Shrimp white spot syndrome virus [gbvrl]: 1387 CDS's (377480 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.9( 10164)  UCU 30.3( 11448)  UAU 14.7(  5551)  UGU 11.6(  4366)
UUC 19.8(  7463)  UCC 15.1(  5700)  UAC 12.6(  4771)  UGC  6.6(  2493)
UUA 16.2(  6128)  UCA 20.1(  7580)  UAA  1.6(   609)  UGA  1.2(   439)
UUG 20.0(  7538)  UCG  7.3(  2744)  UAG  0.9(   339)  UGG  8.7(  3289)

CUU 15.7(  5909)  CCU 18.6(  7011)  CAU  9.9(  3726)  CGU  7.0(  2657)
CUC 11.9(  4500)  CCC  9.6(  3638)  CAC  9.1(  3430)  CGC  4.8(  1813)
CUA 11.6(  4396)  CCA 13.6(  5125)  CAA 18.2(  6883)  CGA  4.2(  1602)
CUG 10.1(  3826)  CCG  3.3(  1251)  CAG 10.5(  3982)  CGG  2.3(   877)

AUU 25.3(  9553)  ACU 20.7(  7808)  AAU 32.3( 12203)  AGU 14.4(  5430)
AUC 15.6(  5894)  ACC 12.0(  4529)  AAC 23.5(  8887)  AGC  7.8(  2945)
AUA 18.9(  7144)  ACA 21.7(  8176)  AAA 37.0( 13979)  AGA 19.6(  7393)
AUG 28.1( 10606)  ACG  6.8(  2571)  AAG 31.6( 11927)  AGG 13.3(  5027)

GUU 19.6(  7408)  GCU 18.8(  7111)  GAU 33.6( 12682)  GGU 14.4(  5421)
GUC 10.7(  4023)  GCC 13.8(  5192)  GAC 20.3(  7673)  GGC  8.2(  3113)
GUA 16.0(  6049)  GCA 20.5(  7723)  GAA 47.4( 17893)  GGA 22.8(  8600)
GUG 16.8(  6346)  GCG  5.7(  2166)  GAG 19.3(  7290)  GGG  9.2(  3470)

Coding GC 41.57% 1st letter GC 45.77% 2nd letter GC 39.39% 3rd letter GC 39.56%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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