Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC001283A_C01 KCC001283A_c01
(554 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|AAC82365.1| unknown [Myxococcus xanthus] 49 3e-05
ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24... 47 2e-04
ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Strept... 46 4e-04
ref|NP_296138.1| conserved hypothetical protein [Deinococcus rad... 45 8e-04
ref|NP_688457.1| cell wall surface anchor family protein [Strept... 44 0.001
>gb|AAC82365.1| unknown [Myxococcus xanthus]
Length = 542
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-05
Identities = 55/166 (33%), Positives = 64/166 (38%), Gaps = 20/166 (12%)
Frame = -1
Query: 554 TPRPCRWHRRSRRHPARWRTAARRSSACRPG*GRTASWRSPAAPRPAPGSPR-------- 399
+P P R HR SR R T ARRS P R A R+PA P G PR
Sbjct: 62 SPPPRRRHRGSRHRSFR-PTCARRSGRRCPAPSRHAR-RNPAGPSRRCGPPRKSTPTRCC 119
Query: 398 -PQPQPARCAA---APAW**RRSCPRRRTQTEAARCQQDWSKAKRPAPARR*G*CLAPGQ 231
P P P RC A APA R+CP + A+ C P P P Q
Sbjct: 120 TPCPAPPRCRARPSAPAPSAGRTCPTAGPSSCASGCCPTGRCGSAPGPTPHGAEPSPPSQ 179
Query: 230 RQAPVTPTAGTGAR--PRR*RSGA----VPGQQPTTRGCGE--TAC 117
+P ++G R PR R+ A P P R CG T C
Sbjct: 180 SPSPAPASSGGRRRTHPRPARASAAGATAPACLPPPRCCGRPGTGC 225
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.1
Identities = 41/148 (27%), Positives = 50/148 (33%), Gaps = 11/148 (7%)
Frame = -1
Query: 545 PCRWHRRSRRHPARWRTAARR-----------SSACRPG*GRTASWRSPAAPRPAPGSPR 399
PC R R P+ +A R S C G +A +P P+P S
Sbjct: 121 PCPAPPRCRARPSAPAPSAGRTCPTAGPSSCASGCCPTGRCGSAPGPTPHGAEPSPPSQS 180
Query: 398 PQPQPARCAAAPAW**RRSCPRRRTQTEAARCQQDWSKAKRPAPARR*G*CLAPGQRQAP 219
P P PA S RRRT AR + A P R C PG A
Sbjct: 181 PSPAPA-----------SSGGRRRTHPRPARASAAGATAPACLPPPR--CCGRPGTGCAR 227
Query: 218 VTPTAGTGARPRR*RSGAVPGQQPTTRG 135
P + + + P RS PG P G
Sbjct: 228 TAPPSTSASHPPPPRS---PGTPPRASG 252
Score = 31.6 bits (70), Expect = 7.4
Identities = 39/118 (33%), Positives = 48/118 (40%), Gaps = 4/118 (3%)
Frame = +3
Query: 168 AAPSSPRPRARPSSWRHRRLPLAWR*ASPSAARRRWPLRLTPVLLTSCGLSLRSSTRTRT 347
A P SP PR R RHR ++R + RR P G S R +
Sbjct: 58 APPRSPPPRRRHRGSRHR----SFRPTCARRSGRRCPAPSRHARRNPAGPSRRCGPPRK- 112
Query: 348 ASSPSRSCCAPRRLWLRTWTSWCRARGSWTSP*SCSTSTRTAR*RPTS----CCPPSR 509
S+P+R CC P R CRAR S +P S + TA P+S CCP R
Sbjct: 113 -STPTR-CCTPCPAPPR-----CRARPSAPAP-SAGRTCPTA--GPSSCASGCCPTGR 160
>ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24413110|emb|CAD47188.1|
Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316]
Length = 1310
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-04
Identities = 35/110 (31%), Positives = 58/110 (51%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S S S S + S+ S T STS++T+
Sbjct: 934 STSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTS-ASTSASTSASTSTSTSASTSASTS 992
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A + SA +AS
Sbjct: 993 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSAS 1042
Score = 45.8 bits (107), Expect = 4e-04
Identities = 35/113 (30%), Positives = 58/113 (50%), Gaps = 3/113 (2%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFM---AKSSCPSPGTRKSTSSATAC 382
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ SP T STS++T+
Sbjct: 838 STSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSA 897
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 898 STSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 950
Score = 45.4 bits (106), Expect = 5e-04
Identities = 34/110 (30%), Positives = 58/110 (51%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S T STSS+T+
Sbjct: 1054 STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTS-ASTSASTSASTSASTSSSTSASTS 1112
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS A + S+ +AS
Sbjct: 1113 ASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSAS 1162
Score = 45.1 bits (105), Expect = 6e-04
Identities = 35/110 (31%), Positives = 56/110 (50%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS SM++S +A +SA +S+S S S S +S S T STS++T+
Sbjct: 918 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASM-SASTSASTSASTSASTS 976
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + S+ST+A+ +MSA +AS A + SA +AS
Sbjct: 977 ASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISAS 1026
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-04
Identities = 32/110 (29%), Positives = 59/110 (53%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S S+ + + +++ + S+ S T STS++T+
Sbjct: 754 STSASTSASTSASTSASTSASTSA-SMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTS 812
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A S +AS
Sbjct: 813 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSAS 862
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-04
Identities = 36/113 (31%), Positives = 56/113 (48%), Gaps = 3/113 (2%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCP---SPGTRKSTSSATAC 382
+TS SM++S +A +SA +S+S + S S S SS S T STS++ +
Sbjct: 1066 STSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSA 1125
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1126 STSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSAS 1178
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-04
Identities = 34/110 (30%), Positives = 58/110 (51%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +S+ +S S + S S S + S+ S STSS+T+ +
Sbjct: 1142 STSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTS-ASTSASTSASMSASTSSSTSASMS 1200
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +A+ A V SA +AS
Sbjct: 1201 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSAS 1250
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 34/110 (30%), Positives = 57/110 (50%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S + S S S + S+ S T STS++T+
Sbjct: 1042 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTS-ASTSASTSASTSASTSASTSASTS 1100
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1101 ASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 1150
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 38/135 (28%), Positives = 66/135 (48%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S T STS++T+
Sbjct: 698 STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTS-ASTSASTSASTSASTSASTSASTS 756
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCWDGR 193
+S+ + S+ST+A+ +MSA + +AS A SA +AS +
Sbjct: 757 ASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAST--SAS 814
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAA 148
+A+M+ A +A
Sbjct: 815 TSASMSASTSASTSA 829
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 35/110 (31%), Positives = 57/110 (51%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S STSS+T+ +
Sbjct: 1106 STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTS-ASTSASTSASMSASTSSSTSASMS 1164
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1165 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSAS 1214
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.005
Identities = 34/110 (30%), Positives = 56/110 (50%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS SM++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S STS++T+
Sbjct: 830 STSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTS-ASTSASTSASMSASTSASTSPSTS 888
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 889 ASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 938
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.007
Identities = 42/184 (22%), Positives = 79/184 (42%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S + S +A +SA +S+S + S S S + S+ S STS++T+
Sbjct: 878 STSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMS-ASTSASTSASMSASTSASTSASTS 936
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCWDGR 193
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A S +AS A+
Sbjct: 937 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSAST-SASTSAST 995
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAADDTRVRRDCMLTVSRQKEFHLKVRVIALQVSAAALFTRAIVSRDP 13
+A+ + +A+ + ++S + A ++ + T A +S
Sbjct: 996 SASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSAST 1055
Query: 12 GAAS 1
A++
Sbjct: 1056 SAST 1059
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.007
Identities = 34/110 (30%), Positives = 54/110 (48%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S S S S +S S T STS++T+
Sbjct: 990 STSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASM-SASTSASTSASTSASTS 1048
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S + S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1049 ASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 1098
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.009
Identities = 34/110 (30%), Positives = 55/110 (49%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S T STS++T+
Sbjct: 1034 STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTS-ASMSASTSASTSASTSASTSASTS 1092
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + SSST+A+ + SA +AS A SA +AS
Sbjct: 1093 ASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSAS 1142
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.016
Identities = 33/110 (30%), Positives = 56/110 (50%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS SM++S +A +SA +S+S + S S S + SS S STS++ +
Sbjct: 1118 STSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMS-ASTSSSTSASMSASTSASMSASTS 1176
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + +S+ST+++ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1177 ASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSAS 1226
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.016
Identities = 33/110 (30%), Positives = 53/110 (48%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S S S S +S S T STS++T+
Sbjct: 794 STSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASM-SASTSASTSASTSASTS 852
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + S+ST+A+ +MSA + S A SA +AS
Sbjct: 853 ASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSAS 902
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.021
Identities = 33/110 (30%), Positives = 58/110 (52%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S S+ + S++ + S+ S STS++T+
Sbjct: 1126 STSASTSASMSASTSASTSASTSA-SMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTS 1184
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S M+ SSST+A+ + SA + +AS A SA +AS
Sbjct: 1185 AS----MSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSAS 1230
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.027
Identities = 32/110 (29%), Positives = 54/110 (49%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S +S S STS++ +
Sbjct: 738 STSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASM-SASMSASTSASMSASTS 796
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + S+ST+A+ +MSA +AS A + SA +AS
Sbjct: 797 ASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAS 846
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.027
Identities = 36/137 (26%), Positives = 64/137 (46%), Gaps = 2/137 (1%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S +S S T STS++ +
Sbjct: 1082 STSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASM-SASTSASTSASMSASTS 1140
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDAN--CWD 199
+S+ + +S+ST+++ +MSA +AS A SA +AS +
Sbjct: 1141 ASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMS 1200
Query: 198 GRAAAAMTERRCAGAAA 148
+A+M+ A +A
Sbjct: 1201 ASTSASMSASTSASTSA 1217
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.18
Identities = 34/117 (29%), Positives = 57/117 (48%), Gaps = 7/117 (5%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFM---AKSSCPSPGTRKSTSSATAC 382
+TS S ++S +A +SA +S+S + S S S + S+ S T S S++T+
Sbjct: 962 STSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSA 1021
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*----GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+ +S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 1022 SISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 1078
Score = 31.2 bits (69), Expect = 9.7
Identities = 20/67 (29%), Positives = 34/67 (49%)
Frame = -3
Query: 423 SPGTRKSTSSATACEVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMP 244
S T STS++T+ + +S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS
Sbjct: 644 SASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTSTSAST 703
Query: 243 SARPAAS 223
SA +AS
Sbjct: 704 SASTSAS 710
Score = 31.2 bits (69), Expect = 9.7
Identities = 23/66 (34%), Positives = 34/66 (50%), Gaps = 3/66 (4%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAK---SSCPSPGTRKSTSSATAC 382
+TS SM++S +A SA +S+S + S S S S+ S T STS++T+
Sbjct: 1194 STSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSA 1253
Query: 381 EVRSSS 364
SSS
Sbjct: 1254 STSSSS 1259
>ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4] gi|25389341|pir||E95206 cell wall surface anchor
family protein [imported] - Streptococcus pneumoniae
(strain TIGR4) gi|14973269|gb|AAK75846.1| cell wall
surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4]
Length = 4776
Score = 45.8 bits (107), Expect = 4e-04
Identities = 39/136 (28%), Positives = 66/136 (47%), Gaps = 1/136 (0%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+ S S ++S +A +SA A +S+S + S S S A +S + + +++SA+A
Sbjct: 2406 SASASTSASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 2465
Query: 372 SSSCLVMTPF-LSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCWDG 196
S+S T S+ST+A+ + SA +ASA A SA +ASA +
Sbjct: 2466 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 2525
Query: 195 RAAAAMTERRCAGAAA 148
A+ + +E A+A
Sbjct: 2526 SASTSASESASTSASA 2541
Score = 45.4 bits (106), Expect = 5e-04
Identities = 38/135 (28%), Positives = 66/135 (48%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S+++S +A +SA +S+S + S S S A +S + + +++SA+A
Sbjct: 1900 STSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSA 1959
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCWDGR 193
S+S S+ST+A+ + SA +ASA A SA +ASA +
Sbjct: 1960 SASASTSAS-ASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASAS 2018
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAA 148
A+ + +E A+A
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A++
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+ + S+S +A+ + SA +ASA S +ASA + +
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A + +A+ + A A+A
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+S + S+ST+A+ + SA +AS A SA +A S
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Query: 222 ACDANCWDGRAAAAMTERRCAGAAA 148
A + +A+ + A A+A
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S+S S+ST+A+ + SA +AS A SA +ASA +
Sbjct: 2986 SAS-------ESASTSASASASTSASASASTSASGSASTSTSASASTSASASASTSASAS 3038
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAADDTRVRRDCMLTVSRQKEFHLKVRVIALQVSAAALFTRAIVSRDP 13
A+ + +E + +A++ + S + A ++A+ T A S
Sbjct: 3039 ASISASE-SASTSASESASTSTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 3097
Query: 12 GAAS 1
A++
Sbjct: 3098 SASA 3101
>ref|NP_296138.1| conserved hypothetical protein [Deinococcus radiodurans]
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QERRH Q H G RG PG GR +PQPGR AD DRRAA
Sbjct: 430 QERRHRQPRPRRVPGVGHRGGGRGLRGRPGRGRRERRRAARPRQPQPGRAADPDRRAAPH 489
Query: 502 HRAGWRRERRCHRQGR 549
G RR R C Q R
Sbjct: 490 PARGSRRPRLCPPQPR 505
Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.1
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Frame = -1
Query: 530 RRSRRHPARWRTAARRSSACR-PG*GRTASWRSPAAPRPAPGSPRPQ---PQPARCAAAP 363
R R P R R RR++ R P GR A AAP PA GS RP+ PQP A P
Sbjct: 452 RGLRGRPGRGRRERRRAARPRQPQPGRAADPDRRAAPHPARGSRRPRLCPPQPRPRTANP 511
Score = 32.3 bits (72), Expect = 4.4
Identities = 32/101 (31%), Positives = 38/101 (36%), Gaps = 7/101 (6%)
Frame = -1
Query: 539 RWHR--RSRRHPARWRTAARRSSACRPG*GRTASWRSPAAPRPAPG-----SPRPQPQPA 381
R HR R RR P R RPG GR R+ +P PG R P PA
Sbjct: 432 RRHRQPRPRRVPGVGHRGGGRGLRGRPGRGRRERRRAARPRQPQPGRAADPDRRAAPHPA 491
Query: 380 RCAAAPAW**RRSCPRRRTQTEAARCQQDWSKAKRPAPARR 258
R + P + PR AR + A+ AP RR
Sbjct: 492 RGSRRPRLCPPQPRPRTANPPGGAR-SRGTGPAREKAPGRR 531
>ref|NP_688457.1| cell wall surface anchor family protein [Streptococcus agalactiae
2603V/R] gi|22534491|gb|AAN00330.1|AE014259_1 cell wall
surface anchor family protein [Streptococcus agalactiae
2603V/R]
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Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCP---SPGTRKSTSSATAC 382
+TS SM++S +A +SA +S+S S S S +S S T STS++T+
Sbjct: 774 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSA 833
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+ +S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 834 SMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 886
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 35/110 (31%), Positives = 56/110 (50%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS SM++S +A +SA +S+S S S S + S+ S STS++T+
Sbjct: 754 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTS-ASTSASTSASMSASTSASTSASTS 812
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 813 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 862
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
Identities = 37/169 (21%), Positives = 79/169 (45%)
Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S + S S S + S+ S STS++T+ +
Sbjct: 790 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTS-ASTSASTSASMSASTSASTSASMS 848
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCWDGR 193
+S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS +
Sbjct: 849 ASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTS 908
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAADDTRVRRDCMLTVSRQKEFHLKVRVIALQVSAAA 46
A+ + + + ++ ++ + L + +++ + + L + A
Sbjct: 909 ASTSASTSSSSSVTSNSSKEKVYSALPSTGDQDYSVTATALGLGLMTGA 957
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Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCP---SPGTRKSTSSATAC 382
+TS SM++S +A +SA +S+S S S S +S S T STS++T+
Sbjct: 734 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSA 793
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S + S+ST+A+ +MSA +AS A + SA +AS
Sbjct: 794 STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAS 846
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.004
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Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSV---VSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATAC 382
+TS SM++S +A +SA +S+S S + + +++ + S+ S T STS++ +
Sbjct: 654 STSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASMSA 713
Query: 381 EVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAASACDANCW 202
+S+ + S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS +
Sbjct: 714 STSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAST-- 771
Query: 201 DGRAAAAMTERRCAGAAA 148
+A+M+ A +A
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Sbjct: 698 STSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASM-SASTSASTSASTSASTS 756
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+S + S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS +
Sbjct: 757 ASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAST--SAS 814
Query: 192 AAAAMTERRCAGAAA 148
+A+M+ A +A
Sbjct: 815 TSASMSASTSASTSA 829
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.016
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Frame = -3
Query: 552 TTSLSMASSLTAPSSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVR 373
+TS S ++S++A +SA +S+S + S S S +S T STS++ +
Sbjct: 770 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAS-----TSASTSASMSASTS 824
Query: 372 SSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
+S+ + +S+ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 825 ASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 874
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.10
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Frame = -3
Query: 513 SSAMADSSSSVVSVPSWLRSNSFMAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVRSSSCLVMTPFLSS 334
S + + S+S+ S + + +++ + S+ S T STS++T+ + +S+ + S+
Sbjct: 642 SESASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSA 701
Query: 333 STNAN*GRTMSARLE*GEAASAGAPLRVMPSARPAAS 223
ST+A+ +MSA +AS A SA +AS
Sbjct: 702 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAS 738
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Frame = -3
Query: 444 MAKSSCPSPGTRKSTSSATACEVRSSSCLVMTPFLSSSTNAN*GRTMSARLE*GEAASAG 265
+++S+ S T STS++ + +S+ M+ S+ST+A+ +MSA +AS
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Query: 264 APLRVMPSARPAAS 223
A SA +AS
Sbjct: 701 ASTSASTSASMSAS 714
