Rhipicephalus microplus [gbinv]: 60 CDS's (25526 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 13.9(   354)  UCU  9.5(   242)  UAU 10.6(   271)  UGU  9.8(   251)
UUC 30.0(   767)  UCC 11.4(   292)  UAC 27.0(   689)  UGC 21.0(   535)
UUA  3.3(    84)  UCA  8.7(   221)  UAA  1.0(    25)  UGA  1.5(    39)
UUG 11.2(   287)  UCG 10.3(   262)  UAG  0.2(     5)  UGG 13.9(   356)

CUU 12.1(   309)  CCU 10.5(   269)  CAU  7.9(   201)  CGU  7.5(   191)
CUC 20.9(   534)  CCC 13.3(   339)  CAC 16.5(   421)  CGC 13.3(   340)
CUA  5.8(   149)  CCA 13.8(   352)  CAA 12.5(   319)  CGA  7.3(   186)
CUG 27.5(   702)  CCG 10.3(   264)  CAG 25.7(   656)  CGG  5.7(   146)

AUU 14.5(   369)  ACU  9.5(   243)  AAU 11.3(   289)  AGU  7.6(   195)
AUC 20.7(   528)  ACC 17.0(   433)  AAC 32.5(   829)  AGC 14.6(   373)
AUA  9.0(   230)  ACA 11.6(   295)  AAA 19.8(   505)  AGA  6.0(   154)
AUG 23.9(   609)  ACG 15.0(   382)  AAG 43.9(  1121)  AGG  9.1(   233)

GUU 14.8(   377)  GCU 17.0(   433)  GAU 19.2(   489)  GGU 15.8(   404)
GUC 19.0(   485)  GCC 28.3(   722)  GAC 39.3(  1003)  GGC 25.0(   637)
GUA  7.6(   193)  GCA 16.8(   429)  GAA 31.6(   806)  GGA 19.7(   502)
GUG 25.7(   656)  GCG 14.5(   370)  GAG 38.0(   971)  GGG  8.0(   203)

Coding GC 52.89% 1st letter GC 55.07% 2nd letter GC 40.32% 3rd letter GC 63.27%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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