Xenopus tropicalis [gbvrt]: 7904 CDS's (3153882 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 21.5( 67826)  UCU 17.9( 56377)  UAU 15.4( 48556)  UGU 10.5( 33038)
UUC 17.2( 54381)  UCC 14.9( 47126)  UAC 15.3( 48097)  UGC 11.1( 34979)
UUA 10.1( 31788)  UCA 12.9( 40587)  UAA  1.1(  3370)  UGA  1.0(  3039)
UUG 14.8( 46734)  UCG  4.1( 12786)  UAG  0.5(  1497)  UGG 11.5( 36334)

CUU 17.2( 54340)  CCU 16.6( 52204)  CAU 12.5( 39503)  CGU  6.1( 19225)
CUC 13.2( 41550)  CCC 12.5( 39392)  CAC 12.6( 39833)  CGC  7.3( 23156)
CUA  9.5( 29833)  CCA 19.0( 60018)  CAA 15.6( 49295)  CGA  6.1( 19179)
CUG 29.4( 92678)  CCG  5.1( 16061)  CAG 29.9( 94251)  CGG  7.2( 22653)

AUU 20.8( 65653)  ACU 15.0( 47355)  AAU 21.5( 67666)  AGU 13.6( 42861)
AUC 17.6( 55538)  ACC 14.3( 45252)  AAC 20.2( 63716)  AGC 16.5( 52185)
AUA 11.8( 37212)  ACA 18.4( 57972)  AAA 32.0(100794)  AGA 14.2( 44705)
AUG 24.7( 77991)  ACG  4.8( 15253)  AAG 32.0(100804)  AGG 11.8( 37132)

GUU 16.1( 50717)  GCU 20.8( 65507)  GAU 29.9( 94213)  GGU 12.1( 38043)
GUC 12.0( 37817)  GCC 18.6( 58556)  GAC 22.8( 71798)  GGC 15.0( 47215)
GUA 10.9( 34318)  GCA 20.5( 64657)  GAA 35.3(111488)  GGA 20.8( 65584)
GUG 22.7( 71555)  GCG  5.2( 16462)  GAG 34.7(109424)  GGG 14.2( 44753)

Coding GC 47.47% 1st letter GC 53.12% 2nd letter GC 39.94% 3rd letter GC 49.37%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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