Sambucus nigra [gbpln]: 27 CDS's (10298 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.4( 200) UCU 13.0( 134) UAU 14.5( 149) UGU 14.5( 149)
UUC 19.4( 200) UCC 15.0( 154) UAC 19.3( 199) UGC 14.1( 145)
UUA 10.0( 103) UCA 8.1( 83) UAA 0.7( 7) UGA 0.3( 3)
UUG 16.5( 170) UCG 10.0( 103) UAG 1.7( 17) UGG 19.4( 200)
CUU 17.1( 176) CCU 12.1( 125) CAU 6.3( 65) CGU 7.2( 74)
CUC 18.4( 189) CCC 15.1( 155) CAC 6.3( 65) CGC 5.3( 55)
CUA 11.3( 116) CCA 12.0( 124) CAA 22.2( 229) CGA 10.1( 104)
CUG 8.6( 89) CCG 4.1( 42) CAG 21.5( 221) CGG 4.8( 49)
AUU 21.2( 218) ACU 20.5( 211) AAU 38.1( 392) AGU 16.5( 170)
AUC 28.1( 289) ACC 24.8( 255) AAC 35.9( 370) AGC 20.5( 211)
AUA 11.7( 121) ACA 17.2( 177) AAA 15.1( 156) AGA 11.1( 114)
AUG 21.3( 219) ACG 7.2( 74) AAG 13.1( 135) AGG 13.4( 138)
GUU 21.0( 216) GCU 24.7( 254) GAU 33.4( 344) GGU 19.0( 196)
GUC 15.0( 154) GCC 15.1( 156) GAC 18.6( 192) GGC 15.1( 155)
GUA 16.8( 173) GCA 20.3( 209) GAA 18.1( 186) GGA 25.3( 261)
GUG 23.7( 244) GCG 7.3( 75) GAG 16.1( 166) GGG 16.8( 173)
Coding GC 47.32%
1st letter GC 48.86%
2nd letter GC 43.97%
3rd letter GC 49.13%
List of codon usage for each CDS
(format)
Homepage