Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC000691A_C01 KCC000691A_c01
(575 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
dbj|BAB91333.1| chloroplast ppGpp synthase/degradase [Chlamydomo... 226 2e-58
gb|AAQ82688.1| Epa4p [Candida glabrata] 48 1e-04
gb|AAQ82687.1| Epa5p [Candida glabrata] 43 0.004
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major] 43 0.004
ref|NP_872435.1| hypothetical protein FLJ35107 [Homo sapiens] gi... 43 0.004
>dbj|BAB91333.1| chloroplast ppGpp synthase/degradase [Chlamydomonas reinhardtii]
Length = 735
Score = 226 bits (576), Expect = 2e-58
Identities = 116/117 (99%), Positives = 117/117 (99%)
Frame = +3
Query: 225 MAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDD 404
MAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDD
Sbjct: 1 MAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDD 60
Query: 405 WHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
WHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSA+SDASS
Sbjct: 61 WHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAFSDASS 117
>gb|AAQ82688.1| Epa4p [Candida glabrata]
Length = 1416
Score = 47.8 bits (112), Expect = 1e-04
Identities = 42/157 (26%), Positives = 74/157 (46%), Gaps = 6/157 (3%)
Frame = +3
Query: 123 CLPYPL------TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPF 284
C P P ++S+S SSS S+++ SS + S +++ S ++S + S+P P
Sbjct: 319 CEPLPTPSQDINSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPS 378
Query: 285 STKRVPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGS 464
S+ S SS + P P S + S + + + S S+S S +S S
Sbjct: 379 SSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS------SSSSSSSSSSSSSPS 432
Query: 465 PSNTGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
PS++ SS + + +S++ + S +SSS+ SS
Sbjct: 433 PSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSS 469
Score = 33.9 bits (76), Expect = 1.7
Identities = 37/145 (25%), Positives = 65/145 (44%)
Frame = +3
Query: 141 TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSG 320
++S+S SSS S++ PSS + S ++S + S+P P S+ S SS
Sbjct: 358 SSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSS---------SSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSS 408
Query: 321 ALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNV 500
+ S + S + + + S S S S +S S S++ SS + +
Sbjct: 409 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS------------SPSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 456
Query: 501 VMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
+S++ + S +SSS+ S +SS
Sbjct: 457 SSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSSS 481
>gb|AAQ82687.1| Epa5p [Candida glabrata]
Length = 1218
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.004
Identities = 43/163 (26%), Positives = 76/163 (46%), Gaps = 12/163 (7%)
Frame = +3
Query: 123 CLPYPL------TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPF 284
C P P ++S+S SSS S+++ SS + S +++ S ++S + S+P P
Sbjct: 319 CEPLPTPSQDINSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPS 378
Query: 285 STKRVPSGRSSGAL---PVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGR---RR 446
S+ S SS + P P S + S + + + S S+S R
Sbjct: 379 SSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSR 438
Query: 447 SVASGSPSNTGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
S +S S S++ SS + + +S++ + S +SSS+ S +SS
Sbjct: 439 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSS 481
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.018
Identities = 40/149 (26%), Positives = 69/149 (45%)
Frame = +3
Query: 129 PYPLTASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSG 308
P P ++S+S SSS S++ PSS + S S ++S + S+ S+ S
Sbjct: 375 PSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSS-------SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 427
Query: 309 RSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSE 488
SS + P P + S + + + S S+S S +S SPS++ SS
Sbjct: 428 SSSSSSPSPSRSSSSSSSSSSS-----------SSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSS 476
Query: 489 AKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
+ + +S++ + S +SSS+ S +SS
Sbjct: 477 SSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSS 505
Score = 33.5 bits (75), Expect = 2.2
Identities = 39/153 (25%), Positives = 68/153 (43%), Gaps = 8/153 (5%)
Frame = +3
Query: 141 TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSG 320
++S+S SSS S++ PSS + S +++ S ++S + S+P P S+ S SS
Sbjct: 450 SSSSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSS---SSSSSSSSSSSSSSSPSPSSSSSSSSSSSSS 506
Query: 321 ALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNV 500
+ + S + + A D + S++ S S + SPS S +
Sbjct: 507 SPSIQPSSKPVDPSPA----------DPSNNPSSVNPSSVNPSSINSSPSIISPSVSTKT 556
Query: 501 VMASNNVTVGFSV--------GASSSAYSDASS 575
V SN T+ +V G +S++ SD+ S
Sbjct: 557 VTLSNGSTITVTVTVTPTSPNGGNSNSDSDSFS 589
>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
Length = 1325
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.004
Identities = 39/152 (25%), Positives = 70/152 (45%), Gaps = 3/152 (1%)
Frame = +3
Query: 129 PYPLTASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSP---RMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRV 299
P ++SAS S+ S+++ PSS + +P +A S +++P S+ P S+
Sbjct: 671 PSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 730
Query: 300 PSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTG 479
PS SS A P S A + + + S S+S + +S +PS++
Sbjct: 731 PSASSSSA-PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS 789
Query: 480 SSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
S+ + + A ++ + +SSSA S +SS
Sbjct: 790 SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 821
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.030
Identities = 42/152 (27%), Positives = 70/152 (45%), Gaps = 5/152 (3%)
Frame = +3
Query: 135 PLTASASLRVRSSSL--RSNTALPSSKTRSPRMA---ATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRV 299
P +S+S SSS S+++ PSS + +P + A S +++P S+ P S+
Sbjct: 823 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 882
Query: 300 PSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTG 479
PS SS A P S + S + + A S S+S S +S +PS +
Sbjct: 883 PSASSSSA-PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP------SASSSSAPSSSSSSAPSASS 935
Query: 480 SSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
SS + ++ + + + +SSSA S +SS
Sbjct: 936 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 967
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.067
Identities = 40/152 (26%), Positives = 67/152 (43%), Gaps = 5/152 (3%)
Frame = +3
Query: 135 PLTASASLRVRSSSL--RSNTALPSSKTRSPRMA---ATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRV 299
P +S+S SSS S+++ PSS + +P + A S +++P S+ P S+
Sbjct: 808 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 867
Query: 300 PSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTG 479
PS SS A S S + A + S S+S S +S +PS +
Sbjct: 868 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP--------SASSSSAPSSSSSSAPSASS 919
Query: 480 SSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
SS + ++ + + + +SSS+ ASS
Sbjct: 920 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 951
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.15
Identities = 41/153 (26%), Positives = 67/153 (42%), Gaps = 6/153 (3%)
Frame = +3
Query: 135 PLTASASLRVRSSSL--RSNTALPSSKTRSPRM----AATYSLATSPLTRSTPIPFSTKR 296
P +S+S SSS S+++ PSS + +P A + S +++P S+ P S+
Sbjct: 947 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1006
Query: 297 VPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNT 476
PS SS A P S + A + + + S+S S +S S ++
Sbjct: 1007 APSASSSSA---PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS 1063
Query: 477 GSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
SS A + +S + +SSSA S +SS
Sbjct: 1064 SSSSAPSASSSS-------APSSSSSAPSASSS 1089
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.20
Identities = 39/151 (25%), Positives = 66/151 (42%), Gaps = 6/151 (3%)
Frame = +3
Query: 141 TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSG 320
+AS+S SSS + +A SS S A + S +++P + S+ S+ PS SS
Sbjct: 932 SASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS 991
Query: 321 ALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVA------SGSPSNTGS 482
A S A S + A + + S+S S + S +PS++ S
Sbjct: 992 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1051
Query: 483 SEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
+ + + A ++ + +SSSA S +SS
Sbjct: 1052 APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1082
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.20
Identities = 39/154 (25%), Positives = 69/154 (44%), Gaps = 7/154 (4%)
Frame = +3
Query: 135 PLTASASLRVRSSSL--RSNTALPSSKTRSPRM----AATYSLATSPLTRSTPIPFSTKR 296
P +S+S SSS S+++ PSS + +P A + S +++P S+ P S+
Sbjct: 853 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 912
Query: 297 VPSGRSSGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGS-PSN 473
SS + P S + S + + A + S+S S +S S PS+
Sbjct: 913 SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS 972
Query: 474 TGSSEAKNVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
+ S+ + + A ++ + +SSSA S +SS
Sbjct: 973 SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1006
>ref|NP_872435.1| hypothetical protein FLJ35107 [Homo sapiens]
gi|21751020|dbj|BAC03887.1| unnamed protein product
[Homo sapiens] gi|33872427|gb|AAH16304.1| FLJ35107
protein [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.004
Identities = 41/145 (28%), Positives = 68/145 (46%)
Frame = +3
Query: 141 TASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSG 320
++S S SSS S++ SS T SP +++ S ++SP + S S+ PS SS
Sbjct: 66 SSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSP-SSSNSSSSSSSSSPSSSSSS 124
Query: 321 ALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNV 500
+ P S + + + + S S+S S +S SPS++GSS + +
Sbjct: 125 SSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSN 184
Query: 501 VMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
S++ + S +SSS+ S SS
Sbjct: 185 SSPSSSSS---SPSSSSSSPSPRSS 206
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.005
Identities = 36/137 (26%), Positives = 63/137 (45%)
Frame = +3
Query: 165 RSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSSGALPVPGSQ 344
RSSS S + L SS S +++ S ++ + S+ P S+ S SS + P S
Sbjct: 36 RSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSS 95
Query: 345 ARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKNVVMASNNVT 524
+ S + + + S S+S S +S SPS++ SS + + +S++ +
Sbjct: 96 SSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPS 155
Query: 525 VGFSVGASSSAYSDASS 575
S +SSS+ +SS
Sbjct: 156 SSSSSSSSSSSSPSSSS 172
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.008
Identities = 39/146 (26%), Positives = 67/146 (45%), Gaps = 1/146 (0%)
Frame = +3
Query: 141 TASASLRVRSSS-LRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRSS 317
++S+S + SSS L S+ SS + SP + + S +S + S+P S+ PS SS
Sbjct: 38 SSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSS 97
Query: 318 GALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAKN 497
+ S + S + + + S S+ S +S SPS++ SS + +
Sbjct: 98 SSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 157
Query: 498 VVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDASS 575
+S++ + S SSS S +SS
Sbjct: 158 SSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSS 183
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.051
Identities = 36/146 (24%), Positives = 68/146 (45%)
Frame = +3
Query: 135 PLTASASLRVRSSSLRSNTALPSSKTRSPRMAATYSLATSPLTRSTPIPFSTKRVPSGRS 314
P ++S++ SSS S+++ PSS S +++ ++S + S+P S+ S S
Sbjct: 83 PSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 142
Query: 315 SGALPVPGSQARLSGAGAVALDGLEGGRDDWHQRYSLSTSGRRRSVASGSPSNTGSSEAK 494
S + P S + S + + + S S+SG S ++ SPS++ SS +
Sbjct: 143 SSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSS------SPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSS 196
Query: 495 NVVMASNNVTVGFSVGASSSAYSDAS 572
+ S + S +S+S+ S +S
Sbjct: 197 SSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSS 222
