Streptomyces collinus [gbbct]: 53 CDS's (17834 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 0.6( 11) UCU 1.0( 18) UAU 0.8( 15) UGU 0.7( 12)
UUC 25.5( 455) UCC 19.0( 338) UAC 15.6( 278) UGC 7.7( 138)
UUA 0.1( 1) UCA 2.1( 37) UAA 0.1( 1) UGA 2.5( 45)
UUG 2.3( 41) UCG 12.6( 225) UAG 0.4( 7) UGG 13.4( 239)
CUU 1.6( 29) CCU 2.7( 48) CAU 2.7( 49) CGU 7.2( 129)
CUC 37.1( 661) CCC 27.6( 493) CAC 25.0( 446) CGC 39.0( 695)
CUA 0.7( 12) CCA 1.5( 27) CAA 2.2( 40) CGA 4.8( 85)
CUG 55.1( 982) CCG 34.6( 617) CAG 23.3( 415) CGG 37.8( 675)
AUU 0.8( 14) ACU 1.1( 20) AAU 0.8( 14) AGU 1.3( 24)
AUC 27.8( 495) ACC 39.9( 712) AAC 15.3( 273) AGC 14.5( 258)
AUA 1.2( 21) ACA 2.5( 45) AAA 1.2( 21) AGA 0.8( 14)
AUG 17.0( 304) ACG 16.1( 287) AAG 14.4( 256) AGG 4.3( 76)
GUU 1.6( 28) GCU 3.8( 67) GAU 3.5( 62) GGU 11.1( 198)
GUC 43.7( 779) GCC 74.5( 1329) GAC 53.5( 954) GGC 60.6( 1081)
GUA 3.3( 58) GCA 6.5( 116) GAA 10.4( 185) GGA 9.9( 177)
GUG 34.8( 621) GCG 47.3( 844) GAG 50.6( 903) GGG 18.7( 334)
Coding GC 72.43%
1st letter GC 73.67%
2nd letter GC 52.73%
3rd letter GC 90.90%
List of codon usage for each CDS
(format)
Homepage