Shewanella sp. ANA-3 [gbbct]: 4367 CDS's (1502413 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.0( 39108)  UCU  8.6( 12943)  UAU 17.6( 26442)  UGU  5.2(  7802)
UUC 13.6( 20496)  UCC  7.3( 10910)  UAC 12.3( 18443)  UGC  5.2(  7877)
UUA 30.2( 45369)  UCA  8.9( 13424)  UAA  1.9(  2893)  UGA  0.5(   687)
UUG 17.6( 26409)  UCG  9.9( 14803)  UAG  0.5(   787)  UGG 12.5( 18801)

CUU 11.6( 17382)  CCU 10.8( 16180)  CAU 13.1( 19752)  CGU 15.5( 23283)
CUC 16.2( 24307)  CCC 10.5( 15787)  CAC  9.4( 14091)  CGC 16.7( 25115)
CUA  8.9( 13409)  CCA 11.3( 16999)  CAA 29.7( 44607)  CGA  3.7(  5581)
CUG 25.0( 37556)  CCG  8.4( 12631)  CAG 19.5( 29317)  CGG  3.9(  5882)

AUU 28.2( 42406)  ACU 12.8( 19195)  AAU 21.0( 31517)  AGU 12.5( 18738)
AUC 25.2( 37786)  ACC 23.4( 35148)  AAC 18.8( 28280)  AGC 18.0( 27114)
AUA  5.7(  8514)  ACA  8.0( 11946)  AAA 29.9( 44925)  AGA  3.7(  5627)
AUG 25.1( 37761)  ACG  9.8( 14677)  AAG 19.7( 29658)  AGG  2.4(  3605)

GUU 14.0( 21066)  GCU 16.4( 24635)  GAU 35.9( 53984)  GGU 23.9( 35859)
GUC 14.6( 21995)  GCC 35.9( 53885)  GAC 17.5( 26231)  GGC 29.3( 44094)
GUA 10.0( 15056)  GCA 16.6( 24970)  GAA 34.1( 51227)  GGA  6.1(  9233)
GUG 29.2( 43874)  GCG 27.0( 40614)  GAG 24.2( 36379)  GGG  8.9( 13341)

Coding GC 48.97% 1st letter GC 55.80% 2nd letter GC 39.36% 3rd letter GC 51.76%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage