KCC000861A_c01
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Fasta Sequence
>KCC000861A_C01 KCC000861A_c01
cgcgctggtcacgacgtccgtgaacgccaagggcggcgtgaagtgggcgggcattggcgg
cggcgacgcagacccagacgGCGATGAGAAGAGCGTCAAGGGCAACGGGCGCAAGGAGGC
TACCCTGCCGCACTCGCCAACAGCGGACAAGCTGGGCGGTGACGGTGGCACGGCCCCGCG
CATGAGTGACGCTGGGGGCCGCAAGTCCGAGGACGGCTCGCTGTCCGACAGCGGCAGTGG
CAGCGGCGATGAGAAGGCGGAGGACGACAAGGCCGCCGAGGGCCAGGACGGGCTGGGGGC
CTGGGGCGGCGGCGGCAACAACTGGGGCGCTGCGGTGGACGACGACCAGGCATCAGGCGT
ATCGGGCAGCCAGGTGGATGGCGCGTCCGTCGTCTCGGGCAGTGAAGCTGGCGGCTACCA
GACTGACTTCAAGCGCGGTCGGCGCTTCAAGAAGCTGATGAAGTTGCTTTCGTCGGCCAA
GGCCAAGGCCGACCTTACGCGCTACAACCGGCACACGTACATCGTGATCGCACTACTGCT
GCTGGTGCACACGATTTGCTTTGCGCTGTTCCTCATCTTCCTGGAGAACCAGAAGAAGTA
TGTGACGGAGGTGGACTCAACCCAGGACACTTCAACGTACGGCTTGGACGTGGCCATCCT
GTCGCGCGCCATGCAGAACGTCTACAACAACAACACCAACCCCGAGTGGTACACGTGGGA
CGACCTGCCAGTGATCCTTAAGGACACCACTTCCGCAATCGACATGATGGAGTTCAACCA
CCAGGGCCTGTACCTGGGCTTCGGCAAGCTGCGGCATCTGGGCGACATCTACGAGCTTGG
TGCCATCTGGGAGGGCCGCACGCTCAACGAGACCCTGTACATCGATACCCGCAACCCGTA
TCACGTGTCTGACCTCAACAGTCTGTGGCTGATGGGCAACGCGCTCATTGCCAGCGGCCG
TGAGCTGGTGTCCAATCACATCCGCATCGCCAACGCTACCGGCAAGAACTTCACACTCAA
CCGCGACTGGCAGTACGTGATCAACAACGGCCCCGCTTCCGTCACCGCCGGCTACCGCTA
CAGTCTGAACGGCATGGTGTTGCGCACCTGGGACAGCGTCGGCCGCGTCAACATGCTGGG
CATTGGCCTGCTGATTGCTGAAGGCGCCGTTGTGTGCGGTATCGCGGCTCTGTACATGTG
GGTGCTGCTCAAGCAGGTGGCGCGCCAGCGCTACAGCCTTTACTCAGTGTTCCTGGTCAT
CCCCACCGGCTTCCTGCGCGCACTGGCAAGCAAGCACGTGCAAGTGGATGGCGAGGACGA
CAACGACAGTGACAGTGATGCGGGCGACGATGCAAATGCCAACAAGGAGCGCAACAAGGA
CACGGCAGCCGTACCGGGTGCAGCCTCCACCAAGGATGGCAAGACTGACGACGGCAAGGG
CGATGACAAGCCTGTCATCCTTCCT


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC000861A_C01 KCC000861A_c01
         (1465 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [...    75  2e-12
ref|NP_523475.2| Salivary gland secretion 1 CG3047-PA [Drosophil...    75  3e-12
ref|XP_039877.6| similar to Mucin 5B precursor (Mucin 5 subtype ...    70  1e-10
gb|AAK61485.1| glycoprotein gp2 [Equine herpesvirus 1]                 70  1e-10
gb|AAK61484.1| glycoprotein gp2 [Equine herpesvirus 1]                 69  2e-10

>pir||T44768 antifreeze glycopeptide AFGP polyprotein precursor [imported] -
            Boreogadus saida gi|2078483|gb|AAC60129.1| antifreeze
            glycopeptide AFGP polyprotein precursor
          Length = 507

 Score = 75.5 bits (184), Expect = 2e-12
 Identities = 120/458 (26%), Positives = 170/458 (36%), Gaps = 10/458 (2%)
 Frame = +3

Query: 33   AA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPR 212
            AA +  A  AAT  + A R A+ AT A      T     + A      RA     AA+P 
Sbjct: 83   AATAATAATAATPARAA-RAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPA 141

Query: 213  TARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPS 392
            TA  P  A  AA      T    AR        AAT        T   A RAAR     +
Sbjct: 142  TAATPATAATAATAATSATAATAAR--------AATPATAATPATPATAARAARAATPAT 193

Query: 393  SRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPR-------PRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCT 551
            +     AAT  T++    + +  +  R  R       P P   AT  T  +         
Sbjct: 194  AATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAAT--------- 244

Query: 552  RFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ 731
              A    +++   R +   R   P T    A T  +   P   +T  T   + T  T  +
Sbjct: 245  --AATAPTAATPARAA---RAATPATAATLA-TAATPATPATPATAATDATAATAATPAR 298

Query: 732  *SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCT-SIPATRITC 908
                TP   +T   + T A    +A+    AT+ +     RAAR+  P T + PAT  T 
Sbjct: 299  --AATPATPAT---AATPATPATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATA 353

Query: 909  LTSTVCG*WATRSLP--AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATAT 1082
             T+      AT + P  AA +  P T+A+    A T+ + AT +T +  A   +P   AT
Sbjct: 354  ATAATAATAATAATPARAARAATPATAAT-AATAATAATAATAATPARAARAATPATPAT 412

Query: 1083 V*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSS 1262
               A    P TA+ A+T  A A     A   A +        ++R    AT  T  +  +
Sbjct: 413  --PATPATPATAATAATA-ATAATAATAATAATAATAPTPARAARAATPATGATPATAPT 469

Query: 1263 PPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSAT 1376
               +     A+T    AR +T      AT   P  +AT
Sbjct: 470  AGTAATAATAATAATPARASTP-----ATAATPVTAAT 502

 Score = 73.9 bits (180), Expect = 7e-12
 Identities = 108/428 (25%), Positives = 153/428 (35%), Gaps = 12/428 (2%)
 Frame = +3

Query: 24   TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAA 203
            TP  A +    A A   +T  R A+ AT A      T     + A       A     AA
Sbjct: 109  TPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAATPATAATAATAATSATAATAARAA 168

Query: 204  SPRTARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMA 383
            +P TA  P A  A A R  R   P  A T     A AAT        T     RAAR   
Sbjct: 169  TPATAATP-ATPATAARAARAATPATAATA-ATAATAATAATAATAATAATPARAARAAT 226

Query: 384  RPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPR-PTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFA 560
              ++     AAT  T++    + +  +  R  R   P   AT  T  + +      T   
Sbjct: 227  PATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAAT 286

Query: 561  LRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SL 740
               ++++    R+             T  T  +   P   +T  T   + T  T  + + 
Sbjct: 287  DATAATAATPARA---------ATPATPATAATPATPATAATAATAATAATAATPAR-AA 336

Query: 741  RTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTST 920
            R   P +    + T A    +A+    AT+ +     RAAR+  P T+  AT  T  T+ 
Sbjct: 337  RAATPAT----AATPATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATA--ATAATAATAA 390

Query: 921  VCG*WAT--RSLPAAVSWCPITSASPTLP--------ARTSHSTATGST*STTAPLPSPP 1070
                 AT  R+  AA    P T A+P  P        A T+ + AT +T +T A  P+P 
Sbjct: 391  TAATAATPARAARAATPATPATPATPATPATAATAATAATAATAATAATAATAATAPTPA 450

Query: 1071 ATATV*T-AWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQ 1247
              A   T A    P TA  A T              A +         +R    ATA T 
Sbjct: 451  RAARAATPATGATPATAPTAGT-------------AATAATAATAATPARASTPATAATP 497

Query: 1248 CSWSSPPA 1271
             + ++P A
Sbjct: 498  VTAATPAA 505

 Score = 72.4 bits (176), Expect = 2e-11
 Identities = 120/465 (25%), Positives = 172/465 (36%), Gaps = 24/465 (5%)
 Frame = +3

Query: 126  CRTRQQRTSWAVTVARP----RA*VTLGAASPRTARCP-TAAVAAAMRRRRTTRPPRART 290
            C +  +     + VARP    RA     AA+P TA  P TAA AA      T   P    
Sbjct: 12   CTSSPRYEQHQLLVARPAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAATAATPATAA 71

Query: 291  GWGPGAAAATTGALRWT-TTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SC 467
                 A AATT A   T  T     RAAR  A P++ A    A    ++A  A+      
Sbjct: 72   TPATAATAATTAATAATAATAATPARAAR-AATPATAATPATAATAATAATAATAE---- 126

Query: 468  FRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAW 647
                   P   AT  T  + +      T  A   ++++     +   R   P T    A 
Sbjct: 127  ------TPARAATPATAATPATAATPAT--AATAATAATSATAATAARAATPATAATPAT 178

Query: 648  TWPSCRA-----PCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASC 812
               + RA     P   +T  T   + T  T    +      ++   ++   A T A+A+ 
Sbjct: 179  PATAARAARAATPATAATAATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAAT 238

Query: 813  GIWATSTSLVPS----GRAARSTRPCT-------SIPATRITCLTSTVCG*WATRSLP-- 953
               A + +  P+     RAAR+  P T       + PAT  T  T+      AT + P  
Sbjct: 239  PATAATAATAPTAATPARAARAATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPAR 298

Query: 954  AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAAST 1133
            AA    P T+A+P  PA T+ + AT +T + TA  P+  A A    A    P TA+ A+T
Sbjct: 299  AATPATPATAATPATPA-TAATAATAAT-AATAATPARAARAAT-PATAATPATAATAAT 355

Query: 1134 CWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMA 1313
                A     A     +R  T    ++    +ATA T  + ++P  +      +T    A
Sbjct: 356  AATAATAATAATPARAARAATPATAATA-ATAATAATAATAATPARAARAATPATPATPA 414

Query: 1314 RTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMT 1448
               T  T   A       +A            P  AR   ARA T
Sbjct: 415  TPATPATAATAATAATAATAATAATAATAATAPTPAR--AARAAT 457

 Score = 70.5 bits (171), Expect = 7e-11
 Identities = 120/489 (24%), Positives = 172/489 (34%), Gaps = 11/489 (2%)
 Frame = +3

Query: 27   PRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAAS 206
            P AA      A A    TA   A+ AT A      T       A T A      T   A+
Sbjct: 28   PAAAARAATPATAATPATAATPATAATAATEATAAT-------AATPATAATPATAATAA 80

Query: 207  PRTARCPTAAVAAA-MRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAA--RW 377
               A   TAA AA   R  R   P  A T     A AAT        T     RAA    
Sbjct: 81   TTAATAATAATAATPARAARAATPATAAT----PATAATAATAATAATAETPARAATPAT 136

Query: 378  MARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPT-LRATTGTRTS*SHYCCWCTR 554
             A P++ A    A    ++A  A+ +  +    P    T     T  R + +        
Sbjct: 137  AATPATAATPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAAT 196

Query: 555  FALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQ----RTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGT 722
             A   ++++  T  +     T  R  +     TA T  +   P   +T  T   + T   
Sbjct: 197  AATAATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAPTPATAATPATAATAATAPTAATPAR 256

Query: 723  TCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCT-SIPATR 899
              +    TP   +T  ++ T A     A+    AT+ +     RAA    P T + PAT 
Sbjct: 257  AAR--AATPATAATLATAATPATPATPATAATDATAATAATPARAATPATPATAATPATP 314

Query: 900  ITCLTSTVCG*WATRSLP--AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPA 1073
             T  T+      AT + P  AA +  P T+A+P     T+ + AT +T +T A   +P  
Sbjct: 315  ATAATAATAATAATAATPARAARAATPATAATPA----TAATAATAATAATAATAATPAR 370

Query: 1074 TATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCS 1253
             A   T     P TA+ A+T          A   A +        ++R    AT  T  +
Sbjct: 371  AARAAT-----PATAATAAT----------AATAATAATAATPARAARAATPATPATPAT 415

Query: 1254 WSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTT 1433
             ++P  +     A+T    A   T  T   AT   P R+A          P       T 
Sbjct: 416  PATPATAATAATAATAATAATAATAATA--ATAPTPARAARAATPATGATPATAPTAGTA 473

Query: 1434 ARAMTSLSS 1460
            A A T+ ++
Sbjct: 474  ATAATAATA 482

 Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.11
 Identities = 48/185 (25%), Positives = 69/185 (36%), Gaps = 12/185 (6%)
 Frame = +3

Query: 942  RSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTAS 1121
            R   AA +  P T+A+P   A T  + AT +T   TA   + PATA        A  TA+
Sbjct: 27   RPAAAARAATPATAATPATAA-TPATAATAAT-EATAATAATPATAATPATAATAATTAA 84

Query: 1122 AASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRAS--------ATAFTQCSWSSPPASC 1277
             A+T    A     A     +   T    ++   A+        A A T  + ++P  + 
Sbjct: 85   TAATAATAATPARAARAATPATAATPATAATAATAATAATAETPARAATPATAATPATAA 144

Query: 1278 AHWQASTCKWMARTTTTVTVMR----ATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAM 1445
                A+T    A + T  T  R    AT   P   AT  R      P       T A A 
Sbjct: 145  TPATAATAATAATSATAATAARAATPATAATPATPATAARAARAATPATAATAATAATAA 204

Query: 1446 TSLSS 1460
            T+ ++
Sbjct: 205  TAATA 209

>ref|NP_523475.2| Salivary gland secretion 1 CG3047-PA [Drosophila melanogaster]
            gi|28380257|gb|AAF50957.3| CG3047-PA [Drosophila
            melanogaster]
          Length = 1225

 Score = 75.1 bits (183), Expect = 3e-12
 Identities = 110/488 (22%), Positives = 165/488 (33%), Gaps = 12/488 (2%)
 Frame = +3

Query: 24   TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAA 203
            TPR+  +       T T  +    S +      P  T    TS   T   PR+  T   +
Sbjct: 514  TPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT-PRSTTTTSTS 572

Query: 204  SPRTARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMA 383
             P T   P +    +     TT P    T    G    T  +   T+T        R   
Sbjct: 573  GPTTTT-PRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTT 631

Query: 384  RPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFAL 563
              S+        R T++   +  +       PR   T   +  T T+        T    
Sbjct: 632  TTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT----TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT 687

Query: 564  RCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRG----TTCQ 731
              +  S  T  +     T PR+   T+ + P+   P  T+TT+T  P+ T      TT  
Sbjct: 688  TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTST 747

Query: 732  *SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCL 911
                T  P+ST  +ST+   T    S    +TS     + R+  +T   TS P T     
Sbjct: 748  SGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTS--TSGPTTTTPRS 805

Query: 912  TSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*----STTAPLPSPPATA 1079
            T+T      T + P + +    +  + T P  T+ ++ +G T     STT    S P T 
Sbjct: 806  TTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTT 865

Query: 1080 TV*-TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSW 1256
            T   T   C  G  +         C          S   TC  C +     +T  T  S 
Sbjct: 866  TPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSG 925

Query: 1257 SSPPASCAHWQASTC---KWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARL 1427
             +     +  + STC       R+TTT +  R T   P  + T T        P      
Sbjct: 926  PTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTP 985

Query: 1428 TTARAMTS 1451
            +T+R  T+
Sbjct: 986  STSRPTTT 993

 Score = 73.6 bits (179), Expect = 9e-12
 Identities = 116/483 (24%), Positives = 164/483 (33%), Gaps = 13/483 (2%)
 Frame = +3

Query: 24   TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAA 203
            TPR+  +       T T  +    S +      P  T    TS   T   PR+  T   +
Sbjct: 530  TPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT-PRSTTTTSTS 588

Query: 204  SPRTARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMA 383
             P T   P +    +     TT P    T    G    T  +   T+T        R   
Sbjct: 589  GPTTTT-PRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTT 647

Query: 384  RPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFAL 563
              S+        R T++   +  +       PR   T   +  T T+        T    
Sbjct: 648  TTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT----TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT 703

Query: 564  RCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRG----TTCQ 731
              +  S  T  +     T PR+   T+ + P+   P  T+TT+T  P+ T      TT  
Sbjct: 704  TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTST 763

Query: 732  *SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATS--TSLVPSGRAARSTR-PCTSIPATRI 902
                T  P+ST  +ST+   T    S    +TS  T+  P      ST  P T+ P  R 
Sbjct: 764  SGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTP--RS 821

Query: 903  TCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*-STTAPLPSPPAT- 1076
            T  TST      T       S    T+ +P     TS S  T +T  STT    S P T 
Sbjct: 822  TTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRSTTTTCTSGPTTT 881

Query: 1077 ---ATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQ 1247
               +T  T   C   T   ++T    +C     P     R  T  C S     +  + T+
Sbjct: 882  TPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSC-----PTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTK 936

Query: 1248 CSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATR-TRQPYRVQPPPRMAR 1424
             S  +P  +      +T      TTT  +    T   PT +  R T  P   +P     R
Sbjct: 937  TSTCAPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPR 996

Query: 1425 LTT 1433
             TT
Sbjct: 997  STT 999

 Score = 70.1 bits (170), Expect = 1e-10
 Identities = 115/497 (23%), Positives = 172/497 (34%), Gaps = 16/497 (3%)
 Frame = +3

Query: 9    SRRP*T--PRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA 182
            +RRP T  PR   +    A  T T  +    + +      P R     ++ + T   PR+
Sbjct: 264  TRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTP-RCTTTTSTCSPTRTTPRS 322

Query: 183  *VTLGAASPRTA--RCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQ 356
              T   + P T   RC T       RR  TT P    T    G    T  +   T T   
Sbjct: 323  TTTTSTSRPTTTTPRCTTTPSTTCTRRPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTCTSGP 382

Query: 357  AYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHY 536
                 R     S+        R T++   +  +       PR   T   +  T T+    
Sbjct: 383  TTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT----TTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 438

Query: 537  CCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTR 716
                T      +  S  T  +     T PR+   T+ + P+   P  T+TT+T  P+ T 
Sbjct: 439  TTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT 498

Query: 717  G----TTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTS 884
                 TT      T  P+ST  +ST+   T    S    +TS     + R+  +T   TS
Sbjct: 499  PRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTS--TS 556

Query: 885  IPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*----STTA 1052
             P T     T+T      T + P + +    +  + T P  T+ ++ +G T     STT 
Sbjct: 557  GPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTT 616

Query: 1053 PLPSPPATAT---V*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWR 1223
               S P T T     T     P T +  ST              + +   T G  ++  R
Sbjct: 617  TSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPR 676

Query: 1224 ASATAFTQCSWSSPPASCAHWQAS-TCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRV 1400
            ++ T  T    ++ P S      S       R+TTT +    T   P RS T T      
Sbjct: 677  STTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPT 735

Query: 1401 QPPPRMARLTTARAMTS 1451
               PR    T+    T+
Sbjct: 736  TTTPRSTTTTSTSGPTT 752

 Score = 68.2 bits (165), Expect = 4e-10
 Identities = 109/470 (23%), Positives = 161/470 (34%), Gaps = 7/470 (1%)
 Frame = +3

Query: 24   TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAA 203
            TPR+  +       T T  +    S +      P  T    TS   T   PR+  T   +
Sbjct: 706  TPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTT-PRSTTTTSTS 764

Query: 204  SPRTARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMA 383
             P T   P +    +     TT P    T    G    T  +   T+T        R   
Sbjct: 765  GPTTTT-PRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTT 823

Query: 384  RPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFAL 563
              S+        R T++   +  +       PR   T   +  T T+       CT    
Sbjct: 824  TTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPT----TTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRSTTTTCTSGPT 879

Query: 564  RCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAP------CRTSTTTTPTPSGTRGTT 725
              +  S  T  +     T PR+   T  + P+   P      C +  TTT   S T+ +T
Sbjct: 880  TTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTKTST 939

Query: 726  CQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARS-TRPCTSIPATRI 902
            C  +  T  P+ST  +ST+R  T    S     T+T+  P+    RS T P TS P T  
Sbjct: 940  C--APTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRST---TTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTT 994

Query: 903  TCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATAT 1082
               T+T      T + P + +    ++ +PT     S +T T S  +TT P  +   T +
Sbjct: 995  PRSTTTTSTSRPTTTTPRSTT--KTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTS 1052

Query: 1083 V*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSS 1262
                    P T +  ST                        C+SR   +    T  + +S
Sbjct: 1053 -------RPTTTTPRSTTTP---------------------CTSRPTTTTPRSTTTTTTS 1084

Query: 1263 PPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPP 1412
             P +             R+TTT          PTR+ T TR+P    P P
Sbjct: 1085 RPTTTT----------PRSTTTPCPTTTPSASPTRTTT-TRRPCPCHPQP 1123

 Score = 66.2 bits (160), Expect = 1e-09
 Identities = 115/498 (23%), Positives = 173/498 (34%), Gaps = 18/498 (3%)
 Frame = +3

Query: 12   RRP*TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VT 191
            RRP TP+   +  +    T  +      + A+       RT    T W   +       T
Sbjct: 109  RRPTTPKTPDTTDSPITTTGAECTCSDRTTASSTDSTTDRTTVTNTDWTTPLCTDTPPCT 168

Query: 192  LGAAS----PRTARCPTAAV--AAAMRRRRTTRPPRARTGWG---PGAAAATTGALRWTT 344
                S    P +    T+ V   +   +  TT  P   T      P   A TT   R TT
Sbjct: 169  CSEESSTAIPSSPCIDTSTVIPTSPCTQETTTPTPTCSTQGTQTTPCTCAQTTTTPRSTT 228

Query: 345  TRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS 524
            T   +        RP++   +   T  TS     +           PR T   TT   T+
Sbjct: 229  TTSTS--------RPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTT-----------PRSTTTTTTRRPTT 269

Query: 525  *SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTP 704
             +  C   T     C+ ++           T PR+   T  + P+   P  T+TT+T +P
Sbjct: 270  TTPRCTTTTS---TCAPTT-----------TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRCTTTTSTCSP 315

Query: 705  SGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRP-CT 881
            + T             P+ST  +ST+R  T         +T+ +  P+    RST   CT
Sbjct: 316  TRTT------------PRSTTTTSTSRPTTTTPRCTTTPSTTCTRRPTTTTPRSTTTTCT 363

Query: 882  SIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST----*STT 1049
            S P T     T+T C    T + P + +    +  + T P  T+ ++ +G T     STT
Sbjct: 364  SGPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTT 423

Query: 1050 APLPSPPATAT---V*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRW 1220
                S P T T     T     P T +  ST              + +   T G  ++  
Sbjct: 424  TTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTP 483

Query: 1221 RASATAFTQCSWSSPPASCAHWQAS-TCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYR 1397
            R++ T  T    ++ P S      S       R+TTT +    T   P RS T T     
Sbjct: 484  RSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGP 542

Query: 1398 VQPPPRMARLTTARAMTS 1451
                PR    T+    T+
Sbjct: 543  TTTTPRSTTTTSTSGPTT 560

 Score = 63.9 bits (154), Expect = 7e-09
 Identities = 98/402 (24%), Positives = 139/402 (34%), Gaps = 78/402 (19%)
 Frame = +3

Query: 480  RPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPR----------- 626
            RP+ T R T  T+        W T+ A + +     T+R+  RR T P+           
Sbjct: 72   RPKSTRRTTKRTKRPRRKTTKWTTKRATKRT-----TKRTTRRRPTTPKTPDTTDSPITT 126

Query: 627  -----------------------TLQRTAWTWPSC------------------------- 662
                                   T+  T WT P C                         
Sbjct: 127  TGAECTCSDRTTASSTDSTTDRTTVTNTDWTTPLCTDTPPCTCSEESSTAIPSSPCIDTS 186

Query: 663  ----RAPCRTSTTTTPTPS----GTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGI 818
                 +PC T  TTTPTP+    GT+ T C  +  T  P+ST  +ST+R  T    S   
Sbjct: 187  TVIPTSPC-TQETTTPTPTCSTQGTQTTPCTCAQTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTT 245

Query: 819  WATSTSLVPSGRAARST---RPCTSIP---ATRITCLTSTV---CG*WATRSLPAAVSWC 971
              TS     + R+  +T   RP T+ P    T  TC  +T         T S P   +  
Sbjct: 246  TTTSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPR 305

Query: 972  PITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCC-APGTASAASTCWALA 1148
              T+ S   P RT+  + T  T ST+ P  + P   T  +  C   P T +  ST     
Sbjct: 306  CTTTTSTCSPTRTTPRSTT--TTSTSRPTTTTPRCTTTPSTTCTRRPTTTTPRSTTTTCT 363

Query: 1149 C*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQAS-TCKWMARTTT 1325
                     + +  CT G  ++  R++ T  T    ++ P S      S       R+TT
Sbjct: 364  SGPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTT 423

Query: 1326 TVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMTS 1451
            T +    T   P RS T T         PR    T+    T+
Sbjct: 424  TTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTT 464

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 9.9
 Identities = 14/30 (46%), Positives = 16/30 (52%)
 Frame = -2

Query: 369  LPDTPDAWSSSTAAPQLLPPPPQAPSPSWP 280
            +P  P+ W      PQ LPPP   PSP WP
Sbjct: 1158 MPGYPNQWPQLPGYPQQLPPP--LPSPQWP 1185

>ref|XP_039877.6| similar to Mucin 5B precursor (Mucin 5 subtype B, tracheobronchial)
            (High molecular weight salivary mucin MG1) (Sublingual
            gland mucin) [Homo sapiens]
          Length = 5858

 Score = 70.1 bits (170), Expect = 1e-10
 Identities = 114/443 (25%), Positives = 168/443 (37%), Gaps = 8/443 (1%)
 Frame = +3

Query: 72   TQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTAAVAAAM 251
            T TA   AS  TG+   P  T    T+W +T     A VT+   S  TA    A      
Sbjct: 4521 TTTATTTAS--TGSTATPSST--PGTTWILTEPSTTATVTVPTGSTATASSTQATAGTPH 4576

Query: 252  RRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTS 431
                 T P    +   P ++  T  AL    +      A  + A PSS ++    TRL+ 
Sbjct: 4577 VSTTATTPTVTSSKATPSSSPGTATALPALRSTATTPTATSFTAIPSS-SLGTTWTRLSQ 4635

Query: 432  SAVG-ASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*R 608
            +    A+ S  +    P    T    T T T+        T  +   ++ + +   +   
Sbjct: 4636 TTTPTATMSTATPSSTPETVHTSTVLTATATTTGATGSVATPSSTPGTAHTTKVPTTTTT 4695

Query: 609  RWTQ-PRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTR 785
             +T  P +   TA T P   +   T TTTTPT SG+  T       + +P +T    T R
Sbjct: 4696 GFTATPSSSPGTALTPPVWISTTTTPTTTTPTTSGSTVTP------SSIPGTT---HTAR 4746

Query: 786  ACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARS-TRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAV 962
              T  + +    AT +   PS     S T P  +  AT IT   ST        S P   
Sbjct: 4747 VLTTTTTTV---ATGSMATPSSSTQTSGTPPSLTTTATTITATGSTT----NPSSTPGTT 4799

Query: 963  SWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTCWA 1142
               P+ +++ T PA TS    + S+  T   LP   +TAT  TA    P  +S   T W 
Sbjct: 4800 PITPVLTSTATTPAATSSKATSSSSPRTATTLPVLTSTATKSTATSFTPIPSSTLWTTWT 4859

Query: 1143 LAC*LLKAPLCAVSRLCTCGC-----CSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKW 1307
            +       P+  +S + T         S+    +AT     + ++ P+S       T + 
Sbjct: 4860 VPA-QTTTPMSTMSTIHTSSTPETTHTSTVLTTTATMTRATNSTATPSS----TLGTTRI 4914

Query: 1308 MARTTTTVTVMRATMQMPTRSAT 1376
            +   TTT T   AT    T S+T
Sbjct: 4915 LTELTTTATTTAATGSTATLSST 4937

 Score = 60.8 bits (146), Expect = 6e-08
 Identities = 110/470 (23%), Positives = 166/470 (34%), Gaps = 18/470 (3%)
 Frame = +3

Query: 78   TAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTAAVAAAMRR 257
            T     + +TG+   P  T    T+W +T     A VT+   S  TA    A        
Sbjct: 3793 TTTATTTESTGSTATPSST--PGTTWILTEPSTTATVTVPTGSTATASSTQATAGTPHVS 3850

Query: 258  RRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTSSA 437
               T P    +   P ++  T  AL    +      A  + A PSS ++    TRL+ + 
Sbjct: 3851 TTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTATSFTAIPSS-SLGTTWTRLSQTT 3909

Query: 438  VGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWT 617
                           P  T+   T + T  + +    T   L  ++++ R   S+    +
Sbjct: 3910 T--------------PTATMSTATPSSTPETAH----TSTVLTTTATTTRATGSVATPSS 3951

Query: 618  QPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTW 797
             P T   T       + P  T+T  T TPS + GT      RTP      W STT   T 
Sbjct: 3952 TPGTAHTT-------KVPTTTTTGFTVTPSSSPGTA-----RTPPV----WISTTTTPTT 3995

Query: 798  ASASCG------------IWATSTSLVPSGRAAR---STRPCTSIPATRITCLTSTVCG* 932
            + ++              +  T+T+ V +G  A    ST+   + P+   T  T T  G 
Sbjct: 3996 SGSTVTPSSVPGTTHTPTVLTTTTTTVATGSMATPSSSTQTSGTPPSLITTATTITATGS 4055

Query: 933  WAT-RSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAP 1109
                 S P      P+ + + T PA TS +    S   TT   P P  TAT       +P
Sbjct: 4056 TTNPSSTPGTTPIPPVLTTTATTPAATSSTVTPSSALGTTHTPPVPNTTATT-HGRSLSP 4114

Query: 1110 GTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQ 1289
             +     T W  A     +     + +      +S   A+ T  TQ   S+P  S  H  
Sbjct: 4115 SSPHTVRTAWTSA----TSGTLGTTHITEPSTGTSHTPAATTGTTQ--HSTPALSSPHPS 4168

Query: 1290 ASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSAT--RTRQPYRVQPPPRMARLTT 1433
            + T +      TT           T +AT  +TR    +   P  A +TT
Sbjct: 4169 SRTTESPPSPGTTTPGHTTATSRTTATATPSKTRTSTLLPSSPTSAPITT 4218

 Score = 60.1 bits (144), Expect = 1e-07
 Identities = 122/469 (26%), Positives = 176/469 (37%), Gaps = 13/469 (2%)
 Frame = +3

Query: 78   TAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTAAVAAAMRR 257
            T     + +TG+   P  T    T+W +T     A VT+   S  TA    A        
Sbjct: 2591 TTTATTTESTGSTATPSST--PGTTWILTEPSTTATVTVPTGSTATASSTQATAGTPHVS 2648

Query: 258  RRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRL---T 428
               T P    +   P ++  T  AL    +      A  + A PSS ++    TRL   T
Sbjct: 2649 TTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTATSFTAIPSS-SLGTTWTRLSQTT 2707

Query: 429  SSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*R 608
            +     S +  S         T+  TT T T            ++   SS+  T  +   
Sbjct: 2708 TPTATMSTATPSSTPETVHTSTVLTTTATTTG--------ATGSVATPSSTPGTAHT--- 2756

Query: 609  RWTQPRTLQRTAWTWPSCRAP--CRT-----STTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST* 767
              T+  T   T +T     +P   RT     STTTTPT   TRG+T   S    +P +T 
Sbjct: 2757 --TKVLTTTTTGFTATPSSSPGTARTLPVWISTTTTPT---TRGSTVTPS---SIPGTT- 2807

Query: 768  WSSTTRACTWASASCGIWAT-STSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATR 944
             + T    T  + + G  AT S+S   SG     T   T+I AT  T   S+  G   T 
Sbjct: 2808 HTPTVLTTTTTTVATGSMATPSSSTQTSGTPPSLTTTATTITATGSTTNPSSTPG---TT 2864

Query: 945  SLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASA 1124
             +P      P+ + + T PA TS +    S   TT   P P  TAT       +P +   
Sbjct: 2865 PIP------PVLTTTATTPAATSSTVTPSSALGTTHTPPVPNTTATT-HGRSLSPSSPHT 2917

Query: 1125 ASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCK 1304
              T W  A     +     + +      +S   A+ T  TQ   S+P  S  H  + T +
Sbjct: 2918 VRTAWTSA----TSGTLGTTHITEPSTGTSHTPAATTGTTQ--HSTPALSSPHPSSRTTE 2971

Query: 1305 W-MARTTTTVTVMRATMQ-MPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAM 1445
               +  TTT    RAT +   T + ++TR    +   P  A +TT   M
Sbjct: 2972 SPPSPGTTTPGHTRATSRTTATATPSKTRTSTLLPSSPTSAPITTVVTM 3020

 Score = 55.5 bits (132), Expect = 2e-06
 Identities = 106/430 (24%), Positives = 150/430 (34%), Gaps = 19/430 (4%)
 Frame = +3

Query: 213  TARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPS 392
            T    T + A       T  PP+  T     + A T  A     T   + R A  +   +
Sbjct: 3152 TTTATTGSTAIPSSTPGTAPPPKVLT-----STATTPTATSSKATSSSSPRTATTLPVLT 3206

Query: 393  SRAVKLAATRLT---SSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFAL 563
            S A K  AT  T   S  +G + +       P    T  AT  T    S      T   L
Sbjct: 3207 STATKSTATSFTPIPSFTLGTTGT------LPEQTTTPMATMSTIHPSSTPETTHTSTVL 3260

Query: 564  RCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPT--PSGTRGTTCQ*S 737
               +++ R   SM    + P +   T W          T+  T PT  PS T GTT    
Sbjct: 3261 TTKATTTRATSSM----STPSSTPGTTWILTELTTAATTTAATGPTATPSSTPGTTW--I 3314

Query: 738  LRTPLPQST*W----SSTTRACTWASASCGIWATSTSLVP---SGRAARSTRP--CTSIP 890
            L  P   +T      S+ T + T A+A      TST+  P   S RA  S+ P   T++P
Sbjct: 3315 LTEPSTTATVTVPTGSTATASSTRATAGTLKVLTSTATTPTVISSRATPSSSPGTATALP 3374

Query: 891  ATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPIT-SASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSP 1067
            A R T  T T     A  S     +W  ++ + +PT    T+  ++T  T  T+  L + 
Sbjct: 3375 ALRSTATTPTATSVTAIPSSSLGTAWTRLSQTTTPTATMSTATPSSTPETVHTSTVLTTT 3434

Query: 1068 P----ATATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASAT 1235
                 AT +V T     PGTA                P  +     T       W ++ T
Sbjct: 3435 TTTTRATGSVATP-SSTPGTAHTTKVPTTTTTGFTATPSSSPGTALT----PPVWISTTT 3489

Query: 1236 AFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPR 1415
              T    +  P+S       T       TTT T +         S+T+T       P P 
Sbjct: 3490 TPTTRGSTVTPSSIP----GTTHTATVLTTTTTTVATGSMATPSSSTQTSGTTHTPPVPN 3545

Query: 1416 MARLTTARAM 1445
                T  R++
Sbjct: 3546 TTATTHGRSL 3555

 Score = 54.3 bits (129), Expect = 5e-06
 Identities = 78/280 (27%), Positives = 115/280 (40%), Gaps = 16/280 (5%)
 Frame = +3

Query: 669  PCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSST----TRACTWASASCGIWATSTS 836
            P   +T++T TPS T GTT    L  P   +T  +ST    T   T  +A      T+T+
Sbjct: 2037 PSTPATSSTATPSSTPGTTW--ILTKPTTTATTTASTGSTATPTSTLRTAPPPKVLTTTA 2094

Query: 837  LVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSAS-PTLPARTS 1013
              P+  ++++T   +   AT +  L ST        + P A S  PI S+S  T   R S
Sbjct: 2095 TTPTVTSSKATPSSSPGTATALPALRSTA-------TTPTATSVTPIPSSSLGTTWTRLS 2147

Query: 1014 HSTATGST*STTAPLPSPPA--TATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSR 1187
             +T   +T ST  P  +P    T+TV TA     G   + +T  +       A    V  
Sbjct: 2148 QTTTPTATMSTATPSSTPETAHTSTVLTATATTTGATGSVATPSSTPG---TAHTTKVPT 2204

Query: 1188 LCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSS---------PPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVM 1340
              T G  ++   +  TA T   W S            + +    +T      TTTT TV 
Sbjct: 2205 TTTTGFTATPSSSPGTALTPPVWISTTTTPTTRGSTVTPSSIPGTTHTATVLTTTTTTVA 2264

Query: 1341 RATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
              +M  P+ S+T+T        PP +   TTA  +T+  S
Sbjct: 2265 TGSMATPS-SSTQTS-----GTPPSLT--TTATTITATGS 2296

 Score = 53.1 bits (126), Expect = 1e-05
 Identities = 75/285 (26%), Positives = 112/285 (38%), Gaps = 8/285 (2%)
 Frame = +3

Query: 300  PGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRP 479
            P   A TT +   T T     R A     P  + +   AT  T ++  A+ S  S     
Sbjct: 2061 PTTTATTTASTGSTATPTSTLRTA-----PPPKVLTTTATTPTVTSSKATPS--SSPGTA 2113

Query: 480  RPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPS 659
               P LR+T  T T+ S      +      +  S  T  +       P +   TA T   
Sbjct: 2114 TALPALRSTATTPTATSVTPIPSSSLGTTWTRLSQTTTPTATMSTATPSSTPETAHTSTV 2173

Query: 660  CRAPCRTS--TTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATST 833
              A   T+  T +  TPS T GT    + + P   +T +++T  +    + +  +W  ST
Sbjct: 2174 LTATATTTGATGSVATPSSTPGTAH--TTKVPTTTTTGFTATPSSSPGTALTPPVWI-ST 2230

Query: 834  SLVPSGRAAR---STRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPA 1004
            +  P+ R +    S+ P T+  AT +T  T+TV    AT S+    S    +   P+L  
Sbjct: 2231 TTTPTTRGSTVTPSSIPGTTHTATVLTTTTTTV----ATGSMATPSSSTQTSGTPPSLTT 2286

Query: 1005 RTSHSTATGST---*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAAS 1130
              +  TATGST    ST    P PP   T  T       T + +S
Sbjct: 2287 TATTITATGSTTNPSSTPGTTPIPPVLTTTATTPAATSNTVTPSS 2331

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 3e-05
 Identities = 121/525 (23%), Positives = 185/525 (35%), Gaps = 72/525 (13%)
 Frame = +3

Query: 75   QTAMRRASRATGARRLPCRTR------QQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTAA 236
            QT     +  TG+  +P  T       +  TS A T     +  T  ++SPRTA      
Sbjct: 3147 QTTAATTTATTGSTAIPSSTPGTAPPPKVLTSTATTPTATSSKAT-SSSSPRTATTLPVL 3205

Query: 237  VAAAMRR--------------------RRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQ 356
             + A +                      +TT P    +   P +   TT      TT+  
Sbjct: 3206 TSTATKSTATSFTPIPSFTLGTTGTLPEQTTTPMATMSTIHPSSTPETTHTSTVLTTKAT 3265

Query: 357  AYRAARWMARPSSR------AVKLAATRLTSSAVG----ASRS**SCFRRPRPRPTLRAT 506
              RA   M+ PSS         +L     T++A G     S +  + +    P  T   T
Sbjct: 3266 TTRATSSMSTPSSTPGTTWILTELTTAATTTAATGPTATPSSTPGTTWILTEPSTTATVT 3325

Query: 507  TGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTST 686
              T ++ +      T   L+  +S+  T   +  R T P +   TA   P+ R+   T T
Sbjct: 3326 VPTGSTATASSTRATAGTLKVLTSTATTPTVISSRAT-PSSSPGTATALPALRSTATTPT 3384

Query: 687  TTTPT--PSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACT--WASASCGIWATSTSLVPSGR 854
             T+ T  PS + GT      +T  P +T  S+ T + T      S  +  T+T+   +G 
Sbjct: 3385 ATSVTAIPSSSLGTAWTRLSQTTTPTAT-MSTATPSSTPETVHTSTVLTTTTTTTRATGS 3443

Query: 855  AAR-----STRPCTSIPATRITCLTSTVCG---------*W-------ATRSLPAAVSWC 971
             A       T   T +P T  T  T+T             W        TR      S  
Sbjct: 3444 VATPSSTPGTAHTTKVPTTTTTGFTATPSSSPGTALTPPVWISTTTTPTTRGSTVTPSSI 3503

Query: 972  PITSASPTLPARTSHSTATGS---------T*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASA 1124
            P T+ + T+   T+ + ATGS         T  TT   P P  TAT        P +   
Sbjct: 3504 PGTTHTATVLTTTTTTVATGSMATPSSSTQTSGTTHTPPVPNTTATT-HGRSLPPSSPHT 3562

Query: 1125 ASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCK 1304
              T W  A     + +   + +      +S   A+ T+ TQ   S+P  S  H  + T +
Sbjct: 3563 VRTAWTSA----TSGILGTTHITEPSTVTSHTPAATTSTTQ--HSTPALSSPHPSSRTTE 3616

Query: 1305 W--MARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTT 1433
                  TTT       +    T + ++TR    +   P  A +TT
Sbjct: 3617 SPPSPGTTTPGHTRGTSRTTATATPSKTRTSTLLPSSPTSAPITT 3661

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 3e-05
 Identities = 79/297 (26%), Positives = 109/297 (36%), Gaps = 45/297 (15%)
 Frame = +3

Query: 636  RTAWTWP--SCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLP------------------ 755
            RTA T P  +  A   T+T+ TP PS T GTT     +T  P                  
Sbjct: 4399 RTATTLPVLTSTATKSTATSVTPIPSSTLGTTGTLPEQTTTPVATMSTIHPSSTPETTHT 4458

Query: 756  --------------QST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPA 893
                           ST   S+T   TW        AT+T+      A  S+ P T+   
Sbjct: 4459 STVLTTKATTTRATSSTSTPSSTPGTTWILTELTTAATTTA-ATGPTATPSSTPGTTWIL 4517

Query: 894  TRITCLTSTVC--G*WATRSLPAAVSWC---PITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPL 1058
            T +T   +T    G  AT S     +W    P T+A+ T+P   + STAT S+   TA  
Sbjct: 4518 TELTTTATTTASTGSTATPSSTPGTTWILTEPSTTATVTVP---TGSTATASSTQATAGT 4574

Query: 1059 PSPPATATV*TAW------CCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRW 1220
            P    TAT  T          +PGTA+A     + A         A+    + G   +R 
Sbjct: 4575 PHVSTTATTPTVTSSKATPSSSPGTATALPALRSTATTPTATSFTAIPS-SSLGTTWTRL 4633

Query: 1221 RASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQP 1391
              + T     S ++P ++      ST      TTT  T   AT      +A  T+ P
Sbjct: 4634 SQTTTPTATMSTATPSSTPETVHTSTVLTATATTTGATGSVATPSSTPGTAHTTKVP 4690

 Score = 51.2 bits (121), Expect = 5e-05
 Identities = 74/260 (28%), Positives = 108/260 (41%), Gaps = 19/260 (7%)
 Frame = +3

Query: 669  PCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTR--ACTWASASCGIWATSTSLV 842
            P   +T++T TPS T GTT   + +T    +T  + +T   + T  +A      TST+  
Sbjct: 3123 PSTPATSSTATPSSTPGTTWILTEQTTAATTTATTGSTAIPSSTPGTAPPPKVLTSTATT 3182

Query: 843  PSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITS----ASPTLPART 1010
            P+  ++++T   +   AT +  LTST     AT+S   A S+ PI S     + TLP +T
Sbjct: 3183 PTATSSKATSSSSPRTATTLPVLTST-----ATKS--TATSFTPIPSFTLGTTGTLPEQT 3235

Query: 1011 SHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAAS-------TCWALAC*LLKAP 1169
            +   AT ST   ++  P    T+TV T         S+ S       T W L      A 
Sbjct: 3236 TTPMATMSTIHPSS-TPETTHTSTVLTTKATTTRATSSMSTPSSTPGTTWILTELTTAAT 3294

Query: 1170 LCA-----VSRLCTCGCCSSRWRASATA-FTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTV 1331
              A      +   T G        S TA  T  + S+  AS     A T K +  T TT 
Sbjct: 3295 TTAATGPTATPSSTPGTTWILTEPSTTATVTVPTGSTATASSTRATAGTLKVLTSTATTP 3354

Query: 1332 TVMRATMQMPTRSATRTRQP 1391
            TV+ +     +   T T  P
Sbjct: 3355 TVISSRATPSSSPGTATALP 3374

 Score = 50.4 bits (119), Expect = 8e-05
 Identities = 101/384 (26%), Positives = 137/384 (35%), Gaps = 42/384 (10%)
 Frame = +3

Query: 66   TQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARC--PTAAV 239
            T T +    +S    A  LP   R   T+   T   P    +LG    R ++   PTA +
Sbjct: 2098 TVTSSKATPSSSPGTATALPA-LRSTATTPTATSVTPIPSSSLGTTWTRLSQTTTPTATM 2156

Query: 240  AAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAAT 419
            + A     ++ P  A T     A A TTGA     T       A     P++      AT
Sbjct: 2157 STATP---SSTPETAHTSTVLTATATTTGATGSVATPSSTPGTAHTTKVPTTTTTGFTAT 2213

Query: 420  RLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*---SHYCCWCTRFALRCSSSSWRT 590
              +S     +      +      PT R +T T +S    +H     T      ++ S  T
Sbjct: 2214 PSSSPGTALTPP---VWISTTTTPTTRGSTVTPSSIPGTTHTATVLTTTTTTVATGSMAT 2270

Query: 591  RRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*W 770
              S  +    P +L  TA T         T+T +T  PS T GTT       P+P     
Sbjct: 2271 PSSSTQTSGTPPSLTTTATTI--------TATGSTTNPSSTPGTT-------PIPPVLTT 2315

Query: 771  SSTTRACT--WASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCT-SIPATRITCLTSTVCG*WAT 941
            ++TT A T    + S  +  T T  VP+  A    R    S P T  T  TS   G   T
Sbjct: 2316 TATTPAATSNTVTPSSALGTTHTPPVPNTMATTHGRSLPPSSPHTVRTAWTSATSGILGT 2375

Query: 942  ----------------------RSLPAAVSWCPI--TSASPTLPARTS--HSTATGST*S 1043
                                   S PA  S  P   T+ SP  P  T+  H+TAT  T +
Sbjct: 2376 THITEPSTVTSHTLAATTGTTQHSTPALSSPHPSSRTTESPPSPGTTTPGHTTATSRTTA 2435

Query: 1044 TTAP--------LPSPPATATV*T 1091
            T  P        LPS P +A + T
Sbjct: 2436 TATPSKTRTSTLLPSSPTSAPITT 2459

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 2e-04
 Identities = 62/212 (29%), Positives = 76/212 (35%), Gaps = 1/212 (0%)
 Frame = +3

Query: 744  TPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTV 923
            TP   ST   S+T   TW        AT+T    S     ST   T I     T  T TV
Sbjct: 3770 TPATSSTATPSSTPGTTWILTKLTTTATTTESTGSTATPSSTPGTTWILTEPSTTATVTV 3829

Query: 924  -CG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWC 1100
              G  AT S   A +  P  S + T P  TS      S+  T   LP+  +TAT  TA  
Sbjct: 3830 PTGSTATASSTQATAGTPHVSTTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTATS 3889

Query: 1101 CAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCA 1280
                 +S+  T W              +RL      S     +AT  T    S+P     
Sbjct: 3890 FTAIPSSSLGTTW--------------TRL------SQTTTPTATMSTATPSSTP----- 3924

Query: 1281 HWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSAT 1376
                 T       TTT T  RAT  + T S+T
Sbjct: 3925 ----ETAHTSTVLTTTATTTRATGSVATPSST 3952

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 2e-04
 Identities = 81/297 (27%), Positives = 115/297 (38%), Gaps = 17/297 (5%)
 Frame = +3

Query: 621  PRTLQRTAW--TWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST----*WSSTT 782
            P +   T W  T  +  A    ST +T TPS T GTT    L  P   +T      S+ T
Sbjct: 2577 PSSTPGTTWILTELTTTATTTESTGSTATPSSTPGTTW--ILTEPSTTATVTVPTGSTAT 2634

Query: 783  RACTWASASCGIWAT--STSLVPSGRAARSTRP--CTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSL 950
             + T A+A     +T  +T  V S +A   + P   T++PA R T  T T     A  S 
Sbjct: 2635 ASSTQATAGTPHVSTTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTATSFTAIPSS 2694

Query: 951  PAAVSW-------CPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAP 1109
                +W        P  + S   P+ T  +  T +  +TTA   +  AT +V T     P
Sbjct: 2695 SLGTTWTRLSQTTTPTATMSTATPSSTPETVHTSTVLTTTA--TTTGATGSVATP-SSTP 2751

Query: 1110 GTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQ 1289
            GTA                P  +     T       W ++ T  T    +  P+S     
Sbjct: 2752 GTAHTTKVLTTTTTGFTATPSSSPGTARTLPV----WISTTTTPTTRGSTVTPSSI---P 2804

Query: 1290 ASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
             +T      TTTT TV   +M  P+ S+T+T        PP +   TTA  +T+  S
Sbjct: 2805 GTTHTPTVLTTTTTTVATGSMATPS-SSTQTS-----GTPPSLT--TTATTITATGS 2853

 Score = 48.9 bits (115), Expect = 2e-04
 Identities = 81/297 (27%), Positives = 108/297 (36%), Gaps = 33/297 (11%)
 Frame = +3

Query: 669  PCRTSTTTTPTPSGTRGTT------CQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATS 830
            P   +T++T TPS T GTT         +  T    ST   S+T   TW        AT 
Sbjct: 3768 PSTPATSSTATPSSTPGTTWILTKLTTTATTTESTGSTATPSSTPGTTWILTEPSTTATV 3827

Query: 831  TSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WA-----------------TRSLPAA 959
            T    S   A ST+     P    T  T TV    A                 T + P A
Sbjct: 3828 TVPTGSTATASSTQATAGTPHVSTTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTA 3887

Query: 960  VSWCPITSAS-PTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTC 1136
             S+  I S+S  T   R S +T   +T ST  P  S P TA   T       T  A  + 
Sbjct: 3888 TSFTAIPSSSLGTTWTRLSQTTTPTATMSTATP-SSTPETAHTSTVLTTTATTTRATGSV 3946

Query: 1137 WALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSW----SSPPASCAHWQASTCK 1304
               +     A    V    T G   +   +  TA T   W    ++P  S +    S+  
Sbjct: 3947 ATPSSTPGTAHTTKVPTTTTTGFTVTPSSSPGTARTPPVWISTTTTPTTSGSTVTPSSVP 4006

Query: 1305 WMAR-----TTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
                     TTTT TV   +M  P+ S+T+T        PP +  +TTA  +T+  S
Sbjct: 4007 GTTHTPTVLTTTTTTVATGSMATPS-SSTQTS-----GTPPSL--ITTATTITATGS 4055

 Score = 47.8 bits (112), Expect = 5e-04
 Identities = 43/133 (32%), Positives = 52/133 (38%), Gaps = 1/133 (0%)
 Frame = +3

Query: 744  TPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTV 923
            TP   ST   S+T   TW        AT+T    S     ST   T I     T  T TV
Sbjct: 2568 TPATSSTAMPSSTPGTTWILTELTTTATTTESTGSTATPSSTPGTTWILTEPSTTATVTV 2627

Query: 924  -CG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWC 1100
              G  AT S   A +  P  S + T P  TS      S+  T   LP+  +TAT  TA  
Sbjct: 2628 PTGSTATASSTQATAGTPHVSTTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATTPTATS 2687

Query: 1101 CAPGTASAASTCW 1139
                 +S+  T W
Sbjct: 2688 FTAIPSSSLGTTW 2700

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.062
 Identities = 57/194 (29%), Positives = 79/194 (40%), Gaps = 16/194 (8%)
 Frame = +3

Query: 843  PSGRAARSTRPCTSIPATR--ITCLTSTVC-----G*WATRSLPAAVSWC---PITSASP 992
            PS  A  ST   +S P T   +T LT+T       G  AT S     +W    P T+A+ 
Sbjct: 2566 PSTPATSSTAMPSSTPGTTWILTELTTTATTTESTGSTATPSSTPGTTWILTEPSTTATV 2625

Query: 993  TLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWC------CAPGTASAASTCWALAC* 1154
            T+P   + STAT S+   TA  P    TAT  T          +PGTA+A     + A  
Sbjct: 2626 TVP---TGSTATASSTQATAGTPHVSTTATTPTVTSSKATPFSSPGTATALPALRSTATT 2682

Query: 1155 LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVT 1334
                   A+    + G   +R   + T     S ++P ++      ST       TTT T
Sbjct: 2683 PTATSFTAIPS-SSLGTTWTRLSQTTTPTATMSTATPSSTPETVHTSTV-----LTTTAT 2736

Query: 1335 VMRATMQMPTRSAT 1376
               AT  + T S+T
Sbjct: 2737 TTGATGSVATPSST 2750

 Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.24
 Identities = 70/257 (27%), Positives = 99/257 (38%), Gaps = 18/257 (7%)
 Frame = +3

Query: 744  TPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTV 923
            TP   ST   S+T   TW        AT+T+   S  A  S+ P T+ P   +T   +T 
Sbjct: 4327 TPATSSTAMPSSTPGTTWILTELTTTATTTASTGS-TATPSSTPGTAPPPKVLTSPATT- 4384

Query: 924  CG*WATRSLPAAVSWCPITSASP----TLPARTS---HSTAT------GST*STTAPLPS 1064
                     P A S    +S+SP    TLP  TS    STAT       ST  TT  LP 
Sbjct: 4385 ---------PTATSSKATSSSSPRTATTLPVLTSTATKSTATSVTPIPSSTLGTTGTLPE 4435

Query: 1065 PPAT--ATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRAS--A 1232
               T  AT+ T    +    +  ST         +A     +   T G   + W  +   
Sbjct: 4436 QTTTPVATMSTIHPSSTPETTHTSTVLTTKATTTRATSSTSTPSSTPG---TTWILTELT 4492

Query: 1233 TAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKW-MARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYRVQPP 1409
            TA T  + + P A+ +    +T  W +   TTT T   +T    T S+T     + +  P
Sbjct: 4493 TAATTTAATGPTATPSSTPGTT--WILTELTTTATTTASTGSTATPSST-PGTTWILTEP 4549

Query: 1410 PRMARLTTARAMTSLSS 1460
               A +T     T+ +S
Sbjct: 4550 STTATVTVPTGSTATAS 4566

>gb|AAK61485.1| glycoprotein gp2 [Equine herpesvirus 1]
          Length = 826

 Score = 69.7 bits (169), Expect = 1e-10
 Identities = 76/266 (28%), Positives = 110/266 (40%), Gaps = 6/266 (2%)
 Frame = +3

Query: 681  STTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGI-WATSTSLVPSGRA 857
            +TTTTPT S T  TT   +   P   +T  + TT A T A  +     ATST    +  +
Sbjct: 108  TTTTTPTASTTTPTT---TTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTS 164

Query: 858  ARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST 1037
              +T   T++P T  T   +T        +  AA +    T+A+ T  A T+ +T T +T
Sbjct: 165  TTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT 224

Query: 1038 *S--TTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCS 1211
             S  TTA   S   TA   TA      T +AA+T  A           A +   T    +
Sbjct: 225  TSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT--TAATTTAATTTAATTTAAT 282

Query: 1212 SRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQP 1391
            +    +  + T  S S+  AS +   AST    A  T+T T   AT   PT ++  T   
Sbjct: 283  TTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTAT-SATPTSTSTSAAATTSTPTPTSAATSAE 341

Query: 1392 YRVQPP---PRMARLTTARAMTSLSS 1460
               + P   P     T + A T+ +S
Sbjct: 342  STTEAPTSTPTTDTTTPSEATTATTS 367

 Score = 66.2 bits (160), Expect = 1e-09
 Identities = 96/361 (26%), Positives = 131/361 (35%), Gaps = 2/361 (0%)
 Frame = +3

Query: 57   AAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTAA 236
            + +T+T T    AS  T        T    T+   T A   A  T   A+  +    T  
Sbjct: 103  STSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTP 162

Query: 237  VAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLAA 416
             +       TT P  A T      AA TT A   TTT      AA   A  ++ A   AA
Sbjct: 163  TSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAA---TTT------AATTTAATTTAATTTAA 213

Query: 417  TRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTRR 596
            T   ++   A+ S               ATT   TS +      T      ++++  T  
Sbjct: 214  TTTAATTTAATTS--------------SATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTT 259

Query: 597  SM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSS 776
            +             TA T  +      T+T  T T S T G+T      T  P +    S
Sbjct: 260  A-----ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSA----S 310

Query: 777  TTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVC-G*WATRSLP 953
            T  + T  S S    AT+++  P+  AA S    T  P +  T  T+T      AT S  
Sbjct: 311  TATSATPTSTSTSAAATTSTPTPTS-AATSAESTTEAPTSTPTTDTTTPSEATTATTSPE 369

Query: 954  AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPG-TASAAS 1130
            +       TSA+ T     SH++   ST ST+   PS   T T  TA       T S+AS
Sbjct: 370  STTVSASTTSATTTAFTTESHTSPDSSTGSTSTAEPSSTFTLTPSTATPSTDQFTGSSAS 429

Query: 1131 T 1133
            T
Sbjct: 430  T 430

 Score = 58.2 bits (139), Expect = 4e-07
 Identities = 95/390 (24%), Positives = 149/390 (37%), Gaps = 17/390 (4%)
 Frame = +3

Query: 264  TTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAA----RWMARPSSRAVKLAATRLTS 431
            TT    + +G G   ++ TT +    TT      ++       + PSS + + ++T  TS
Sbjct: 28   TTTSSSSTSGSGQSTSSGTTNSSSSPTTSPPTTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATS 87

Query: 432  SAVGASRS**SCF------RRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTR 593
            S+  ++ S  +              PT   TT T T+ +      T      +S+S  T 
Sbjct: 88   SSAPSTASSTTSIPTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETT 147

Query: 594  RSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WS 773
                       T   TA + P+   P  TSTTTT     T  TT       P   ST   
Sbjct: 148  -----------TATATATSTPTTTTP--TSTTTT-----TATTT------VPTTASTTTD 183

Query: 774  STTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLP 953
            +TT A T A+ +     T+ +   +   A +T   T+  AT  +  T+       + +  
Sbjct: 184  TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAAT----TSSATT 239

Query: 954  AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAAST 1133
            AA +    T+A+ T  A T+ +T T +T  TTA   +   T    T      G+ ++ ST
Sbjct: 240  AATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT--TTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGST 297

Query: 1134 CWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMA 1313
                A     +   A S   T    S+   A+AT  T    S+  ++ +  +A T     
Sbjct: 298  STTGASTSTPSASTATSATPT----STSTSAAATTSTPTPTSAATSAESTTEAPTSTPTT 353

Query: 1314 RTTT-------TVTVMRATMQMPTRSATRT 1382
             TTT       T +    T+   T SAT T
Sbjct: 354  DTTTPSEATTATTSPESTTVSASTTSATTT 383

 Score = 53.5 bits (127), Expect = 9e-06
 Identities = 89/380 (23%), Positives = 136/380 (35%), Gaps = 13/380 (3%)
 Frame = +3

Query: 42   SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTAR 221
            SG++ ++ T   ++    S  T +   P  T     S   T +   A     +++P TA 
Sbjct: 38   SGQSTSSGTTNSSSSPTTSPPTTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTA--ATSSSAPSTAS 95

Query: 222  CPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRA 401
              T+   +      TT P  + T      AA TT A     T   +  A    A  ++ +
Sbjct: 96   STTSIPTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATS 155

Query: 402  VKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSS 581
                 T  +++   A+ +       P    T   TT   T+ +      T  A   ++++
Sbjct: 156  TPTTTTPTSTTTTTATTT------VPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT 209

Query: 582  WRTRRSM*RRWTQPRTLQRT--AWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLP 755
                 +     T   T   T  A T  +  A   T+ TTT   +    TT   +      
Sbjct: 210  TTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTT 269

Query: 756  QST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*W 935
             +T  ++TT A T  +A+     TS S   +G +  +    T+  AT  +  TS      
Sbjct: 270  AATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSATPTSTSTSAA---- 325

Query: 936  ATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSH-----------STATGST*STTAPLPSPPATAT 1082
            AT S P   S    TSA  T  A TS            +TAT S  STT    +  AT T
Sbjct: 326  ATTSTPTPTS--AATSAESTTEAPTSTPTTDTTTPSEATTATTSPESTTVSASTTSATTT 383

Query: 1083 V*TAWCCAPGTASAASTCWA 1142
              T        +S  ST  A
Sbjct: 384  AFTTESHTSPDSSTGSTSTA 403

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 3e-05
 Identities = 86/360 (23%), Positives = 125/360 (33%), Gaps = 23/360 (6%)
 Frame = +3

Query: 57   AAATQTQTAMRRASR-ATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPTA 233
            AA+T  +T    A+  +T     P  T    T+ A T     A  T    +  T    T 
Sbjct: 139  AASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTT---TTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATT 195

Query: 234  AVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKLA 413
              A       T     A T       AATT +     T   A  AA   A  ++ A   A
Sbjct: 196  TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTA 255

Query: 414  A--TRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWR 587
            A  T  T++A   + +  +         T   TTG+ TS S      +      S+++  
Sbjct: 256  ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSA 315

Query: 588  TRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTT--CQ*SLRTPLPQS 761
            T  S     T       T+   P+  A    STT  PT + T  TT   + +  T  P+S
Sbjct: 316  TPTS-----TSTSAAATTSTPTPTSAATSAESTTEAPTSTPTTDTTTPSEATTATTSPES 370

Query: 762  T*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WAT 941
            T  S++T + T  + +     +  S   S   A  +   T  P+T             +T
Sbjct: 371  TTVSASTTSATTTAFTTESHTSPDSSTGSTSTAEPSSTFTLTPSTATPSTDQFTGSSAST 430

Query: 942  RSLPAAVSWCP------ITSASPTLPARTSHSTAT------------GST*STTAPLPSP 1067
             S     S  P      IT +S T  A T+  ++T             +T   T P PSP
Sbjct: 431  ESDSTDSSTVPTTGTESITESSSTTEASTNLGSSTYESTEALETPDGNTTSGNTTPSPSP 490

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.18
 Identities = 40/163 (24%), Positives = 67/163 (40%), Gaps = 2/163 (1%)
 Frame = +3

Query: 978  TSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*L 1157
            T+ S +  + +  ST++G+T S+++P  SPP T++           +S ++   + A   
Sbjct: 28   TTTSSSSTSGSGQSTSSGTTNSSSSPTTSPPTTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATS 87

Query: 1158 LKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQAST-CKWMARTTTTVT 1334
              AP  A          SS      +  T+ + ++P AS      +T     A TTT VT
Sbjct: 88   SSAPSTA----------SSTTSIPTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVT 137

Query: 1335 VMRAT-MQMPTRSATRTRQPYRVQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
               +T  +  T +AT T  P    P        T    T+ S+
Sbjct: 138  TAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTAST 180

>gb|AAK61484.1| glycoprotein gp2 [Equine herpesvirus 1]
          Length = 374

 Score = 69.3 bits (168), Expect = 2e-10
 Identities = 67/261 (25%), Positives = 103/261 (38%), Gaps = 1/261 (0%)
 Frame = +3

Query: 681  STTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGI-WATSTSLVPSGRA 857
            +TTTTPT S T  TT   +   P   +T  + TT A T A  +     ATST    +  +
Sbjct: 108  TTTTTPTASTTTPTT---TTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTS 164

Query: 858  ARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST 1037
              +T   T++P T  T   +T        +  AA +    T+A+ T  A TS +T   +T
Sbjct: 165  TTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATT 224

Query: 1038 *STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSR 1217
             S T    +  AT    T+      T S+A+T    +         A +   T    ++ 
Sbjct: 225  SSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSS--------ATTAATTSSATTAA 276

Query: 1218 WRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQPYR 1397
              +SAT     S ++  A+      +     A TTT  T   AT    T +A  T     
Sbjct: 277  TTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 336

Query: 1398 VQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
               P   +  TT  + ++ S+
Sbjct: 337  TGSPTSGSTSTTGASTSTPSA 357

 Score = 68.2 bits (165), Expect = 4e-10
 Identities = 68/264 (25%), Positives = 106/264 (39%), Gaps = 3/264 (1%)
 Frame = +3

Query: 678  TSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRA 857
            +S+T+    S + GTT   S  T  P +T  S  T   T + +S    ++ST+   S  A
Sbjct: 32   SSSTSGSGQSTSSGTTNSSSSPTTSPPTTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATSSS-A 90

Query: 858  ARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLPAAVSWCPITSASPTL---PARTSHSTAT 1028
              +    TSIP +  T  T+T     A+ + P   +  P T+A+ T     A TS  T T
Sbjct: 91   PSTASSTTSIPTSTSTETTTTTPT--ASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTT 148

Query: 1029 GST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAASTCWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCC 1208
             +  +T+ P  + P + T  TA    P TAS  +     A         A +   T    
Sbjct: 149  ATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 208

Query: 1209 SSRWRASATAFTQCSWSSPPASCAHWQASTCKWMARTTTTVTVMRATMQMPTRSATRTRQ 1388
            ++    +++A T  + SS   +     A+T    +  TT  T   AT    T SAT    
Sbjct: 209  TTTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAAT 268

Query: 1389 PYRVQPPPRMARLTTARAMTSLSS 1460
                      +  TTA   +S ++
Sbjct: 269  TSSATTAATTSSATTAATTSSATT 292

 Score = 67.4 bits (163), Expect = 6e-10
 Identities = 85/349 (24%), Positives = 139/349 (39%), Gaps = 10/349 (2%)
 Frame = +3

Query: 264  TTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAA----RWMARPSSRAVKLAATRLTS 431
            TT    + +G G   ++ TT +    TT      ++       + PSS + + ++T  TS
Sbjct: 28   TTTSSSSTSGSGQSTSSGTTNSSSSPTTSPPTTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATS 87

Query: 432  SAVGASRS**SCF------RRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRCSSSSWRTR 593
            S+  ++ S  +              PT   TT T T+ +      T      +S+S  T 
Sbjct: 88   SSAPSTASSTTSIPTSTSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETT 147

Query: 594  RSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTPLPQST*WS 773
                       T   TA + P+   P  TSTTTT T + T  TT   +  T    +T  +
Sbjct: 148  -----------TATATATSTPTTTTP--TSTTTT-TATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAA 193

Query: 774  STTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRAARSTRPCTSIPATRITCLTSTVCG*WATRSLP 953
            +TT A T A+ +    AT+T+   S     +T    +  AT  +  T+       T +  
Sbjct: 194  TTTAATTTAATTTA--ATTTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATT 251

Query: 954  AAVSWCPITSASPTLPARTSHSTATGST*STTAPLPSPPATATV*TAWCCAPGTASAAST 1133
            ++ +    TS++ T    +S +TA  ++ +TTA   S   TA   TA      T +AA+T
Sbjct: 252  SSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATT 311

Query: 1134 CWALAC*LLKAPLCAVSRLCTCGCCSSRWRASATAFTQCSWSSPPASCA 1280
              A             +   T    +    + +T+ T  S S+P AS A
Sbjct: 312  TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTA 360

 Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.006
 Identities = 67/276 (24%), Positives = 95/276 (34%), Gaps = 9/276 (3%)
 Frame = +3

Query: 57  AAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAAS---------P 209
           + +T+T T    AS  T        T    T+   T A   A  T   A+         P
Sbjct: 103 STSTETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTP 162

Query: 210 RTARCPTAAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARP 389
            +    TA          TT    A T       AATT A   T     A   +      
Sbjct: 163 TSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAA 222

Query: 390 SSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS*SHYCCWCTRFALRC 569
           ++ +   AAT  TSSA  A+ +  +         T  ATT + T+ +      T      
Sbjct: 223 TTSSATTAAT--TSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSS 280

Query: 570 SSSSWRTRRSM*RRWTQPRTLQRTAWTWPSCRAPCRTSTTTTPTPSGTRGTTCQ*SLRTP 749
           ++++  T  +     T   T   TA T  +      T+T  T T + T   T   +  T 
Sbjct: 281 ATTAATTSSATTAATTTAAT--TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTG 338

Query: 750 LPQST*WSSTTRACTWASASCGIWATSTSLVPSGRA 857
            P S   S+T  + +  SAS    AT TS   S  A
Sbjct: 339 SPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSATPTSTSTSAAA 374

 Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.14
 Identities = 47/164 (28%), Positives = 56/164 (33%), Gaps = 2/164 (1%)
 Frame = +3

Query: 24  TPRAA*SGRALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAA 203
           T  A  S    AA T + T     S AT A      T    TS A T A   +  T    
Sbjct: 210 TTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATT 269

Query: 204 SPRTARCPT--AAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARW 377
           S  T    T  A  AA      T     A T       AATT A   TTT      A   
Sbjct: 270 SSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAA--TTTAATTTAATTT 327

Query: 378 MARPSSRAVKLAATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATT 509
            A  ++     + T  ++S  GAS S  S        PT  +T+
Sbjct: 328 AATTTAATTTGSPTSGSTSTTGASTSTPSASTATSATPTSTSTS 371

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.53
 Identities = 37/158 (23%), Positives = 53/158 (33%)
 Frame = +3

Query: 51  ALAAATQTQTAMRRASRATGARRLPCRTRQQRTSWAVTVARPRA*VTLGAASPRTARCPT 230
           A   A  T  A   A+  T A      T    T+   + A   A  +    +  T+   T
Sbjct: 188 ATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATT 247

Query: 231 AAVAAAMRRRRTTRPPRARTGWGPGAAAATTGALRWTTTRHQAYRAARWMARPSSRAVKL 410
           AA  ++     TT              AATT +     T   A  AA   A  ++ A   
Sbjct: 248 AATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTSSATTAATTTAATTTAATTT 307

Query: 411 AATRLTSSAVGASRS**SCFRRPRPRPTLRATTGTRTS 524
           AAT   ++   A+    +         T   TTG+ TS
Sbjct: 308 AATTTAATTTAATT---TAATTTAATTTAATTTGSPTS 342



EST assemble image


clone accession position
1 MXL100c09_r BP098859 1 466
2 MXL009e04_r BP093515 301 795
3 LCL046a05_r AV628710 606 1114
4 MXL056c09_r BP096304 625 912
5 MXL017a02_r BP094013 859 1260
6 CL79a07_r AV397160 871 1377
7 HCL071b04_r AV643522 945 1465
8 HCL038f07_r AV641684 1026 1401
9 LCL041b06_r AV628396 1075 1395




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute