KCC000460A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC000460A_C01 KCC000460A_c01
CATATAGAACTATCGATACGAAAATGCTGTTTGCGAGCTCCATTATACTTGTGTTAGCCA
TTTCGGTAGCTGCACAGAACTCGGGCTTAAAATGCGACAAAAGCGTCTTGGCAACATCCT
CTAGCAGCCCGTTAGCGTTGAGCGATATCGCGCTGGTGCTGGTGTCGTCGCGAAGCGAGG
CCGCAGCGGAGTGGGTTACGGGCCAGCGGTTCTGGCGAAAGAAGGGCGTCGACATCATAA
TCTTAGCTTCTAATGTCACCGCTGACAACGAATGGGCTGACGGCGCTGACAAGGGCGGTC
GCGAAGCCTGGATTCGTGCCGAAGGAGGCGACGATGCGGAGGTTGCGGCGACAGCCGCTG
TGAAAGCCACGGCTTTCTTGCGTGGAAACGGCGGCAAGATACCCAAATGGATTTTCGTGA
CGCAAACACACTCGGTCGTCAACCTGCTGGCTCTCCGGGACGCGCTGGCCGAGCTGGACC
CATCTGAGCCGCACGCGGTCACAGACGCGCTGTTTTGCGAGCGGCGGGGTGCGGGAGCGG
CCGCGCAGCAAAGGCGACTGCGCAACTCTCCGCCACACGCCATTGGCGGGGCCGCCGCAG
TGGGCGCGTGCACTCCCTGCCATCACGGGAACTCCCTATCACCGGCTGAGTGCGCTAAGA
TTAATCCTGGAGGCGGCGTTGCGCTCTCCTGGGCCTTGGCGGCGTCATGCCACCCCT


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC000460A_C01 KCC000460A_c01
         (717 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]                 46  7e-04
pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] ...    45  0.001
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]                       45  0.001
ref|NP_610371.1| CG14755-PA [Drosophila melanogaster] gi|7304067...    44  0.003
emb|CAD27464.1| SPAPB15E9.01c [Schizosaccharomyces pombe]              43  0.006

>emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]
          Length = 873

 Score = 45.8 bits (107), Expect = 7e-04
 Identities = 54/227 (23%), Positives = 93/227 (40%), Gaps = 1/227 (0%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            A  A  S+ P      A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 653  APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 712

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
             S  SAS ++  S  SSSA ++  +S                 P      A + +++ A 
Sbjct: 713  SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSS----------------APSSSSSSAPSASSSSAP 756

Query: 343  TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAA-SLRD 167
            +S+SS PSA   +S  P S+ SA S S+ +  +    S P    +  P + S++A S   
Sbjct: 757  SSSSSAPSA--SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 814

Query: 166  DTSTSAISLNANGLLEDVAKTLLSHFKPEFCAATEMANTSIMELANS 26
             ++ S+ S +A       A +  S   P   +++  +++S    A+S
Sbjct: 815  SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASS 861

 Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.003
 Identities = 39/150 (26%), Positives = 63/150 (42%), Gaps = 2/150 (1%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            A  A  S+ P      A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 715  APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 774

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKA--VAFTAAV 350
             S  SAS ++  S  SSSA ++  +S  ++             P      A   + ++A 
Sbjct: 775  SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 834

Query: 349  AATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSA 260
            +++S+S+P ++   AS    SAPSA S SA
Sbjct: 835  SSSSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSA 864

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.010
 Identities = 39/155 (25%), Positives = 70/155 (45%)
 Frame = -3

Query: 607  APTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTEC 428
            AP+A++   +           ++AP+   S  SAS ++  S  SSSA ++  +S  ++  
Sbjct: 623  APSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS 682

Query: 427  VCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLE 248
                       P      A + +++ A +S+SS PSA   +S P  S+ SA S S+ +  
Sbjct: 683  SSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS-SSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 740

Query: 247  AKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAIS 143
            +    S P    +  P + S+A S    ++ S+ S
Sbjct: 741  SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 775

 Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.68
 Identities = 45/219 (20%), Positives = 89/219 (40%), Gaps = 2/219 (0%)
 Frame = -3

Query: 697  KAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRS 518
            + + S++ P     + S+     P      AP++++   +           ++AP+   S
Sbjct: 616  ETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 675

Query: 517  QNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATS 338
               +S ++     SSS++ S  +S  +              P        A +++  ++S
Sbjct: 676  SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS--------SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 727

Query: 337  ASSPPSARIQA--SRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDD 164
            +SS PSA   +  S    SAPSA S SA +  +    S P    +  P + S+A S    
Sbjct: 728  SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS----SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 783

Query: 163  TSTSAISLNANGLLEDVAKTLLSHFKPEFCAATEMANTS 47
            ++ S+ S +A       A +  S   P   +++  +++S
Sbjct: 784  SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS 822

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.89
 Identities = 45/191 (23%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 2/191 (1%)
 Frame = -3

Query: 592  APPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTK 413
            A P     +  +   C        S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++           
Sbjct: 598  AQPELLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSA----------- 646

Query: 412  IHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQA--SRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKI 239
                  P        A +++  ++S+SS PSA   +  S    SAPSA S SA +  +  
Sbjct: 647  ------PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS-- 698

Query: 238  MMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNANGLLEDVAKTLLSHFKPEFCAATEM 59
              S P    +  P + S+A S    ++ S+ S +A       A +  S   P   +++  
Sbjct: 699  --SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 756

Query: 58   ANTSIMELANS 26
            +++S    A+S
Sbjct: 757  SSSSSAPSASS 767

>pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] - Leishmania
           major (fragment) gi|5420389|emb|CAB46680.1|
           proteophosphoglycan [Leishmania major]
          Length = 383

 Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.001
 Identities = 47/190 (24%), Positives = 77/190 (39%)
 Frame = -3

Query: 703 AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
           A  A  S+ P      A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 40  APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 99

Query: 523 RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
            S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++                 P        A +++  +
Sbjct: 100 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA-----------------PSSSSSAPSASSSSAPS 142

Query: 343 TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDD 164
           +S+SS PSA   +S P  S+ SA S S+ +  +    S P    +  P + S+A S    
Sbjct: 143 SSSSSAPSAS-SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 201

Query: 163 TSTSAISLNA 134
           ++ S+ S +A
Sbjct: 202 SAPSSSSSSA 211

 Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.016
 Identities = 44/195 (22%), Positives = 84/195 (42%), Gaps = 1/195 (0%)
 Frame = -3

Query: 607 APTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTEC 428
           AP+A++               ++AP+   S  SAS ++  S  SSSA ++  +S  ++  
Sbjct: 10  APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS 69

Query: 427 VCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLE 248
                      P        A +++  ++S+S+P ++   A     SAPSA S SA +  
Sbjct: 70  SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 129

Query: 247 AKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAA-SLRDDTSTSAISLNANGLLEDVAKTLLSHFKPEFCA 71
           +    S P    +  P + S++A S    ++ S+ S +A       A +  S   P   +
Sbjct: 130 S----SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 185

Query: 70  ATEMANTSIMELANS 26
           ++  +++S    A+S
Sbjct: 186 SSAPSSSSSAPSASS 200

 Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.028
 Identities = 40/150 (26%), Positives = 64/150 (42%), Gaps = 2/150 (1%)
 Frame = -3

Query: 703 AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
           +A +  S++ P     A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 71  SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 129

Query: 523 RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
            S  SAS ++  S  SSSA ++  +S  ++             P      A + +++ A 
Sbjct: 130 SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 189

Query: 343 TSASSPPSARIQA--SRPPLSAPSAHSLSA 260
           +S+SS PSA   +  S    SAPSA S SA
Sbjct: 190 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 219

 Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.68
 Identities = 33/134 (24%), Positives = 62/134 (45%)
 Frame = -3

Query: 544 AAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVA 365
           ++AP+   S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++  ++                    + +
Sbjct: 1   SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 60

Query: 364 FTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSA 185
            ++A +++S+S+P ++   A     SAPSA S SA +  +    S P    +  P + S+
Sbjct: 61  SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS----SAPSASSSSAPSSSSS 116

Query: 184 AASLRDDTSTSAIS 143
           A S    ++ S+ S
Sbjct: 117 APSASSSSAPSSSS 130

>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
          Length = 1325

 Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.001
 Identities = 46/190 (24%), Positives = 79/190 (41%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            +A +  S++ P     A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 775  SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 834

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
             S  SAS ++  S  SS+ SAS  +S   +             P        A +++  +
Sbjct: 835  SSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS--SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS 892

Query: 343  TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDD 164
            +S+SS PSA   +S P  S+ SA S S+ +  +    S P    +  P + S++A     
Sbjct: 893  SSSSSAPSAS-SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 951

Query: 163  TSTSAISLNA 134
            +S  + S +A
Sbjct: 952  SSAPSSSSSA 961

 Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.012
 Identities = 40/158 (25%), Positives = 70/158 (43%)
 Frame = -3

Query: 607  APTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTEC 428
            AP+A++   +           ++AP+   S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++      
Sbjct: 670  APSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA------ 723

Query: 427  VCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLE 248
                        P     A + +++ A +S+SS PSA   +S  P S+ SA S S+ +  
Sbjct: 724  ------------PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA--SSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 769

Query: 247  AKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNA 134
            +    S P    +  P + S+A S    ++ S+ S +A
Sbjct: 770  SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 807

 Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.028
 Identities = 45/192 (23%), Positives = 81/192 (41%), Gaps = 2/192 (1%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            +A +  S++ P     A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 821  SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 879

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKA--VAFTAAV 350
             S  SAS ++  S  SSSA ++  +S  ++             P      A   + ++A 
Sbjct: 880  SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 939

Query: 349  AATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLR 170
            +++S+S+P ++   A     SAPSA S SA +  +    S P    +  P + S++A   
Sbjct: 940  SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS----SAPSASSSSAPSSSSSSAPSA 995

Query: 169  DDTSTSAISLNA 134
              +S  + S +A
Sbjct: 996  SSSSAPSSSSSA 1007

 Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.23
 Identities = 35/148 (23%), Positives = 63/148 (41%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            +A +  S++ P     A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 960  SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 1019

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
             S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++  ++                    + + ++A ++
Sbjct: 1020 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA----------------PSASSSSAPSS 1063

Query: 343  TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSA 260
            +S+S+P ++   A     SAPSA S SA
Sbjct: 1064 SSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 1091

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.40
 Identities = 42/186 (22%), Positives = 71/186 (37%), Gaps = 4/186 (2%)
 Frame = -3

Query: 592  APPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTK 413
            A P     +  +   C        S  SAS ++  S  SS+ SAS  +S   +       
Sbjct: 645  AQPELLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSAS--SSSAPSSSSSAPS 702

Query: 412  IHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKI-- 239
                  P        A +++  ++S+S+P ++   A     SAPSA S SA +  +    
Sbjct: 703  ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 762

Query: 238  --MMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNANGLLEDVAKTLLSHFKPEFCAAT 65
                S P    +  P   S++A     ++ SA S +A       A +  S   P   ++ 
Sbjct: 763  ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 822

Query: 64   EMANTS 47
              A++S
Sbjct: 823  PSASSS 828

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.89
 Identities = 44/191 (23%), Positives = 77/191 (40%), Gaps = 4/191 (2%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            +A +  S++ P     A SA     P      AP+A++               ++AP+  
Sbjct: 684  SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP-SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 742

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
             S  SAS ++  S  SS+ SAS  ++  ++                        ++A +A
Sbjct: 743  SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS-----------------------SSAPSA 779

Query: 343  TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEA----KIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAAS 176
            +S+S+P S+    S    SAPS+ S SA +  +        S P    +  P + S+A S
Sbjct: 780  SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 839

Query: 175  LRDDTSTSAIS 143
                ++ S+ S
Sbjct: 840  ASSSSAPSSSS 850

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 5.8
 Identities = 40/192 (20%), Positives = 75/192 (38%)
 Frame = -3

Query: 703  AAKAQESATPPPGLILAHSAGDREFP*WQGVHAPTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPR 524
            +A +  S++ P     +  +     P      AP++++   +           ++AP+  
Sbjct: 937  SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 996

Query: 523  RSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAA 344
             S   +S ++  S  SSSA                         P     A + +++ A 
Sbjct: 997  SSSAPSSSSSAPSASSSSA-------------------------PSSSSSAPSASSSSAP 1031

Query: 343  TSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDD 164
            +S+SS PSA   +S  P S+ SA S S+ +  +    S P    +  P + S+A S    
Sbjct: 1032 SSSSSAPSA--SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 1089

Query: 163  TSTSAISLNANG 128
            ++ S+ S   +G
Sbjct: 1090 SAPSSSSSFLSG 1101

>ref|NP_610371.1| CG14755-PA [Drosophila melanogaster] gi|7304067|gb|AAF59106.1|
           CG14755-PA [Drosophila melanogaster]
          Length = 284

 Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.003
 Identities = 43/175 (24%), Positives = 82/175 (46%), Gaps = 9/175 (5%)
 Frame = -3

Query: 568 ELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECV----CVTKIHLG 401
           ++++ +C  ++     S +S+S ++C S  SSS+SA+   +  TT  V    C T  +  
Sbjct: 115 KMQAMICNKSSSTNNSSSSSSSSSSCSSSSSSSSSATSTLTSCTTAAVVPSNCSTNANKS 174

Query: 400 ILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPF 221
            + P+ +   +A      A S+    ++ + +SR PL+A       A T+ AK   S   
Sbjct: 175 PVSPYSQSLGMAIGIGAGAGSSPLREASPLPSSRSPLNA------IASTIAAKSPCS--- 225

Query: 220 FRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNANGLLEDVAKTLL-----SHFKPEFCA 71
                 P +  +A+S   ++S+  ++LN     E V++T L     +HF+   C+
Sbjct: 226 ---GAAPASPPSASS---NSSSHVLALNIK--TESVSRTALLNLCITHFRLSNCS 272

>emb|CAD27464.1| SPAPB15E9.01c [Schizosaccharomyces pombe]
          Length = 744

 Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.006
 Identities = 49/191 (25%), Positives = 80/191 (41%), Gaps = 3/191 (1%)
 Frame = -3

Query: 607 APTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTEC 428
           A +A++ P+     + S    +A+  P  S NS S T+  S   +SA+++   S  +T  
Sbjct: 351 ATSASSTPLT---SVNSTTATSASSTPLTSVNSTSATSASSTPLTSANSTTSTSVSSTAP 407

Query: 427 VCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTA-AVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTL 251
              T     +LP          +A +  ATSASS P + +  S    SA S    S  + 
Sbjct: 408 SYNTS---SVLPTSSVSSTPLSSANSTTATSASSTPLSSVN-STTATSASSTPLSSVNST 463

Query: 250 EAKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNANGL--LEDVAKTLLSHFKPEF 77
            A    STP    N    T +++  L    STSA S ++  L        T +S   P +
Sbjct: 464 TATSASSTPLTSVNSTTATSASSTPLTSVNSTSATSASSTPLTSANSTTSTSVSSTAPSY 523

Query: 76  CAATEMANTSI 44
             ++ +  +S+
Sbjct: 524 NTSSVLPTSSV 534

 Score = 34.3 bits (77), Expect = 2.0
 Identities = 30/161 (18%), Positives = 67/161 (40%)
 Frame = -3

Query: 607 APTAAAPPMACGGELRSRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTEC 428
           A +A++ P+     + S    +A+  P  S +SA+ T   S  S+  S+    +  +   
Sbjct: 300 ATSASSTPLT---SVNSTTTTSASSTPLSSVSSANSTTATSTSSTPLSSVNSTTATSASS 356

Query: 427 VCVTKIHLGILPPFPRKKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLE 248
             +T ++             +  +  A +++S+P ++    +   +S+ +    ++  L 
Sbjct: 357 TPLTSVNSTTATSASSTPLTSVNSTSATSASSTPLTSANSTTSTSVSSTAPSYNTSSVLP 416

Query: 247 AKIMMSTPFFRQNRWPVTHSAAASLRDDTSTSAISLNANGL 125
              + STP    N    T +++  L    ST+A S ++  L
Sbjct: 417 TSSVSSTPLSSANSTTATSASSTPLSSVNSTTATSASSTPL 457

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 5.8
 Identities = 29/142 (20%), Positives = 58/142 (40%)
 Frame = -3

Query: 559 SRLCCAAAPAPRRSQNSASVTACGSDGSSSASASRRASRLTTECVCVTKIHLGILPPFPR 380
           S    +A+  P  S NS + T+  S   SS +++   S  +T    V           P 
Sbjct: 430 STTATSASSTPLSSVNSTTATSASSTPLSSVNSTTATSASSTPLTSVNSTTATSASSTP- 488

Query: 379 KKAVAFTAAVAATSASSPPSARIQASRPPLSAPSAHSLSAVTLEAKIMMSTPFFRQNRWP 200
               +  +  A +++S+P ++    +   +S+ +    ++  L    + STP    N   
Sbjct: 489 --LTSVNSTSATSASSTPLTSANSTTSTSVSSTAPSYNTSSVLPTSSVSSTPLSSANSTT 546

Query: 199 VTHSAAASLRDDTSTSAISLNA 134
            T +++  L    ST+A S ++
Sbjct: 547 ATSASSTPLTSVNSTTATSASS 568



EST assemble image


clone accession position
1 CL31c11_r AV395032 1 562
2 LCL055a11_r AV629240 79 608
3 LCL020c11_r AV627050 82 543
4 MXL075f12_r BP097438 88 527
5 HCL085b05_r AV644270 88 611
6 MXL042f08_r BP095491 89 465
7 MXL042f02_r BP095485 89 470
8 HCL050f04_r AV642367 90 606
9 MXL068f04_r BP097008 103 566
10 CL68h06_r AV396953 110 647
11 MXL001g04_r BP092980 179 302
12 MXL013h01_r BP093791 182 485
13 HCL046a02_r AV642124 265 688
14 LCL047f11_r AV628830 358 813




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute