Thermotoga naphthophila [gbbct]: 37 CDS's (13046 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.0(   261)  UCU 14.1(   184)  UAU 10.8(   141)  UGU  5.4(    71)
UUC 31.9(   416)  UCC 11.3(   148)  UAC 23.5(   306)  UGC  2.8(    36)
UUA  3.4(    44)  UCA  8.0(   105)  UAA  0.5(     7)  UGA  2.0(    26)
UUG 17.1(   223)  UCG  8.0(   104)  UAG  0.3(     4)  UGG  9.0(   118)

CUU 25.1(   328)  CCU  9.9(   129)  CAU  5.9(    77)  CGU  3.5(    46)
CUC 27.4(   357)  CCC  9.7(   127)  CAC 10.2(   133)  CGC  2.1(    28)
CUA  2.7(    35)  CCA  9.7(   127)  CAA  4.5(    59)  CGA  3.4(    44)
CUG 24.9(   325)  CCG  8.5(   111)  CAG 11.5(   150)  CGG  2.9(    38)

AUU 15.6(   203)  ACU  7.0(    91)  AAU 11.9(   155)  AGU  8.5(   111)
AUC 27.1(   353)  ACC 11.9(   155)  AAC 22.0(   287)  AGC  7.6(    99)
AUA 28.1(   367)  ACA 12.1(   158)  AAA 45.8(   598)  AGA 27.0(   352)
AUG 22.8(   298)  ACG 13.3(   173)  AAG 33.0(   431)  AGG 16.3(   213)

GUU 30.1(   393)  GCU 14.0(   183)  GAU 32.5(   424)  GGU 21.0(   274)
GUC 13.6(   178)  GCC 14.6(   190)  GAC 19.7(   257)  GGC  7.4(    96)
GUA 10.8(   141)  GCA 14.0(   182)  GAA 56.0(   730)  GGA 33.8(   441)
GUG 32.1(   419)  GCG 15.4(   201)  GAG 35.3(   460)  GGG  9.6(   125)

Coding GC 45.62% 1st letter GC 52.18% 2nd letter GC 34.39% 3rd letter GC 50.28%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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