Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC000163A_C01 KCC000163A_c01
(1128 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|AAO50865.1| similar to Leishmania major. Ppg3 [Dictyostelium ... 105 1e-21
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major] 105 1e-21
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ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Strept... 100 8e-20
gb|AAK95470.1| LF3 [cercopithicine herpesvirus 15] 98 2e-19
>gb|AAO50865.1| similar to Leishmania major. Ppg3 [Dictyostelium discoideum]
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SSSSSSSSSSS ++++S+ +SSS S+ SS+ + + S +SSSSS
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SS+ + S S+ S+ ++ +S+ S+ + SS +S S+S ++ SS
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+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+ +S++++ SSS + S+S+
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++S + + +S + + + + +SS+ + S S S +SSS
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SSSSSSSSSSS ++++S+ +SSS SS+ + + S SSSSS
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SS+ + S S+ S+ ++ +S+ S+ + SS +S S+S ++ SS
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++ +SS + +SSS S+ S S+S ++ ++S S+S S+SS + SS S+ +S
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+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+ +S++++ SSS + S+S+ + +
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+ ++S + + +S + + + + +SS+ + S S S +SSS
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+ ++ S++ +S+++
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SSSSSSSSSSS ++++S+ +SSS SS+ + + S +SSSSS
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SS+ + S S+ S+ ++ +S+ S+ + SS +S S+S ++ SS
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++ +SS + +SSS S+ S S+S ++ ++S S+S S+SS + SS S+ +S
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+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+ +S+++ +
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TSSSSS SS+ + S S+ S+ ++ +S+ S+ + SS +S S+S ++
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SS ++ +SS + +SSS S+ S S+S ++ ++S S+S S+SS + SS
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S+ +S+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+ +S++++ SSS + S+S
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+ + + + ++S + + +S + + + + +SS+ + S S S
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+SS + SS S+ +S+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+ +S++++
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SSS + S+S+ + + + ++S + + +S + + + + +SS
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+ + S S S +SSS + ++ S++ +S+++
Sbjct: 240 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 272
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G +S I S S+S ++ ++S S+S S+SS + SS S+ +S+ SSSS+S+S
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SSSS +S+ S S S SS SS+ +S++++ SSS + S+S+ + + + ++S
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+ + +S + + + + +SS+ + S S S +SSS + ++ S++ +S
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+++
Sbjct: 235 SSS 237
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D+ + + + SS S+ +S+ SSSS+S+SSSSS +S+ S S S SS SS+
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+S++++ SSS + S+S+ + + + ++S + + +S + +
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+ + +SS+ + S S S +SSS + ++ S++ +S+++
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>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
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SS+SSSSSS+ A+++SA +SSS PS S+ + + +P S+SS
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+ PSSSS++ S+SSS SAPS S S +S SSA +S+++A +SS + S+S+ + +
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SSSS+ SSSSS +++A + +SSS PS+ + + + + +P
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S+SS S+ + S P ++ S+ ++ +SA SA + SS +S P +S ++
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S+ ++ P +SS ASSS SAPS S+S +A +AS SA S+SS SS S
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+ +S+ PS+SS+S SSSS +SAPS S S SS SSA AS+++A SSS S+S+
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+ + + P ++S A + P AS AP + + S+ + PS S
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S SSS A +A S++ S+++
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+ + + S P S+ SA A+ +SA S+ +S +S P S S ++ SS
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S+ PSSSS++ S+SSS SAPS S S S S SSA +S+++A +SS + S+S+ +
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+ + P ++S + A + P + + AP+SS+ + PS S S SSS
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A +A S++ S+++
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+ PSSSS S S+SS +SAPS S S +S SSA +S+++A +SS + S+S+ +
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Query: 411 TVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSL 232
+ + P ++S + A + P A + +SS+ + S S PS +SSS
Sbjct: 1011 SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP--SASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 1068
Query: 231 IALAACSAAGASAN 190
+ ++ SA +S++
Sbjct: 1069 PSASSSSAPSSSSS 1082
Score = 92.8 bits (229), Expect = 1e-17
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Frame = -1
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S+ SSSSS+ S +++++ +SSS PS+ + + + + +P S+SS
Sbjct: 722 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 781
Query: 948 GSSTKAGISKP-VSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSM 772
S+ + S P S+ SA ++ +SA SA + SS +S P ++S + P SS
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A P SS A +SSS SAPS S+S A ++S + S S+SS SS P S+ +
Sbjct: 836 SA--PSASSSSAPSSSS---SAPSASSSSAPSSSSS-APSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 889
Query: 591 STWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTL 412
+ SSSS ++SSSS S+ S S SS + + +S++ SSS S+S+ +
Sbjct: 890 APSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSA 949
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+ + P ++S + A + P + + AP+SS+ + PS S S SSS
Sbjct: 950 SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP---SASSSSAPSSSS-SSAPSASSSSAPSSSS 1005
Query: 231 IALAACSAAGASANT 187
A +A S++ S+++
Sbjct: 1006 SAPSASSSSAPSSSS 1020
Score = 89.4 bits (220), Expect = 1e-16
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+SSSS+ SSSS A +AS+ ++ S S+ SS+ + S +SSSSS
Sbjct: 870 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS 929
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S + + S+ SA A+ +SA S+ +S +S P S S ++ SS
Sbjct: 930 APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 989
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTS 589
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Sbjct: 990 SSAPSASSSSAPSSSS---SAPSASSS---SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 1043
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+ PSSSS++ S+SSS A SAPS S S SS SSA SA+++ SS + F S S
Sbjct: 1044 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA-PSASSSSAPSSSSSFLSGS 1102
Score = 85.1 bits (209), Expect = 2e-15
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SS+ SSSSS+ A+++SA +SSS PS S+ + + S ++SSSS
Sbjct: 873 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS------APSASSSSAPSSSSSSAP-----SASSSS 921
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
S+ + + S+ SA ++ +SA SA + SS +S P +S ++ S+
Sbjct: 922 APSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 981
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTS 589
++ P +SS A ++SS SAPS S+S A A+S + S S+S+ + SS P S S
Sbjct: 982 SSAPSSSSSSAPSASS--SSAPSSSSS-APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS---S 1035
Query: 588 TWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTLT 409
+ PS+SS+S SSSS A + S S + SS S+ AS+++A SSS S+S+ + +
Sbjct: 1036 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 1095
Query: 408 VTFWPG 391
+F G
Sbjct: 1096 SSFLSG 1101
Score = 80.9 bits (198), Expect = 4e-14
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Query: 939 TKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMRATL 760
T++ S P ++ S+ ++ +SA SA + SS +S P ++S + P SS A
Sbjct: 664 TESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP------SASSSSAPSSSSSA-- 715
Query: 759 PVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWP 580
P SS A +SSS SAPS S+S A S S++ SASS + SS SA +S+ P
Sbjct: 716 PSASSSSAPSSSS---SAPSASSSSAP---SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 769
Query: 579 SSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSA-DASAATADLSSSDTRFFSASTLRTLTVT 403
SSSS+S S+SS +SAPS S S +S SSA +S+++A +SS + S+S+ + + +
Sbjct: 770 SSSSSSAPSASS-SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 828
Query: 402 FWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSLIAL 223
P ++S P AS AP + + S+ + PS S S SSS A
Sbjct: 829 SAPSSSSSA-----PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 883
Query: 222 AACSAAGASANT 187
+A S++ S+++
Sbjct: 884 SASSSSAPSSSS 895
Score = 73.2 bits (178), Expect = 8e-12
Identities = 69/204 (33%), Positives = 105/204 (50%), Gaps = 1/204 (0%)
Frame = -1
Query: 1125 SSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDS-PGW*YFLTSSSSS 949
SSSSSS+ S+ +++A + +SSS PS+ S+ A + S P S+SSS
Sbjct: 908 SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 967
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
+ + + + S+ SA ++ +SA SA + SS +S P +S ++ S+
Sbjct: 968 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 1027
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTS 589
++ P +SS ASSS SAPS S+S A +AS SA S+SS SS S+ +S
Sbjct: 1028 SSAPSSSSSAPSASSS---SAPSSSSS--APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1082
Query: 588 TWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSG 517
+SSS++ SSSSS S G
Sbjct: 1083 APSASSSSAPSSSSSFLSGSGSDG 1106
Score = 71.2 bits (173), Expect = 3e-11
Identities = 70/195 (35%), Positives = 103/195 (51%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
SSSS+ SSSSS A +AS+ ++ S PS S+ + + +P S+SSS
Sbjct: 934 SSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS----SSAPSASSSSAPSSSSSAP-------SASSS 982
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
+ + + S P ++ S+ ++ +SA SA + SS +S P ++S + P SS
Sbjct: 983 SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP------SASSSSAPSSSSS 1036
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTS 589
A P SS A +SSS SAPS S+S A ++S + S S+SS SS P SA +S
Sbjct: 1037 A--PSASSSSAPSSSS---SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP--SASSS 1089
Query: 588 TWPSSSSTSTSSSSS 544
+ PSSSS+ S S S
Sbjct: 1090 SAPSSSSSFLSGSGS 1104
Score = 64.7 bits (156), Expect = 3e-09
Identities = 73/211 (34%), Positives = 109/211 (51%), Gaps = 11/211 (5%)
Frame = -1
Query: 786 P*SSMRATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPG 607
P + ++ P SS A +SSS SAPS S+S A S S++ SASS + SS
Sbjct: 662 PETESSSSAPSASSSSASSSSS---SAPSASSSSAP---SSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 715
Query: 606 RSARTSTWPSSSST------STSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSA-DASAATADLSSSD 448
SA +S+ PSSSS+ S++ SSS +SAPS S S SS SSA AS+++A SSS
Sbjct: 716 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS-SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 774
Query: 447 TRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSLAFLVN----PDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTV 280
+ ++S+ + + P ++S A + P AS AP + + S+
Sbjct: 775 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 834
Query: 279 VTVPSYSEPSFTSSSLIALAACSAAGASANT 187
+ PS S S SSS A +A S++ S+++
Sbjct: 835 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 865
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-07
Identities = 58/185 (31%), Positives = 94/185 (50%), Gaps = 13/185 (7%)
Frame = -1
Query: 702 SRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWPSSSSTSTSSSS-------- 547
+ +A + +S + S S+SS + SS P S+ ++ SSS+ S SSSS
Sbjct: 656 TENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 715
Query: 546 ---SVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSL 376
S +SAPS S S +S SSA +S+++A +SS + S+S+ + + + P ++S
Sbjct: 716 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS 775
Query: 375 AFLVNPDASLEMCTRPLVLAP--KFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSLIALAACSAAG 202
A P AS AP + AP+SS+ + PS S S SSS A +A S++
Sbjct: 776 A----PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS-SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 830
Query: 201 ASANT 187
S+++
Sbjct: 831 PSSSS 835
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-07
Identities = 53/164 (32%), Positives = 89/164 (53%)
Frame = -1
Query: 678 MAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSS 499
+ ASD + + T+ SS P SA +S+ SSSS++ S+SSS SAPS S S +S
Sbjct: 649 LLASDCATENACKPETESSSSAP--SASSSSASSSSSSAPSASSS--SAPSSSSSAPSAS 704
Query: 498 DSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVL 319
SSA +S+++A +SS + S+S+ + + + P ++S + A + P
Sbjct: 705 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP--- 761
Query: 318 APKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSLIALAACSAAGASANT 187
+ + AP+SS+ + PS S S SSS A +A S++ S+++
Sbjct: 762 SASSSSAPSSSS-SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 804
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-05
Identities = 51/176 (28%), Positives = 88/176 (49%), Gaps = 4/176 (2%)
Frame = -1
Query: 705 PSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWPSSSSTSTSSSS----SVA 538
P AS A + + S+SS SS S+ ++ SSSS +SSSS S +
Sbjct: 647 PELLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 706
Query: 537 SAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNP 358
SAPS S S +S SSA +S+++A +SS + S+S+ + + + P ++S A +
Sbjct: 707 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS-SSSSAPSASS 765
Query: 357 DASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSLIALAACSAAGASAN 190
++ + A + +SS+ + S S PS +SSS + ++ SA +S++
Sbjct: 766 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 821
>ref|NP_492875.2| pre-mRNA splicing SR protein related (68.2 kD) (rsr-1)
[Caenorhabditis elegans] gi|19571645|emb|CAB04214.3| C.
elegans RSR-1 protein (corresponding sequence F28D9.1)
[Caenorhabditis elegans]
Length = 601
Score = 100 bits (250), Expect = 4e-20
Identities = 108/370 (29%), Positives = 150/370 (40%), Gaps = 54/370 (14%)
Frame = -2
Query: 1100 PRRQQQPQPTPPRQ*S------GSG*CRGRQPGSTPARKRAPTRRAGSTS*RPAR--HRA 945
P R P+ TPPR+ + G G R+ GS R+R+P RR P R R+
Sbjct: 175 PARALSPRKTPPRRNASPGGDGGGGSPAARRGGSAGNRRRSPPRRGSPRRGSPRRDTRRS 234
Query: 944 APRRRASQSRCPPTR------RAERPEPQRTARSWAPSSRPWPADR-------------- 825
PRRR S PP R R E P R + SR +R
Sbjct: 235 PPRRRGS----PPARGGDRRDRREDRRPVRDEKEREEESRRREIERKKRHEEAELRQKAI 290
Query: 824 --------SGSCRSTRTPGTRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSGSRHRPGQPPGQRWPP 669
SGS R R+P +SP RSP + P R+ SR + P +R
Sbjct: 291 ASVAARAKSGSPRRRRSPSASKSPPPARRRRSPSQSKSPAPKRAKSRSKSPPAPARRRRS 350
Query: 668 PTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAP-----PPHPRRHRWHQRPRGQAR**C 504
P++ + PP P R +++ + PP R +P PP PRR R + R A
Sbjct: 351 PSASKSPPPAPKR-----AKSRSKSPPARRRRSPSASKSPPAPRRRRSPSKSRSPA---- 401
Query: 503 HPTPQPTPQQRQRT*APATRASSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWRSW*TQTPAWKCAPGRW 324
P + P +R+R +P+ S P+ RS S A PR RS P+ +P
Sbjct: 402 -PKREIPPARRRR--SPSASKSPPAPKRAKSRSKSPPA-PRRRRS-----PSQSKSP--- 449
Query: 323 CWRRSSRKRRTPRRSSRCPRTQSPPS----------RPPA**PWR---PARQRAPQRTHG 183
+ R+RR+P +S + PR + PS R PA P R P R+R+P+R
Sbjct: 450 ----APRRRRSPSKSPQAPRRRRSPSGSKSRSPRRRRSPAAAPRRRQSPQRRRSPRRRRS 505
Query: 182 PKAGHR*TPP 153
P + R P
Sbjct: 506 PSSSSRSRSP 515
Score = 89.4 bits (220), Expect = 1e-16
Identities = 111/371 (29%), Positives = 154/371 (40%), Gaps = 52/371 (14%)
Frame = -2
Query: 1121 RPRRPP---APRR---QQQPQPTPPRQ*SGSG*CRG---------RQPGSTPARKRAPTR 987
R R PP +PRR ++ + +PPR+ GS RG R+P + +R
Sbjct: 212 RRRSPPRRGSPRRGSPRRDTRRSPPRR-RGSPPARGGDRRDRREDRRPVRDEKEREEESR 270
Query: 986 RAGSTS*RPARHRAAPRRRAS--------QSRCPPTRRA----ERPEPQRTARSWAPSSR 843
R R RH A R+ + +S P RR+ + P P R RS + S
Sbjct: 271 RREIE--RKKRHEEAELRQKAIASVAARAKSGSPRRRRSPSASKSPPPARRRRSPSQSKS 328
Query: 842 PWPADRSGSCRSTRTPGTRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSGSRHRPGQPPGQRWPPPT 663
P P +S P RR RSP + PPA ++ R PP +R P+
Sbjct: 329 PAPKRAKSRSKSPPAPARRR--------RSPSASKSPPPAPKRAKSRSKSPPARRRRSPS 380
Query: 662 SRRPCPPPPSRRECP---QSRAGQRGPPPGR----------PPAP---------PPHPRR 549
+ + PP P RR P +S A +R PP R PPAP PP PRR
Sbjct: 381 ASK-SPPAPRRRRSPSKSRSPAPKREIPPARRRRSPSASKSPPAPKRAKSRSKSPPAPRR 439
Query: 548 HRWHQRPRGQAR**CHPTPQPTPQQRQRT*APATRASSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWRS 369
R P+ +P R+R +P+ + R R RSPSG P R
Sbjct: 440 RR-------------SPSQSKSPAPRRRR-SPSKSPQAPRRR----RSPSGSKSRSPRR- 480
Query: 368 W*TQTPAWKCAPGRWCWRRSSRKRRTPRR---SSRCPRTQSPPSRPPA**PWRPARQRAP 198
++PA AP R R+S ++RR+PRR S R++SPP PP P + + Q+AP
Sbjct: 481 --RRSPA--AAPRR---RQSPQRRRSPRRRRSPSSSSRSRSPP--PPPRRPRQDSEQQAP 531
Query: 197 QRTHGPKAGHR 165
P+ R
Sbjct: 532 VAVKSPEMKKR 542
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-13
Identities = 73/237 (30%), Positives = 99/237 (40%), Gaps = 16/237 (6%)
Frame = -2
Query: 1127 APRPRRPPAPRRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRAPTRRAGSTS*RPARHR 948
+P + PAP+R + +PP R R P ++ + AP R + PAR R
Sbjct: 322 SPSQSKSPAPKRAKSRSKSPPAPAR-----RRRSPSASKSPPPAPKRAKSRSKSPPARRR 376
Query: 947 AAP-----------RRRASQSRCPPTRRAERPEPQRTARSWAPSSRPWPADRSGSCRSTR 801
+P RR S+SR P +R E P +R A S P P +S
Sbjct: 377 RSPSASKSPPAPRRRRSPSKSRSPAPKR-EIPPARRRRSPSASKSPPAPKRAKSRSKSPP 435
Query: 800 TPGTRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARS-GSRHRPGQPPGQRWPPPTSRRPCPPPPSRRE 624
P RRSP +SP P RR P++S + R P G + P RR P RR+
Sbjct: 436 APRRRRSPS---QSKSPAPRRRRSPSKSPQAPRRRRSPSGSKSRSPRRRRSPAAAPRRRQ 492
Query: 623 CPQSRAG---QRGP-PPGRPPAPPPHPRRHRWHQRPRGQAR**CHPTPQPTPQQRQR 465
PQ R +R P R +PPP PRR R Q QA P +P+ ++R
Sbjct: 493 SPQRRRSPRRRRSPSSSSRSRSPPPPPRRPR--QDSEQQA-----PVAVKSPEMKKR 542
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-07
Identities = 78/276 (28%), Positives = 102/276 (36%), Gaps = 33/276 (11%)
Frame = -2
Query: 827 RSGSCRSTRTPGTRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSGSRHRPGQPPGQRWPPP---TSR 657
R + R R P SP+ PP R+ P G +R R G +R PP + R
Sbjct: 165 REKAVRDDRIPARALSPRKTPPRRNASPGGDGGGGSPAAR-RGGSAGNRRRSPPRRGSPR 223
Query: 656 RPCP------PPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAPPPHPRRHRWHQRPRGQAR**CHPT 495
R P PP RR P +R G R R P R + + R
Sbjct: 224 RGSPRRDTRRSPPRRRGSPPARGGDR-----RDRREDRRPVRDEKEREEESRRREIERKK 278
Query: 494 PQPTPQQRQRT*AP-ATRASSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWRSW*TQTPAWKCAPGRWCW 318
+ RQ+ A A RA S PR RSPS P P R + + + AP R
Sbjct: 279 RHEEAELRQKAIASVAARAKSGSPRRR--RSPSASKSPPPARRRRSPSQSKSPAPKRAKS 336
Query: 317 RRSS-----RKRRTPRRSSRCP--------RTQSPPSR----------PPA**PWRPARQ 207
R S R+RR+P S P R++SPP+R PPA P R+
Sbjct: 337 RSKSPPAPARRRRSPSASKSPPPAPKRAKSRSKSPPARRRRSPSASKSPPA-----PRRR 391
Query: 206 RAPQRTHGPKAGHR*TPPGACQPARARGAERCGHGP 99
R+P ++ P P PAR R + P
Sbjct: 392 RSPSKSRSP------APKREIPPARRRRSPSASKSP 421
>ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4] gi|25389341|pir||E95206 cell wall surface anchor
family protein [imported] - Streptococcus pneumoniae
(strain TIGR4) gi|14973269|gb|AAK75846.1| cell wall
surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4]
Length = 4776
Score = 99.8 bits (247), Expect = 8e-20
Identities = 98/326 (30%), Positives = 168/326 (51%), Gaps = 1/326 (0%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S S + +S A T + ++S+S+
Sbjct: 4000 SASTSASASASTSASASASTSASAS-ASTSASASASISASESASTSA-------SASAST 4051
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
+S A S SA ++ A+ +++ SA T S+ AS S S +T +S
Sbjct: 4052 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSA------SASASTS-ASAS 4104
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTS 589
A+ ++S AS S SA S SAS +A A++ ISAS SAS+ +S ++ ++
Sbjct: 4105 ASTSASASASTSASESASTSA-SASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASAST 4163
Query: 588 TWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAAT-ADLSSSDTRFFSASTLRTL 412
+ +S+STS S S+S +++ S S S S+ +SA ASA+T A S+S + SAST +
Sbjct: 4164 SASASASTSASESASTSTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 4223
Query: 411 TVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSL 232
+ + +TS + + AS T A A ++ST + + + S ++S+
Sbjct: 4224 SASTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASA-SASTSASASASTSASASASTS 4282
Query: 231 IALAACSAAGASANTRTEGRTPVNAT 154
+ +A ++A ASA+T +A+
Sbjct: 4283 ASASASTSASASASTSASASASTSAS 4308
Score = 97.4 bits (241), Expect = 4e-19
Identities = 98/331 (29%), Positives = 163/331 (48%), Gaps = 6/331 (1%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKW-VRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSS 952
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S + ST S T + ++S S
Sbjct: 528 SASTSTSASASTSASASASTSASASASISASESASTSASESASTSTSASA---STSASES 584
Query: 951 SGSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSM 772
+ +S A S SA ++ A+ +++ SA T S AS S S + +S
Sbjct: 585 ASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASAS---AST 641
Query: 771 RATLPVTSSM*AGASSS*RISAP---SRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRS 601
A+ ++S A AS+S +SA S SAS +A A++ SAS SAS+ +S +
Sbjct: 642 SASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASA 701
Query: 600 ARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAAT-ADLSSSDTRFFSAST 424
+ +++ +S+STS S+S+S +++ S S S S+ +SA ASA+T A S+S + SAST
Sbjct: 702 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 761
Query: 423 LRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFT 244
+ + + + S++ + S A T A S++ S S +
Sbjct: 762 SASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASA 821
Query: 243 SSSLIALAACS-AAGASANTRTEGRTPVNAT 154
S+S A A+ S +A ASA+T +A+
Sbjct: 822 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSAS 852
Score = 97.4 bits (241), Expect = 4e-19
Identities = 98/331 (29%), Positives = 163/331 (48%), Gaps = 6/331 (1%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKW-VRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSS 952
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S + ST S T + ++S S
Sbjct: 3014 SASTSTSASASTSASASASTSASASASISASESASTSASESASTSTSASA---STSASES 3070
Query: 951 SGSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSM 772
+ +S A S SA ++ A+ +++ SA T S AS S S + +S
Sbjct: 3071 ASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASAS---AST 3127
Query: 771 RATLPVTSSM*AGASSS*RISAP---SRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRS 601
A+ ++S A AS+S +SA S SAS +A A++ SAS SAS+ +S +
Sbjct: 3128 SASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASA 3187
Query: 600 ARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAAT-ADLSSSDTRFFSAST 424
+ +++ +S+STS S+S+S +++ S S S S+ +SA ASA+T A S+S + SAST
Sbjct: 3188 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 3247
Query: 423 LRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFT 244
+ + + + S++ + S A T A S++ S S +
Sbjct: 3248 SASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASA 3307
Query: 243 SSSLIALAACS-AAGASANTRTEGRTPVNAT 154
S+S A A+ S +A ASA+T +A+
Sbjct: 3308 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSAS 3338
Score = 97.1 bits (240), Expect = 5e-19
Identities = 98/329 (29%), Positives = 170/329 (50%), Gaps = 4/329 (1%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S S +S A T + ++S+S+
Sbjct: 1402 SASTSASASASTSASASASTSASAS-ASTSASASASTSASASASTSA-------SASAST 1453
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
+S A IS SA ++ A+ +++ SA T S AS S S + +S+
Sbjct: 1454 SASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASAS---ASIS 1510
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAP---SRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSA 598
A+ ++S A AS+S SA S SAS +A A++ ISAS SAS+ +S ++
Sbjct: 1511 ASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASAS 1570
Query: 597 RTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAAT-ADLSSSDTRFFSASTL 421
+++ +S+STS S+S+S +++ S S S S+ +SA ASA+T A S+S + SAST
Sbjct: 1571 ASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTS 1630
Query: 420 RTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTS 241
+ + +TS + + AS T + + ++ST +V + + S ++
Sbjct: 1631 ASESA------STSASASASTSASASAST---------SASASASTSASVSASTSASESA 1675
Query: 240 SSLIALAACSAAGASANTRTEGRTPVNAT 154
S+ + +A ++A ASA+T +A+
Sbjct: 1676 STSASASASTSASASASTSASASASTSAS 1704
Score = 97.1 bits (240), Expect = 5e-19
Identities = 101/326 (30%), Positives = 168/326 (50%), Gaps = 1/326 (0%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+SV S +S A T + ++S+S+
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Query: 600 ARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASA---------------ATA 466
+ +++ +S+STS S+S+S++++ S S S S+ +S ASA A+A
Sbjct: 2672 SASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASASTSASASASTSASASASTSASASA 2731
Query: 465 DLSSSDTRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSS 286
+S+S++ SAS + + + +TS + + AS T A A S+
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+ S SE + TS+S A + SA A ASA+T +A+
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Frame = -1
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S+S+S+S+S+S +A+ SA TS+S ++ S++ + + S ++S+S+
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+S A IS SA ++ A+ +++ SA T S+ AS S S +T +S
Sbjct: 2332 SASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSA------SESASTS-TSAS 2384
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A+ + S AS+S SA S SAS +A A++ SAS SAS+ + S+ SA TS
Sbjct: 2385 ASTSASESASTSASASASTSA-SASASTSASASASTSASASAST-SASASTSASESASTS 2442
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+S+STS S+S+S +++ S S S S+ +SA ASA+T A S+S + SAST +
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+ +TS + + AS T A + + ++ST + + + S ++S+
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+ +A ++A SA+T +A+
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S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S ++ +S++ + + S ++S+S+
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+S A S SA ++ A+ +++ SA + S+ AS S S + S S
Sbjct: 2818 STSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSA 2877
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A+ + S AS+S SA S SAS +A A++ SAS SAS+ +S ++ +
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++ S+STS S+S+S +++ S S S S+ +SA SA+T A S+S + SAST +
Sbjct: 2937 TSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSAS 2996
Query: 414 LTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEMCTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYS-EPSFTSS 238
+ + + S + + S A T A S+++ S S S ++S
Sbjct: 2997 ASASTSASASASTSASGSASTSTSASASTSASASASTSASASASISASESASTSASESAS 3056
Query: 237 SLIALAACSAAGASANTRTEGRTPVNAT 154
+ + +A ++A SA+T +A+
Sbjct: 3057 TSTSASASTSASESASTSASASASTSAS 3084
Score = 84.3 bits (207), Expect = 3e-15
Identities = 101/337 (29%), Positives = 161/337 (46%), Gaps = 12/337 (3%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+S S +ST A + ++S+S+
Sbjct: 4422 SASTSASASASTSASASASTSASAS-----ASTSASASASTSASASAS-----TSASASA 4471
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+S A S SA ++ A+ +++ SA IS+ S S S + S
Sbjct: 4472 STSASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASASTSA 4531
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S+ A+ ++S AS+S ISA S SAS +A A++ SAS SAS S +
Sbjct: 4532 SVSASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASA 4591
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S SA TS S+S+++++S+S+ ASA S S S S+ +SA ASA+T A S+S +
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SAST + + +TS + + AS T S++ T S
Sbjct: 4651 ASASASTSASASA------STSASASASTSASASASTSA------------SASASTSAS 4692
Query: 264 YSEPSFTSSSLIALAACSAAGASANTRTEGRTPVNAT 154
S + S+S A+ SA+ + +N+ + V T
Sbjct: 4693 ASASTSASASASTSASASASTSVSNSANHSNSQVGNT 4729
Score = 74.7 bits (182), Expect = 3e-12
Identities = 76/235 (32%), Positives = 119/235 (50%), Gaps = 7/235 (2%)
Frame = -1
Query: 1128 SSSSSSSSSSS*AATASADTSSSVKWVRLMPRPSTRLDSSTKAGTDSPGW*YFLTSSSSS 949
S+S+S+S+S+S +A+ASA TS+SV S +ST A + +++S S+
Sbjct: 4510 SASTSASASASTSASASASTSASVS-----ASTSASASASTSASASAS-----ISASESA 4559
Query: 948 GSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSLASRPVRVLPFHSNSRNTP*SSMR 769
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Sbjct: 4560 STSASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASAS-ASTS 4618
Query: 768 ATLPVTSSM*AGASSS*RISAP---SRSASRAAMAASDISASMSAS-SITKGMSSKPGRS 601
A+ ++S A AS+S SA S SAS +A A++ SAS SAS S + S+ S
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A TS S+S S S S+S+S +++ S S S S +SA+ S + +S T
Sbjct: 4679 ASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSVSNSANHSNSQVGNTSGST 4733
Score = 73.6 bits (179), Expect = 6e-12
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Query: 1002 AGTDSPGW*YF-----LTSSSSSGSSTKAGISKPVSAHSARRAA*ASADSAELGTFISSL 838
A TD G YF + SS++ S S VSA + A+ +++ SA T S+
Sbjct: 357 ARTDRIGINYFNGGGKVVESSTTSQSLSQSKSLSVSASQSASASASTSASASASTSASAS 416
Query: 837 ASRPVRVLPFHSNSRNTP*S-SMRATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDI 661
AS S S + S S A+ ++S AS S SA S SAS +A A++
Sbjct: 417 ASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASASASTSASESASTSA-SASASTSASASAST 475
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SAS SAS+ +S ++ +++ S+STS S+S+S +++ S S S S+ +S A
Sbjct: 476 SASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASGSASTSTSA 535
Query: 480 SAAT-------------ADLSSSDTRFFSASTLRTLTVTFWPG*TTSLAFLVNPDASLEM 340
SA+T A +S+S++ SAS + + + +TS + + AS
Sbjct: 536 SASTSASASASTSASASASISASESASTSASESASTSTS--ASASTSASESASTSASASA 593
Query: 339 CTRPLVLAPKFTKAPNSSTVVTVPSYSEPSFTSSSLIALAACSA-----AGASANTRTEG 175
T A A S++ S SE + TS+S A + SA A ASA+T
Sbjct: 594 STSASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 653
Query: 174 RTPVNAT 154
+A+
Sbjct: 654 SASTSAS 660
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S+S+S+S S+S +A+ASA TS+S + S +S A T + ++S+S+
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Query: 780 SSMRATLPVTSSM*AGASSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRS 601
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Sbjct: 4639 ASTSASASASTSASASASTS-----ASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 4693
Query: 600 ARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTL 421
+ +++ +S+STS S+S+S + + S + S ++S + +L ++ T S L
Sbjct: 4694 SASTSASASASTSASASASTSVSNSANHSNSQVGNTSGSTGKSQKELPNTGTESSIGSVL 4753
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.82
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Frame = -1
Query: 660 SASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWPSSSSTSTSSSSSVASAPSRSGSVIMSSDSSADA 481
SAS ++ S ++ S+ SA TS +S+STS S S+S +++ S S S + +A A
Sbjct: 73 SASSTSLSASESASTSASESASTSA-STSASTSASESASTSASTSISASSTVVGSQTAAA 131
Query: 480 SAATADLSSSDTR 442
+ ATA D +
Sbjct: 132 TEATAKKVEEDRK 144
Score = 35.4 bits (80), Expect = 1.8
Identities = 31/106 (29%), Positives = 52/106 (48%)
Frame = -1
Query: 729 SSS*RISAPSRSASRAAMAASDISASMSASSITKGMSSKPGRSARTSTWPSSSSTSTSSS 550
S+S S+ S SAS +A ++ SAS SAS+ S+ SA TS S S++ST
Sbjct: 69 STSNSASSTSLSASESASTSASESASTSAST---SASTSASESASTSASTSISASSTVVG 125
Query: 549 SSVASAPSRSGSVIMSSDSSADASAATADLSSSDTRFFSASTLRTL 412
S A+A + + D AS A +++ + + ++ R++
Sbjct: 126 SQTAAATEATAKKV-EEDRKKPASDYVASVTNVNLQSYAKRRKRSV 170
>gb|AAK95470.1| LF3 [cercopithicine herpesvirus 15]
Length = 890
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Identities = 122/394 (30%), Positives = 143/394 (35%), Gaps = 52/394 (13%)
Frame = -2
Query: 1124 PRPRRPPAP------RRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRA-------PTRR 984
PR RPPAP R +Q+P PP + SG R P S ++ P R
Sbjct: 179 PRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERG 238
Query: 983 AGSTS*RPAR--HRAAPRRRASQSRCPPTRRAERPEPQRTARSWAPSSRPW--------- 837
+G RP R R R PP ER R R APSSR
Sbjct: 239 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGH 294
Query: 836 -PADRSGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRP 699
P +R R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RP
Sbjct: 295 PPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRP 354
Query: 698 GQPPGQRWPPPTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAP----PPHPRR---HRW 540
G PP +R P R PP PS R ++R PPP R P PP P R
Sbjct: 355 GHPPPERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRT 412
Query: 539 HQRPRGQAR**CHPTPQPTPQQR-QRT*APATRA---SSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWR 372
QRP HP P+ R R AP++R + QRP P SG RP
Sbjct: 413 RQRPG-------HPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPA 465
Query: 371 SW*TQTPAWKCAPGRWCWRRSS--RKRRTPRRSSRC-PRTQSPPSRPPA**PWRPARQRA 201
+ PG R S R R P SSR RT+ P PP
Sbjct: 466 PSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPP------------ 513
Query: 200 PQRTHGPKAGHR*TPPGACQPARARGAERCGHGP 99
P+R GP+ PP R +R GH P
Sbjct: 514 PERGSGPRGTR---PPAPSSRTGQRTRQRPGHPP 544
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-19
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Frame = -2
Query: 1124 PRPRRPPAP------RRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRA-------PTRR 984
PR RPPAP R +Q+P PP + SG R P S ++ P R
Sbjct: 334 PRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERG 393
Query: 983 AGSTS*RPAR--HRAAPRRRASQSRCPPTRRAERPEPQRTARSWAPSSRPW--------- 837
+G RP R R R PP ER R R APSSR
Sbjct: 394 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGH 449
Query: 836 -PADRSGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRP 699
P +R R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RP
Sbjct: 450 PPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRP 509
Query: 698 GQPPGQRWPPPTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAP----PPHPRR---HRW 540
G PP +R P R PP PS R ++R PPP R P PP P R
Sbjct: 510 GHPPPERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRT 567
Query: 539 HQRPRGQAR**CHPTPQPTPQQR-QRT*APATRA---SSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWR 372
QRP HP P+ R R AP++R + QRP P SG RP
Sbjct: 568 RQRPG-------HPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPA 620
Query: 371 SW*TQTPAWKCAPGRWCWRRSS--RKRRTPRRSSRC-PRTQSPPSRPPA**PWRPARQRA 201
+ PG R S R R P SSR RT+ P PP
Sbjct: 621 PSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPP------------ 668
Query: 200 PQRTHGPKAGHR*TPPGACQPARARGAERCGHGP 99
P+R GP+ PP R +R GH P
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Query: 1124 PRPRRPPAP------RRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRA-------PTRR 984
PR RPPAP R +Q+P PP + SG R P S ++ P R
Sbjct: 458 PRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERG 517
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+G RP R R R PP ER R R APSSR
Sbjct: 518 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGH 573
Query: 836 -PADRSGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRP 699
P +R R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RP
Sbjct: 574 PPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRP 633
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G PP +R P R PP PS R ++R PPP R P PP P R
Sbjct: 634 GHPPPERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRT 691
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QRP HP P+ R R AP++R + QRP P SG RP
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Query: 371 SW*TQTPAWKCAPGRWCWRRSS--RKRRTPRRSSRC-PRTQSPPSRPPA**PWRPARQRA 201
+ PG R S R R P SSR RT+ P PP
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Query: 200 PQRTHGPKAGHR*TPPGACQPARARGAERCGHGP 99
P+R GP+ PP R +R GH P
Sbjct: 793 PERGSGPRGTR---PPAPSSRTGQRTRQRPGHPP 823
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AP P R +Q+P PP + SG R P S ++ P R +G
Sbjct: 29 APGPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRG 88
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RP R R R PP ER R R APSSR P +R
Sbjct: 89 TRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPER 144
Query: 824 SGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRPGQPPG 684
R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RPG PP
Sbjct: 145 GSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP 204
Query: 683 QRWPPPTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAP----PPHPRR---HRWHQRPR 525
+R P R PP PS R ++R PPP R P PP P R QRP
Sbjct: 205 ERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPG 262
Query: 524 GQAR**CHPTPQPTPQQR-QRT*APATRA---SSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWRSW*TQ 357
HP P+ R R AP++R + QRP P SG RP
Sbjct: 263 -------HPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRT 315
Query: 356 TPAWKCAPGRWCWRRSS--RKRRTPRRSSRC-PRTQSPPSRPPA**PWRPARQRAPQRTH 186
+ PG R S R R P SSR RT+ P PP P+R
Sbjct: 316 GQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPP------------PERGS 363
Query: 185 GPKAGHR*TPPGACQPARARGAERCGHGP 99
GP+ PP R +R GH P
Sbjct: 364 GPRGTR---PPAPSSRTGQRTRQRPGHPP 389
Score = 83.2 bits (204), Expect = 8e-15
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Frame = -2
Query: 1106 PAPRRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRAPTRRAGSTS*RPARHRAAPRRRA 927
P R Q P P P S +G ++PG P P R +G RP AP R
Sbjct: 20 PNQRTQGHPAPGPS---SRTGQRTRQRPGHPP-----PERGSGPRGTRPP----APSSRT 67
Query: 926 SQSRCPPTRRAERPEPQRTA--RSWAPSSRPWPADRSGSCRSTRTPGTRRSPQCGPPCRS 753
Q +R P P+R + R P P P+ R+G TR+ P PP R
Sbjct: 68 GQRT---RQRPGHPPPERGSGPRGTRP---PAPSSRTGQ-------RTRQRPGHPPPERG 114
Query: 752 PPPCRRGPPARSG-----SRHRPGQPPGQRWPPPTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPP 588
P PPA S +R RPG PP +R P R PP PS R ++R PP
Sbjct: 115 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPP 172
Query: 587 PGRPPAP----PPHPRR---HRWHQRPRGQAR**CHPTPQPTPQQR-QRT*APATRA--- 441
P R P PP P R QRP HP P+ R R AP++R
Sbjct: 173 PERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPG-------HPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQR 225
Query: 440 SSQRPRSGP*RSPSGQAEPRPWRSW*TQTPAWKCAPGRWCWRRSS--RKRRTPRRSSRC- 270
+ QRP P SG RP + PG R S R R P SSR
Sbjct: 226 TRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTG 285
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Sbjct: 286 QRTRQRPGHPP------------PERGSGPRGTR---PPAPSSRTGQRTRQRPGHPP 327
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Identities = 84/259 (32%), Positives = 97/259 (37%), Gaps = 45/259 (17%)
Frame = -2
Query: 1124 PRPRRPPAP------RRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRA-------PTRR 984
PR RPPAP R +Q+P PP + SG R P S ++ P R
Sbjct: 613 PRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERG 672
Query: 983 AGSTS*RPAR--HRAAPRRRASQSRCPPTRRAERPEPQRTARSWAPSSRPW--------- 837
+G RP R R R PP ER R R APSSR
Sbjct: 673 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGH 728
Query: 836 -PADRSGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRP 699
P +R R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RP
Sbjct: 729 PPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRP 788
Query: 698 GQPPGQRWPPPTSRRPCPPPPSRRECPQSRAGQRGPPPGRPPAP----PPHPRR---HRW 540
G PP +R P R PP PS R ++R PPP R P PP P R
Sbjct: 789 GHPPPERGSGPRGTR--PPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRT 846
Query: 539 HQRPRGQAR**CHPTPQPT 483
QRP HP P+ T
Sbjct: 847 RQRPG-------HPPPEQT 858
Score = 65.5 bits (158), Expect = 2e-09
Identities = 73/230 (31%), Positives = 86/230 (36%), Gaps = 53/230 (23%)
Frame = -2
Query: 1124 PRPRRPPAP------RRQQQPQPTPPRQ*SGSG*CRGRQPGSTPARKRA-------PTRR 984
PR RPPAP R +Q+P PP + SG R P S ++ P R
Sbjct: 644 PRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERG 703
Query: 983 AGSTS*RPAR--HRAAPRRRASQSRCPPTRRAERPEPQRTARSWAPSSRPW--------- 837
+G RP R R R PP ER R R APSSR
Sbjct: 704 SGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPP----ERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGH 759
Query: 836 -PADRSGSCRSTRTPG--------TRRSPQCGPPCRSPPPCRRGPPARSG-----SRHRP 699
P +R R TR P TR+ P PP R P PPA S +R RP
Sbjct: 760 PPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRP 819
Query: 698 GQPP--------GQRWPPPTSR-------RPCPPPPSRRECPQSRAGQRG 594
G PP G R P P+SR RP PPP + + G+RG
Sbjct: 820 GHPPPERGSGPRGTRPPAPSSRTGQRTRQRPGHPPPEQTQ----TLGKRG 865
