mitochondrion Sceloporus tristichus [gbvrt]: 263 CDS's (84949 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 29.4(  2500)  UCU 10.4(   887)  UAU  4.6(   395)  UGU  0.9(    79)
UUC 20.3(  1724)  UCC 10.2(   866)  UAC 28.5(  2418)  UGC  9.3(   791)
UUA 30.0(  2551)  UCA 43.4(  3691)  UAA  2.3(   196)  UGA 22.1(  1878)
UUG  1.2(   105)  UCG  0.1(     5)  UAG  0.8(    67)  UGG  5.8(   489)

CUU 22.3(  1894)  CCU  6.4(   541)  CAU  2.3(   199)  CGU  6.1(   520)
CUC 31.8(  2701)  CCC  3.9(   331)  CAC  6.9(   590)  CGC  6.0(   512)
CUA 71.9(  6109)  CCA 51.9(  4408)  CAA 27.9(  2373)  CGA 12.6(  1072)
CUG 11.2(   955)  CCG  8.7(   737)  CAG  3.3(   283)  CGG  0.0(     0)

AUU 46.1(  3918)  ACU  9.4(   797)  AAU  9.6(   816)  AGU  0.4(    31)
AUC 37.3(  3166)  ACC 23.8(  2020)  AAC 21.0(  1788)  AGC  6.1(   522)
AUA 53.9(  4579)  ACA 38.5(  3270)  AAA 24.1(  2045)  AGA  0.0(     0)
AUG 20.4(  1731)  ACG  6.7(   569)  AAG  0.7(    59)  AGG  0.0(     0)

GUU  6.1(   517)  GCU 17.6(  1494)  GAU  0.2(    19)  GGU  3.9(   335)
GUC  9.6(   818)  GCC 20.6(  1748)  GAC 12.2(  1033)  GGC 14.6(  1240)
GUA 18.8(  1595)  GCA 37.5(  3182)  GAA 29.1(  2476)  GGA 21.1(  1793)
GUG  2.5(   214)  GCG  0.6(    49)  GAG  4.9(   418)  GGG  9.9(   840)

Coding GC 41.00% 1st letter GC 48.26% 2nd letter GC 40.84% 3rd letter GC 33.89%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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