Bacillus clausii KSM-K16 [gbbct]: 4087 CDS's (1230992 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 34.1( 41994)  UCU  9.8( 12043)  UAU 20.9( 25754)  UGU  3.7(  4495)
UUC 10.3( 12663)  UCC  7.0(  8578)  UAC 12.3( 15084)  UGC  4.1(  5029)
UUA 22.1( 27198)  UCA 10.4( 12778)  UAA  1.9(  2372)  UGA  0.8(   934)
UUG 24.9( 30670)  UCG  9.0( 11103)  UAG  0.6(   781)  UGG 10.9( 13471)

CUU 22.7( 27997)  CCU 11.5( 14197)  CAU 15.5( 19085)  CGU 10.3( 12628)
CUC 10.7( 13181)  CCC  3.4(  4185)  CAC  7.1(  8694)  CGC 11.8( 14507)
CUA  9.4( 11558)  CCA 13.4( 16515)  CAA 28.6( 35260)  CGA  5.5(  6816)
CUG 10.8( 13265)  CCG 10.0( 12353)  CAG 11.3( 13960)  CGG  8.3( 10230)

AUU 40.0( 49261)  ACU  8.1(  9952)  AAU 20.4( 25144)  AGU  7.1(  8687)
AUC 19.1( 23460)  ACC  7.7(  9450)  AAC 16.7( 20577)  AGC 13.3( 16358)
AUA  7.6(  9330)  ACA 20.4( 25085)  AAA 41.3( 50878)  AGA  4.6(  5698)
AUG 26.1( 32143)  ACG 18.8( 23160)  AAG 16.1( 19872)  AGG  3.8(  4721)

GUU 20.5( 25256)  GCU 22.4( 27551)  GAU 28.4( 34948)  GGU 11.8( 14532)
GUC 20.6( 25347)  GCC 19.9( 24491)  GAC 21.2( 26123)  GGC 30.0( 36928)
GUA 13.7( 16920)  GCA 24.4( 30071)  GAA 52.6( 64711)  GGA 15.4( 18961)
GUG 17.8( 21970)  GCG 20.9( 25749)  GAG 21.5( 26419)  GGG 14.5( 17861)

Coding GC 45.32% 1st letter GC 54.61% 2nd letter GC 37.30% 3rd letter GC 44.06%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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