KCC001250A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC001250A_C01 KCC001250A_c01
cgcccacggagccgagtacaaaaagatcGAGTGCCACTTGTTCTACACAGCATTCGCAAT
CCTTCTTCTGTCCCTGAGCCGTTTGGGCCCACCTCGCGACCCCAACACAAAATGCTCGCG
CACCGCGCCACCGTTTCCAGCCGCGTTGCTGCTCCGTCCTCTCGGAGGGCTGCACTGGTA
GTCAAGGCGCAGTCGCTGGACAGCAGCACTGTTGGCACCAAGGTGGAGCGCTGGCTGAAG
ACGCCCTTCGATATCCTCACCTTCGGCCCCCGCGTTGGTGCCGGCGCGTTGCTGTCCGTG
CCTGAGCGCCTGCAGACCCTGCAAAGCGATGTGGAGAAGGCCATTGAGCTGCTGCAGGAC
CCTCGGCCGCTGGAGGAGAAGCAGGCTGTGGTCCTGAAGGAGGTGGAGGACACGCTGGTT
GAGTTCCTGGAGAAAGGCGCCACCGTGGAGAGCGACGTGCTGGCCAACGTCAAGACCATC
CTGCCGCCCGAGGCCGCCACGCTGCTCAACGAGCTCATCCCCGAGCCGCCCAACAAGAGC
CACGGCCCCAACGTGGTGCGGTGGAGCGCTGGAGTCACGCGGCCCCGCGGCCGCGTACTA
TACAGCAG


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC001250A_C01 KCC001250A_c01
         (608 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

pir||EDBEIF immediate-early protein IE180 - suid herpesvirus 1 (...    45  6e-04
ref|NP_688457.1| cell wall surface anchor family protein [Strept...    45  8e-04
gb|AAF78235.1| 163R* [porcine adenovirus 3]                            45  0.001
ref|ZP_00065777.1| COG0724: RNA-binding proteins (RRM domain) [M...    44  0.001
ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24...    44  0.001

>pir||EDBEIF immediate-early protein IE180 - suid herpesvirus 1 (strain
           Indiana-Funkhauser)
          Length = 1460

 Score = 45.4 bits (106), Expect = 6e-04
 Identities = 31/93 (33%), Positives = 36/93 (38%), Gaps = 11/93 (11%)
 Frame = -2

Query: 469 RWPARRSPRWRLSPGTQPACPPPPSGPQPASPPAAEGPAAAQWPSPHRFAG--------- 317
           R P + S R R  P   P   PPP  P+P  PPA   P A   P+P R  G         
Sbjct: 148 RRPRQHSQRQRPGPPAAPGARPPPQPPRPPPPPAPPAPPAP--PAPRRPRGDGPPRGGTR 205

Query: 316 --SAGAQARTATRRHQRGGRR*GYRRASSASAP 224
             S G +     RRHQ   +R   RR      P
Sbjct: 206 SVSPGRRRGLGPRRHQHSQQRWPQRRHGGGPLP 238

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 5.4
 Identities = 19/42 (45%), Positives = 20/42 (47%), Gaps = 3/42 (7%)
 Frame = -2

Query: 469 RWPARRSPRWRLSPGTQPACPPPPSG---PQPASPPAAEGPA 353
           RWP RR        G  P  PPPP     P  A+PP AEG A
Sbjct: 226 RWPQRRH-----GGGPLPQPPPPPGRSRRPAAAAPPPAEGTA 262

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 9.3
 Identities = 35/113 (30%), Positives = 39/113 (33%)
 Frame = +3

Query: 255 PHLRPPRWCRRVAVRA*APADPAKRCGEGH*AAAGPSAAGGEAGCGPEGGGGHAG*VPGE 434
           P  RPP    R       PA PA            P A     G GP  GG  +   PG 
Sbjct: 165 PGARPPPQPPRPPPPPAPPAPPA------------PPAPRRPRGDGPPRGGTRSV-SPGR 211

Query: 435 RRHRGERRAGQRQDHPAARGRHAAQRAHPRAAQQEPRPQRGAVERWSHAAPRP 593
           RR  G RR    Q       +   QR H      +P P  G   R + AAP P
Sbjct: 212 RRGLGPRRHQHSQ-------QRWPQRRHGGGPLPQPPPPPGRSRRPAAAAPPP 257

>ref|NP_688457.1| cell wall surface anchor family protein [Streptococcus agalactiae
            2603V/R] gi|22534491|gb|AAN00330.1|AE014259_1 cell wall
            surface anchor family protein [Streptococcus agalactiae
            2603V/R]
          Length = 970

 Score = 45.1 bits (105), Expect = 8e-04
 Identities = 42/130 (32%), Positives = 60/130 (45%), Gaps = 3/130 (2%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            + MS+ +S + S      T AS S ST A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 797  ASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA-STSASMSASTSASTSASMSASTSAST 855

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTS 174
            S+SM+ STS       S + S + + +       S    +  ST V T   S+  + +TS
Sbjct: 856  SASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVST---SASTSASTS 912

Query: 173  AALREDGAAT 144
            A+     + T
Sbjct: 913  ASTSSSSSVT 922

 Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.001
 Identities = 40/122 (32%), Positives = 59/122 (47%), Gaps = 6/122 (4%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S +   STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 808  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSAST 867

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTS 174
            S+SM+ STS       S + S + + T      +S    +  ST   T   SS  ++T++
Sbjct: 868  SASMSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSAST---SSSSSVTSN 924

Query: 173  AA 168
            ++
Sbjct: 925  SS 926

 Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.002
 Identities = 38/128 (29%), Positives = 60/128 (46%), Gaps = 1/128 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S      +STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 657  ASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMS------ASTSASTSASTSASTSASTSAS 710

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAA 168
            M+ STS       S + S + + +    +  S    +  ST   T   +S+  + +TSA+
Sbjct: 711  MSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAS 770

Query: 167  LREDGAAT 144
                 +A+
Sbjct: 771  TSASTSAS 778

 Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
 Identities = 38/136 (27%), Positives = 63/136 (45%), Gaps = 1/136 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S +++  +STS  T+A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 768  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSA--STSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA 825

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAALRE 159
            STS       S + S + + +       S       ST   T   +S+  + +TSA++  
Sbjct: 826  STSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSA 885

Query: 158  DGAATRLETVARCASI 111
              +A+   T +   S+
Sbjct: 886  STSASMSATTSASTSV 901

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.007
 Identities = 41/135 (30%), Positives = 61/135 (44%), Gaps = 1/135 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+SM+ 
Sbjct: 792  SASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASMSASTSASTSASMSA 849

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAALR-E 159
            STS       S + S + + +       S       ST       S+  + TTSA+    
Sbjct: 850  STSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAST-------SASMSATTSASTSVS 902

Query: 158  DGAATRLETVARCAS 114
              A+T   T A  +S
Sbjct: 903  TSASTSASTSASTSS 917

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.007
 Identities = 40/137 (29%), Positives = 65/137 (47%), Gaps = 3/137 (2%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 732  SASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSA-STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAS 790

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
             + STS       S + S + + +    +  S    +  ST   +  +S+  + +TSA++
Sbjct: 791  TSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAST---SASMSASTSASTSASM 847

Query: 164  REDGAATRLETVARCAS 114
                +A+   +++   S
Sbjct: 848  SASTSASTSASMSASTS 864

 Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.009
 Identities = 37/128 (28%), Positives = 60/128 (45%), Gaps = 1/128 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 709  ASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASMSASTSAS 766

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAA 168
             + STS       S + S + + +       S    +  ST   T    S+  + +TSA+
Sbjct: 767  TSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 826

Query: 167  LREDGAAT 144
                 +A+
Sbjct: 827  TSASTSAS 834

 Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.020
 Identities = 39/134 (29%), Positives = 63/134 (46%), Gaps = 1/134 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T AS S ST A  S ++++ +STS   +A  S+S   S S+S
Sbjct: 777  ASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 834

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
            M+ STS       S + S + + +       S       ST   T   S+  + +TSA++
Sbjct: 835  MSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSAST---SASMSASTSASM 891

Query: 164  -REDGAATRLETVA 126
                 A+T + T A
Sbjct: 892  SATTSASTSVSTSA 905

 Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.034
 Identities = 36/125 (28%), Positives = 58/125 (45%), Gaps = 1/125 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+  S + S      T ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+SM+ 
Sbjct: 684  SASMSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASTSASTSASMSA 741

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAALRE 159
            STS       S + S + + +       S    +  S    T    S+  + +TSA++  
Sbjct: 742  STSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSA 801

Query: 158  DGAAT 144
              +A+
Sbjct: 802  STSAS 806

 Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.058
 Identities = 41/141 (29%), Positives = 63/141 (44%), Gaps = 4/141 (2%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            + MS+ +S + S      T ASTS S  A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 685  ASMSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA-STSASTSASTSASTSASTSASMSAST 743

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTT 177
            S+S + STS       S + S + + +       S    +  ST   T    S+  + +T
Sbjct: 744  SASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSAST 803

Query: 176  SAALREDGAATRLETVARCAS 114
            SA+     +A+   +++   S
Sbjct: 804  SASTSASTSASTSASMSASTS 824

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.076
 Identities = 35/134 (26%), Positives = 64/134 (47%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 752  SASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASMSASTSASTSA 809

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAALRED 156
            STS       + T ++  A T       +    S  ++   +  +S+  + +TSA++   
Sbjct: 810  STS-------ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSAS 862

Query: 155  GAATRLETVARCAS 114
             +A+   +++   S
Sbjct: 863  TSASTSASMSASTS 876

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.076
 Identities = 38/132 (28%), Positives = 62/132 (46%), Gaps = 1/132 (0%)
 Frame = -1

Query: 536  LLGGSGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGS 357
            LL  S  +S S+ A++   M    ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S
Sbjct: 640  LLSESASTSASTSASTSASMS---ASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASMSASTSAS 694

Query: 356  CSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALT 180
             S+S + STS       S + S + + +       S    +  S    T    S+  + +
Sbjct: 695  TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 754

Query: 179  TSAALREDGAAT 144
            TSA++    +A+
Sbjct: 755  TSASMSASTSAS 766

>gb|AAF78235.1| 163R* [porcine adenovirus 3]
          Length = 163

 Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.001
 Identities = 30/83 (36%), Positives = 38/83 (45%), Gaps = 2/83 (2%)
 Frame = -2

Query: 466 WPARRSPRWRLSPGTQPACPPPPSG--PQPASPPAAEGPAAAQWPSPHRFAGSAGAQART 293
           WPA  SP    +P    A PP P+   P P S P  E P   Q PSP   A +  A+ R+
Sbjct: 68  WPAAVSPPPPAAPAAAAAAPPAPAASCPPPRSDPPMETPPGTQTPSPPSPAAAVAAE-RS 126

Query: 292 ATRRHQRGGRR*GYRRASSASAP 224
            +R   R G+     R S +S P
Sbjct: 127 GSRPAPRSGQGRPPLRRSHSSRP 149

>ref|ZP_00065777.1| COG0724: RNA-binding proteins (RRM domain) [Microbulbifer degradans
           2-40]
          Length = 584

 Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
 Identities = 47/156 (30%), Positives = 72/156 (46%)
 Frame = -1

Query: 536 LLGGSGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGS 357
           ++GGS  SS SS   S        +S+S S+ +  S +STS SS+S  +T   SSS   S
Sbjct: 249 IIGGSSSSSSSSSTGSSS------SSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSST---SSSSSSS 299

Query: 356 CSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTT 177
            SSS + STS       S + S++ + +       S    S  S+   +   SS   +  
Sbjct: 300 SSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGGVIF 359

Query: 176 SAALREDGAATRLETVARCASILCWGREVGPNGSGT 69
           SA    D  +T+    A   + + W R+ GPN +G+
Sbjct: 360 SADFESDSDSTQ---PAGWDNFIGW-RQNGPNPNGS 391

>ref|NP_735966.1| Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316] gi|24413110|emb|CAD47188.1|
            Unknown [Streptococcus agalactiae NEM316]
          Length = 1310

 Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.001
 Identities = 37/125 (29%), Positives = 61/125 (48%), Gaps = 1/125 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 808  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASTSTSTSASTSA 865

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAALRE 159
            STS       S + S + +P+       S    +  ST   T   +S+  + +TSA++  
Sbjct: 866  STSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSA 925

Query: 158  DGAAT 144
              +A+
Sbjct: 926  STSAS 930

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.002
 Identities = 42/134 (31%), Positives = 60/134 (44%), Gaps = 7/134 (5%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS-------STSFRTTACFSSSG 366
            + MS+ +S + S        ASTS ST A  S  STS S       STS  T+A  S+S 
Sbjct: 1133 ASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSA-STSASMSASTSASTSASTSASMSAST 1191

Query: 365  RGSCSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCA 186
              S S+SM+ STS       S + S + + +       S    +  ST V T   S+  +
Sbjct: 1192 SSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASMSATTSASTSVST---SASTS 1248

Query: 185  LTTSAALREDGAAT 144
             +TSA+     + T
Sbjct: 1249 ASTSASTSSSSSVT 1262

 Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
 Identities = 40/134 (29%), Positives = 62/134 (45%), Gaps = 1/134 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S      +STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 1121 ASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMS------ASTSSSTSASMSASTSASMSAS 1174

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
             + STS       S + S++ + +       S    +  ST   T   S+  + +TSA++
Sbjct: 1175 TSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSAST---SASMSASTSASM 1231

Query: 164  -REDGAATRLETVA 126
                 A+T + T A
Sbjct: 1232 SATTSASTSVSTSA 1245

 Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
 Identities = 42/138 (30%), Positives = 64/138 (45%), Gaps = 11/138 (7%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS---STSFRTTACFSSSGR 363
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S +   STS S   STS  T+A  S+S  
Sbjct: 1069 ASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTS 1128

Query: 362  GSCSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-----VLLS 198
             S S+SM+ STS       S + S + + +    +  S       ST   T       +S
Sbjct: 1129 ASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSSSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMS 1188

Query: 197  SDCALTTSAALREDGAAT 144
            +  + +TSA++    +A+
Sbjct: 1189 ASTSSSTSASMSASTSAS 1206

 Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.003
 Identities = 38/130 (29%), Positives = 62/130 (47%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+SM+ 
Sbjct: 736  SASTSASTSASTSASTSASTSASTSA--STSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSA 793

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAALRED 156
            STS       S + S + + +    +  S    +  ST     + +S  A T+++     
Sbjct: 794  STSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAST--SASMSASTSASTSASTSAST 851

Query: 155  GAATRLETVA 126
             A+T   T A
Sbjct: 852  SASTSTSTSA 861

 Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.004
 Identities = 38/137 (27%), Positives = 65/137 (46%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T ASTS S  A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 657  ASMSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSTS--TSASTSASTSASTSAS 714

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
            M+ STS       S + S + + +       S    +  ST   T   S+  + +TSA+ 
Sbjct: 715  MSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAST---SASTSASTSAST 771

Query: 164  REDGAATRLETVARCAS 114
                +A+   +++   S
Sbjct: 772  SASTSASMSASMSASTS 788

 Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.009
 Identities = 41/130 (31%), Positives = 60/130 (45%), Gaps = 3/130 (2%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 873  ASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSA-STSASMSASTSASTSASMSASTSAST 931

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTS 174
            S+S + STS       S + S + + +       S    +  ST   T   S+  + +TS
Sbjct: 932  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAST---STSTSASTS 988

Query: 173  AALREDGAAT 144
            A+     +A+
Sbjct: 989  ASTSASTSAS 998

 Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.009
 Identities = 43/138 (31%), Positives = 62/138 (44%), Gaps = 8/138 (5%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S +   STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 848  SASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSAST 907

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT--VLLSSDCALT 180
            S+SM+ STS       S + S + + +       S    +  ST   T   + +S  A T
Sbjct: 908  SASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSAST 967

Query: 179  TSAALREDGAATRLETVA 126
            +++      A+T   T A
Sbjct: 968  SASTSASTSASTSTSTSA 985

 Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
 Identities = 37/128 (28%), Positives = 61/128 (46%), Gaps = 1/128 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S        ASTS ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 817  ASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA--STSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSAS 874

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAA 168
            M+ STS       S + S + + +       S       ST   T   +S+  + +TSA+
Sbjct: 875  MSASTSASTSPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSAS 934

Query: 167  LREDGAAT 144
                 +A+
Sbjct: 935  TSASTSAS 942

 Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
 Identities = 36/127 (28%), Positives = 63/127 (49%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T AS S ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S SSS
Sbjct: 1049 ASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASTSASTSASTSASTSSS 1106

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
             + STS       S + S + + +    +  S    +  ST   +  +S+  + +TSA++
Sbjct: 1107 TSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSAST---SASMSASTSSSTSASM 1163

Query: 164  REDGAAT 144
                +A+
Sbjct: 1164 SASTSAS 1170

 Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.012
 Identities = 37/125 (29%), Positives = 59/125 (46%), Gaps = 1/125 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+SM+ 
Sbjct: 728  SASTSASTSASTSASTSASTSASTSA--STSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSA 785

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAALRE 159
            STS       S + S + + +       S       ST   T    S+  + +TSA+   
Sbjct: 786  STSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA 845

Query: 158  DGAAT 144
              +A+
Sbjct: 846  STSAS 850

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.015
 Identities = 41/134 (30%), Positives = 61/134 (44%), Gaps = 10/134 (7%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS-------STSFRTTACFSSSG 366
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S +   STS S       STS  T+A  S+S 
Sbjct: 752  SASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSAST 811

Query: 365  RGSCSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCA 186
              S S+SM+ STS       S + S + + +       S    +  ST   T   S+  +
Sbjct: 812  SASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSAST---SASTS 868

Query: 185  LTTSAALREDGAAT 144
             +TSA++    +A+
Sbjct: 869  ASTSASMSASTSAS 882

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.015
 Identities = 38/138 (27%), Positives = 65/138 (46%), Gaps = 1/138 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S        ASTS ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 941  ASMSASTSASTSASTSASMSASTSASTSA--STSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSAS 998

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAA 168
            M+ STS       S + S + + +       S    +  ST   T    S+  + +TSA+
Sbjct: 999  MSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 1058

Query: 167  LREDGAATRLETVARCAS 114
                 +A+   +++   S
Sbjct: 1059 TSASTSASTSASMSASTS 1076

 Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.020
 Identities = 36/125 (28%), Positives = 60/125 (47%), Gaps = 1/125 (0%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++ +STS  T+A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 704  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSA--STSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSA 761

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAALRE 159
            STS       S + S + + +       S    +  ST   T    S+  + +TSA++  
Sbjct: 762  STSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSA 821

Query: 158  DGAAT 144
              +A+
Sbjct: 822  STSAS 826

 Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.026
 Identities = 45/143 (31%), Positives = 64/143 (44%), Gaps = 6/143 (4%)
 Frame = -1

Query: 536  LLGGSGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS---STSFRTTACFS 375
            LL  S  +S S+ A++   M    ASTS ST A  S +   STS S   STS  T+A  S
Sbjct: 640  LLSESASTSASTSASTSASMS---ASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTS 696

Query: 374  SSGRGSCSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSS 195
            +S   S S+S + STS       S + S + + +       S    +  ST   T   +S
Sbjct: 697  TSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAST--SAS 754

Query: 194  DCALTTSAALREDGAATRLETVA 126
              A T+++      A+T   T A
Sbjct: 755  TSASTSASTSASTSASTSASTSA 777

 Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.034
 Identities = 38/130 (29%), Positives = 62/130 (47%), Gaps = 3/130 (2%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            + +S+ +S + S      T ASTS ST A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 1021 ASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSA-STSASTSASTSASTSASMSASTSAST 1079

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTS 174
            S+S + STS       + T ++  A T       +    S  ++   +  +S+  + +TS
Sbjct: 1080 SASTSASTS-------ASTSASTSASTSASTSSSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTS 1132

Query: 173  AALREDGAAT 144
            A++    +A+
Sbjct: 1133 ASMSASTSAS 1142

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.044
 Identities = 38/135 (28%), Positives = 60/135 (44%), Gaps = 2/135 (1%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+  S + S      T ASTS ST A  S ++++ +STS   +A  S+S   S S+S
Sbjct: 777  ASMSASMSASTSASMSASTSASTSASTSA--STSASTSASTSASMSASTSASTSASTSAS 834

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLS--SDCALTTSA 171
            M+ STS       S + S + + +       S    +  S    T   +  S  A T+++
Sbjct: 835  MSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSASTSAS 894

Query: 170  ALREDGAATRLETVA 126
                  A+T   T A
Sbjct: 895  TSASTSASTSASTSA 909

 Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.058
 Identities = 41/145 (28%), Positives = 63/145 (43%), Gaps = 11/145 (7%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN---STSVS---STSFRTTACFSSSGRGSC 354
            S  +S + S      T ASTS ST A  S +   STS S   STS  T+A  S+S   S 
Sbjct: 884  SPSTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASM 943

Query: 353  SSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-----VLLSSDC 189
            S+S + STS       S + S + + +       S    +  ST   T       +S+  
Sbjct: 944  SASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSAST 1003

Query: 188  ALTTSAALREDGAATRLETVARCAS 114
            + +TSA+     +A+   +++   S
Sbjct: 1004 SASTSASTSASMSASTSASISASTS 1028

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.076
 Identities = 36/128 (28%), Positives = 60/128 (46%), Gaps = 1/128 (0%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S ++++ +STS   +A  S+S   S S+S
Sbjct: 833  ASMSASTSASTSASTSASTSASTSTSTSA--STSASTSASTSASMSASTSASTSPSTSAS 890

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPT-VLLSSDCALTTSAA 168
             + STS       S + S + + +       S    +  ST   T    S+  + +TSA+
Sbjct: 891  TSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSAS 950

Query: 167  LREDGAAT 144
                 +A+
Sbjct: 951  TSASTSAS 958

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.076
 Identities = 36/124 (29%), Positives = 57/124 (45%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T AS S ST A  S ++++  STS  T+A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 1004 SASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSA--STSASTSASTSASMSASTSASTSA 1061

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAALRED 156
            STS       S + S + + +       S    +  ST   T   SS  + +TSA+    
Sbjct: 1062 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSAST---SSSTSASTSASTSAS 1118

Query: 155  GAAT 144
             +A+
Sbjct: 1119 TSAS 1122

 Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.099
 Identities = 41/147 (27%), Positives = 65/147 (43%), Gaps = 10/147 (6%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRN-------STSVS---STSFRTTACFS 375
            + MS+ +S + S      T ASTS ST A  S +       STS S   STS  T+A  S
Sbjct: 681  ASMSASTSASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASTSASTS 740

Query: 374  SSGRGSCSSSMAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSS 195
            +S   S S+S + STS       S + S + + +    +  S    +  S    T   S+
Sbjct: 741  ASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASTSASMSASMSASTSASMSAST---SA 797

Query: 194  DCALTTSAALREDGAATRLETVARCAS 114
              + +TSA+     +A+   +++   S
Sbjct: 798  STSASTSASTSASTSASTSASMSASTS 824

 Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.099
 Identities = 42/137 (30%), Positives = 60/137 (43%), Gaps = 3/137 (2%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S  STS S   STS   +A  S+S   S S+S
Sbjct: 972  SASTSASTSTSTSASTSASTSASTSASMSA-STSASTSASTSASMSASTSASISASTSAS 1030

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAAL 165
            M+ STS       S + S + + +       S    +  S    T   +S  A T+++  
Sbjct: 1031 MSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSAST--SASTSASTSASTS 1088

Query: 164  REDGAATRLETVARCAS 114
                A+T   T A  +S
Sbjct: 1089 ASTSASTSASTSASTSS 1105

 Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.099
 Identities = 41/135 (30%), Positives = 58/135 (42%), Gaps = 5/135 (3%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVS---STSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S  STS S   STS  T+A  S+S   S S+S
Sbjct: 932  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMSA-STSASTSASTSASTSASTSTSTSASTSAS 990

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTD--SNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSA 171
             + STS       S +   S + + +      IS    +  S        +S  A T+++
Sbjct: 991  TSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSASISASTSASMSASTSASTSASTSASTSAS 1050

Query: 170  ALREDGAATRLETVA 126
                  A+T   T A
Sbjct: 1051 MSASTSASTSASTSA 1065

 Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.22
 Identities = 36/119 (30%), Positives = 56/119 (46%)
 Frame = -1

Query: 524  SGMSSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSS 345
            S  S+  S + S      T ASTS ST A  S +++S  STS   +A  S+S   S S+S
Sbjct: 1157 SSTSASMSASTSASMSASTSASTSASTSASMSASTSS--STSASMSASTSASMSASTSAS 1214

Query: 344  MAFSTSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAA 168
             + STS       S + S + + T      +S    +  ST   T   SS  ++T++++
Sbjct: 1215 TSASTS----ASMSASTSASMSATTSASTSVSTSASTSASTSAST---SSSSSVTSNSS 1266

 Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.49
 Identities = 37/130 (28%), Positives = 55/130 (41%)
 Frame = -1

Query: 515  SSLSSVAASGGRMVLTLASTSLSTVAPFSRNSTSVSSTSFRTTACFSSSGRGSCSSSMAF 336
            S+ +S + S      T ASTS ST A  S      +STS   +A  S+S   S S+S + 
Sbjct: 988  SASTSASTSASMSASTSASTSASTSASMS------ASTSASISASTSASMSASTSASTSA 1041

Query: 335  STSLCRVCRRSGTDSNAPAPTRGPKVRISKGVFSQRSTLVPTVLLSSDCALTTSAALRED 156
            STS       S + S + + +       S    +  ST   T   +S  A T+++     
Sbjct: 1042 STSASTSASMSASTSASTSASTSASTSASMSASTSASTSAST--SASTSASTSASTSAST 1099

Query: 155  GAATRLETVA 126
             A+T   T A
Sbjct: 1100 SASTSSSTSA 1109



EST assemble image


clone accession position
1 CM030d08_r AV397415 1 622
2 LC054h04_r AV622808 29 529
3 MXL064e01_r BP096761 33 520
4 MX230b11_r BP090860 34 486
5 LC046b04_r AV622173 34 526
6 MX031d01_r BP087307 34 460
7 LCL016f07_r AV626849 34 315
8 LC081h01_r AV624732 37 567
9 MX010d06_r BP086505 42 341
10 MX259d07_r BP092804 59 558




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute