Sus scrofa [gbmam]: 2953 CDS's (1168059 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 15.5( 18160)  UCU 12.2( 14246)  UAU 10.9( 12717)  UGU  9.3( 10902)
UUC 23.9( 27973)  UCC 18.5( 21586)  UAC 18.9( 22023)  UGC 14.4( 16776)
UUA  5.5(  6442)  UCA  8.9( 10448)  UAA  0.8(   883)  UGA  1.5(  1739)
UUG 11.6( 13518)  UCG  4.8(  5607)  UAG  0.5(   628)  UGG 14.9( 17440)

CUU 11.2( 13109)  CCU 15.9( 18561)  CAU  8.5(  9900)  CGU  4.1(  4792)
CUC 23.2( 27053)  CCC 22.1( 25796)  CAC 15.6( 18267)  CGC 12.1( 14145)
CUA  5.7(  6653)  CCA 14.3( 16692)  CAA  9.9( 11567)  CGA  5.6(  6519)
CUG 46.1( 53901)  CCG  8.4(  9860)  CAG 35.0( 40912)  CGG 11.9( 13943)

AUU 13.4( 15660)  ACU 11.2( 13038)  AAU 14.2( 16598)  AGU  9.5( 11082)
AUC 24.6( 28754)  ACC 22.6( 26456)  AAC 21.9( 25606)  AGC 20.0( 23327)
AUA  6.2(  7191)  ACA 12.3( 14403)  AAA 20.3( 23681)  AGA 10.3( 12052)
AUG 21.9( 25610)  ACG  7.7(  9022)  AAG 33.1( 38617)  AGG 11.4( 13258)

GUU  9.2( 10755)  GCU 16.8( 19642)  GAU 19.1( 22309)  GGU 10.0( 11651)
GUC 17.3( 20245)  GCC 31.7( 36983)  GAC 28.5( 33278)  GGC 25.7( 29987)
GUA  5.5(  6447)  GCA 13.0( 15141)  GAA 23.4( 27310)  GGA 16.0( 18686)
GUG 33.0( 38572)  GCG  8.9( 10339)  GAG 41.1( 48046)  GGG 18.5( 21555)

Coding GC 54.72% 1st letter GC 56.73% 2nd letter GC 42.44% 3rd letter GC 64.99%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage