Thermococcus kodakarensis KOD1 [gbbct]: 2352 CDS's (657527 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 13.1(  8625)  UCU  4.8(  3170)  UAU  8.7(  5729)  UGU  1.7(  1106)
UUC 29.9( 19675)  UCC  9.2(  6040)  UAC 29.4( 19332)  UGC  3.6(  2370)
UUA  4.2(  2739)  UCA  7.4(  4852)  UAA  0.7(   440)  UGA  2.4(  1591)
UUG  5.7(  3770)  UCG  6.3(  4127)  UAG  0.5(   321)  UGG 12.9(  8480)

CUU 20.9( 13747)  CCU  6.1(  4041)  CAU  3.0(  1983)  CGU  2.1(  1349)
CUC 44.3( 29117)  CCC 13.0(  8516)  CAC 12.9(  8462)  CGC  8.0(  5241)
CUA  6.3(  4133)  CCA  9.5(  6269)  CAA  2.6(  1719)  CGA  1.1(   709)
CUG 22.7( 14900)  CCG 15.1(  9943)  CAG 15.6( 10230)  CGG  3.2(  2108)

AUU 13.4(  8785)  ACU  8.6(  5653)  AAU  5.5(  3644)  AGU  4.5(  2938)
AUC 23.9( 15747)  ACC 16.5( 10820)  AAC 26.5( 17436)  AGC 18.0( 11831)
AUA 32.0( 21054)  ACA  7.6(  5028)  AAA 18.2( 11985)  AGA 12.5(  8243)
AUG 22.7( 14939)  ACG 13.3(  8748)  AAG 50.2( 33012)  AGG 31.3( 20560)

GUU 29.0( 19054)  GCU 13.1(  8597)  GAU 15.4( 10136)  GGU 12.8(  8438)
GUC 28.5( 18708)  GCC 30.3( 19935)  GAC 32.0( 21055)  GGC 25.5( 16780)
GUA  8.5(  5572)  GCA 13.9(  9128)  GAA 27.1( 17803)  GGA 21.6( 14214)
GUG 17.1( 11254)  GCG 17.0( 11159)  GAG 60.9( 40029)  GGG 15.8( 10408)

Coding GC 52.83% 1st letter GC 55.47% 2nd letter GC 36.86% 3rd letter GC 66.17%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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