KCC000735A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC000735A_C01 KCC000735A_c01
ggcggacatggaagccgcagacaaggcagcggcggttatggaagaggcgcgcaagcatgt
ggaggcacacaagcagcgacAGCAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA
GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGACAA
ACGGAACCTCTTCCAGCGTCTGCTTGGTGGCTGCTATAGCGGCTTGGGCGCTGACGCCCC
TGGCAGCAGCAGTGACGACGCTCTGCGCGAGCCTATGCCCACAGCCCCTGCCGGCACTGC
TGGTGCGGCGCCCGCCGCCAATGGGCAGATCCGCAGCCATGCGGCCATCCTGACTGACGC
CGCGGTCATCTTCAAGATCGAGCTCGTCGTAGAAGCGGACAAACACAGGATGGCAAAGTC
AGGCGGAGATAGTTCATGCTGCGCTACTGCGGCTGGCTCTTGAAGAGACGCATGCGCTCA
TCGCGCGGATACAGAGTAAGAGCGACACCATGAGGGCGGTTGCGGCAGCCGACCTGATCG
TGGAGTTAAAGGCGGCGGCGGAGTTTCTCGCATATGCGCGTGAACGCATCTGTGAGGCCA
TCA


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC000735A_C01 KCC000735A_c01
         (603 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

gb|AAB05810.1| super cysteine rich protein; SCRP [Homo sapiens]        95  9e-19
ref|NP_800965.1| hypothetical protein VPA1455 [Vibrio parahaemol...    84  1e-15
ref|NP_496274.1| putative protein (15.6 kD) (2K854) [Caenorhabdi...    78  1e-13
gb|AAO52657.1| similar to Dictyostelium discoideum (Slime mold)....    77  1e-13
ref|NP_763435.1| TPR repeat containing protein [Vibrio vulnificu...    77  2e-13

>gb|AAB05810.1| super cysteine rich protein; SCRP [Homo sapiens]
          Length = 46

 Score = 94.7 bits (234), Expect = 9e-19
 Identities = 27/30 (90%), Positives = 27/30 (90%)
 Frame = -1

Query: 183 RLSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 94
           R  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC
Sbjct: 8   RSRCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 94.4 bits (233), Expect = 1e-18
 Identities = 27/29 (93%), Positives = 27/29 (93%)
 Frame = -1

Query: 177 SCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 91
           S CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC
Sbjct: 9   SRCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 94.4 bits (233), Expect = 1e-18
 Identities = 26/29 (89%), Positives = 27/29 (92%)
 Frame = -1

Query: 162 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCR 76
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC +
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCCLK 39

 Score = 94.0 bits (232), Expect = 1e-18
 Identities = 26/27 (96%), Positives = 26/27 (96%)
 Frame = -1

Query: 165 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 85
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 94.0 bits (232), Expect = 1e-18
 Identities = 26/27 (96%), Positives = 26/27 (96%)
 Frame = -1

Query: 168 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 88
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 90.9 bits (224), Expect = 1e-17
 Identities = 26/28 (92%), Positives = 26/28 (92%)
 Frame = -1

Query: 153 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCRCL 70
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC C CL
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCCL 38

 Score = 89.7 bits (221), Expect = 3e-17
 Identities = 25/27 (92%), Positives = 25/27 (92%)
 Frame = -1

Query: 147 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCRCLC 67
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC C C
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 89.4 bits (220), Expect = 4e-17
 Identities = 26/30 (86%), Positives = 26/30 (86%)
 Frame = -1

Query: 189 RFRLSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 100
           R R  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCC
Sbjct: 8   RSRCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCC 37

 Score = 82.0 bits (201), Expect = 6e-15
 Identities = 24/33 (72%), Positives = 26/33 (78%)
 Frame = -1

Query: 135 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCRCLCASTCLRASSI 37
           CCCCCCCCCCCCCCCCCCC C C   CL+ S +
Sbjct: 11  CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCFCCCLKHSKV 43

>ref|NP_800965.1| hypothetical protein VPA1455 [Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633]
           gi|28809857|dbj|BAC62798.1| hypothetical protein [Vibrio
           parahaemolyticus]
          Length = 618

 Score = 84.3 bits (207), Expect = 1e-15
 Identities = 43/65 (66%), Positives = 51/65 (78%)
 Frame = +2

Query: 5   DMEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKR 184
           D EAA K  +V+EE  K  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++
Sbjct: 429 DFEAAKKNLSVVEEKLKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 488

Query: 185 NLFQR 199
              Q+
Sbjct: 489 QQQQQ 493

 Score = 72.8 bits (177), Expect = 4e-12
 Identities = 34/49 (69%), Positives = 42/49 (85%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ  +N
Sbjct: 467 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQN 515

 Score = 72.4 bits (176), Expect = 5e-12
 Identities = 34/47 (72%), Positives = 41/47 (86%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDK 181
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ K
Sbjct: 466 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQK 512

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-12
 Identities = 33/49 (67%), Positives = 43/49 (87%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ +++
Sbjct: 465 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKS 513

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/52 (65%), Positives = 43/52 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQ 196
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q
Sbjct: 463 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQ 514

 Score = 69.7 bits (169), Expect = 3e-11
 Identities = 33/52 (63%), Positives = 42/52 (80%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQ 196
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+ +    Q
Sbjct: 468 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQ 519

 Score = 65.9 bits (159), Expect = 4e-10
 Identities = 31/53 (58%), Positives = 42/53 (78%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+ Q + K+   Q+
Sbjct: 472 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQEQGQQ 524

 Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-08
 Identities = 32/64 (50%), Positives = 42/64 (65%)
 Frame = +2

Query: 8   MEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           +E ADK    + E     EA K+     +++ +QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++ 
Sbjct: 413 LEEADKQYKKLLEENPDFEAAKKNLSVVEEKLKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 472

Query: 188 LFQR 199
             Q+
Sbjct: 473 QQQQ 476

 Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-08
 Identities = 31/57 (54%), Positives = 39/57 (68%), Gaps = 8/57 (14%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ--------QQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+ Q        QQ Q QQD  N
Sbjct: 477 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQEQGQQSQNQQDAEN 533

 Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05
 Identities = 21/48 (43%), Positives = 35/48 (72%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKR 184
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQ+ Q + +Q+Q QQ Q QQ  ++K+
Sbjct: 488 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQEQGQQSQNQQDAENKK 535

 Score = 49.3 bits (116), Expect = 4e-05
 Identities = 21/48 (43%), Positives = 34/48 (70%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKR 184
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQ+ Q + +Q+Q QQ Q QQ  + +
Sbjct: 487 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQEQGQQSQNQQDAENK 534

 Score = 45.1 bits (105), Expect = 8e-04
 Identities = 23/64 (35%), Positives = 38/64 (58%), Gaps = 11/64 (17%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQ-----------QQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQ           QQ Q QQ  + ++++Q+ +  
Sbjct: 484 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSQNRTKQEQGQQSQNQQDAENKKEKQESEHK 543

Query: 188 LFQR 199
             Q+
Sbjct: 544 AKQQ 547

>ref|NP_496274.1| putative protein (15.6 kD) (2K854) [Caenorhabditis elegans]
           gi|7495472|pir||T18975 hypothetical protein C06A1.6 -
           Caenorhabditis elegans gi|3874010|emb|CAA90055.1|
           Hypothetical protein C06A1.6 [Caenorhabditis elegans]
          Length = 152

 Score = 77.8 bits (190), Expect = 1e-13
 Identities = 27/46 (58%), Positives = 27/46 (58%), Gaps = 6/46 (13%)
 Frame = -1

Query: 174 CCCC---CCCCC---CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCRCLCASTC 55
           CCCC   CCCCC   CCC CC  CCC  CC CC  CCC C C   C
Sbjct: 71  CCCCRPRCCCCCRPKCCCTCCRTCCCTRCCTCCRPCCCGCGCGCGC 116

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-12
 Identities = 33/66 (50%), Positives = 33/66 (50%), Gaps = 16/66 (24%)
 Frame = -1

Query: 204 SRRWKRFRLSCCCCCC------CCCCCC---CCCCC---CCCCCC--CCC--CCCCCCRC 73
           S R KR    C CC C      C CCCC   CCCCC   CCC CC  CCC  CC CC  C
Sbjct: 47  SSRVKRNGGCCGCCGCGGGGGGCGCCCCRPRCCCCCRPKCCCTCCRTCCCTRCCTCCRPC 106

Query: 72  LCASTC 55
            C   C
Sbjct: 107 CCGCGC 112

 Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-10
 Identities = 22/37 (59%), Positives = 22/37 (59%)
 Frame = -1

Query: 183 RLSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCRC 73
           R  CCC CC  CCC  CC CC  CCC C C C CC C
Sbjct: 83  RPKCCCTCCRTCCCTRCCTCCRPCCCGCGCGCGCCGC 119

 Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-06
 Identities = 21/42 (50%), Positives = 21/42 (50%), Gaps = 6/42 (14%)
 Frame = -1

Query: 141 CCCCCCC------CCCCCCCCCCCCCCRCLCASTCLRASSIT 34
           CC CC C      C CCCC   CCCCCR  C  TC R    T
Sbjct: 56  CCGCCGCGGGGGGCGCCCCRPRCCCCCRPKCCCTCCRTCCCT 97

>gb|AAO52657.1| similar to Dictyostelium discoideum (Slime mold).
           Phosphatidylinositol phosphate kinase 6 (Fragment)
          Length = 227

 Score = 77.4 bits (189), Expect = 1e-13
 Identities = 37/59 (62%), Positives = 44/59 (73%)
 Frame = +2

Query: 5   DMEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDK 181
           D+   D    +  E +K +  H+Q+QQ QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ +
Sbjct: 64  DINIKDSILIIQGEKKKSIIKHQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 122

 Score = 62.4 bits (150), Expect = 5e-09
 Identities = 27/50 (54%), Positives = 40/50 (80%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNL 190
           ++ ++H +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ +   ++ D+ ++
Sbjct: 86  QQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLENSNKENDEPSI 135

 Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-06
 Identities = 24/52 (46%), Positives = 35/52 (67%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQ 196
           ++  +  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ +   ++  +     F+
Sbjct: 88  QQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLENSNKENDEPSIEEFE 139

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.015
 Identities = 16/49 (32%), Positives = 33/49 (66%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQ +   ++  +   ++ ++D ++
Sbjct: 96  QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLENSNKENDEPSIEEFEEDVKS 144

 Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.025
 Identities = 16/46 (34%), Positives = 31/46 (66%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQD 178
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQ +   ++  +   ++ ++
Sbjct: 95  QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLENSNKENDEPSIEEFEE 140

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.82
 Identities = 14/50 (28%), Positives = 30/50 (60%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNL 190
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQ +   ++  +   ++ ++  + K  L
Sbjct: 99  QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLENSNKENDEPSIEEFEEDVKSKSEL 148

>ref|NP_763435.1| TPR repeat containing protein [Vibrio vulnificus CMCP6]
           gi|27359481|gb|AAO08425.1|AE016813_177 TPR repeat
           containing protein [Vibrio vulnificus CMCP6]
          Length = 650

 Score = 77.0 bits (188), Expect = 2e-13
 Identities = 37/65 (56%), Positives = 51/65 (77%)
 Frame = +2

Query: 5   DMEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKR 184
           +++ A     ++E+A++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++
Sbjct: 429 NLKQAQTNREIVEKAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 488

Query: 185 NLFQR 199
              Q+
Sbjct: 489 QQQQQ 493

 Score = 75.9 bits (185), Expect = 4e-13
 Identities = 37/63 (58%), Positives = 48/63 (75%)
 Frame = +2

Query: 11  EAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNL 190
           E  +KA    ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++  
Sbjct: 438 EIVEKAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 497

Query: 191 FQR 199
            Q+
Sbjct: 498 QQQ 500

 Score = 73.2 bits (178), Expect = 3e-12
 Identities = 36/64 (56%), Positives = 48/64 (74%)
 Frame = +2

Query: 8   MEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           +E A +     ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++ 
Sbjct: 440 VEKAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 499

Query: 188 LFQR 199
             Q+
Sbjct: 500 QQQQ 503

 Score = 72.4 bits (176), Expect = 5e-12
 Identities = 34/47 (72%), Positives = 41/47 (86%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDK 181
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ K
Sbjct: 488 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQK 534

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 482 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQK 534

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-12
 Identities = 34/49 (69%), Positives = 41/49 (83%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ   N
Sbjct: 489 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSN 537

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-12
 Identities = 33/49 (67%), Positives = 43/49 (87%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ +++
Sbjct: 487 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKS 535

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 453 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 505

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 458 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 510

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 452 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 504

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 470 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 522

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 459 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 511

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 460 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 512

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 461 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 513

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 457 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 509

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 456 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 508

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 466 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 518

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 465 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 517

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 467 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 519

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 468 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 520

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 464 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 516

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 469 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 521

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 455 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 507

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 471 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 523

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 472 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 524

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 473 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 525

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 474 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 526

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 475 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 527

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 476 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 528

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 477 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 529

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 481 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 533

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 480 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 532

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 463 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 515

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 479 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 531

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 478 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 530

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 43/53 (80%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++    R
Sbjct: 486 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNR 538

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 462 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 514

 Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-12
 Identities = 34/53 (64%), Positives = 44/53 (82%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 454 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 506

 Score = 69.3 bits (168), Expect = 4e-11
 Identities = 32/49 (65%), Positives = 41/49 (83%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+   R+
Sbjct: 491 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRD 539

 Score = 68.2 bits (165), Expect = 9e-11
 Identities = 32/52 (61%), Positives = 42/52 (80%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQ 196
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+  ++ N  Q
Sbjct: 492 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQ 543

 Score = 63.2 bits (152), Expect = 3e-09
 Identities = 34/64 (53%), Positives = 44/64 (68%)
 Frame = +2

Query: 8   MEAADKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           +EA  KA A     ++     +  ++ +QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++ 
Sbjct: 417 LEAYQKALAKNPNLKQAQTNREIVEKAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 476

Query: 188 LFQR 199
             Q+
Sbjct: 477 QQQQ 480

 Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-08
 Identities = 29/54 (53%), Positives = 40/54 (73%), Gaps = 5/54 (9%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ-----QQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ+      Q Q +++ N
Sbjct: 496 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENREN 549

 Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-06
 Identities = 29/60 (48%), Positives = 39/60 (64%)
 Frame = +2

Query: 20  DKAAAVMEEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRNLFQR 199
           DKA    ++A       KQ Q  ++  ++ +QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ ++   Q+
Sbjct: 414 DKALEAYQKALAKNPNLKQAQTNREIVEKAKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 473

 Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-05
 Identities = 21/49 (42%), Positives = 34/49 (68%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQQQQ+   +  Q Q + +++  N
Sbjct: 504 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENRENAPN 552

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.002
 Identities = 18/47 (38%), Positives = 31/47 (65%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDK 181
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQQQ+   +  Q Q + ++   +K
Sbjct: 507 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENRENAPNK 553

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.043
 Identities = 16/47 (34%), Positives = 29/47 (61%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDK 181
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQQ+   +  Q Q + ++    + K
Sbjct: 509 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENRENAPNKAK 555

 Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.22
 Identities = 14/49 (28%), Positives = 30/49 (60%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQQQQ+   +  Q Q + ++    +  +++
Sbjct: 510 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENRENAPNKAKEKS 558

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 1.4
 Identities = 12/49 (24%), Positives = 29/49 (58%)
 Frame = +2

Query: 41  EEARKHVEAHKQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQDKRN 187
           ++ ++  +  +Q+QQQQQQQQ+   +  Q Q + ++    + +++ + N
Sbjct: 513 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKSSNRDNQSQSENRENAPNKAKEKSQEN 561



EST assemble image


clone accession position
1 LCL008f10_r AV626412 1 448
2 CL58g11_r AV396249 124 603




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute