Macaca fascicularis papillomavirus type 1 [gbvrl]: 6 CDS's (2383 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 31.9( 76) UCU 16.8( 40) UAU 29.4( 70) UGU 10.5( 25)
UUC 7.1( 17) UCC 20.1( 48) UAC 7.1( 17) UGC 9.7( 23)
UUA 23.9( 57) UCA 15.5( 37) UAA 1.7( 4) UGA 0.8( 2)
UUG 15.1( 36) UCG 3.8( 9) UAG 0.0( 0) UGG 13.4( 32)
CUU 14.3( 34) CCU 22.7( 54) CAU 13.4( 32) CGU 8.8( 21)
CUC 6.3( 15) CCC 10.9( 26) CAC 4.6( 11) CGC 5.9( 14)
CUA 12.6( 30) CCA 17.2( 41) CAA 26.9( 64) CGA 12.2( 29)
CUG 10.9( 26) CCG 3.8( 9) CAG 25.2( 60) CGG 6.7( 16)
AUU 23.5( 56) ACU 15.9( 38) AAU 28.5( 68) AGU 18.9( 45)
AUC 5.5( 13) ACC 13.8( 33) AAC 12.6( 30) AGC 10.5( 25)
AUA 15.9( 38) ACA 28.1( 67) AAA 26.0( 62) AGA 26.4( 63)
AUG 15.1( 36) ACG 2.9( 7) AAG 16.4( 39) AGG 15.9( 38)
GUU 23.9( 57) GCU 18.5( 44) GAU 39.4( 94) GGU 18.9( 45)
GUC 6.7( 16) GCC 13.4( 32) GAC 18.9( 45) GGC 16.8( 40)
GUA 17.2( 41) GCA 23.9( 57) GAA 38.2( 91) GGA 17.2( 41)
GUG 12.6( 30) GCG 7.1( 17) GAG 28.5( 68) GGG 13.4( 32)
Coding GC 43.95%
1st letter GC 51.70%
2nd letter GC 44.06%
3rd letter GC 36.09%
List of codon usage for each CDS
(format)
Homepage