Methylibium petroleiphilum PM1 [gbbct]: 4449 CDS's (1417264 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  2.0(  2856)  UCU  1.2(  1700)  UAU  3.1(  4380)  UGU  0.9(  1274)
UUC 31.3( 44412)  UCC  8.2( 11676)  UAC 17.9( 25408)  UGC  8.9( 12601)
UUA  0.1(   211)  UCA  1.3(  1901)  UAA  0.2(   248)  UGA  2.6(  3672)
UUG  6.5(  9232)  UCG 19.0( 26911)  UAG  0.4(   529)  UGG 15.1( 21456)

CUU  2.9(  4101)  CCU  2.7(  3888)  CAU  4.5(  6355)  CGU  6.2(  8836)
CUC 25.5( 36172)  CCC 16.3( 23044)  CAC 18.4( 26059)  CGC 49.6( 70315)
CUA  0.8(  1161)  CCA  2.5(  3478)  CAA  3.8(  5377)  CGA  3.7(  5284)
CUG 73.3(103870)  CCG 33.4( 47321)  CAG 33.4( 47356)  CGG 15.2( 21596)

AUU  2.0(  2819)  ACU  1.5(  2128)  AAU  2.6(  3661)  AGU  1.9(  2706)
AUC 36.7( 51997)  ACC 26.4( 37416)  AAC 19.8( 27991)  AGC 20.6( 29178)
AUA  0.4(   519)  ACA  1.8(  2520)  AAA  1.6(  2290)  AGA  0.6(   883)
AUG 21.5( 30410)  ACG 20.1( 28557)  AAG 27.7( 39279)  AGG  1.9(  2692)

GUU  2.6(  3737)  GCU  6.2(  8727)  GAU  9.8( 13906)  GGU  8.5( 12102)
GUC 28.4( 40221)  GCC 63.5( 90003)  GAC 43.6( 61792)  GGC 61.9( 87666)
GUA  1.3(  1780)  GCA  8.7( 12319)  GAA 12.7( 17987)  GGA  3.7(  5242)
GUG 44.6( 63199)  GCG 55.3( 78413)  GAG 41.3( 58564)  GGG  9.8( 13880)

Coding GC 68.97% 1st letter GC 69.41% 2nd letter GC 47.94% 3rd letter GC 89.55%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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