Methanococcus maripaludis C7 [gbbct]: 1788 CDS's (513919 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 32.1( 16506)  UCU 12.3(  6335)  UAU 20.7( 10621)  UGU  8.2(  4211)
UUC 10.2(  5230)  UCC  5.3(  2725)  UAC 18.0(  9247)  UGC  4.8(  2449)
UUA 36.2( 18601)  UCA 23.2( 11903)  UAA  2.9(  1494)  UGA  0.3(   161)
UUG 12.8(  6575)  UCG  4.6(  2369)  UAG  0.3(   142)  UGG  6.7(  3461)

CUU 24.6( 12633)  CCU 10.8(  5567)  CAU  6.9(  3538)  CGU  1.8(   900)
CUC  8.0(  4124)  CCC  3.0(  1545)  CAC  8.0(  4088)  CGC  0.5(   246)
CUA  5.6(  2890)  CCA 15.4(  7901)  CAA  9.7(  4980)  CGA  2.8(  1418)
CUG  3.8(  1946)  CCG  4.1(  2127)  CAG  9.1(  4677)  CGG  1.4(   712)

AUU 47.6( 24452)  ACU 17.2(  8815)  AAU 36.2( 18617)  AGU 10.8(  5558)
AUC 17.9(  9210)  ACC  7.6(  3902)  AAC 19.5( 10034)  AGC  6.5(  3365)
AUA 28.7( 14738)  ACA 19.4(  9981)  AAA 76.0( 39052)  AGA 17.9(  9224)
AUG 25.5( 13120)  ACG  6.0(  3101)  AAG 10.9(  5619)  AGG  6.9(  3528)

GUU 35.1( 18052)  GCU 14.3(  7357)  GAU 40.3( 20693)  GGU 17.1(  8767)
GUC  4.8(  2487)  GCC  3.6(  1852)  GAC 15.7(  8066)  GGC  7.7(  3949)
GUA 23.8( 12240)  GCA 34.5( 17723)  GAA 74.9( 38483)  GGA 34.6( 17792)
GUG  5.1(  2607)  GCG  4.8(  2491)  GAG  7.5(  3875)  GGG  7.5(  3847)

Coding GC 34.22% 1st letter GC 44.67% 2nd letter GC 32.16% 3rd letter GC 25.82%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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