

Query: 361  ALTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT-ARPPCAW 528
             +TT+P P + + P              P   + TP T     T TP T   P C W
Sbjct: 1118 TMTTLP-PTTTSSPLTTT----------PLPPSITPPTFSPFSTTTPTTPCVPLCNW 1163

 Score = 45.8 bits (107), Expect = 7e-04
 Identities = 43/125 (34%), Positives = 58/125 (46%), Gaps = 21/125 (16%)
 Frame = +1

Query: 10   STGTST*LSPAVR-----PGSTAPRPAFSTTCA---AT*SSPRPWTSPA-PLTSTWSASS 162
            S  T+T  SP +      P +T P    +TT +    T ++P P T+P+ P+T+T + SS
Sbjct: 1033 SPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSS 1092

Query: 163  R-----PPTGLATPS---RPAPPTTLST----ATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPW 306
                  PPT + TPS    P+PPTT  T     T + P    P   S T PT S      
Sbjct: 1093 TTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTT 1152

Query: 307  CTRPC 321
             T PC
Sbjct: 1153 PTTPC 1157

>gb|AAA59875.1| mucin
          Length = 573

 Score = 96.3 bits (238), Expect = 5e-19
 Identities = 89/254 (35%), Positives = 113/254 (44%), Gaps = 6/254 (2%)
 Frame = +1

Query: 10  STGTST*LSPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP 189
           S  T+T  +P   P +T P P  +TT     ++P P T+P+P  ST   ++ PPT     
Sbjct: 81  SPPTTTTTTP---PPTTTPSPPITTT-----TTPPPTTTPSPPIST--TTTPPPT----- 125

Query: 190 SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALT 369
           + P+PPTT  +     P PP   T +TT P  +  P P  T P T  A  T LP     T
Sbjct: 126 TTPSPPTTTPSPPTTTPSPP---TTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPASTTTLPP----T 178

Query: 370 TMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT---ARPPCAWAFPP 540
           T P P + T          +  P  PT+   TP T     T  PPT   + PP     PP
Sbjct: 179 TTPSPPTTTTTTPP----PTTTPSPPTTTPITPPT---STTTLPPTTTPSPPPTTTTTPP 231

Query: 541 PT*TPHSTRAQAAVALMRPPTI---SPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCT 711
           PT TP    +        PPTI   +P PTT+   P  T         T SPPTTTP   
Sbjct: 232 PTTTP----SPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT-TTTPPPTTTPSPPTTTPITP 286

Query: 712 PGASTTLRTRPPAT 753
           P ++TTL   PP T
Sbjct: 287 PTSTTTL---PPTT 297

 Score = 95.9 bits (237), Expect = 6e-19
 Identities = 85/259 (32%), Positives = 101/259 (38%), Gaps = 24/259 (9%)
 Frame = +1

Query: 49  PGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWS----ASSRPPTGLATP---SRPAPP 207
           P +T P P  STT     ++P P T+P+P T+T S      S P T   TP   + P+PP
Sbjct: 107 PPTTTPSPPISTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPSPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPP 161

Query: 208 TTL------STATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALT 369
           TT       ST T      P P T +TT P  +  P P  T P T     T LP  +  +
Sbjct: 162 TTTPITPPASTTTLPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPS 221

Query: 370 TMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*T-PGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPP-- 540
             P   +   P        +  P  PT    T P T    P  T  T  PP     PP  
Sbjct: 222 PPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTT 281

Query: 541 -PT*TPHSTRAQAAVALMRPP---TISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTP-- 702
            P   P ST          PP   T +P PTT+   P  T P       T  PPTTTP  
Sbjct: 282 TPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSS 341

Query: 703 --RCTPGASTTLRTRPPAT 753
               TP   TT  T P  T
Sbjct: 342 PITTTPSPPTTTMTTPSPT 360

 Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-16
 Identities = 84/262 (32%), Positives = 108/262 (41%), Gaps = 22/262 (8%)
 Frame = +1

Query: 34  SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTST-----WSASSRPPTGLATP--- 189
           S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T      S ++ PPT   +P   
Sbjct: 171 STTTLPPTTTPSPPTTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPT 225

Query: 190 --SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASA 363
             + P P TT S  T   P PP   T +TT P  +  P P    P TT     P  T S 
Sbjct: 226 TTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPP---TITTTTPPPTTTPSP----PTTTTTTPPPTTTPSP 278

Query: 364 LTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPC----AWA 531
            TT P    +T P +      +  P  P +   TP       T +PPT   P        
Sbjct: 279 PTTTP----ITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTT---TPSPPTTTTPSPPITTTT 331

Query: 532 FPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPPTIS---PTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTT-- 696
            PPPT TP S           PPT +   P+PTT+   P  T     S      PPTT  
Sbjct: 332 TPPPTTTPSSP----ITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMT 387

Query: 697 --TPRCTPG-ASTTLRTRPPAT 753
             +P  TP   +TT+ T PP T
Sbjct: 388 TPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTT 409

 Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-12
 Identities = 71/233 (30%), Positives = 100/233 (42%), Gaps = 11/233 (4%)
 Frame = +1

Query: 49  PGSTAPRPAFSTTCAA---T*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPA-----P 204
           P +T P P  +TT +    T ++P P T+P+P T+T   ++ PPT   TPS P      P
Sbjct: 231 PPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT--TTTPPPT--TTPSPPTTTPITP 286

Query: 205 PTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPT---ASALTTM 375
           PT+ +T        P P T +T  PT++ +P    T         TP PT   +S +TT 
Sbjct: 287 PTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTT 346

Query: 376 PRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TP 555
           P P + T    +           PT+   +P T    P+ T   + PP     P PT TP
Sbjct: 347 PSPPTTTMTTPS-----------PTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTP 395

Query: 556 HSTRAQAAVALMRPPTISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCTP 714
                        PPT + +P T+   P +  P   S   T +P  TTP C P
Sbjct: 396 SPPTTTMTTL---PPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTTP--TTP-CVP 442

 Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-12
 Identities = 72/215 (33%), Positives = 89/215 (40%), Gaps = 4/215 (1%)
 Frame = +1

Query: 121 TSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPAPPTTLSTATWA*PGP---PCPRTASTTVPTSSR 291
           T+P+P T+T S      T L   + P+PPTT +T     P P   P P   +TT P  + 
Sbjct: 55  TTPSPPTTTPSPPPTSTTTLPPTTTPSPPTTTTTT----PPPTTTPSPPITTTTTPPPTT 110

Query: 292 APQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPG 471
            P P    P +T     P  T S  TT P P + T             P  PT+   TP 
Sbjct: 111 TPSP----PISTTTTPPPTTTPSPPTTTPSPPTTT-------------PSPPTTTTTTP- 152

Query: 472 TRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPPTISPT-PTTSACWPWAT 648
                    PPT  P      PP T TP +  A        PPT +P+ PTT+   P  T
Sbjct: 153 ---------PPTTTP-----SPPTT-TPITPPASTTTL---PPTTTPSPPTTTTTTPPPT 194

Query: 649 *PRARSLRCTRSPPTTTPRCTPGASTTLRTRPPAT 753
                    T SPPTTTP   P ++TTL   PP T
Sbjct: 195 --------TTPSPPTTTPITPPTSTTTL---PPTT 218

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
 Identities = 79/254 (31%), Positives = 99/254 (38%), Gaps = 17/254 (6%)
 Frame = +1

Query: 34  SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP----SRPA 201
           S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T   +  PPT   T     + P+
Sbjct: 210 STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTT---TPSPPTITTTTPPPTTTPS 261

Query: 202 PPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPR 381
           PPTT +T       P  P T   T PTS+    P  T         TP P     TT P 
Sbjct: 262 PPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPP-----TTTPS 316

Query: 382 PVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TPHS 561
           P + T P           P   T+    P T    P  T P+  P      P PT TP S
Sbjct: 317 PPTTTTP----------SPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSP-PTTTMTTPSPTTTPSS 365

Query: 562 -----TRAQAAVALMRPPT--ISPTPTTSACWPWAT----*PRARS--LRCTRSPPTTTP 702
                T   +      PPT   +P+PTT+   P  T     P   S  L  T  PP+ TP
Sbjct: 366 PITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITP 425

Query: 703 RCTPGASTTLRTRP 744
                 STT  T P
Sbjct: 426 PTFSPFSTTTPTTP 439

 Score = 60.5 bits (145), Expect = 3e-08
 Identities = 56/177 (31%), Positives = 76/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
 Frame = +1

Query: 34  SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTW------SASSRPPTGLATPSR 195
           S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T       + ++ PPT   TPS 
Sbjct: 289 STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPT--TTPSS 341

Query: 196 P-----APPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTAS 360
           P     +PPTT  T       P  P T +TT P+S+  P P  T   T     TP P  +
Sbjct: 342 PITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPIT-TTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTT 400

Query: 361 ALTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT-ARPPCAW 528
            +TT+P P + + P              P   + TP T     T TP T   P C W
Sbjct: 401 TMTTLP-PTTTSSPLTTT----------PLPPSITPPTFSPFSTTTPTTPCVPLCNW 446

 Score = 45.8 bits (107), Expect = 7e-04
 Identities = 43/125 (34%), Positives = 58/125 (46%), Gaps = 21/125 (16%)
 Frame = +1

Query: 10  STGTST*LSPAVR-----PGSTAPRPAFSTTCA---AT*SSPRPWTSPA-PLTSTWSASS 162
           S  T+T  SP +      P +T P    +TT +    T ++P P T+P+ P+T+T + SS
Sbjct: 316 SPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSS 375

Query: 163 R-----PPTGLATPS---RPAPPTTLST----ATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPW 306
                 PPT + TPS    P+PPTT  T     T + P    P   S T PT S      
Sbjct: 376 TTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTT 435

Query: 307 CTRPC 321
            T PC
Sbjct: 436 PTTPC 440

>pir||A43932 mucin 2 precursor, intestinal - human (fragments)
          Length = 3020

 Score = 96.3 bits (238), Expect = 5e-19
 Identities = 89/254 (35%), Positives = 113/254 (44%), Gaps = 6/254 (2%)
 Frame = +1

Query: 10   STGTST*LSPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP 189
            S  T+T  +P   P +T P P  +TT     ++P P T+P+P  ST   ++ PPT     
Sbjct: 1423 SPPTTTTTTP---PPTTTPSPPITTT-----TTPLPTTTPSPPIST--TTTPPPT----- 1467

Query: 190  SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALT 369
            + P+PPTT  +     P PP   T +TT P  +  P P  T P T  A  T LP     T
Sbjct: 1468 TTPSPPTTTPSPPTTTPSPP---TTTTTTPPPTTTPSPPMTTPITPPASTTTLPP----T 1520

Query: 370  TMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT---ARPPCAWAFPP 540
            T P P + T          +  P  PT+   TP T     T  PPT   + PP     PP
Sbjct: 1521 TTPSPPTTTTTTPP----PTTTPSPPTTTPITPPT---STTTLPPTTTPSPPPTTTTTPP 1573

Query: 541  PT*TPHSTRAQAAVALMRPPTI---SPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCT 711
            PT TP    +        PPTI   +P PTT+   P  T         T SPPTTTP   
Sbjct: 1574 PTTTP----SPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT-TTTPPPTTTPSPPTTTPITP 1628

Query: 712  PGASTTLRTRPPAT 753
            P ++TTL   PP T
Sbjct: 1629 PTSTTTL---PPTT 1639

 Score = 92.0 bits (227), Expect = 9e-18
 Identities = 80/257 (31%), Positives = 97/257 (37%), Gaps = 24/257 (9%)
 Frame = +1

Query: 55   STAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPAPPTTL------ 216
            +T P P  STT     ++P P T+P+P T+T S  +  P+   T +   PPTT       
Sbjct: 1451 TTTPSPPISTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPSPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPMT 1505

Query: 217  -------STATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTM 375
                   ST T      P P T +TT P  +  P P  T P T     T LP  +  +  
Sbjct: 1506 TPITPPASTTTLPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPP 1565

Query: 376  PRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*T-PGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPP---P 543
            P   +   P        +  P  PT    T P T    P  T  T  PP     PP   P
Sbjct: 1566 PTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTP 1625

Query: 544  T*TPHSTRAQAAVALMRPP---TISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTP---- 702
               P ST          PP   T +P PTT+   P  T P       T  PPTTTP    
Sbjct: 1626 ITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPI 1685

Query: 703  RCTPGASTTLRTRPPAT 753
              TP   TT  T P  T
Sbjct: 1686 TTTPSPPTTTMTTPSPT 1702

 Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-16
 Identities = 84/262 (32%), Positives = 108/262 (41%), Gaps = 22/262 (8%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTST-----WSASSRPPTGLATP--- 189
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T      S ++ PPT   +P   
Sbjct: 1513 STTTLPPTTTPSPPTTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPT 1567

Query: 190  --SRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASA 363
              + P P TT S  T   P PP   T +TT P  +  P P    P TT     P  T S 
Sbjct: 1568 TTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPP---TITTTTPPPTTTPSP----PTTTTTTPPPTTTPSP 1620

Query: 364  LTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPC----AWA 531
             TT P    +T P +      +  P  P +   TP       T +PPT   P        
Sbjct: 1621 PTTTP----ITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTT---TPSPPTTTTPSPPITTTT 1673

Query: 532  FPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPPTIS---PTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTT-- 696
             PPPT TP S           PPT +   P+PTT+   P  T     S      PPTT  
Sbjct: 1674 TPPPTTTPSSP----ITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMT 1729

Query: 697  --TPRCTPG-ASTTLRTRPPAT 753
              +P  TP   +TT+ T PP T
Sbjct: 1730 TPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTT 1751

 Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-12
 Identities = 71/233 (30%), Positives = 100/233 (42%), Gaps = 11/233 (4%)
 Frame = +1

Query: 49   PGSTAPRPAFSTTCAA---T*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPSRPA-----P 204
            P +T P P  +TT +    T ++P P T+P+P T+T   ++ PPT   TPS P      P
Sbjct: 1573 PPTTTPSPPTTTTPSPPTITTTTPPPTTTPSPPTTT--TTTPPPT--TTPSPPTTTPITP 1628

Query: 205  PTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPT---ASALTTM 375
            PT+ +T        P P T +T  PT++ +P    T         TP PT   +S +TT 
Sbjct: 1629 PTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTT 1688

Query: 376  PRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TP 555
            P P + T    +           PT+   +P T    P+ T   + PP     P PT TP
Sbjct: 1689 PSPPTTTMTTPS-----------PTTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTP 1737

Query: 556  HSTRAQAAVALMRPPTISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCTP 714
                         PPT + +P T+   P +  P   S   T +P  TTP C P
Sbjct: 1738 SPPTTTMTTL---PPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTTP--TTP-CVP 1784

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 1e-11
 Identities = 79/254 (31%), Positives = 99/254 (38%), Gaps = 17/254 (6%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATP----SRPA 201
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T   +  PPT   T     + P+
Sbjct: 1552 STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTT---TPSPPTITTTTPPPTTTPS 1603

Query: 202  PPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPR 381
            PPTT +T       P  P T   T PTS+    P  T         TP P     TT P 
Sbjct: 1604 PPTTTTTTPPPTTTPSPPTTTPITPPTSTTTLPPTTTPSPPPTTTTTPPP-----TTTPS 1658

Query: 382  PVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*TPHS 561
            P + T P           P   T+    P T    P  T P+  P      P PT TP S
Sbjct: 1659 PPTTTTP----------SPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSP-PTTTMTTPSPTTTPSS 1707

Query: 562  -----TRAQAAVALMRPPT--ISPTPTTSACWPWAT----*PRARS--LRCTRSPPTTTP 702
                 T   +      PPT   +P+PTT+   P  T     P   S  L  T  PP+ TP
Sbjct: 1708 PITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITP 1767

Query: 703  RCTPGASTTLRTRP 744
                  STT  T P
Sbjct: 1768 PTFSPFSTTTPTTP 1781

 Score = 62.8 bits (151), Expect = 6e-09
 Identities = 66/242 (27%), Positives = 92/242 (37%), Gaps = 21/242 (8%)
 Frame = +1

Query: 64   PRPAFSTTCAAT*SSPRPWTS----------PAPLTSTWSASSRP-PTGLATPSR-PAPP 207
            P P   TT      +P P ++          P P+++T + +  P PTG  TP+  P   
Sbjct: 1893 PTPTPITTTTTVTPTPTPTSTQSPNGLQAPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITT 1952

Query: 208  TTLSTATWA*PGPPCPRTAS-TTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPRP 384
            TT  T T    G   P T   TT  T +  P P  T+  T     TP+ T + +T  P P
Sbjct: 1953 TTTVTPTPTPTGTQTPTTVLITTTTTMTPTPTPTSTKSTTV----TPITTTTTVTATPTP 2008

Query: 385  VSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPP-T*TPHS 561
                 P    +   +     PT    + G     PT T          + PPP + TP +
Sbjct: 2009 TGTQTPTMIPISTTTTVTPTPTPTTGSTGP----PTHTSTAPIAELTTSNPPPESSTPQT 2064

Query: 562  TRAQAA-------VALMRPPTISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRSPPTTTPRCTPGA 720
            +R+ ++       +    PP I  T T     P A  P   S   T SPP +T    PG 
Sbjct: 2065 SRSTSSPLTESTTLLSTLPPAIEMTSTAPPSTPTA--PTTTSGGHTLSPPPSTTTSPPGT 2122

Query: 721  ST 726
             T
Sbjct: 2123 PT 2124

 Score = 60.5 bits (145), Expect = 3e-08
 Identities = 56/177 (31%), Positives = 76/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
 Frame = +1

Query: 34   SPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTW------SASSRPPTGLATPSR 195
            S    P +T P P  +TT     ++P P T+P+P T+T       + ++ PPT   TPS 
Sbjct: 1631 STTTLPPTTTPSPPPTTT-----TTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPT--TTPSS 1683

Query: 196  P-----APPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTAS 360
            P     +PPTT  T       P  P T +TT P+S+  P P  T   T     TP P  +
Sbjct: 1684 PITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPIT-TTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTT 1742

Query: 361  ALTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPT-ARPPCAW 528
             +TT+P P + + P              P   + TP T     T TP T   P C W
Sbjct: 1743 TMTTLP-PTTTSSPLTTT----------PLPPSITPPTFSPFSTTTPTTPCVPLCNW 1788

 Score = 59.3 bits (142), Expect = 6e-08
 Identities = 71/260 (27%), Positives = 101/260 (38%), Gaps = 18/260 (6%)
 Frame = +1

Query: 19   TST*LSPAVRP-GSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPW----TSPAPLTSTWSASSRP-PTGL 180
            T+T ++P   P G+  P     TT      +P P     T+  P+T+T + ++ P PTG 
Sbjct: 1952 TTTTVTPTPTPTGTQTPTTVLITTTTTMTPTPTPTSTKSTTVTPITTTTTVTATPTPTGT 2011

Query: 181  ATPSR-PAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRA----------PQPWCTRPCTT 327
             TP+  P   TT  T T      P P T ST  PT +            P P  + P T+
Sbjct: 2012 QTPTMIPISTTTTVTPT------PTPTTGSTGPPTHTSTAPIAELTTSNPPPESSTPQTS 2065

Query: 328  WAWRTPLPTASAL-TTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPP 504
             +  +PL  ++ L +T+P  + +T         ++  P  PT+   T G     P     
Sbjct: 2066 RSTSSPLTESTTLLSTLPPAIEMT---------STAPPSTPTAPTTTSGGHTLSP----- 2111

Query: 505  TARPPCAWAFPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPPTISPTPTTSACWPWAT*PRARSLRCTRS 684
               PP     PP T T  +T   ++      P+   T TTSA   W              
Sbjct: 2112 ---PPSTTTSPPGTPTRGTTTGSSSAPT---PSTVQTTTTSA---WT------------- 2149

Query: 685  PPTTTPRCTPGASTTLRTRP 744
             PT TP  TP    T   RP
Sbjct: 2150 -PTPTPLSTPSIIRTTGLRP 2168

 Score = 58.9 bits (141), Expect = 8e-08
 Identities = 70/249 (28%), Positives = 95/249 (38%), Gaps = 17/249 (6%)
 Frame = +1

Query: 67   RPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWS-ASSRPPTGLATPSRPAPPTTLSTATWA*PG 243
            +P   TT      +P P T+   +T T +  S++ P GL  P+ P P +T +T T   P 
Sbjct: 1881 QPTTMTTTTTENPTPTPITTTTTVTPTPTPTSTQSPNGLQAPT-PTPISTTTTVTPT-PT 1938

Query: 244  PPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTTMPRPVSLTRPRAAALCG 423
            P   +T +TT  T++    P  T   T       + T + +T  P P S        +  
Sbjct: 1939 PTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTVLITTTTTMTPTPTPTSTKSTTVTPITT 1998

Query: 424  ASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARP-PCAWAFPPPT*TPHSTRAQAAVALMRPP 600
             +     PT       T     T T  T  P P   +  PPT T  ST   A +    PP
Sbjct: 1999 TTTVTATPTPTGTQTPTMIPISTTTTVTPTPTPTTGSTGPPTHT--STAPIAELTTSNPP 2056

Query: 601  TISPTPTTS---------ACWPWAT*PRARSLRCTRSPPT-TTPRCTPGAST-----TLR 735
              S TP TS         +    +T P A  +  T  P T T P  T G  T     +  
Sbjct: 2057 PESSTPQTSRSTSSPLTESTTLLSTLPPAIEMTSTAPPSTPTAPTTTSGGHTLSPPPSTT 2116

Query: 736  TRPPATRHR 762
            T PP T  R
Sbjct: 2117 TSPPGTPTR 2125

 Score = 46.2 bits (108), Expect = 6e-04
 Identities = 84/303 (27%), Positives = 111/303 (35%), Gaps = 57/303 (18%)
 Frame = +1

Query: 10   STGTST*LSPAVR-----PGSTAPRPAFSTTCA---AT*SSPRPWTSPA-PLTSTWSASS 162
            S  T+T  SP +      P +T P    +TT +    T ++P P T+P+ P+T+T + SS
Sbjct: 1658 SPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSPPTTTMTTPSPTTTPSSPITTTTTPSS 1717

Query: 163  R-----PPTGLATPS---RPAPPTTLST----ATWA*PGPPCPRTASTTVPT----SSRA 294
                  PPT + TPS    P+PPTT  T     T + P    P   S T PT    S+  
Sbjct: 1718 TTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPLPPSITPPTFSPFSTTT 1777

Query: 295  PQPWCTRPCTTWAW----RTPLPTASALTTMPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTS--- 453
            P   C   C    W    +         T +   V      A   C A+  P  P     
Sbjct: 1778 PTTPCVPLCNWTGWLDSGKPNFHKPGGDTELIGDVCGPGWAANISCRATMYPDVPIGQLG 1837

Query: 454  ----AA*TPGTRC*H----PTGTPPTA--------RPPCAWAFPPPT*TPHSTRAQAAVA 585
                   + G  C +    P G  P A           C     P T T  +T       
Sbjct: 1838 QTVVCDVSVGLICKNEDQKPGGVIPMAFCLNYEINVQCCECVTQPTTMTTTTTENPTPTP 1897

Query: 586  LMRPPTISPTPT-TSACWP---WAT*PRARSLRCTRSPP-----TTTPRCTPGASTTLRT 738
            +    T++PTPT TS   P    A  P   S   T +P      T TP  TP  +TT  T
Sbjct: 1898 ITTTTTVTPTPTPTSTQSPNGLQAPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVT 1957

Query: 739  RPP 747
              P
Sbjct: 1958 PTP 1960

 Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.041
 Identities = 35/100 (35%), Positives = 44/100 (44%), Gaps = 2/100 (2%)
 Frame = +1

Query: 10   STGTST*LSPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLAT- 186
            ST   + L PA+   STAP    ST  A T +S     SP P T+T S    P  G  T 
Sbjct: 2075 STTLLSTLPPAIEMTSTAPP---STPTAPTTTSGGHTLSPPPSTTT-SPPGTPTRGTTTG 2130

Query: 187  -PSRPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQP 303
              S P P T  +T T A    P P +  + + T+   P P
Sbjct: 2131 SSSAPTPSTVQTTTTSAWTPTPTPLSTPSIIRTTGLRPYP 2170

 Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.15
 Identities = 52/195 (26%), Positives = 71/195 (35%)
 Frame = +1

Query: 13   TGTST*LSPAVRPGSTAPRPAFSTTCAAT*SSPRPWTSPAPLTSTWSASSRPPTGLATPS 192
            TGT T   P + P ST      + T     + P   TS AP+    +++  P +     S
Sbjct: 2009 TGTQT---PTMIPISTTTTVTPTPTPTTGSTGPPTHTSTAPIAELTTSNPPPESSTPQTS 2065

Query: 193  RPAPPTTLSTATWA*PGPPCPRTASTTVPTSSRAPQPWCTRPCTTWAWRTPLPTASALTT 372
            R        + T     PP     ST  P++  AP        TT        T+   T 
Sbjct: 2066 RSTSSPLTESTTLLSTLPPAIEMTSTAPPSTPTAP--------TT--------TSGGHTL 2109

Query: 373  MPRPVSLTRPRAAALCGASRGPRRPTSAA*TPGTRC*HPTGTPPTARPPCAWAFPPPT*T 552
             P P + T P      G + G    +S+A TP T       T  T+    AW    PT T
Sbjct: 2110 SPPPSTTTSPPGTPTRGTTTG----SSSAPTPST-----VQTTTTS----AWT---PTPT 2153

Query: 553  PHSTRAQAAVALMRP 597
            P ST +      +RP
Sbjct: 2154 PLSTPSIIRTTGLRP 2168



EST assemble image


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1 LCL005h12_r AV626291 1 461
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Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute