Solanum habrochaites [gbpln]: 26 CDS's (13220 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 29.5( 390) UCU 22.8( 301) UAU 17.5( 232) UGU 9.7( 128)
UUC 15.9( 210) UCC 14.3( 189) UAC 13.3( 176) UGC 6.8( 90)
UUA 19.1( 253) UCA 27.0( 357) UAA 0.7( 9) UGA 0.4( 5)
UUG 33.9( 448) UCG 5.7( 76) UAG 0.9( 12) UGG 11.6( 154)
CUU 33.9( 448) CCU 13.7( 181) CAU 19.9( 263) CGU 6.6( 87)
CUC 19.6( 259) CCC 6.7( 88) CAC 12.1( 160) CGC 2.0( 26)
CUA 15.9( 210) CCA 17.4( 230) CAA 24.3( 321) CGA 4.5( 60)
CUG 7.9( 105) CCG 3.9( 51) CAG 8.4( 111) CGG 1.1( 15)
AUU 32.8( 433) ACU 16.9( 224) AAU 41.5( 548) AGU 16.7( 221)
AUC 13.2( 174) ACC 8.6( 114) AAC 25.5( 337) AGC 12.5( 165)
AUA 17.2( 227) ACA 20.3( 269) AAA 31.0( 410) AGA 13.5( 179)
AUG 20.5( 271) ACG 8.0( 106) AAG 26.1( 345) AGG 9.2( 121)
GUU 19.6( 259) GCU 16.1( 213) GAU 37.4( 494) GGU 17.4( 230)
GUC 7.2( 95) GCC 6.1( 80) GAC 12.2( 161) GGC 5.9( 78)
GUA 9.8( 129) GCA 16.2( 214) GAA 32.8( 434) GGA 27.7( 366)
GUG 10.5( 139) GCG 2.7( 36) GAG 24.3( 321) GGG 13.8( 182)
Coding GC 39.78%
1st letter GC 45.73%
2nd letter GC 36.58%
3rd letter GC 37.03%
List of codon usage for each CDS
(format)
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