Salmonella typhimurium LT2 [gbbct]: 4696 CDS's (1477317 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 23.3( 34407)  UCU  7.2( 10665)  UAU 17.1( 25288)  UGU  4.8(  7154)
UUC 15.3( 22562)  UCC 10.1( 14953)  UAC 11.6( 17079)  UGC  6.6(  9817)
UUA 13.2( 19499)  UCA  6.2(  9186)  UAA  1.9(  2781)  UGA  1.0(  1466)
UUG 12.4( 18352)  UCG  9.5( 14062)  UAG  0.3(   452)  UGG 15.2( 22479)

CUU 11.8( 17442)  CCU  7.2( 10564)  CAU 13.3( 19643)  CGU 18.8( 27700)
CUC 10.4( 15425)  CCC  6.9( 10235)  CAC  9.6( 14171)  CGC 23.3( 34474)
CUA  4.9(  7257)  CCA  5.8(  8501)  CAA 12.7( 18796)  CGA  3.6(  5268)
CUG 53.6( 79180)  CCG 24.7( 36447)  CAG 31.0( 45726)  CGG  6.9( 10266)

AUU 29.3( 43251)  ACU  6.7(  9935)  AAU 17.8( 26263)  AGU  7.3( 10831)
AUC 24.4( 36114)  ACC 23.3( 34480)  AAC 20.1( 29752)  AGC 17.4( 25762)
AUA  5.3(  7886)  ACA  5.8(  8515)  AAA 31.7( 46882)  AGA  2.3(  3451)
AUG 27.4( 40490)  ACG 18.8( 27756)  AAG 11.3( 16630)  AGG  1.6(  2422)

GUU 15.5( 22914)  GCU 12.8( 18891)  GAU 31.6( 46740)  GGU 17.4( 25643)
GUC 18.2( 26821)  GCC 29.1( 42983)  GAC 20.3( 30060)  GGC 35.3( 52100)
GUA 11.4( 16792)  GCA 13.0( 19160)  GAA 35.4( 52232)  GGA  8.7( 12841)
GUG 25.2( 37210)  GCG 42.5( 62843)  GAG 20.7( 30586)  GGG 12.0( 17784)

Coding GC 53.36% 1st letter GC 59.34% 2nd letter GC 41.20% 3rd letter GC 59.53%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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