Xenopus laevis [gbvrt]: 13021 CDS's (5662188 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 21.1(119702)  UCU 18.8(106312)  UAU 15.5( 87863)  UGU 10.8( 60968)
UUC 16.8( 95334)  UCC 15.1( 85475)  UAC 14.7( 83378)  UGC 10.5( 59482)
UUA 10.1( 56991)  UCA 13.4( 75894)  UAA  1.0(  5595)  UGA  0.9(  5088)
UUG 15.2( 85856)  UCG  3.8( 21713)  UAG  0.4(  2340)  UGG 11.2( 63671)

CUU 17.0( 96095)  CCU 17.4( 98763)  CAU 12.7( 71669)  CGU  6.3( 35867)
CUC 13.0( 73797)  CCC 12.1( 68448)  CAC 12.5( 70592)  CGC  6.7( 37763)
CUA  9.2( 52118)  CCA 19.7(111548)  CAA 16.8( 95157)  CGA  6.4( 36084)
CUG 27.8(157341)  CCG  4.7( 26705)  CAG 29.5(167173)  CGG  6.4( 36200)

AUU 21.0(118742)  ACU 15.9( 90232)  AAU 22.3(126208)  AGU 14.4( 81642)
AUC 17.5( 99311)  ACC 14.1( 79920)  AAC 20.5(116351)  AGC 16.1( 91124)
AUA 11.6( 65595)  ACA 19.0(107531)  AAA 32.9(186066)  AGA 14.7( 83020)
AUG 25.0(141543)  ACG  4.7( 26597)  AAG 31.9(180533)  AGG 11.4( 64806)

GUU 16.3( 92219)  GCU 21.1(119272)  GAU 30.3(171463)  GGU 12.6( 71591)
GUC 12.0( 67849)  GCC 17.2( 97349)  GAC 22.6(127939)  GGC 14.2( 80278)
GUA 10.6( 60008)  GCA 20.6(116368)  GAA 36.5(206804)  GGA 21.4(121273)
GUG 22.1(125311)  GCG  4.7( 26633)  GAG 34.3(194344)  GGG 12.9( 73284)

Coding GC 46.96% 1st letter GC 52.76% 2nd letter GC 39.93% 3rd letter GC 48.19%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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