Syntrophus aciditrophicus SB [gbbct]: 3168 CDS's (944128 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.7( 19584)  UCU  6.9(  6543)  UAU 16.8( 15907)  UGU  4.7(  4474)
UUC 21.8( 20584)  UCC 18.9( 17852)  UAC 12.7( 11962)  UGC  8.5(  8015)
UUA  4.8(  4516)  UCA  7.3(  6847)  UAA  1.3(  1223)  UGA  1.6(  1465)
UUG 11.8( 11157)  UCG  9.2(  8720)  UAG  0.5(   480)  UGG 10.6( 10039)

CUU 20.2( 19066)  CCU  8.6(  8098)  CAU 12.1( 11404)  CGU  7.8(  7397)
CUC 19.6( 18521)  CCC 15.8( 14919)  CAC  7.8(  7342)  CGC 13.0( 12285)
CUA  1.9(  1747)  CCA  4.1(  3857)  CAA  7.2(  6832)  CGA  6.2(  5870)
CUG 42.4( 40008)  CCG 15.6( 14735)  CAG 23.9( 22558)  CGG 20.0( 18905)

AUU 23.6( 22306)  ACU  5.9(  5540)  AAU 18.5( 17429)  AGU  6.4(  6014)
AUC 37.4( 35296)  ACC 18.6( 17543)  AAC 16.7( 15780)  AGC 12.2( 11558)
AUA  7.7(  7261)  ACA  8.9(  8372)  AAA 29.4( 27756)  AGA  8.7(  8229)
AUG 25.9( 24499)  ACG 15.5( 14608)  AAG 26.1( 24607)  AGG  9.7(  9183)

GUU 17.1( 16121)  GCU 11.9( 11216)  GAU 30.5( 28766)  GGU 12.3( 11614)
GUC 24.1( 22709)  GCC 35.6( 33655)  GAC 22.4( 21180)  GGC 25.3( 23857)
GUA  6.8(  6456)  GCA 12.7( 11956)  GAA 43.6( 41153)  GGA 20.8( 19657)
GUG 19.3( 18211)  GCG 20.9( 19699)  GAG 25.0( 23608)  GGG 16.3( 15377)

Coding GC 52.48% 1st letter GC 57.07% 2nd letter GC 40.05% 3rd letter GC 60.32%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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