データベース

Plants related / 植物関連データベース

Kazusa Genome DataBase

ゲノム配列に関するデータベース

Kazusa Transcript DataBase

転写産物に関するデータベース

Kazusa Marker DataBase

DNA マーカーに関するデータベース

Plant Genome DataBase Japan (PGDBj)

植物ゲノム関連情報の統合化データベース

メタボローム解析に関するデータベース

  • KOMICS メタボローム用に開発したデータベースや解析ツールへのポータルサイト
  • KomicMarket 生体物質の MS スペクトル解析情報データベース
  • MassBase 生体物質の MST 情報データベース
  • MS-MS Fragment Viewer フラボノイド化合物の MS/MS スペクトル情報データベース
  • KaPPA-View シロイヌナズナ代謝パスウェイ解析情報データベース
  • Metabolonote メタボローム解析時のサンプルや分析情報などの管理についてのデータベース
  • Food Metabolome Repository 様々な食品を LC-MS 分析したデータに関するデータベース

Others / その他のデータベース

  • KATANA シロイヌナズナ遺伝情合データベース
  • MiBASE マイクロトムの EST、Unigene、マーカー、GO などのデータベース
  • KaFTom マイクロトムの完全長 cDNA に由来する EST および完全長配列のデータベース
  • TACWeb シロイヌナズナの TAC ベクターについてのデータベース
  • CoP  植物の共発現遺伝子ネットワーク解析データベース
  • RnR シロイヌナズナ培養細胞の制御ネットワーク予測データベース
  • DAGViz 真核生物ゲノム遺伝子の GO 解析データベース

Software / ソフトウェア

  • Genotype Matrix Mapping GMM Genotype Matrix Mapping:QTL 間の相互作用を検出する解析プログラム
  • Plant phenotyping software 植物の形質評価を高精度化・高効率化するための画像解析プログラム
  • Polyans ゲル電気泳動イメージから遺伝子型のタイピングを行う画像解析プログラム
  • KAGIANA シロイヌナズナ共発現遺伝子機能解析プログラム
  • ConfeitoGUI 相関ネットワーク解析ツール

Human related / ヒト関連データベース

cDNA project

cDNA に関するデーターベース

  • HUGE ヒト長鎖 cDNA (KIAA cDNA) 解析情報データベース
  • ROUGE マウス長鎖 cDNA (mKIAA cDNA) 解析情報データベース
  • CREATE portal InGaP:mKIAA 抗体、mKIAA cDNA マイクロアレイ解析、パスウェイデータベース
  • KOP ヒト蛋白質発現クローン(Flexi ORF clones)データベース

FTP